Map Locations of contig_47036 (8988 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_47036

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62859 4 2116 bp MLOC_62859.1 Available Available LOC_Os04g46620.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13104.m04698 protein T-complex protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_62859






Contig Sequence (8988 bp)

>contig_47036 8988 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGTGCCTATGAACAAATCCTATAAATGTAACTTAAGGCAACCATTAGTTCATAGAAATTG
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ATAGTACCTTGCTGTCTTTTCTCAGGGAATCTGACATAACAAAGGAGCGAATTGAGAAAG
TTCTCAAGGCTGGTGCTAATGTTGTATTTACCACCAAGGGAATTGATGATATGTCATTGA
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AGTGAATGTCATATTTTTTCTTTGCTGCTGGTACTTTTGGGGTGGTGCAGACAGAATCTG
TTATACTACAGTTAGCATAATATGTTTGTTAGTTTAGCCTTATGGCAGAATTTATCGCAT
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AGTGTCTGTTTCATAATTGATTTGATTTTTATGAATTTGAAAAGATGTACTGGGTTGTTT
TTGTTTATGTGGATATCACTTTGTGTTGAGTGTAACTAAATCTGCTGTATTGGCGTTTGA
TGAAACATCATTTCAGTACTTTGTTGAGGCTGGAGCAATTGCAGTAAGACGTGTGCGTAA
GGAGGATTTGCGCCATGTTGCCAAGGCAACAGGTGCGACAATGGTATGACTTATTTCTTC
ATATTGTCATATTGCCGATTAAATATTTATGATCAAGGAGTATTTTCATAATTTACACTA
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TGTTTTAAAGATTCTAAAGAAATTTGCAATATTGGAATGCATTTATTTGATGATTTCCCA
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TCTGTTTGTTGCTACTAAGTGTGACCCGGAGTTAAAAATTTAGCTGGTGCTTTCTTGTTC
CCAGTCTTGATATTTTTCCAAGATTCTTTTGTATATCATGCTTGTTGCTGGCCTATACGA
TGTCATTTTTGCAGCTTTCTTTGATGCCTTGTTTTCAATAGCCCCAATCCCAGTTCTTGA
GAACTTTTTTCATTCTTGAAGGAGAATAGGAACAGTTAAAAGGCATCATTTAAATGAACC
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GTAGAAGCTGCATTATCTGTGTACCTGGAGAATCTTGCTACAACCCTTGGATCCAGGGAG
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ATCTTTGCACCTATGATACTTGCATTCTGAACCGCATGATATACTAATGGGAGCAAGGCT
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GTAACAGTAACTGCTTCTAGATATATTTTTTAGTTCAATCATCATTCATTGTACTTGCCC
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GTTGTTGGCCGCCTGTCACCCACTGTGTTCATGTCAAGATTCATGGCACATCTCATATAC
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ATCAAGCTTGACAAGGAAGAGTCTGGCCAAGAAGAGTAGCCACATGCCATTTTACGATCC
CTGGTTGCTGTTTGTTATGCCATGGCTGGTGCTATAGACTCGTAGATTGCTGCTTGTGAT
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ATGTGCGAGAGTGTATCGTTGTGTGTGGGTAGTAGAAGGACTCGTGAATGGAAGCAAATT
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ATGTCTTGATCCACTGTTACCACTGCCTCAGGAAGCTGCTGCATCATGGTCGGCCCATTT
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GTTTAGCCAAAATAAAGGCGACCTAGATATGGTTTTAATAGTCTGAAATCTTTGTATGTA
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AATTTTAGTTCATGCACATTCAAGGTTATAATATGGGAAAATCTAATCTGTAGCGTGTGC
ATTGCTGAGTTTTGATGCGACGGATTTCCACCCACGTCTGATTTGTTTTTTCTTTTATTT
TTTGAAGCCACATGTCGGATTTCTTGGTGCGTGATTAGATGGTATAATATTTTCCATCTT
GCGGAACAACATGCAGCCAAACCCCTCTCTTTTAGTCATGCATGCAATGATGTTATCGAA
TTTGCTTTAAATGATCGGAATTCAAAAACTTTTATCTCTTAAACCGTTAATTTGATTGAT
GATCTTCTTTGTTGTTGTTGACTTTGTTTTGATGAAATCTTCAAAACTATATCTCATGTG
AACATGTTTTGATAACTTCTTTTTTGTTCGTACCTATCATATTTGTTGCACTTACTTGTC
ATATTAGTAAGTACTTAGTTGTCTGATAAAAAATAACTTAATCACCATATTTTTGAAAAT
TGTGTATAAATATGACATCTCGACATAATCAAGCTGGCAATCACAAACAACTTATTTTAG
GCGATTCCGCGCAAAAATATGACAGCTCAATATATTTAAAACCGATGACCACAAAAAAAT
CATTTTTGGTCATCGTTTCTAAATATGACAATTCGGCATAGTTAAACTAACAAACACACA
ATAATTTTGCAAAGTTGTATGTAATTATGACAAGTTGGCATATTTAAATTGACAAACACA
ACCTATGACATGCTTTTATATCATGTATAATGAAAACGACTACAAGGCTTTGTAGAAACA
ACATTAAAAAGTACCAATTAAGTTATTTTTCTCAAACAAGTGGCTAATAATATGGCAAGT
GGTCAAAAAATGTGGCAAGTATGAACGAAAAAAATAGTTGACGGAACATGTCGACATGAG
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TTAACGGTTTTGTAGATAAAACTTTTTGAATTTGCAACAACGCAGGAA