Map Locations of contig_47956 (9132 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_47956

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63773 1 2099 bp MLOC_63773.1 Available Available LOC_Os03g42220.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13103.m04543 protein T-complex protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_63773






Contig Sequence (9132 bp)

>contig_47956 9132 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GATGTTACTTATAAGTTATAATTTAGTGATGATGAGATCTCAAAGTATAACAATCAATTC
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TGCACTAACGTATGCCCATGATTAGGAAAATAAATCATAATGCAACGCTTGAGTTAGTCT
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GGGCAAATTATCAAATCCCAAAGTAACATGGGGCAAACAATCTAATCTTCCCACATCCCC
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GGAAACCTCGACTTCAGAACCACTCCCATCGTCCAAACCCATGACAGCGACCACTGACCC
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GGTGAATAATTTTAGAACACAAATTAATCATTTTTCGAAATACATGTTGGATATTTCAAA
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GCAAGCCCTAGCCTCCTCCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGTGTCTTCTTCTCCCCGCCTCCG
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CCTCCGCCCCGTCGCCCGTCCCCGAGGTGCTCCGCCCGACCGCCCCCAGTTTGTTCTCTT
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GGCAGATGGAGAGGGTGCTCAAGGATGACGCCATCCAGGAGAAGGGCGAGCGCGCCAGGA
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GTTGCATAATGTGCTTTTGCAACTGCGCGCAATGAGTTTACTGGTCTCCTTGGGACCGGA
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GGAGTTCTTATTCATTTGATTTTATCCTCCTTGCAGGCATCTTTTGTAGGTGCCATGGCG
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GAAAAAACCTGCAGACTGGGCAAAGATGGCGCCAGCCATTCGAATGCTAGAGGGTTTTCC
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GGGCGGAGTGTCACCGTTACAAATGATGGCGCCACCATTTTGAAGTCACTTCATATCGAC
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GAACCCACTTGATTAGTTGGTTGCATGCATGTGCTCTCCAATTAAAAGAAAATGTAGTCC
TTAATGATTGTTAGACATCTCAAAAGTCCAAGATGATGAAGTTGGTGATGGAACAACTTC
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AAAAATCATCTCCCTCAATCTTGGCAACTTCTGGATTTAAAAAGTAAGATGGTACCTTGA
AAAAAAAACCGAAAGCAGTGCACTTCTGCGTTGATGTCATTTTGGCAATGGACAACTACG
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CTTATTAATGCAGAAATGATACACATGATATTTGAAAGAAAAAAGGATGCACATGGATAC
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TTTGTTGCAAAGGACCATGGACAACAAAGACAACACAGGTCACCTATTTAGTTACCGTCT
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AACTATATTTAAACACTCTGTAATCTTTTTTAGTAATTACTTATGTTATGTGGAAGAAAA
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CATGGAATACTAGCTACCTGGTATCATTGGTTTCCTAGTTAGGACTTGGCACCGAGTCTC
AAAATAAAAACTTGGGACTTGGCAGTAATTTTCAGTCAGATGTATAAAGTTTATTGCACC
CAGGAATATATTTCTGACAAAAAACATTCATTGGTGCTGCAGACAAGTTCAGATCAGATC
TCATGAACATTGCCATGACTACGCTTAGTTCAAAAATTCTCTCCCAGGACAAAGAGTATT
TTGCTGAACTTGCAGTTGATGCTGTCCTCAGGCTTAAGGTATAATTAAATGATTATGGAA
