Map Locations of contig_47818 (11893 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_47818

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63659 1 719 bp AK358692 Available Available None
MLOC_63658 1 390 bp AK251391.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_63659






CDS Structure of MLOC_63658






Contig Sequence (11893 bp)

>contig_47818 11893 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGAGATATATGCTCTAACAGCGACGCCGTTGTAGGCGACATCCGCGAGCCCGAGCGCTG
CTGGTGCGCGGTCGGAGCGGCTGCTCGATGATAGGTTCGTGAGCGGAACGCCGAGCGCCA
AGAGGCGACGACGAATAAATACAGCGGAGGGCATCACTGCGCCATGCGCCGGTAGATCAA
GGCTTAGCTGCACCGCGCAATCGGCAGCCACCGCTGCTGTGCATGTCTCCGTGCGATGGA
GGTCGCAGGTAGAGCCAAGCCGCCATGGCGGCCACATGCGCGCTCCCCGTGAAGCAAAAA
AGATGGTGCAAGGCAGCAAACAGTACCTACGGGTGTTGACAGAGACAAACAGAGGCACCA
TCATGGCGGCTCCCTTATCGCCACACCGCGGTAGAATGTAGATGGTGCTATCCATCACTA
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CACATTGAAATAAGCGGCCCGCGCCACCACCACCGCGCCCTCGACCACCTTATTCGCGGC
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ACCCGCACCGCGCTGTGTGTGTTATGATAGGTGAGGAGTGGGGGAGAAGTGAGGGAGATA
GGGAGAGGGGGGATGGGCGGTGCAACACGTTCACTAATGTATTCATCATAGTAAACGACT
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ATTTAGTACATGTCTCCGTACTCTTTAGTATGATAGCTTGGGGGTAACTAGAATTTTTTA
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TAACTAACGTCGCCTCTATCATAACTTGATATTGGCAATATAACTGGGTCTGTCGCTCTT
GTAGTGATGCTTTACTGGTACTGCTGTTTCCTTAGTTGTTTTTAAGTACACAGTTTTGAG
ATACAATGTTTTGCCTAACTTATCTGATTAGGCATATTTGAAGCGTCCCTACTTGTAATT
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GTGCAATTGTTTTGTTATCATTTTGGAATATGCATGTTCTTTTATTTGAACAAATGTTAT
GATCACTTGTTTATAGGACGATAGTCTAGGCAGCCTTAAAATTTACATTATTATGAATCT
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CTCTCCGTCTGGACACTGGTAACTTCTCATGGGGTAGTGAGGCCACAACCCGCAAGACCC
GTCTCCTGGATGTGGTTTACAATTCGTCAAACAATGAGCTTGTGAGGACTCAGACCCTTG
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ATGGAGTGGAAATCGGTAGGAAGAAGAAAGCTGCTGCCGCTGCCAAAAAGGATGCTGCTG
AGGTAATATTCTTGTTATTTGTATTGCAGTTCTTCAACATGATCTTAGTATTTACTGGTT
AGCTTGTTGAGGGTGGGTTACTTAGTTGTAATGATATTCAGTTTTGTAGTTGTGTAACAC
AAGTGCATGTTCTTTTTTATTCTGATTGCACTTTTCAATCTCAACTGTTATGTCCAACTT
GTTCATGAATAAATTAACTCAATTGCTCTTTGTAGATACAGCATAATCTTTGTTGTTTTG
AACAACTCTCAACTGAATTTGTTCATTTTGCCAATAATGTTTCCATGCCCTAGTTTAAAT
AATGTCCTTTTCCCCTTTGAATCTACCAATCTCTGCTCCAGCCTATAAATAGTTGCTCAC
TGTTTATGTTTTCTTGATCATATTTTCTCTTGTGCAGGGGCAAGAGGCTGAGGTTGCTGC
TGCTGCCACAGAGGAAGCAAAGAAGAGCAACAAAGTCCAGAGGAAGCTTGAGAAGCGTCA
GCAGGGGCGCACTCTGGACTCACACATTGAGGAGCAGTTCAGCGGTGGAAGGTTGCTGGC
TTGCATTTCGTCTCGCCCTGGGCAGTGTGGGAGAGCTGATGGGTAAGCTACACATCAGAT
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AGGGCAAGGAGCTGGAGTTCTACATGAGGAAGCTCCAGAAGAAGAAGGGCAAGGGTGCCA
CAGCATAGGCGCTGAAGAGCTGCATGTTACTCGTTGGGTTTTCTTAGTTGTTGCGTCAAT
GTCTGTTTACAGACATACTGAACACCATTTTCTGTAAACGGTTCCGGTCTAGGTTGAACT
