Map Locations of contig_49000 (5995 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_49000

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64563 5 2916 bp AK356945 Available Available None
MLOC_64564 2 330 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_64563






CDS Structure of MLOC_64564






Contig Sequence (5995 bp)

>contig_49000 5995 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTTGCTGCTGCTTCATTCATGATTGCTGTTTAGCTAACCACTACACTGGTGCTCCCCCC
TGCTTGTTTATGTTTAACCACTACACTGGAGTATTGCCTTGGCAAATGATTAGAACTCTT
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CGTACAACCTCCTGTGAATGTTTGGACGTATTAATCTATAGTTTTACTCTAAGCATTTCT
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GTCGCTTGATTCATAGCGGCATTCTGTGCTTGAATGTAACGTGGTGGAATGCGTCTAGTC
ACTGTGCGAGGATGATGCAGTTCTACCAAACGATGAACTCGAGGCTTTGGTTACTCCCCT
AATGCATGGGCAATCAACGAAAGCGAGTTCCAAATCTCCTTGCTACCAAAGGCAAATCTT
TTGCCTCCGTTTCAAAAAAAAAAAAAAATCCCCTTGCTACCTTCATCCCCGCCTCCTTCC
ACACTCATCCGAGAGCTAGGGGTAGTATCAAATTCGGGTGGTCATTGGCCGTCATGTATG
GTTCTCCAATACACCACCCAATCTATGTATTCCTGTGATCACCACATGAAATAAAGGACG
CCTTTTATCTAAAAAGGAAAAAAGAGATCCCAACCAAAAACTTATAGCGTTCTCGGCTGA
CATTACACAGCTCAAAGCAGCTTTTTCGCCGAACTTTAGCCTAGCCTTCTCTGTCTAAGT
GAGATGGGAAGTGGAACTATATGAGCGCTAGTTGTTAATACAAGTCATAGCAAATAGCTT
ACGATTTGCCCCTTGCCTGCACATAACTTTGTTGATTGATGCACTTGCAGTAGGTTGATC
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GTAATCCAATTAATTTTCATTTCAGTGATAGAAAATGCCGGCACTAAGCAGCCTGATTAA
CCAACACTAGCAGAATTACTTTATGAAGTACAACTAGCTCAGTAGGCACTCAGAAACATA
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TCTTTTAGATCACTTGTATAATTAACATCAAGTTCAAAGCATAGACAAAGTGCGAGTTAA
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