Map Locations of contig_47641 (9034 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_47641

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63493 1 809 bp None Available Available None
MLOC_63494 1 235 bp MLOC_63494.1 Available Available None
MLOC_63492 2 1590 bp MLOC_63492.1 Available Available LOC_Os01g45390.2, FRAME:+1, EVALUE:2e-111, 13101.m04654 protein HD domain containing protein 2, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_63493






CDS Structure of MLOC_63494






CDS Structure of MLOC_63492






Contig Sequence (9034 bp)

>contig_47641 9034 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGTATCTCGGCCAAATTTTATGTGTTCATAACAAGTGCGGGGAGCAAATGTTGTATCAGG
TTTTCTCGACCTAATTCGAAGTTTTCTTAACAAATGTGGAGTGCAAATGTCTTTGTTTCT
TTTCAAACATGACTACACATATCTCATGGTATAGTTTTGATGAATAGTGCATTGTTGGTT
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GCAAATAATCAATTGCTTTCTCGGCGTAGAATTGTAGGGATGTTTTTAAGTGTTGTTGTC
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CGGCCTCCTGCGCCGCTCGCCGCCGCGTATCCTCCCTCCGAGGCGCCTCGCTTGTGGTGC
CCGCGCTGTCTCCGGGAGCCCTGGGCAAGGCGGATCGCCCGTGCCCAGGCGGCCGCCGCA
GCCTCTGGACGCCGCGGCAGTCGCGCCGCCCTCGCCGGTATCATCCGCGGCGTCGTCCGC
CGCCTCGGCCATCGATTTCCTCACTCTCTGCCATAGCCTCAAGGTAAATCACGTGATGCT
TGCTACTTCCTTTGCTGGTTTATACGTTGTGTACCATCAGACTGGTGATACTCCTAGGTC
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GGGCACAAAACTATACAATACTCGATCCGAGCAGGATTTCATATATGCAAGTTTTGAAAC
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TGCCGCGAACACAAAATTCAGCCCAACGGGCCGACCCAAACGGACGCGCGTCCATTTTTT
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GAAGAAGGTTCTGATGCCTGAGGAGCACGCCGTTCAATCGTTGAGGAGGAAGAACCGCCG
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GCCGATTCTAGGACATACAAAATAAGGAGCTCGCATTGGAGGGGCAGACCCTGCTGATTC
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GCTGTAAATCGAGAAAGGTTAAGTTTTCTAATCCCCCCTTTGTAATATTGATATTAAAGT
GACACTTTTAGGTCCCATTTTCCATTAATCATTACTACTCTACTTGCTGCTGAAGAAACA
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TCCAATAAACATATTTATATTTACTTGTTGATTCTGTGTGCTGTTCTTCAGCTGCTCTTT
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TCTCCATTTGTGACAAGAATTTTCAGTTCTTAAATGAATGTTCGATAACATTGTGTTAAC
TTAATTGAATTTACTGTTTTCTAGCTGAGGAAATTAAGGGGCTGTGGGAAGAATACGAAA
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TTTCTTAACTTCATACTTTGTTAATAAATATTGGTTCGGCTTTCCTTACACGTGTCGTCT
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TGGACATAGCACACAGTTCTATACTTTCAAGTTTTATAGAGGATGTACTCTTGGTAAACC
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AATTGTGTTCTTCACAGATGTCCTATTTACTGCATCACAGCTCAAATAATTCAGTACTCC
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CCAGACATGTGAATTTCTGGCACTTTAAAGCATTTAAGTTTGTTAATGGATATTAATAAT
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AACCTGCCCTTACAAATAATATGCGTCTAAATCATCATGTTTTTGTTGCATCTTTGTGAT
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ACATAGTTGGAATCTGCTGCTACCTTGTTGGCAATAACAGGAAACTACTTGATTCATACG
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AATTTACAGCAAATAAGAGAAATTCCCACTCAAGAATGAATGATTTCGCATAAAAGCTCA
CTTTGTTAGCAAGCTTTCTAGAAAAACGTGATCAAGTTTCACATGTGCTATATGGATGGT
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TTATTAATAGCCCTTCAAATTTGTTTTCAGGTCCAGAAAATGGTAAATGAGTTTGGCTTC
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TCAAGATCTTGACTAAGTTCTACAATCACGGGGTAAGTTACAAGAGTTACTACTCATCAC
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GGGTTAGCTGTCCGGCCAATCTTTAGCCAGATAGCTCTGTGGTAGCCAGCAGTTAAAGGA
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TGCCCAGGTCATCTGCACCCTGTCAGAAAAAAAATCAAAACAAATACTAACAAAATTCAA
AAAAATCCAGATTTTTCCCATGGTAGATAAGTTCTTGCGTGAAGTCCGCTTCAATTTTCA
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AAAATGATTTTTTTTTTCTTTTTTGAATATTTTTAGTATTTGTTTTATTTATTTTTACTC
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GAGTTACAGGTGAAATATCATGTAAAATCCTCTTTTGTCTTTGAACAAAACAAAATGTTA
CTTGGGCTTAAGCATATGAATGCTAACAGTGCCCTTATGAAATGTTTAAAATGTAGCTCA
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GCAGCCTAAGATGATGGGGTTACCACTTCCCAGGTTTAAAATTCACTAACCAAAAGCAGT
TACGTGCTATACTGCTATTGTCGGGCATACAACAGTCCTGACTATACAACCAGTCTAATT
GAGTTTTTTAACAGATTAATAGAAGCCACACCCATTGCCTAGGTCCTTTTCTAAAAGTAA
GCAGCAACGTTTAGTCAAGTTGGTGGTGTTAAGCTTCATGCACTAGCCAACACAATCAAA
AATCCGAACTGATGGAAGGGCTAGTGCAATCCACGTATGCTGTAACAACCCCTCTCAACT
GGAAGAGAGCGACGGCGCGCGAAACTCACGTATGAATCAAGAGGCCTCTACGTGGACACA
AAGGGGGGCTACCAGCAATTTTTTAATAAATTGCGAAAAGACTTGAACTCAAGACCTTAG
CTCTGATACCATGATAAGCTTCATGCACTAACCAACACAACCAAAAGTCTGAACTGATGG
AAAGGGCTAGTGGCAATCCACATATACTGTAACAGATGGCTTGGCGCAGCCATTGTAGAA
ATTTCTTGGCTGGTCTCTTTCCCCTTTATTTGCCCTGTGTGTACCCTTAGAGCATCTCCA
ACAGACGCGTGTCGCCTGCTCACAATTTTTCTTACAGAACGGGCAAGGACTTTTTTTTGC
GCCCGAGTAGGCAGTTGCTTCACCAGGTGCTGCAAATTTTAGCGCGCCGCTATCGCGCTT
CAGCAGGCGCGCTAAAACTACAGCGCGCCGCTCATATTTCAACCATAGTTCATAGATAAA
AACTACTCCTCATCGATAGTTCATAGATAAAAACATTGTTCATAGATAAAAAAGATAAAA
ACTACTCCTAGTCGTTTTCCTCCGACTCGGTGGT