Map Locations of contig_48346 (8393 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_48346

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64084 2 1848 bp MLOC_64084.2 Available Available LOC_Os10g26130.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13110.m02218 protein phenylalanyl-tRNA synthetase, putative, expressed
MLOC_64085 3 1611 bp MLOC_64085.2 Available Available LOC_Os02g52470.2, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13102.m12456 protein ATP-binding domain-containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_64084






CDS Structure of MLOC_64085






Contig Sequence (8393 bp)

>contig_48346 8393 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCTCCCCCGCCTCCCCTCGCAGCTCCCCCCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGA
CGCCGCCGACGCCGACCTTTGCCGAGGATGGCGGCGAAGCAGCCGTTGGCGGACGTGGAG
GACGGGCTCCTCGCCCACCTCAACGCGAACGCCGAGATCCCCGACTCCCGCTCCTTCGCC
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AGGACATCACCAAGGAGACGTGGATGCTCACCGATGAGGCCAAGGGGTATGCCGCGAGGG
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ATGGGGAGGTTGGTGTTGCTTGTTGCTTGTTGTTCCTCCCATATTTTGCATTTCCACTTG
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TGGTAGATCTTCTCTACAAACTTGAACTTATTTTAGGATTTAGGATTGACAACACCATAT
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AGACATCTGTAGAGGTGTGTAAAAAAAACAAAAATGAGTACTCCAAAACGTCTTTTTGAG
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GGTGTATTTGAGCTCCGGAGCAGATAAATAGTAATGGTACTATTTAGCATATCCTAGTGC
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CTATGCCTAGTTTTGGCAAGCCTCGGTTCAGTCCGTCTAGCAGGACGCACGCTTTGCATA
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CTTGTCATTTTATAATCAATTGATCAACTTATTTTTAACTGTACTAGCGAAAGTCATTTA
TGTGGTTATCTTGAGCCAAAAGACTCTAGAGGGGGCAAGCTTTCACGCTAGATGTGCACA
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TTGTGGATATCCGGAAATTTTCGCCAGAGGTTATGATGTCCAGTATAGCTCTAGGCCTGC
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CAAATACAGTATTAGGCACTGATTGTTCGAAGCTTATATTTTAATTATATATTAACCGTC
CCTGGTATCTTGAGATAATGGAACGGGGATCTACTGTTCAACTACAGAGAGAAAAAACTG
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CATACGTGTCATACAGTCAAGGATCAAAATTATTATCAGCGCATGTTTTATGGACAAACC
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TCTTTTTCGTAGGTGTATTTGAAAGGCTTGCATCTTGGGATTGGTCCATCTTCACCAGTA
GTTATGAAAGTGCATCGACTTAACCTATAAGATGAAAGCGTAATGCCAGCACAAAAATTG
TAAAAGAGAGCAACGATAAAAAACAGAATACTTTATTTATTAACCAACATTTACCTTGCA
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GTTACAATCTTATCAACCTTCAAGAGAGCAGCACCTCGGTCTAGTGCCTAATAAGAATGG
AATTATTCATAAATCAATGAGCACGCAATTGCATTACAGATAAAGCTAGGTAGTAGGAGG
TACCTGGCGTCGAAAAACACCACAAAAAGTACAATTGTTTTTCAGGCCAATTGCTTTCAC
AATATCATCCATTGTCCAGTCATAGAGATCCTTATAGGAAACTATTTTCAGTGGTAGGCC
ATACTGCAGTAGGTGAATTGTACGGTTGAATTAGCAACACATGAATGTGCATTTAAATGG
GTTACGTTTCATGAACTAGACGCCTGCCAAAATTAGAACAAAAGAAAACACAAAGAAGTA
AAAAGTTGCAAGAGAATTATGTGTATCGGGTAAGGGGGAGAAACCTGTAGTTCATTCCTT
TTAACAGTTTCTAGGGAGTCATCTCTATAGCCTGTGATTCCTTCATCAATAGATAAGAGG
AACAAATCGAGACCATATTTATGACGTTTATTTAACTCTGATAACACATACGCAAGCACA
GTTGAATCTGCATAACAGTAAAAATATTGTCATAAACAGCTACAGGATCAAGATAGATAA
GCAAGCATTTACACAATAAGCTGAAGAGCATTTGCAGTCATATTTTTTCTAGGGGGGTAT
ATCATATTTATGAAACAGCCAATATATGAACCGTTATCATCACCCATGACTACCTATATT
TTTAACTTGAATAATTGATCATCTTGATTTAAAAATTTATCTCTGCTGCAACAGCGAGAA
GGTTGAACAAACATTTTGATAACACACTCTAATACAAGGCTCTCAAGGAGTAAATGGAAC
CTTGAATATTGGACATGCAAGTGATCAACAGGAGCCGGTACTAAAGTGTTTATCATTCAG
CGAGTAGAGAATATGAAACATATGCATTGCATAAAAACCATCTATTACGTTGTTATTTAT
ACAACACAGGGTCTGCACATACCTTTTCCACCAGAAGCTCCAATTGCCACACGCTCACCG
GCTTTAAACAAATTATTGTCAACAATAGTTTGATGAATCTCGTCCTCGAAGACAATATAG
AAGCATTCCCTACATATCTGAAAGCAAATATCAGACACCACTTCCTGAAACTACAGTAAT
CGGGTCATATGAAGCTACAGCTAAACCATAGGCGCCCGGTTGCTGGAATCATGGAACTAC
CCCTAAAGAAGGAAGCCGGCGAGGCTCACCTGTTCTAGGGTTTTGGGCCGCTTGAGCGCG
GCCTTCCGCTCGCCGCAGCGCTTGCAGAGGCGGCTCCCTGCCCTCGTCGGAGCGGCGGCC
GACTGCATGGGCGCCTGGATGCGTCTTATCCCCGCGCGAGTCCGGTGGATGGTAAGGACT
AGGGATACGACGAGGACACCTGCGGGGTAAAGCAGCCGTGCTTCGGCAGGAGGAGGAGCA
GAGTCTGCTTTCCGGGACGCCGGCGAAGGGGTTTCGGCGGCGTCACGGCGCTGGGGGCGG
ACGAACAGGAGGAGGAGGAGGAGGCAGTTTGGTGGGTCAAGGTTGGCCCAGATTAGGCGG
GCTAGTATTGGGCCGGGCTGGGAAGTGGCGCTGCTGGCTGCTACTTTTTGCTATAGCTGG
CCAAACGGGCCGGCCCGGCACCGCACGGCACGGCCCGTGCTAAACGTGCCTGG