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GAGAAACGTGCTTCGTGCTTGTTTGGCCAGCAGCTCAGGCGGCCTAATCCTTCGAATCTC
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CTACTAAAGGTATATATACTCCTTCCTATATATGGATGTATATAAACATATCTTAGAGTA
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AATACATATTTTAGAGTATAGGTTTATTCATTTTATTTTGAATGTAATTCATAGTAGAAT
TGTTAAAATGTCTTATATTTAAGGGTATATATATATATTCCAAAAATAAAATGGGCTTTG
TGGGTTGAGCGGCAAAGAACAGTTGCTCGGATGAGGAAATTTACATGGAGCAGCCAGAAG
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TCCCCCTTGCGTGGCTCTTCCTCTAACCGGTTGTTGTGTAACAAGTGAGTAGGGCCCAGT
AGAACGCCCATGAATTTTCTCATCAACTTCATGAATTAATTTTATTAACGTGTGACGTTT
TTGGTCCACGTTTATACACTCTCCCAGGGTGCTCCCTTGGTTTCCTGCTTCATCTGCCGT
CTGATTGTTGGTCAAAATCGTCTTCTGCATGAGCTGAAAGTTGCGTTGTTCGTTTTCACT
GCGTGGTAACCTCGCGTTGGCCAATGAAGTGTGGGCTTTTGCGATGTGCTGGTTTGTTAG
GGTGGTCATTGTATTTGAATCAAAAGCATACTACGGTCATTGTGTTTTGAAATACTACGG
TCATGTATACGTATTGAGTTGATTATACAATCATTGTCTCATCGTATAGCTTTGTATTCA
GTTGAGTTGACCGGTCAACTCTCTCTACCATGCCGGGAGGGAGAGCACGGTGGCACGCCA
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CGTCGACACCTTCGCCGCGAGCATCTCCCGCATCACGGCCTTTAGTCGCGCCTCCATGGC
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GCCTTGGCTCGCTCCGCCTCTCGCCGCGCCTCGTCCAACCGCTCACGCGTCGTCTTCTTA
TTCTCCTCGCCGCTGTCCCTCGCTCTTGCGTGCGCCGCGGCGAGCTCGGTGGTCTCGCCG
GCTGGGCTCTTCCTCGAGCGACAGGATGGACGGCGACGATGACCTTCTCTCCTTCCGTCC
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CTTCTTCACCTTGGCCAACGTCGTCGGCGTGCTTCTTGCCACTGGGATGTGTTTATCCTC
CTCCTTGGTGGCCCATTCGATAGCGCGCGCGAACAACTCGACTCCGAGGTTCGCGAGATG
CTCGAAAGCCGCGACCACCTTGGACTCGAGGTCGCCGGCCGCGACGAGCTCATCCCTCAA
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CTCCTGTGTCGTGTCATGGGCGGTGCGGGCTGATTCCAGATCGGCCATTAGAACGTCGAG
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CGCGACGCTGGCCTCCTCCGCAATGGCATCCCGCTCGTTCTTGAGCGTGCCTAGCTCGGC
CCTTGTGGTGCGCAGGTAGACGAGCGCGGCGACGTGGCGGTCTCGGAGGGATTCGAGCTC
GGCCTTGGCCGTGTCAATGTATGTTTGCAGACATACTGAACACCATTTTCTGTAAACGGT
TCTCAAGCTCACTTACAGGTGGGACCCGCATAACATATTCACCCATTGAACGATTAATGT
TGCTTAGGTTGACCAGTCAACTCGACGGCGAGCTAGTGACCGTATAGTCACCTCAACACG
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AATGTTCTCATCAAACTCCTCTTGTGACCATCAACTACGATGCTCAATGCACAATAGATA
GCTTTGTTAGATTGATCTCCACCCGGTTGAGCCCAACGGCCCAACGGCCCCCTTGGCGTG
TGCCCTAATCGGTGGCGCCCAACCCTCTTCTCGTTGGTGGCCCCATGCCGCGAGCGCTAT
AAAGAAAGGTGGGGGTCGGACGCATAGATCACGAGGTTAATTGTGCGCCACACACCCCAC
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GGTATCATCCAGATTGGGTTTAGTATTTTCGATTCCAATCAAAGAATTTTCCCTTTCTCG
AAGAACCCTAAAGTGATAGGGCAAAGAAATTTAGGGGAGAGGGCCTTGAGCTCGCCGGAA
AAGTTGTGCTGCCGCAAGGCCGCACCGTTCCTCTCGATCCGGATGGGCATCGACAAACCG
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GCGGTGCGCTCACCGCAAGGGAACGCGCGGCCGGCGAAAGGGGAGGCAACGACGCCACCA
TCACGGGCTCAGATGGTAGCTGGGGCTCGCGCCTCGTCCTCTATGCCACAGAAGGTGGAG
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TCGACGCCGTCGCCGACGACCGGGATGAGCCTCTCTCCCTGCCGTCTGCGGGATAGAGAT