GTTGGTCATACCATATCTTTTCTATATGCGGGATGTTGCTTGAAGTCTGGATTGGTAGTT
CATAGTTATTCATTCACGTTGTTACATTCTGTTGGTAAAACGCTGATTTGGTATGTGCCA
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CTGGAGGTTCTCTTAAGGATTCCTTTTTGGATGAAGGGTATGTTCTTTCACAAACTATAT
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ATTGGCCTTGGTCAACCAAAGCGAATTGAAAACGCTAATATTCTGGTTGCAAACACTGCT
ATGGACACAGATAAAGTTAAGATTTATGGGGCACGTGTCCGGGTGGATTCAATGGCCAAG
GTTGCAGATATTGAAGCTGCTGAGAAACAGAAAATGAGAGAGAAAGTTGAGAAAATCATT
GGCCACGGGATCAACTGCTTTGTCAACAGGCAGCTAATCTACAACTTTCCTGAAGAACTT
TTTGCTGATGCTGGCATACTCGCAGTTGAGCATGCTGACTTTGAGGGCATCGAGCGGCTA
GCTCTTGTCACTGGTGGTGATATTGCATCAACTTTTGACAACCCAGAGTCTGTGAAGCTT
GGGCACTGCAAGCTCATTGAAGAGATTATGATTGGGGAGGACAGGCTGATTCATTTCTCC
GGGGTTGCGATGGGGCAAGCATGCACCATTGTCCTGAGAGGAGCAAGGTATGCCTTATTT
ATTTGGTGTAGCTCCTTATCATGTACTCTATTATTCAGGCATTCTGTTTTATTTGGCCGC
ACACTGAATACATGTGTCTTGTTGTGTACAGTGAGCATGTGCTTGATGAGGCGGAGAGGT
CCTTGCATGATGCCCTATGTGTGCTTTCTCAGACGGTAACTGACACACGTGTCATATATG
GTGGTGGATGGCCTGAGATGGTGATGTCCAAGGAGGTGGATGAACTTGCAAGGAAGACCC
CTGGAAAGAAATCTCATGCGATTGACGCATTTTCACGCGCCCTGCAAGCCATCCCCACAA
TCATTGCTGATAATGCTGGTCTGGATAGTGCTGAGCTGATCTCCCAGCTCCGAGCCGAGC
ACCACAAAGAGAACAGCACTGCTGGAATTGATGTCATCAGCGGCGGGGTAAGCTCATGGA
GACCACACTGACATGCTATGTAGCTTGTACACAGTGATATCGTTTGAAACTAACATTGTC
TGGTGTCTTGCAGCTGGGAGACATGCAGAAGCGTGGGATATGCGAGGCGTTCAAGGTGAA
GCAGGCCATCGTCCTGTCGGCAACCGAGGCCGCGGAGATGATCCTGAGGGTCGACGAGAT
CATAACCTGCGCCCCGCGCAGGAGGGAGGACAGGATGTGAGCGCTGTTTCGATGCGGCGC
TCTCTTATGTATGATGGTTTGCCGAGTTTTGGCTGGGTTGCTGTGGTCCACGACTGCTTT
AAAGTTTGACCGACCCCCATTTCGATTGTCGTTGAATCCCGACCCCTATAAGCGATCTGG
AACTTGTAGCTGCTAGCGTTGTTCTGTAGGGAGTGGCTTGGTGTTGTTTCAGTTGATTTT
CCACTAGAGGATATAGTGATGTACTTTGTGTTTGCTGTTGGATATCTATCAGCCGTTGCT
ATTAGTGTTGTGGACATGGCACATCTATGGCTGGAATCGGTCCCGGTTTTGATTCTGATG
AGTTGTGCAACAAGATAGGACCTGTGCGCTTGGATCATTGATGATTTGTTTGACAGGTGT
TTACTTGTTGAGTTATTGTTAACTGATCAATTAATTTCGATTCTCCATACCTTTGTCAGA
TGAGAATCTAGTTCTACTGGGCCACATTCAATCATGAACTACTAGTAGGGGTGCTTGGCT
TACATAAAACTGTCACTGCGTAGGACAAACTCTGACGATCTATCTGCCTACGAGTTCTAA
GTACTAAAATATATTTCAAGTCTCATAGCAATGCTATGATGCTAGTATATGATAGTACAT
ACTGTTGTAGAGCGAACGTAAAAAGACAAATAAAGAGCCCAAATGATTTCACTTCTGCTC
CATTGCAATATGACAGACCCACTTATATACAAGGTGAATGGATGTTTTAGGGAGACATTT
TTTCCCCAATAGACACCTTCTGGAAAGCATTCCTCCTATACAATTGATCACATGCTTTAT
TTCATAAGACTCGCCGTTGATCAATTCGTCGTCTGTATATTGCTAATTGAAAACTCCTCC
AAAAACCCTATGGGAAAAATTAAGAAGAAACCTTGTAATAATATGTCATCAAAAACTCCT
TTAAAACCGAGTGGGAAAAATATAAGGATAAACTAGTATGACATATATCCGCACTTGTAT
TTATATTGTCTCGTTAAAAACCTTATATGAGAAACCATCACGGAAAACTCATAAAGGGAA
AAAGAGTACAATATTAATGGTGTGAAGATCACCAACATGTTATAATTTGGGATTCTATTC
CTCCTGAACTTTCCAAACATCAATGGTCTCATACCAATTCCACGAACGAGATTCTGGAAT
ATAAACGTTGGTAGAGACATTGTGAATCTCACAATAATTTGTTTGCATATTACTCTCTTA
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TGCGAAGACATGTATATCCTGTCAGGCTTCAATATAGTTATGGCGGAATAATCCTAGGAA
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