Map Locations of contig_48056 (11722 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_48056

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63871 8 2313 bp AK353851 Available Available None





CDS Structure of MLOC_63871






Contig Sequence (11722 bp)

>contig_48056 11722 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGCGAGACATACCTTCACATATGTTGTCAGAGGCGAAGAAGGCCTCA
TGCTGTGACCACCACCCGTCATCGTCTAGCCGCCCGAACAACCAAGGAACGACCACCAAC
ACATGCAAGCATCACTTGCCGCCAAGATGCCGGCGTGCCACCAAGCCCCCATGACAGTTG
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CATCGTTGCAAATGGACTCTGATTCCACCTATCCCCTCCTCGTCGGCCTCCTTCCGCCCC
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GAGTACCCCTGGCGCTCGCTTCAAATTCCATCAGGAGAAATATTGATCACAAAATTTTGA
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GTCTCCCCCCATTTGAAGACCGTAATTCTTTCTCCATTAACCTCCGGTTTTATTTTAGTT
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TGTGTACTTTATTTCGTCATTTACAATATTTCCATTTGATACTCTACTATGGACCCTCCC
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TATGACCAAGAATGCAAGTCCAAACATGATTATAACCTTTGTTGCAGGAAAATATATCTC
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ATATTATTGACAAGATTGCGGGTATCACTTATTGTCCTTAAAGACATGTAGGGATTGCTG
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TCGATATTGTCAGTTTCTTGGTATCTTTTGACAAACTCACATCAGACGATACATTGTAAT
ATTTTATTTATCATTGTGTGTGCCTTGTCACGGTGATAAAATGTATACAGAGTACAGACA
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TATTCTTGGAAGGATTTGCAGCAGGATGTTCCATGTCCATCCTGACCATCCAAAATCTTA
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GATAATGTTCCAAGAGAGAGACATGTTCTTGCACATCAGCTAAACTACTCATGTAAGTAT
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TTTTTGACTCTATTAAATAATGTCCTCCGATGCATCCGGTTTCCAAAAATCCACTCTCGG
ATCTTCCCGTGCTGCTTCAAGATAGACTCATGTACTTAATCAGCTGGGCCTTGGGTAACT
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GATCTCCTGAACTATGGTGTCAAAATTTGCTGAGCTTCCTTCCCTGATCGCATCGACAGC
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ACGCTGTACTCTTGGGCCTATAGGACACCCCTTGCAAACGTGAGTTTCTATATTACTCAG
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TCCATCTAGTATTTGATGTTTCGTGAAGTCACGTCTCGCATGCACTGGTTGCATCAAACC
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AAAAATCCATGGCCGAGGCGAACTACGCGACAACAGGCAATTTATTCCTCGCCTTGAGCC
GGCTCGCTCCGACACACCGGCCTTCTCCATCATGTCTCGCTCCGCAGCCGCCGCATCCGC
CTCTGCCGTGCGCCTGCGCCACCTCGTCCACACCGTAAGATGCGCGGCTCCGCCCCACCT
TCGCTCCGGCCACTCGCCGACTCGCCGTCCTGGCCGACTTGGCAGGCCCGCGCGACCAAG
CACCGGCTGCACTCCGCGCGTCCTTCGGCCGGCTGCCCGTGAAGCGCCCTCGTCGTGATC
CATGACCATCTGTCAGCAAAGCAGAGGAAGCAACTATATGCAGCCGTTGGCGCCGCTGGT
CTTCGTGGGTTTGTCCTCATGCACCACATAAGATTGGCAGGAGTCCACATACGCCACTTA
AGGCTTTTTATGTGAACGGCGTATGTGGGACTATTGGACGCCGCTGCCACTTACATCCCT
ATATATTACGGCGCCAGCGCGCCGGTCTAAAGATTCGGCTGGCCTGCGCGGGCCGCCTGA
TCTGCTAGACGGGCCACACCGTTAGATCTTTATACAACATTTTTTCTTCGATGCAACAAA
TTTTAATGCTATGCAACAATTTTCGTCAATGGTTGCAATAAAAAAAATAATTATAGCAAA
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CTGTAGCAAATATCTACGTAACGTGTATGCAATTTTTTTACTGAACGGCTGCAACAAAAA
ATGATGTCAGTTGTAGCAAAAAATAACACGGTTGTAGCAAAAGTCAAAACGTCGTTGTAG
CAAAAATCCAACAAACTCGAGTTGCANNNNAACGTATATGCAACTTTTTTACTGGACAAA
TGTAGTAAATAAAAAACACCTGTAGCAAATATGAACGCTGGTTGCAACAAATTTAAACAA
GAAAAAAAGCTGCATGGAAAAC