Map Locations of contig_49190 (8596 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_49190

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64686 2 3216 bp MLOC_64686.1 Available Available LOC_Os10g38080.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13110.m03473 protein OsSub61 - Putative Subtilisin homologue, expressed





CDS Structure of MLOC_64686






Contig Sequence (8596 bp)

>contig_49190 8596 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCTCAAATGAGCTCGGGTGAACAGTTAAATCGAAAAAATAGAAAAAAAAATCAAAAATTA
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GTCCACATGAAGAATTACCAAAAGATTATGAAGGAATTTAAAGATGAGAAATTTACAAAT
GAATAGAGAGCTGAGCTTGAGAAGAAGACCATAAGAGGCACATTCAGGATACCCAAGCAC
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AAGAAAAAGCTAGAATATGCAATAGCTGACCTACTGAATTCAAGAGAGGGGAACAAGAGC
AAGATCAAGAGGATCAATGCAATTTGTGAGTATTATTTATGTTGGATGGTTGTGATGTGA
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TTCTAATGAAGTTTGGCAGTATGAACAATTATGATTTTATGTTGAATATTGTGAAATAGG
GCTGAGATGTTGTTAAACTTAAGAAGTTTGGTTTAAAAACCTATATATATATATATATGT
ATGGTGTTGCAAATTTGAACTTGAGATATTGATTATTTAAATGTTGGTGAAAATGATTAA
CTTTTTTAAGTAATATATTTCAAAATTGTTGCCAAAAGACATTTATTTAAATTTCGATGC
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TTTATGTTTAAAATATACATTTAAATGTTGGTGCAAAAAAGGAAATACATTTTTTATTTT
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TTGTTAAATGGAATGTATTTAAATGTTGGTGCAGCAAAGAAATACATTGGTTGATATTTT
CCTTACAAGGAATGTATTTAAATGTTGGTGCAAAGAAGGAAATATATGATTTAGTTTTTA
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TTATTGTTGTTATGAAAAAGGAAATGTATTGCTTGTTTCTTTTGTTTAAAATATTCTTTA
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TAAAAAACTTCCTGAGTCTGTCATTAGATTATCATTAACAATGACAATTTATTTACATTT
CTCCTTGTGCAAATTGCAGCCCTATTGAGTGATCAGTAATTTTGGTTGAGGCTCATATGG
TTGCATTGATTACAAGAACCTGCCTCTGCTTGAGAACAGCCTTGCGATGGAAACATGACA
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CACAACCGTCTCCAATGTTTATGTCTTTGAATGATAAATCATGTATATTCCCTCTCATAA
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TACTCCAATTTTGAATGGCAACTATTTAGACCGAAGAGGTGTAATTGTTTTTATTTTCCT
GTTTGCTGATACTAGTAGTTGTTGTAAAAGACATTGTGGTTTCTAATAATGAAAATTGAA
GAGTAAGCTCTCTTTATGAAAAGAAAGACTAAAGAGTGGGGAAGTGCATGGATGAACCGG
GTACATATGAACCTAATCGAAAAACACATTTCCAAATGCTAAAAAAACTGGAACAAGGTT
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CCTCTCCTGAAGAGTGCAGTAAGCTGAAGAGAAGCAGATCAAAAGAGTTTGCTCGAGACG
