Map Locations of contig_47089 (10617 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_47089

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62912 1 1362 bp AK369921 Available Available None
MLOC_62913 2 4379 bp MLOC_62913.1 Available Available LOC_Os02g49620.1, FRAME:-1, EVALUE:9e-94, 13102.m05626 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_62912






CDS Structure of MLOC_62913






Contig Sequence (10617 bp)

>contig_47089 10617 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCATAATAACAATGTCTAATGGCATTTTTTTCACAAACATCTAATGAACGATGGCATTTT
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TGTCAACTTCATGCATCTCCAAATTGTCCTCTCTAACTGATACCTGCGTATCTATCTTGT
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TGCATAGATGAAAAGCTATTTGTCAAGAACAAATGTGAAAAGATCAACGTCACTCATCAT
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CTTCAGCTTAGGCGTTGCCTCATCCTCATTGAGAGTCACCAAATTATCCGCCTTGGAACG
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GCTTCCTTTGTCTAAGAACAAGAGACAAGAGATAAACCGTTATTATACTAGTAGAAGAAA
TATAACCCCATTTCAGCTTTGACAATACTTGACAACCATATATAACACCTACTCCCTCCG
TCCCATAATGTAAGACGTTTTCCAACACTACACAAGTGTAAAAAAACGTCTTATATTATG
GGACAGAGGGAGTAGTAAACAACTCAAAGAGCTGGAACCAAAAAAATTGACAAGCATTCA
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TCTTCTTCAGCAGCTTCCTCTTCACTCCAAGCCCAAGCGCCAGCTTCTTATCGACCTTGG
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GTTTTTTTATGAATCAATCGTTCAGTGGCTTACTTGCATGATGTCATTGACATATGTGGC
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CAGATTCTCACCATCAATTAGTTTTTTGTTTGAACATCGAAAGAAAGCACCCTTCTGTCT
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TCTTGTCATTTGCTTTTGAAGTGTTCTATTTAATTAGCTGTGCTGGAGCTAATGAGAAAA
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GTCACAGGCCAACATATCATTTACAGGCCTGAAACTTGCATATTGCCTTTACATATATAC
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TTCTTGCATGTCCCTACTCATTTGGTCCTATGGTTTCCTTGAGAAGTCTGTCTCGTGCCT
GTACATAGCCCATGTTACATGCAAGCTTGAAACAGTTCCAAGCCTGATGTTAAGAAACTT
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AGTTATTTGCCTTCTTATCACCACAAAAGTAGAAGGAATAACAACAAGTATGGTAGTGCA
GTAGAGAAAATGACCTTGAGATTAAGCTAATGTAATGTGGTTACCTCCTGTACAGGAGCT
TGCAACCGCGGGTACTACCAAGAGGCCCACCTGCTGCGTGTTGGTGATGACCAAGCCAGC
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CATGAGCCTTGTTTCTGCTTGCTTGATGGACTTCGTTGCCTTGGGCCACCCAGAGCTTGC
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ATGCCTGTTTCACATGTCATTTAGTTCCCAATCTGCGTGCCTATCTGAGATTCAAAAGGC
ACCCATTTCTGCTTGTAAACCTATGTTTGGATGAAACATCAAACAGTACAAACAGACAGT
CGCCACTCGGTTACAGCAAAATAGAGATAGCTCGGGAAAGTGCCCTGTGCACCCGAGCTC
AAATGAGCTTGGGTGAACAGTGATATTCAAAAAATATTTTAAAAGATTCAAAAAATCAGA
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GCTCCCTGCGATTCTAAATATAAGACCTAGGGATTTCACTATGAACTACATATAGATGTA
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AAGATATGACTGGGATGTGGAGACTGGGCATGCACGCTCATGACGCCACGGTCCTGAAAA
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CGTCCCTGGTGGACCAACGTGTCAGCCCGATTAGCAGCTGGACCGAGATGAAAGGATCTC
TCGCTGAATGTCTACAGTAATCTAGACAGCCCATTATAGCCTAGTTAAAAGTAGAAAAAA
GGGAGCTAGAAGCCTTCCATGTTTTTTTTTCTCGCGAGAGGCCCGGGTCGGCCTTTGCGA
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TTTTTTCCTATCGCAACACGCAGGTTTTTAGCTATCGCAACAGGCAGGTTTTTGGCCCGG
GTTTTTTGGTGAAAAAAAGTTTGTTAAAACCTATCAACATGGAATCTAGTTTTGAAGATC
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CCTTGTTCCCCTGTCGGAAATAAAAAACAATAGGACCAGGTCCGTATCCCAAACAGATGA
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GTACGTTTTTCCTCACTTTTCATTAGTTTTTTTCTCTTCTTCCTCACGTATTCATTTTTT
TCTTTGTTTAGTTTGCTCCCTTTCTTGTTTTTCATCAATTTTCTTTTGATTTCTCTCTTG
GTTTCACTTGTTTTCCAATACACTTTTTTGGTATATATCTAATAAATATTTAATATTTTT
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ACATTTTTCCTATAAACATTTCATGTTGTATAATTTTTTGTATACATGATACACGTTTTC
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AGAGTTATTTGTAATATGTAGTATTTTCATAAATAAATAAAGTAAAAGGAAAAAACATAA
AAATAAAATAAAAAATGATAATATGGGTGCGGTTTGTGGTTAGTGGTGCGATATGTTGTC
CCAGTATGGAGCTCCCCTTGAGCGAGATATTAGTTCCCCCTCATTCGTGTCTGGGCTCGA
GTGTGCAGCACTCGGGTTGACCTGGCACAACCCGTTTACGAACCGTGCCCTTCATGATTA
TGGGTTGGGCCGGTCCTTGTCGTGTCGACCTATTTGGCCAGCTGCATTGGATTTGGCACT
TTGGCCTAGTTGAGGTGCATGAAACACGAAACACACGTGTTTTGGAAATAGCTATGGCAT
GGACACATGAAAATAGCTTTCAGGGTATCATATTTGTAAGTTTTCGACAAACGAAGGACG
GAATTTGGATAAAGGTTCTCGGATTCTAGTGAATTTTATCATGTACATACATACATCCCA
CATTATGACATTCCCAGATTGGTGCTACAGTAACCCTGTAGTCAAGCGACAGTAACCCCA
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AGTCGAGTTCGAAATTTAAAAATAAAGTCGAACGAGAAACGTTTTATGATGTTAAGTAAA
AATGTCGGGAGAGTTATTGAAATTCCCTAATAAGTTATAAAAATGAATAGAATTTTTTTA
ATGGTATTAAAAGTCCTATATAGTTAGAACAGAGAGAGATATATATAAAATAATAATAAT
AACAGGATGTCAGAAAGTAAAAGTAAGAAAAACAAATGATAATGAAAAAAAAACTAAGCC
CCAGGCCAACTAGGCCAAAGTGGCCCAGCCGGCCACTCCCACCCAACCCTAGCGATCCGG
CTGATCGCTCCCTCCCCACTCCCCCTCCTGCCGCCGCCAAGGGATCGCCCCAACCCC