GAACACGGCTGGAGGGAAGGAAGGAGAGGTGCGCGAGGCGCGGTGGTCTTCGACCCCGTC
GCCGGCGGTTGGACTGAGTGTCGCCGGCGCATGGGGGAAATGGCTTAGGATTTCCCCTCG
GCCTCGTCGCGGGGCAGTTTTGACCGAGTGTCACGCATGCGACCGTTGGATGGCGCCGAC
GCGCATCGGACGACCAGGAGGCTTAGCGGGAACAGGCCACGGGCCGGGCCGCGCGGAATG
GGCTCTTGGACCGAAAAAAGAGGAGGCCACACTCGCACGCCCAACCACGCGTGCTAGGCC
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TTACACGGATTTCATTCGACGCGGACTACGCAAAGAAGCGAAAGAAGCATTGAAGTCACA
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CTTCAAGGTAGACTTCTAAACGTTCACAAACTCGGTCATCCGACAATCCACAATTTCCTC
GTGGATGCATTAGACCATGACGCCTAACCGTTTGGAAGATGCACAATCTTCAAAGGTAAC
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GTTTTTTCACAAATGATTTTCTCTCAAAGTCCTCAGAGCATGGGTTGCTCTCAAATGATA
CTTGTCAATTTCTCTATCGGAGCATTCAACCAACTAGTGGTTGTGGGGGCGGCTATATAT
AGCCAGGGTGCAACCCCACATGATATGACATAAATGGCTCTAATGATATGACCGTTGTAA
GGGTAAGTGATATGTCTCCAACGTATCTATAATTTTTGATTGTTCGATGCTATAATATTA
TCATTCTGGGATACATTTTGGGTATTCATTTATTTAATAAAATTATTTTTGAGCACTAAG
ATATTAACCCAGTGTCGAGTGCGAGTTGTTGTTTTCTGCATATTTTTTTGATTTTGAGGT
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AAGAAGACCTGGGAGCTTTAGGAGGAGACCGAAGGCTACACGAGGGAGCCACCACATATC
AGGGTGCGCCAAGGGGGTGGACGCGCCTTGCTGTGTGGTGCCCCCTTGTGTGGCCTCTTG
ACGTCGCTCTACGTCCTATAATTCTAATAAATCCTGAAAACTCTAAGGAGCCTCCCGAAA
CACTTTTTTGCCGCCGCAAGCGTGTGTTCTACCGTGCGCCCATCTGGAGCCCTTCTCTAG
TGTCGTGTCAAAGGTGGGATCGATCACGGAGGGCCTCTACATCATTGTCGCTGCTCCCAT
GGTGATGTGTGAGTAGTTCACCACCGACCTACGGGGCCGTAGTTAGTACCTAGATGGCTA
TATCTCCCTCTCTTCATCTTTAATATAATGATCACCACATCTTTGCTTTGATCTATCTGA
TGCAATTCTTTTGTGCGGTGCATTTGTTGGGATCCAATGGATTGTGGGTTCATGTTCATA
TTATTCATGATAAAATATTTGAGTCTTCTTTGAAGTCTATATTTGATTCTTCTTTGCATG
ATTATTATAGCTTCGTAAATATCTCCGATCTATTGATTTGGTTTTGCCAACTAGATTAAT
CATTCTTCAATTGTGTGCGTTGTAGTGGGTTCAACCTAGCGGTGCTCTATATTTCAGTGA
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AATTTATATTGGTTGAGTTCTCTTTGTCTATATCATGTCATTGTTNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNACTTAATACTCTAGATGCATCCTCGATAGCAGTTGATGGGTGGAGTAAAAGTAA
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TACCCATCATATACTTACTTTATGAGAGATGCCACTAGGNNNAACTATGGCCCCCGAGTC
TATTCACTAATATTTTACAAACTCTAAAATTAACTCGCTGTCTTTATTTACTTTTTATTT
ATTTTACAGTTATCAACTATCATCTACACACTTTACTTGCTCGCAAATAAAGAGTCCAAG
GGATTGACAACCCTCTTGCCNNNGTTGGGTGCAAGTGTTTGTTTTTTTGTGTGTAGGAGC
TGAAGACGGGGGTTGCGTGCTACTTCTGCCGGTTCAATAATCTTGGTTCTTAGTGAGAGA
AATATTTATCTATATGGTGCAGCATCACACATTCCTCTTAACGGAAAACCCAACGCAAAT
CACAAGTATCATGAAGGATTTCTGGCGCCGCTGGTGGGGAGTATCATCAACCTACTATAA
AGTACCTTCACACAACTTATCATTCACTTGTTCTTATTTTTATTTGCTGTTATATTTTGT
TTGCTTCATAAAAATCAAAAATACAAAAATATTTACCTTTGCTAGTTGCTAGTTTAATTC
TTTGTTTGCTAGTTTACTTGTCTTGCTTGTTACTTTGCTTGCTCGGTCACAATGTCTCAA
GATAATACTAAATTGTGTGTCTTTTAAAATACTAATAACAATGATTTTATTAGTACACTA
TACCACCCGCCACTAGCGCTGAGTCTTATGATATAAATGCTGCATTGCTGAATCTTGTGA
TGATAGAACAATTTTTGGGAAGTCCTAATGNNNNNNNNNNNNCTCATCTTAATACCTTTG
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