GAGAGAACCAGTCGGGGACAAGTTGCAGAAGCCATGTGCAAGACAATCAAAACACTGGAG
TGGAAGTATATGTACTTTATTGCTCACCAGTACCACTAAGCCTTGCTTTTATCCAAGCTC
CCGATAATTAACATGCTGGAAATGTTAATGTATGTATGTTGCCAGGAGCATTGAACCATC
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GCATCGGTCTTGTTTGGATACTCTAACTTGATTAGAGATTAGAGTCAGATTTTAACTTTA
AACTAACCATAAACTAACTCTAACCAAAAAATGTTTGGATGAAAGGGTTAGATTGTCAAT
AAATACAGTTTTTCCAATCATTTAGCTCCTTTATCCATGATTTTGTGTGATAGAGGTAGA
AGGAAAAGTAGCTTTTCCTGTGATCCATCTAACTCTAACCCAAATAAACACATTTTGGAT
GGATTAGTTTTTTTGGATGGGTTAGATACATCTAAACAACTCTAGTATGTTTGGATGTTT
TCGAATTAGTTCGATTCAATCTAACTAACTCTAATTCTAACTAACTCTAACTAGTCATGA
TCCAAACAGGGCTATCGAAGAAAAGGCAAGTGAAAAGCTCATCTCTGTTGCCCTGTTGCC
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CATGTAAAGTGGGTGTAGTCAGCTAGTCATGCAGTTCAGTTCATTGCAAATCTTGACCCT
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GGAGACGCATTTTTATTGATTCGCGCTATTTACAGAACAAAATTGCTCCAGTTTGCATGC
AGCCAGTGCAACTGCAAAACCATGGAAGCGCAGCAGCCTACTAAAGTACTGATGCTGATG
CTACCTAGCTATACATGCTGCCGTTTGCAGAATCACTACGCGGCCTTGGCTGGAACCACA
ATGGGGCTCCGCACGATGTGGTCATCGGAGACCCACTTCAGGTTGCCCTCGGCGCCGGCG
ACGCTAGGCTGCCCCGCCCACCGCACCGTCACCGTGAAGCTCTGCTTCTCCTTGGCCTCT
GTGAACCGCAGCATCGGCGGCTGCACCGTCACCGACACGTCTCTGGGCATGTCCACCACG
GCGGTGTACACGGAGTTGGGTTTCCCGACGTTGGTCACCGTGCGGTTGACCGTGATCGGC
TGGGCCAGCAGGTTGACGACGAGGGATGGGTAGTTCAGCTCTGCTTCGGTGGTGGCCTTG
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AGGCCGCAAAGGTAGGGGATGTAGTCGTCGGCGTGGAGGTCGTAGACCAAGCCGGGGTCG
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TGCTCGTCCTTGAGGGGCACGCCGGTGCGGTCCACGGCGTCCGACGTCGTCATGATGGCC
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CCGTCGGAGAACTCCGTGTGCGACTCGCTCGGCGCCCACGCCGCGAGTATGTTCATGCCG
GGCCCCGTGATGTCCGGCTTCAGGATGCCCGGGCTGGCCTTGCTCGGACCTCTGGACGAG
AAGAAAGTAACGGCCGGCGCCGGCGACGCGCCCATGACCGTGCCCTTGAACGCGATGCTC
GCCGTCGGGTTGGCCGTGGAGTTGATGTAGGCCGCGATCTTGGTCCCGGCATCGTAGCTC
ACGTGCGACGCAGGGAGGACATGCGGGTCGGCGAAGGTGGTGTACCCTTCGGCTGCTCTG
TTCATCACGATCATGCCCACGCCGTCGTACGCGGACACGGTCTGGCCAGCCTCGATGCGG
CCGTTCAGGCCTCTGCTCTCGCAGAGCACCACCTTGTCGCTCACCTCGGCTCCGCGCAGC
ACGCTGCAATCGCGGCTTGTCTCGGAGCCGTCGGCACCGGGGTACACGAGCGGAAAGGGC
TTTGCGGCGGAGTTGTTGCCTGGCTGGAACAGGGACTCGCCGTCGAACTCCTCGCCGTTG
CCGAGCCTCACGGTGGTGCGTATCGCGCGGTCCATCGTGCCGGCCGCGACGGTGAGCATC
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GCGTCCAGCCCGGCGATGATGTCCATGATGGAGCAGCGGCTGCGGGTACAAACCTTGTAA
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TTGGCGTTCTCCACGAAGTTGCCCGCGGCCGTGCTGGCCGTGTGCGTGCCGTGGCCCGCG
