Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_47505 (7618 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_47505

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_63344 11 3174 bp None Available Available LOC_Os10g07566.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-16, 13110.m07663 protein LRR19, putative
MLOC_63346 1 915 bp MLOC_63346.1 Available Available None
MLOC_63347 1 1516 bp AK365257 Available Available None
MLOC_63345 2 1474 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_63344






CDS Structure of MLOC_63346






CDS Structure of MLOC_63347






CDS Structure of MLOC_63345






Contig Sequence (7618 bp)

>contig_47505 7618 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTGGAAGTTTCGTTGGTGGAGTATGTTCAGCCAATTGTAATTGCTAAGTACACCCAGCAG
ACGGTGGATTAACGAGGGCTGTTAGATTAAGATCTGTGGGATTAATCGTGGGGTGTTGAT
TGGTTATTTTTTTGGTGGGGCGTTTGATGGGGTGTCTGTAGTGTAATTCTTGTTCGATTG
TTTAATAGTAGTATAGATTACACAATTGATTTTCATCCGTGGCCGCGCATGTTCTTCGGC
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CTCCACTTATAGTGATTGGAAGCAAACAATCGACCACACATGACTTAAATAGGTAAGGTA
AGTGCGGCCCATTCAAATTGATACATTATTTATTTATTTATTATTTAGAATTCTGTTTAA
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AATGTTGGTGTACGTTGAAAAATGTTGAAGCGTGTATTCGTTCATAGGGATGAATATGCG
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AGCCTGCCCCCCAATCCCCCTCTCCTCCGAGCACGGCGACGGCGCCGCCGCCCGCCGGCG
TTCCATGGGGATTCGCAACACCCATCTGTTGTCCCAGGCATCCAAACGGAGGATCCTTGC
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AGTTCAGCCGAGTAAAACTGCATCTTAATTGAGGTGATTATTTTCTGGGTTTCAACTAGG
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CAAACCCAACTACTCCCTCTGTACCATAATATTTGTTGTATTTTTCCCCAACAACAAATA
TTTAGGAACACAGGGAGTAGTTACTTCTTGAGCGTCTACACATTCTAGCCAAAGGCACTC
TGAACTAGTTCTTAAGCAAAAAAATCTGAATTTGGTTCGTTGTGCAATATATTTACACAT
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GGTTTCCTTCTTGATCTGCAATCTGCATCGCCTAGTGATTAATCTAGTAAGTAGGTCTCA
TGTTGGGGGCACATTTTGCAGGTCCCTCTGCTTGTGTGGATCACATGGCATTGAATGCCC
TGCAGTGAGTAGTTGATGAGTAGTAATTGTGGTGATGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCA
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GAATTGCTGAGGGGAGTAGAGTGCTAGTACTTCTCTTGGAGAGTTTGACAAGGTAGTAGT
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ACCTGATGCTTTCCACCGGATGGATGGATTTCAAGCTGCAACCTGATGCTTTCCACCGGA
TGGATGGATTTCAAGCTGCAACCTGATGCTTTCCACCGGATGGATGGATTTCAAACTGCA
ACCTGAAGCTTTCCACCTGTGCTTGGTTCCTGCAGGCTTGGATGTTTCATTTCAGTCGCT
TTTACTCAAAGGTTTATGTCGTGATATGCTAATTTTTTTCTTGGAAAATGTTGTGATATA
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ATGATGTAGGGTCGTCATGTGCTTGTGACTGTTTTGTTTGACTCCACACTGATGAAACCT
GAATGCTACTACTATAACTGTCTTCTCTCATAAGCTAAGAAAAAAAAAGGTGGTTACATT
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GTTGTTTTTCAGGCACATGAATTTTCAGTACCTGGGAGATTGAGCAAGCAGGACCAACCT
GCTTAATTAACTTGGTCTCTGCTTTGTGTCGCGTGCAAATCAAACCAGGCGCGTCGTCGC
TGCCGGAAGGATCTACTGTACAGGTTGGTTCTCCCCTTTTTCCAGGTGATGTGTGTGCTT
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TGCACTGCTGCTCTACTTGTTTCGGTGCTCATGTTATTGTCCCTGATGCTCTTGTTTCTA
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GTCGGCGAGATAAGCTGGAGGACTCCAAGCATGGAGGGTTCGCTGGCAAGATGAAGAAGA
GGATGAAGCATATCAAGACCTGGCCGCGTCTGGCAGCAAAGCTCCAAGAAATCGAAGCCC
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TGCCATGTCTCTGTCTGTGTTCGTGCAGATAGGTGCATAGAACGCCAGCATGATAGTTCA
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GCACACAAAGATGAAAACTTAATTGGTCACTATGGCTAGGTACAGCCTATAGAAAACTAT
