Map Locations of contig_48867 (9634 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_48867

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64467 2 2482 bp MLOC_64467.1 Available Available LOC_Os11g01836.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13111.m00099 protein pentatricopeptide, putative, expressed
MLOC_64466 1 1750 bp MLOC_64466.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_64467






CDS Structure of MLOC_64466






Contig Sequence (9634 bp)

>contig_48867 9634 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCCCTCGTTTTGGTCGATATTAATTATATGACCACGTATATGCTCGGGGGGCCTCCAAA
AATTGTGCGCCCCGTGCGGCCGCCCCCGCGGAACCCCCCAAGGGCTGGCCCTGGCCACGC
GGGAAGGGGGTCCTTTCCGTTTTTATCGCCTGCATGTGGTCTTTTCTGGTAAATGCGTTC
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ACGGAGCCTAAGTGTTTAGGGGCTCTTCATATATCTGTAATCTGGGTGTGAAGAGCGAGG
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CCGTCGCCGCCAGCGCAGGACACCGGGCCTTGCTCGCGTGGTACCGGCGGCGGCGGTCCG
TTTTTCCCCTGCGCGGCGATGCGGCTCGAGTGGTGGCGGCTGGCGACAATGCACCCAGGC
CGGCAACGGATCCCGTGGCGGTGCAGCTTCGCGGGTGGCGTGGCTGCTTAGCTGCGGGGC
GGTGCGATGGCTGGCGGCGGCGCCCTTCCGGCCCAGATCTGGCCATCTGGGTCTGGGCGG
GCTTGACGTGGGCTTTCCGGCATCGTCTTCGGCGGAAGGAGGTGTGGCTGGTGCGTGGGG
TGGCGGAGACGATCGCACGCGTACGTCAGCGCGGTGACGGGAGCTTTCACTAGCCTGTTT
CAGGCTCGGTTGGTCAGAGGTGTCTTGTTTGCTCTCGAGCTGCGTCCTGTCGGTTACAGC
CAAGGGTGGTGGAGGTTGTCCTCTCCGGCATGGCTGTTGACTCTGCCGCTCCCGTTACCG
GCTGCTTCCTCTTGATCACGTCGGTCTCGCTTTGCTTGCCACGGTGAGACGGCGATGGTG
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GTCCGAGTCGTCGTTGGTTAGCGGTTGGGAGAAATCCTTGTCGGCTTGTCTGGCATCGAC
ACGATGACGTTCGTGGGTGTTGTCGTGCCTTCTTGAAGGGCGTCGATTATGCCCCTTCCC
CCACGCTCTTTCACGTATCGGGGAAAACCGTAGGACTTGTCCGGGGTAGCAGCGTCGTAG
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AGGTGCGCGGCTATAGCAATTCCCCTCTAAACATCTCCCTAAACTAAGCTTGACATATGT
GTGAGTGCATAATCTCTCTCTATCTTTTCCTCCAGCATGCACAAAGACACCGACAGAGCT
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CCACGGGTAGCAACGGGCACGAAGTTGGAGGTCAGCGACGAGGCATCGATGGTGTTGCGT
GGTGGCGGCGGTTGTGGCGATGAGTTGGGTGGCGCGGTGGCGACAACCCTGAGGCAGAGG
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GAAAATATTGGATTTAGAGGAGTTCGTTGGAGCTTGTATTTTTTTTAGCCGACTTTCTCT
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TGGCTGACTGACTAAATATAGTCGGCTGGGGGCAAGTTTATTCTTTTTAAACCCAATATC
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AGATGCCCCGAGAGAGCAAACATAATCTGTGTCCCTGAAAACATTTTGAGTTAATAATGT
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ATTGCATGTACTAGTACAAAATAGAAACTTCCGTACAAAAGCAGTCCCACAAAGCCTTCA
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CCTCGTCCAGGGCGTCAGCTCCAGCGATCGCCTTCCACCCCTCACCGTCAAACTGCTCCA
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TTCCTCCTCCGGCCTCCACGTCCACGCCCTCCGCCTACACTCCCTCCTCCCCGTCCCCTC
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TCTAGGGACTGCGCTGATTGATATGTATGCCAAGTGTGGGCGCACAGGCGAGGCATGGGT
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GGGCCTGACTGGGCATGGTAGGATTGGATTTGCCCTTGTCGGCAAGATGGAGAAGTCAGG
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GATTGAGCACTATGGTTGTATGGTCGACCTGCTCAGTCGCGCTGGGTTGCTCCAGGAAGC
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TGGTGGCTGCAAGATTCACCGAGACGCTGAGCTTGCAGAACATGTCTTGAAGCAGCTCAT
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GAAAACCATGGGTTACAAACCAACTACCGATGTGGTGATGTTCGACGTTGAAGATGAGGA
