Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
No map location | ![](/morexGenes/blast_net_images/contig_48346_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-OregonWolfe_maploc.png) |
No map location |
Predicted Genes from contig_48346
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_64084 |
2 |
1848 bp |
MLOC_64084.2 |
Available |
Available |
LOC_Os10g26130.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13110.m02218 protein phenylalanyl-tRNA synthetase, putative, expressed |
MLOC_64085 |
3 |
1611 bp |
MLOC_64085.2 |
Available |
Available |
LOC_Os02g52470.2, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13102.m12456 protein ATP-binding domain-containing protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_64084
CDS Structure of MLOC_64085
Contig Sequence (8393 bp)
>contig_48346 8393 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCTCCCCCGCCTCCCCTCGCAGCTCCCCCCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGA
CGCCGCCGACGCCGACCTTTGCCGAGGATGGCGGCGAAGCAGCCGTTGGCGGACGTGGAG
GACGGGCTCCTCGCCCACCTCAACGCGAACGCCGAGATCCCCGACTCCCGCTCCTTCGCC
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TGTATCTTGTGAATGGTTCACACGGCCCTCTACGGTCTACGCAAACACATATCCTACCCA
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CTTATTTATCTCTCATGTCATTTTGAAGCCCGTCCTGTCAATTTCCAACCACGGCCAACT
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AGACATCTGTAGAGGTGTGTAAAAAAAACAAAAATGAGTACTCCAAAACGTCTTTTTGAG
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AGAAAATTTATTGATGTTCATCCACAATTTTTTTTCATTTTGTTTACTACTCCCTCCCTT
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GGTGTATTTGAGCTCCGGAGCAGATAAATAGTAATGGTACTATTTAGCATATCCTAGTGC
AGTACAGAGTATAACTTGGCCTTCACCTCTTGTACATGCAAACACACACACAGACGACAA
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CTATGCCTAGTTTTGGCAAGCCTCGGTTCAGTCCGTCTAGCAGGACGCACGCTTTGCATA
ATTTCTACAGAAGCCAAGATTTTCATCTGATATTGAGTCCGTAAAAGGGTTGGATAAGTT
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CTTGTCATTTTATAATCAATTGATCAACTTATTTTTAACTGTACTAGCGAAAGTCATTTA
TGTGGTTATCTTGAGCCAAAAGACTCTAGAGGGGGCAAGCTTTCACGCTAGATGTGCACA
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TTGTGGATATCCGGAAATTTTCGCCAGAGGTTATGATGTCCAGTATAGCTCTAGGCCTGC
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AATCCTACTTTTGGACATCAAAAGTCTTTACCTCATCCTTTCCAGATCTTTAATAAATTC
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CTCCAAGTATGGAGGAAGAAAGCATAGCAGAACTATAATAATGTGTATGGCATTGACTAT
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CCTGGTATCTTGAGATAATGGAACGGGGATCTACTGTTCAACTACAGAGAGAAAAAACTG
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CATACGTGTCATACAGTCAAGGATCAAAATTATTATCAGCGCATGTTTTATGGACAAACC
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GTTATGAAAGTGCATCGACTTAACCTATAAGATGAAAGCGTAATGCCAGCACAAAAATTG
TAAAAGAGAGCAACGATAAAAAACAGAATACTTTATTTATTAACCAACATTTACCTTGCA
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GTTACAATCTTATCAACCTTCAAGAGAGCAGCACCTCGGTCTAGTGCCTAATAAGAATGG
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TACCTGGCGTCGAAAAACACCACAAAAAGTACAATTGTTTTTCAGGCCAATTGCTTTCAC
AATATCATCCATTGTCCAGTCATAGAGATCCTTATAGGAAACTATTTTCAGTGGTAGGCC
ATACTGCAGTAGGTGAATTGTACGGTTGAATTAGCAACACATGAATGTGCATTTAAATGG
GTTACGTTTCATGAACTAGACGCCTGCCAAAATTAGAACAAAAGAAAACACAAAGAAGTA
AAAAGTTGCAAGAGAATTATGTGTATCGGGTAAGGGGGAGAAACCTGTAGTTCATTCCTT
TTAACAGTTTCTAGGGAGTCATCTCTATAGCCTGTGATTCCTTCATCAATAGATAAGAGG
AACAAATCGAGACCATATTTATGACGTTTATTTAACTCTGATAACACATACGCAAGCACA
GTTGAATCTGCATAACAGTAAAAATATTGTCATAAACAGCTACAGGATCAAGATAGATAA
GCAAGCATTTACACAATAAGCTGAAGAGCATTTGCAGTCATATTTTTTCTAGGGGGGTAT
ATCATATTTATGAAACAGCCAATATATGAACCGTTATCATCACCCATGACTACCTATATT
TTTAACTTGAATAATTGATCATCTTGATTTAAAAATTTATCTCTGCTGCAACAGCGAGAA
GGTTGAACAAACATTTTGATAACACACTCTAATACAAGGCTCTCAAGGAGTAAATGGAAC
CTTGAATATTGGACATGCAAGTGATCAACAGGAGCCGGTACTAAAGTGTTTATCATTCAG
CGAGTAGAGAATATGAAACATATGCATTGCATAAAAACCATCTATTACGTTGTTATTTAT
ACAACACAGGGTCTGCACATACCTTTTCCACCAGAAGCTCCAATTGCCACACGCTCACCG
GCTTTAAACAAATTATTGTCAACAATAGTTTGATGAATCTCGTCCTCGAAGACAATATAG
AAGCATTCCCTACATATCTGAAAGCAAATATCAGACACCACTTCCTGAAACTACAGTAAT
CGGGTCATATGAAGCTACAGCTAAACCATAGGCGCCCGGTTGCTGGAATCATGGAACTAC
CCCTAAAGAAGGAAGCCGGCGAGGCTCACCTGTTCTAGGGTTTTGGGCCGCTTGAGCGCG
GCCTTCCGCTCGCCGCAGCGCTTGCAGAGGCGGCTCCCTGCCCTCGTCGGAGCGGCGGCC
GACTGCATGGGCGCCTGGATGCGTCTTATCCCCGCGCGAGTCCGGTGGATGGTAAGGACT
AGGGATACGACGAGGACACCTGCGGGGTAAAGCAGCCGTGCTTCGGCAGGAGGAGGAGCA
GAGTCTGCTTTCCGGGACGCCGGCGAAGGGGTTTCGGCGGCGTCACGGCGCTGGGGGCGG
ACGAACAGGAGGAGGAGGAGGAGGCAGTTTGGTGGGTCAAGGTTGGCCCAGATTAGGCGG
GCTAGTATTGGGCCGGGCTGGGAAGTGGCGCTGCTGGCTGCTACTTTTTGCTATAGCTGG
CCAAACGGGCCGGCCCGGCACCGCACGGCACGGCCCGTGCTAAACGTGCCTGG