Map Locations of contig_47733 (12388 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_47733

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63588 9 3220 bp MLOC_63588.1 Available Available LOC_Os12g16650.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13112.m01765 protein Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_63588






Contig Sequence (12388 bp)

>contig_47733 12388 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACACAAACCGGGACTAAAGGTGATGCACATGCGGGCTGCCCACCGCGNNNNNNNNNNNNN
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ACAGTGGCTTCCTACTCCTAGTGAAAAGATTGAGACTCAGCCGATTCCTGGTTACGCTGA
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TCCTTTCTTTTGCAGCCAAGTTTTGGCCCTGGGCTTTGATGAAAGGTTCCTCCGTATATG
GGAGTACTACCTCATATTCTCTGCGGCTGGTTTCAAGTCACGAGCAATTGGAGATTACCA
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TTTTTGTGGAAAGGAGGTATGCTCCAGGTACTAATTGTGGTGCCTGAATGGCTGACATGC
ATATCCTCCATGCAGGTTGTTTTCTCTCGTCCAGGCAATCGTCGTCTAGGCCAGCCTTGA
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ACGAGATTTTAATAAGTCAGTCCTGGAATGATTCGCTCATGCCGGAATCCTACTCAGGTG
GTTTGGTGATCTATCTTGTTGTTTAACCATGCAATGGTTAGTTTTTCGTGGGAGTGTCTT
GTTATCCATCAATTAACTAGAATTTTGAGAATTGTATGTAAGGAACTGGTTTGTTTGCTT
TAATATCTATGAGGAAGAGTTGATGTCCTTGCTTGTAGTTTCTCATGATCTGATCTATTC
GGTGTTTGCCGTTTTCAATGCTTGCTTGCGAAGAGAATCAATATATGTTCCTGAGTATCA
TGTTTCACCAATGACTGAGGAGGACTTTTGCTAACAGAAAAGATGAGATCTCTTTGGCTA
GTTTTTGTTAAAGGGGATGGCAGCAGTAAATACCTTCGTCCTTCCTCCATGTTGGAATCA
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TGTAAAGTGGTCTGTATATCGTGTGATCGTAATTGCCGGTTGGTAAAGCTAGCACAGTGA
CATTTCTTCAATTAATGACAGTTTTGTTTATCTTTATCCACCCATCTACTCCCTCCGTTC
CTAAATNNNNNTCTTTTAAGCGATTTCACTAAAGGACTACATACATAGCAAAATGAGTAA
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