Map Locations of contig_47747 (6610 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_47747

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63594 1 1654 bp MLOC_63594.1 Available Available None
MLOC_63593 1 969 bp MLOC_63593.1 Available Available LOC_Os11g38959.1, FRAME:+3, EVALUE:8e-122, 13111.m03833 protein 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_63594






CDS Structure of MLOC_63593






Contig Sequence (6610 bp)

>contig_47747 6610 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGTCTTTACTTCCCGCTGCTATACTTGTAGGCTTGCATGTGTAGGGTGTGTTTGACTTG
CTATAGCTGCTAAAATCTGCCAACAATCAAAATTGGGAAAAGGCTATGTTTTAGTTTGTC
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GTTTCCTTCAGCATAAACTACAAACCATAAAAAAATGTCAGTTAAATTTTAAACTGAAGA
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TACTATCCTTGCTCAAGGTAGTTAGCAAGTACTCCCTCCGTTCCTAANNNNNNNNNNNNN
NNNATATTGCACTATGAACTACATACAGATGTACATAGACATATTTTAAAATGTAGATTC
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ATACATGTGAGAGGTCTCAGCATAAAAAAATTGCATCATACATGTGAGAGGTCTCAGCAT
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CGGAGGATTACTGCTGCTGTTATGTTGCCAGGCAAGTGTAAACTTGGCATCGGTCCTTTG
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AGACTTTCAGTGGAATAGGCAGCAGACTCGGCTAGCTAGTGATCTGTACCACCACATGCT
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AAGAAGCAGCCTCGCTAGCTAGGGATCCAAAGAAAGAAGAAGCAAAATATGCCTGTAAAT
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GAGCGGCGGC