GAAGGAGCACACTCTGGTTTATCACAGCGAGAAACTTGCCATTGCATTTTGCCTTCTCAG
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ACTTTACTGATTCTGCTGGGAGAAATCAGAAGGTGCTGTATTTTCGTTTTGAAACTTGAA
GCGCTGGTTTGTTTGTTCTTGTGTGTAGCTTCAGTTTATTACAGAAATAAAAAATGTGTC
AATGTTTCTGAATATTTGCGCCTCTCTTTAGGTGTTAGGTTGATGGTTAAGGCCATGTTT
GTTTGGGCTTTTGCTTCTGCTTTTGCAGCTTTTTCACTATGGCAAAAAAGCCACAAAAGC
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AGACCTTACCAGTTGTTCTTCTGCATCACAGTTCTTCCACAGATTGTTGCCATACACCAT
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GCCTGAACTGGCACAAATTAGTCATTATTGCAGTATTTCAACACAGTACTCACCACAGTT
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AAGAGCTCATTACTTGAGGTTCAGGTACACAAGGTAGCCTGAATTGGGGTGCTCTGCTGT
CCTGCATTGTGCGGTTTCCGTCTCCATTCCCATGTCTTATCAAGGTTATCTGGCGTCTCA
TGTCTCACATTGTGCTTCCTTTTCCAATCCCATGGCTTCTCAGGGTTATCAGATGCCCAA
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TCTAGTTGGTAGATATGCCCCCTTAGGTATTAACCAAATAACCTATACAGTAGTTTGTAA
GCATGTCAAGTTCATTTTAGATATGAAAGGTGTTTCATATCACAAGTGGCACTATACCAA
AAAGAGTTTTAAATGCACTATTATTTCTTACTTCTGCAAATTCTTTGCGTTTGTCGTAAA
TCTTGTAATGCCATGCATGACCCTCCTTCAGCATTTGTTCCTGAGAGATGAATATATGAT
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ACTGCATTCCCATTTCCGGTGCATCAATGCCCCTGTTTACTAAATGAAACTCATGCATTT
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TGCCTTGCAAGGATCTCATCTTTTGGAGTATATATTATCCTGCTCATAGATATCTTTAGT
ATATGGATGCTTATATAACTCACGATAGAACTAGCACAAATTTCAAAGTTTATGATTTAA
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TTCTACAGACAGCACTGGTACTATCACTTCATTTGGCCTTTTAGGTGAGTCCCTTTCCTC
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CTGCACGCCGTCTGCTAGTGATACCGGATGGTGCTCTGTGGTGACTACAGGGGGAGTTGG
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TAACTATTGTTGTTTTTCTTTGCACAACATTATAGCAGGACGACAAGGCTGAGTCTTTTT
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TCTCTAATGACCAAATGTTCATGGCCTTTTCAATACCTTATGTGGGAGTACTAATTAGAA
TATGAAAAAAGATACAAACAAGCCTTTGAAAAAAAGTTGAAATTAGTAGCTCTCTCTATG
TACTGAAAAAATGTTACCTCCAAATTAGCTCCCTGGATCCTGCCCAGAGCTGTAGCAACT
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ATATTCCTATACCTGTTCTTGTTCAAAGTACGGGTTAAATTTGACTCCTTGATTTTGTTT
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CATACCATGAGAATTCTTATATTTTGCGAAGGACCATCATTTATATTAATCAGAGTTGGC
AATTATTTATCTTTACTCACCAGCATGTCTGATATTGAACTCTGAGAAATGAAGCCAACT
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GCTGTTTTTCTTATATGCTCATACCATTTAGCTTGTGCTTTCTTGGATGATGTAACATGC
TCTCCAAGCCCTTCAGGAACCTAACAGTATCAATGAAAAAAACACTTGCATCATAGGAAA
GCTAGAGACTGGGTTAATTTTGCCACAAATCATAATGTGATTTTTGTTCATGGATAACCA
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GCATTTTAACTTTGACATTGTCTATGAAAAAATCTGCAAATATATACAATATCAAATCTA
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GAATGTATCTAGTCACGTTTTAGTATTTACATACATCCATTTTTAGACAAACTTAAGACA
AGAATTTTGGGACGGAGGGAGTATTTCATAATAAATCTAAGGAATTTAATTTGGTGTTCT
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TGCTAGCATGATACTTTATGGGTCAGAGTCTAATTAATCGAAAAATCCCCACTAACACAA
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CCTTATGCAAGGCCATAAATTCAGATTACAGGTATCAAGGTAAAAATTAATGACTACTTT
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TCCTCTCCTCATTTAAGCAGCTGATAGTAGCTGTGATGCTTCGACTGATGTGTACAGTTA
ATGCAAACAAGCAAAAAGCAAGACACTAGCCATGGCCATCAACTTAAACATAGCAGCACC
AGATGAAAGAGAGGAAGAAGATGGCAGGATAACC