Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_47625 (6541 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_47625

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63478 1 1330 bp MLOC_63478.1 Available Available None
MLOC_63479 1 653 bp AK356898 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_63478






CDS Structure of MLOC_63479






Contig Sequence (6541 bp)

>contig_47625 6541 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGGCATATTTCCAACACCATCACCACCATCGCCAACAATAACGACGATTAGGTCGCGAG
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GAGAAACGAAAAAGTAAAAAAAAAACAAATTTGGCTCATCGATATGTCGGTCCCACATGC
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TCCTTTCCATCTGGATTTTCTCAGACACTTGTATGTTCGGTATTCTAAAATGGTGTGACC
TCTTTTCCTTCCGTAGATTATGGTGACATTTATGTTGTAAATGTTAGGTAGATGATACTT
TTCATGATTTATGTTTTTTTATGATGTGATTCTCAAATCTTATCTGGTAGGCAACACTTA
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GCAAATCTTTTAAGATGCGGTAGTTTATGTAGTATTTCTATCGTGTTTCTTTTTTTCTTT
GTAATGGGCTGGAAGGCCTGATGAATCGTTCGATCGGGGTCCATCCCAGCGGGAAGATAT
CAGGTGCTAGGTGCTCCTGGAGCTTTCCGGTCGTTGCATCTGAGATCCAAAGGTCAAGAT
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CACATCCGTAAAACATAATTGAATCTCAAATCCAACGGCCGGAAAGCTCCTGAAGCATCT
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GCGCTACCGTTTCGGGCGCTCCACCGGAGGCGGGAAAACCGTGCGCGCGGCAAAACCAGT
TCAGCGCGCGGGCGAAAACGTCATCACGTGCCGTTTTTTTGCTACGCCCGCTCCCTCGCG
CGGCAAACTCAAGCACCCGCTCGCAACTCCACCTACCCCATCCTGTCGCGGCGCCGCCGC
CACCTGCGTCACCCCATTTCTTTCGACGACCGTTCCGGCGCTTTCCCGACCTATCCCCCG
TGTCGTTGCTGCTTCCTCTGTCACCGCCGCCCCCCTTCTGTCTCTCTCTAGTCACCACCG
CCCCTCGCACGCGGCAGTCGACCGACAAACAGTGCCCGGCCGCCCACTGCCGCTCGGCGC
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