Map Locations of contig_47583 (7973 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_47583

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63428 1 1226 bp MLOC_63428.1 Available Available LOC_Os01g61860.2, FRAME:+3, EVALUE:1e-86, 13101.m06608 protein TBC domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_63428






Contig Sequence (7973 bp)

>contig_47583 7973 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATCGTGCCTTAACCGTCGAGCTTCTTTCATCGACGGTTGTCGTGGATTATGATTTTCTGC
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GAAGATCACGGACCGGCGAGCCATGGACATACCCGCCGTTCGATGTTGGCGCCGCTCTCG
AGGCGAGCCATGACCTCTTCCTGAATCACATGCCACTTGTAGCATGCTAGTTGGATGCTC
GCCCGATGGTTGGACATGGCCTTGTCGCCGCGCTCCCTGTGTATGCCGACGAACTCGGGG
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TGGTTCGCGCCGGTGATCGGGTCTATGCTGATAGTCTTCTATGCTTCGGCGAGGTACTCG
TCTTCCTTCGCCGTCCACTTGACGCAGGGCTCATCCGGCTCCCCGTTGGCCGCCCGTTTC
TTCTTCTTTCTCCCTTTGCTCCTCGCCGGCTCCGGCTTTGCTGGTTCTTCGTCCTCCACC
TCCTCCTCGATATCGTCGGGTTCAGCGTCGTCCATCTCGTCACCGACGTCCAGCATTTCC
TCTTGCGTGCCGAACCCGGGGCACGAAGCGGAGGCTCAGGGTTGTTGATGATCTCCTCCA
TCTTGGCGTAGGTGTGCTGAACTGTGGCACCGAACCCAACGCGAAAGGCACGGGGCCACG
GCGCAAACCCATCGCAGATGAACCCGAGTACGTCGACGAGTAGCCGTACTGGGTCTTTTG
GCCGGCGATGAACGCGGAAGGTGTGCGCGGAAGGTGTGCGCGGAAGGTGTGCGCGGGAAG
GTGGTGTTGGGGTTGAAGCCGCCGAGAGCGGTGCCGTCGACACATTCCGACGAGGGCGCG
TAGCCCCACACCGACAATGGGAAGTTGGTAGGCGACGCGACGCTCTACTGGCTACCTCAC
GCGCCTTGTGGTAACGGGCCCGCCTATGAAGGTGAAAAGATCGGCCGCTCGTTCACCATG
GCCGAGCGAGACGATGCCTCCTTCCCCGTCGCCGCATCCCTGGCTTTCTTCATGATGGGC
CCGTTCCACCGATCGATGGTCACCGCCGCCCGACGGACAATACCGCCCTTCCACCACGCG
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GGTTTTGTGGCTTAGCAAGGGGCGATGTACTTATTCGGTGGCATGGCGGGGGGAGAAGAT
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GAAAAGAGTTTCCTTTAATAGTTTCTTTTGTTTACTTATTTTGATTGATAATCTTATACC
TTAGTTATTTTTTAATCTTGCAGGGTGGAGTTTTTCACTGGACTGCCGTTGTCAAAGCCG
TCCGAGTCGGCATCGAGCACCAGCCACTCGAACTTCATGGATGTATCATTGTGCGGGGTG
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TGTGGCGGTGCACCATTTTGATCGGTGACGATGGGATTATGCATTGGAGTGTTGGTCGGT
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GGTCAACATGGGAGCCAAGACATCGTGCCAATGGACATGATGTTCATGGACACCCCTTTT
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GAATCTATGTTAGAATCGAGGCTTGTCGTAAATATGTTTGTGAACATTACGATGAACAAG
TGAGGGAGGCTTGACCTTCCCCATGGAGATGCCCTTAGATCAACTCTAGCAGAGTGGTGG
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AAACTTAGAGTCTTCGATCACTACAAGAAATATGTCAATTTGCAACCCTCCATATTGGTC
CCTAAAAGGTCGTTGTGTTTCATTTTTGACCTTTTTGTGACCAAAAGCAGTTGGTCAAAA
GTTGGTCGTCTTTAGTGAAACTTAGCGACCTTGTTTGTGAAATAGTCGTAGAAGTTTACG
ACTAAAATAAAATATCGTAGATTCTATGATCAATTGTTTTGATCACTAGGAGTCTGCACA
TGCCACGTCACATCCAACATGGCAAGCTGACGTGACAAAATTATGACCACATGAATTGGT
CATAGATTGGAATGGGCCCGGTCCATTTGGGTGCTTTACATGAGCCCAGTCCAACAATTC
GGTCTTTCTAGTATTATTTTTCCTCCAATGGGCTGTGTAGGAGGGGTTGGCTGAGAAGAG
AGGGAATGTTGTGGTCCGTGACACAAGTTTATAAAACCGAAAAATGTCCAACGAATAAAC
CGATGACGGTGCCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAAACGGACTCCGATTGCGACAAA
ATTTGACACATGGTCTAGCTACACTATAATAATACCTCACTCTAACTTTCAACCCAAGCC
GAGAAAGTTTTCTACACACTTTTAAAAACAATATTATAATGATGCTGCGGGCGCGTACGT
GTGTGGTTGGTCTCGAAACGGTCAATGAAAAAACATGAAGAACCGACAACTAATAAGAGA
TGCAAGTTTTGAAAAATGACGACAACGGAGTGCTGATGCAATGTGGATGATGCACATGAT
GCAATGATGAATGCGACAAACAAAATAATCACACAACGACAACGGAATGAATGGGGAATC
TTCTCGAGTGTCGGTTCCGGGTTGTTACAACATAAACTGGGGTTTAAGTTTGTGTCACTC
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AGTGTTATATAGTCGACGTTCACATAACACAACTAAGGGGGTCACAACATTCATATCATC
GAAATATCGAACGAATATGAACTTCACATGACTACTTGCAACACGACTTCTCCCGTGGCC
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