Map Locations of contig_48118 (10565 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_48118

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63914 2 1184 bp MLOC_63914.1 Available Available LOC_Os12g07640.1, FRAME:+2, EVALUE:5e-94, 13112.m00801 protein MYB family transcription factor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_63914






Contig Sequence (10565 bp)

>contig_48118 10565 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCTTCGACATCTTTTATGATTGTGAAGTTGGACAAGGAAGACAATGTAATGGTTATGTTT
GGCTATATCTGCATAGAAGTTATATTGTTATGGATNNNNNNNNNNNNNNNGCTTGTTTAG
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TGTACCTAGAAGTGATTTTTGAAAAAAATAAAGAGCAAACTATGATGCATGTGCAGTTCA
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TAACTTACTTTTGAGAACACTTCTTTAAAATAAACGTAGTATTACAAGTTTATTATTTTT
TCTGATAACTTGGTCACATTTAATGACACAATGTCAAGTTTTTTCAATTTTTCAATTTTT
CTTGAAATTTTCATGCCCATATCGAAATGCGCTAGTTTTTGATTCTTGGAAATTTTTTTG
GTGTTTCTATGATTAAATAGATACTTTTGTATCTAGAAAAGATTTTTTTTTAAATGAAAA
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TTTTCTTTTTCACGAGAGGTGTCTCACAACTTTTTACACCCAACCATTTAGTCGAGTGTA
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AGGCGAAGTTTTAAAAGTTAATTTTTGATGAAGTAATGGTCCTAAGGATCTACAATAGCA
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TAAATGAAATTGAAGTATATAACCTAGTATATGAGTCGTTTGAGATATGAGAAATCTATT
CCTATTAATTAAGAAAATAGATATTCTTAATCAATCATGCTATTTTATATAAAAATCCCA
TGATGTCTCTCATATTAAACCCACGGTACATATCATATGTTTTTTACAATACTCGTGTCT
TCTAAACCATAACTTCAATTTTAACATGTTATATATGAAATTTGATTAGAAAAATATGTA
CAATCTGAATATGATGTTATTTTATCTGTTAACCATTAAAAAACTACTATCTAGGTGCAA
TTTTAGTCAGTACTGATCTGGATTGTGGATGAACATTTCAGCAAAAGCATGATTGGAGAC
GAAATTAAAGATCACTTGCATGTTTCTTTATACGTCTTAAATCTACATGCGAGCCGTGTT
TAAATAAGAGACCCGTGAAATCTTAAATTGTGTTTTATAGGTTAAGATCATCTTTGTTGA
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ATTTTTTCCAGTTGCAAACCCTTTTGCTGGTACAAACTAAAACAAAATAAATGCTGCGAT
GAGATAGGACTAAGGTAAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGGCTCCGGACAGGAGGAGAAGCAT
GCCATTGCCTACCTACCAACCTACCAAATCCGTCCCTGGGGCTCCGCAACCACTGACTCA
CGCCAACTCGGTCAAATGTCTCGGAGTGATCCGGGTCAATGGGAATGGGACCCTTTCCGC
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TGGAGAAGGGTGCTGGAGATCGCTCCCCAAAGCAGCAGGTACAGTATATATCTCTATTTT
ATTTTTATTTTTGCGGGTGAGTATATATCTCTATTTGGTATGCCTTGCCGACTCAACCTT
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CCTCGGCGGTGCCATAATCGACCTGAACCTGTCCATAAGCCCGCCCTGCCAGCCGCCTTC
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GCTATGCTTGTGCTTGAACCGGCTGGGGTTGCACGGCAGCGAGGGGTGCAGCTGTGTGGG
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TCTTTTGCTTCGTGACACCTTTTTGTCCATTACCACTTCATTTCATTTACGGACGCTTCT
CCAGCCTTGTGTCACGTATGTCTCGTCTCTACTTCTGATTTTCTAAAACGAAAGTTCTAA
GCCCGATATTCAGATGTACTTTCGTCTTGCCTTTTACTATTGGCAATTGCTATTTTTCAG
ACGTACTGAATTTCTGTAACAGGTAGGCACGAATTGGATGTCGTCGAATCCGAATCTTGT
GGCCGCGATGTTGTTGGTTGTTGTGCGTGTCTTTCGGTTTGCATGGGATCTAGCACGTTT
CTAACACTGAGTATTCAGTTCAGATCGCAACACAACAATAAAGGCTAAACCACTAGCTTA
GGCTACTTCTTGAATTCACACACACAATGCAGCAACAGGTTTTGAGCAATGGCCATGGCG
GCAGGATCTCCGCGCCATAAGTGGCAGCAAGAACCATGGTTCCAAGAGCAGCAGCAACAC
CCATCAAGGAAGCCTCTTCTTCTTCAGCTCCGGCACCCGCCCCCCTCCTCGAGCCAGGAG
GCCTGTGACTGTGAGGGTGAGCAGCAAGGAGGAGAGGGTGATGAGGATTTCGAGGAGGAG
ACATGCAAGCTACGTGGGGAGGTGGAGGTCTTGAAGGAGGTGGAGAGGTTGCAGCTGCTT
AACACCGAGCTGGAATGCGACAAGAACGTCCTGACGCACCAGCTCACCCTTGCGCGCTGC
ACCATGACCCGACTTGAGGAGCAGAATGACATCCATGTAAGTTGGGCTCCATGTCAGCAC
ATACCTCTTTGATCGCTCTGCAGTTGCTTCTTCTTCCATTTCCTGAAAACCAAACTGAAT
TTATTTTGTATGTACATCTCTCCCTTTACCTTCAACCTTCTTTGATCTACATGAAATGTT
CATCCTCATTCACAAATACACACTAGAGCGAATGGCTAATAGACAACAAATGATTTTTAG
TGCCATGAGCAAACCACAACCCCCGAAGGCCCCCTCACCCATCGCAGACCTGATAACTTA
TGCAC