Map Locations of contig_49044 (8194 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_49044

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64595 1 349 bp MLOC_64595.1 Available Available LOC_Os01g41960.1, FRAME:-2, EVALUE:7e-17, 13101.m04307 protein retrotransposon protein, putative, unclassified
MLOC_64594 1 988 bp AK249901.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_64595






CDS Structure of MLOC_64594






Contig Sequence (8194 bp)

>contig_49044 8194 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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CGCGTCGTACTCGCGGACGGTATTGTCGACGGCGTCGAACATGCCGAGGCCGAGCCGCAT
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GAGTAGAAGAACGTGTGGTCGAGCGATGTATTTATAGGGCGCGCCGAGCGTTGTATGCCA
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TCCTCGTGCGTGGTGTTTGCAGCTGCTATTAAAGATGCTCAATCCAATACTTTCTCTGTT
TGTAACTAAAAAACATTTAGATCAATACTTTCTCTGTTTGTAAATAAAAAACATTTAGAG
ATCTTAATACGGATTACATACTAAATGTAGATTTACTCATTTTATTTTACATATATATTC
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GGTTGCATCGAAATATCTTTTCTTATGTTCTGTACTTTGATCTTCTTTCCAACTGTCCGG
CCTTTTCCCAAAATGTCCTCTCCGTTTCGTGAAAATTGAAGGTAAATGAGGCATTAGAAT
TGATATTAATGTGCAAAACATGATTGATAAAAATTAAATTATCACTAAAACTAGTGTAGT
AGAATGGACGTATCAATGGTCGCAGATTGAGCAGGGCGCACACTCAGACCGCACTGGCGC
GAGTGATGGCTATTTTTTTTAAATAATACATTTTTAATAAATTTGAAAAATATTACATAG
GTTTAAAAAGTTTAAAAGTAACACACCACCGGCTTCACCAAAGCCGTCTCGCTCCAGTCG
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AATATATGAAAATGACTACTCTATGTTAACTATTTTCGTAATTGTTACCCAATATATATC
ATGGAGATAATAATTTAATGAATCAATGAAATCT