TCGTCCACCGGCGGCGCGGACGAGTTCACGGCGGCGCTGCCGAACGCGCGCGCCCCGATG
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TTGGGCGGCGGCTCGAGGCCGCCGTCCCCGAACGACGGGTGGCTGGGCAGGATCCCCGTG
TCCAAGATGCCAATCACGACCCCGCGGCCGAACCCGGAGCGGCTCCAGAACCCCTCGTTC
CCGAGGTGGAGGCCGAGGAAGCCCGGCGAGCGGGTGGTGGCGAGCGGCAGGAACACCTCC
GGGTACAGCCGGAGGCACCCCTCCGTGGCCCTCAGCGCGTCGGCCTCCTCGTCCGTGAGC
CGCGCGGCGAAGCCGGTGAACACGTCGCTGTAGGAGTAAATGATGCGGGGGCCAAGGTCC
TCGGCGCCGCCGTCCGACTCGGGCTCCGACTCGAGCGCGGCCGTCCGCGGGAGGAACGAG
CGGTGCCAGTCCTGGACGGAGCCGACGGGGCCGGCCCTCGGGTCGAGGTGGACGACGTAG
TTCTTGCGCGCACGCAGGTACGACGCGCCGAGCAGCGGCTGCAGGGACAGGAGGAGGAAG
GCGACGAACCACGGGGACTCCATGAGCGGCAATGGCGAGGCGGAGTCGGGCCGGTGAGTG
CGGCGACGACGATGGGCTCCCGCTCCGGTCGAGCCCGGCGGCCTCTTTATACGGGGAAGG
TGGCAGCCGAGGCCTGCGTCGCGTGGGGGCCTGAGGGGGAAGGGAGTGGAGTGGAGTGAT
GGGGTGAGCAGTGGCACTGGGCGTGAGCTGGAGGGCAGTGGCGCTGCGTTACTGGTGTAA
AATGATGGCCTTTCATTGTGTATTTGCATCGGTGTGGGGCGCAGTACTGCTCCTGCTACT
AGCTCCGGCGCCACTGTTCCAGCCAGGCAACAACTCCGCCGCGTCCGGTGGATGTGGATC
TACGTGCCGCTGACCGATGTCCCGTGCCCCTGGATGCGTATGGCGATAGCTGGCCCGGTC
GGGATCGGATTCCGGTGCCTCCCGCTCGTAGATCGGGGGGAGATGGTACTTTCTGTGGGG
CCACCGCGCCGTGCCGGTGGACGACGGTGAGCCGATTCGTGTCACGCCCACGGCGGTGCG
GGACGGGCGGCGCTATCCAGGGGGTCAAATGGCCGGTTGACACGACACGTCCAAGATATG
GCCCGCCTTTTGACGACGGTGGCGTGAACGCGCATGTGCACAGGGTGGACGAGCGCCCGC
AGGTGGGTCGGTCGGTACGGTGACTACTACTACTACTAGAAACGCATGGCGGTGGTGGTT
GATGATTCCCCTGCGAGGAAAACGGAGGACCCGGGTCACGCATATCTGGGAAAGGGCGGC
ACGACCGGCATTTATGCTTCGTGGAAATATGGAATTACTACTAGTGTATATGACAATTGA
TTCGCGTTCACTCCCCGACGATGACGCACCTCGCGTCTGGCTAGCAGCAACGCCCACCCG
CATTTTGAATTCTTGAACCAGAGGACAAACTGCAATCAATCCTCTGCCCCGCAAAACCAA
CAAATTCGTGTTTCCAATACGGCGTGGGGTAGCCACGGCCACGGCCACAGAGGCACAGAG
CTCGTTCGGCCGAACCCTGCGCTGGGCCTCCTCAAACATGCCCATATGCACGGGCGCACC
GTCTTCTGGGATGCAGACATTTCTGCTCACGAGCGCACAAAATGCCGTAGTACGTAGGCG
CTGGCCTCGAGCAGATTAACCTTTCGCTTTTAGCCCGATCCACGAGTTTTGAACTTGCAC
CTGCTACTAGCTCCGGCGGGGTCGGGCGGTAAAAAGTGTATGCAAACGTAGCCCGTGGCG
CAAGTATCCAAGCCGCCAGCGTGCGTGCACTGCACCCGCCCTGCCGTCGTGTCCGGTTGG
TCGGAACGCTCAGACGTAGATACTCGCGCCATTTTCTTTTTGAGAGGATACTCGCGCCAT
TTTAAACTGTAGAACTGGGCCACTTCTCTCGGAATGGCATGCATGTCAGAGACGCACACG
CGGCGCGGATATAGCAAATCCCTACCAGAAAAATACGTGAATGAACCCGGATACATCTTC
GTGTTGTATGTTCATGTATAAAGTTTCACAGAAAAACAACTTGCTTGTCATCTATGAAAA
TAAAAATTTAGAAAAAACGAAGGCAAAAAATTGGCTCATATGTTAAATAAGAGGAGGATA
GAATTTTTGTTACAAACTCCACGCTACATCGAGCTCATTCTCCAGGTACAATCTCCGAAG
CACCGATACGTCGCTG