ATTTAATTCCGGCTGATATCCAGATGTACAGTATTTGAACAGCAAGTCCACGTCACAACC
GTTTCCTATTTCTTTTTTAATTATTCAGAACTTTTCATGTCCGTGGTTTCTTTTAGCCCC
ACGTATTTGTTGTAACATCCTTTTGCCTTCTTTTTTCTTGGGGACTCTGCACGTTAACGT
TTTTTTTGTACGTACAATTTTGTGTAAGATCCTATCAAAGTTCTTTCCTTATTTAATCCT
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GAAGGCAGATTGTGATAGGGGCTACCACTTGCGTGTTGCGGTACAAAGCAGTGGACGGCA
AGGATAGCAGCTTCAGGACCGTATCAGCATTATATTCCTGGTGTTGGAACGCAAGACTCT
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CATGAGAGCATGGTCATATGCTTCTGGAAACCCAATCTTGGTTTACGTTGTTGTAAATTA
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TAATGCAAAGTTCATCTGTTTTTCTGAGAAAAGGAACACAAAGTTATCTAAACAAATATT
TGTTTCTACAATAAGGAATAGAGGTGCTCTTTTTCTCATCTGTCCTATGACAGGGGGTGA
ATCCATCCTTCCGAGGAACCGGACGAGTGGTTCTGACATGTATATCGACCGAAATTTGTT
TACAAGAGTAAACAAAAAAAGTCATATATGTTGAACTTAACTGAAATTACTTTGTTGTTT
CTGCAATAACAAGTGCAGGACCAGGAAGGCAGTTTGTGACAGGGGCTGCCACTTGCTAGT
AGCTTCAGTCTTAGGGTAACATATCACAGGACCACAAGATTTTTCTGCCCCATCTACTGG
GTAACTCACAGTATCCACCCATTCTTCAGAAATTGCAACTGTCACTGTTACTAGAATTTC
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GCTCTGTTCTTAAATGTGTTCTTTAATTCCATGACCGCGACGATTTCTTAGCGGCAAAGA
GGGGAAAAGGCTATCTATCTATGTCTTTGCACAATCCTGAAGGGTAGATTATGAGAAACT
GCAACAATGCCAATTATGCAGCTGGAAACTCAACCTAGAATGATGTTGCTGTAAACTAAA
ACCACATCTCAATAAATTTGTGATGAAATTGGAGACCAATGGTTTTATGGGTCTTTCATA
TGCAAAAGAAAAGAAAATGCATGCAAGCTAGCTTCTCAGTGATAATCTTCATCCACTAAC
TGTATGTTCTCTGAAAATGTTTCTCAACAAGAAAAAGGCAGCCTTTTGTCACCTCTCACA
GACTTATTTGTATCAAGAATTTACTACTCAAGTAATATTTTTCATCATAATTTATCAAGA
GTAATGAGCAAACAAATAGATGGATGTAAGATTTCATACTTATTTGATGAAGTTGCTCCG
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AACTTTTACAGATATAAGTTAATACCACATATTGTATCTATACCTCACACATCGTTTTCC
TCTGACACCACACTCAATTCCTCCTCCGAGACCGCCGTCAGCTCGGAAGTGAAATGGTAA
GAGTCCTCCACATGGATGTGTCCTTCGTCACAGAAAAACGGCCTCGAAGGCATCTGCAGG
CCATCAACCCCAGCCTCCAGGATCTCAATGACCTCGCTCATCGTTGGCCGATCACGAGAC
CTCATCTGAATACACCATAATCCGACAACACACAGCTTCTTCTCCAGCTCGTGCATGTCG
GCAGCAACTGGAGATATCTCGCCCGCTTCTTCCCGGGTCAGCTGGTCGTACACCCATGAC
GGATAGTACGCCTGGCTTGAGGACCCCATGTTTGGATCAGCGTTCCTTCTCCCGCCGGCC
ATCTCCAGCAACAGCATCCCGAAGCTGTACACGTCGGACTTGCTGGATATGACGCCGAAG
CTCCGGGATATCATCTCGGGGGCTATGTAGCCGACGGTTCCCCGCATGGCGCTCAAAGGA
ACGAAACTGTCGCCCCTCGGGTACAGCTTGGCAAGCCCGAAATCTGCGACCTTTGGGACG
AAATTGTTGTCGAGAAGGATGTTGTGCGGCTTAATGTCAAAGTGTAGAATCTGCATGTCG
CACCCCTGGTGTAAGTAGTTGATCCCCCTGGCAATGCCCAGAGCGATCTCGTTGAGCTTG
TCCCATGAGAAGCTCTTCTCAGTAGAGAAGATGTACTTGTCCAGAGAACCATTGGGCATG
TACTCGTAGACTAAGGCCCTTTGCATTTCCTCCGAGCAGAACCCCATCAAACGCACAACG
TTGACGTGGTGGATCCTGCCGATGGTGGAGACCTCGCTGATGAAATCTTCTCCATTGCAA
TTTGAGTTGCCCTCTAGCATCTTGACGGCGACATGGACACCGCCTGGGAGTAGCATGCCC
TTGTACACAGTGCCGTAGCCCCCTTGGCCCAATTTGTCTCTGAAATGGCTTGAGATTGCA
ACGATGTCTGTGTAGGCATACCTCGTAGGGCCAATCATTTGTTGAATCCTGAGGAACTTC
TCAACTGCATCAATTATGATCCTTGTTTTCCAGTACTTGTAGGCTAGGAATATCCATACA
GCCAGGGGTGCCAACAAGAACCTACATAGTACTGCCCAACAAGGCGACACATACAGATGT
AAGCTAGATACTTATGTCCAAGATTTTGTCCATGATGATTAAAAGCATGTAAATTCAATT
TTGAAACTAAAAGGAATATAATTCTCACGTACCGAAAAAGAACTTGGGGACAGCAATCAC
CGATAATATGGTCACAACAACCAAAACAAACGGTGTTGTGTAGTAGTGATCGTTGGAGTA
CTGAGTCACGCATTCTAAGAAGTGCACTTCACTCCAGAAAAAAGCATGAGTCCAGTTCAC
GATGCTTGCACCAGATGATTGCTCCTTGAAGTAGCTGCAGATCATATCATTTTAAAGAAA
TTGATTTAGAACGGAGCACGGTTCTTGGATTCCATTTGCATACTAATTCAATCCCATTTG
CAAACAACAACAGTGTTCGACTTTGCCACCATGTAATTCGACTATGTGTTCTATTCTGGA
CGGTTGTTTTAAAATTTGACATAATCTAACCTGTGCCCGACATGGATGGAGTAGTGCA