Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_46890_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-MorexXBarke_maploc.png) |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_46890_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-OregonWolfe_maploc.png) |
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Predicted Genes from contig_46890
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_62716 |
4 |
2039 bp |
MLOC_62716.1 |
Available |
Available |
LOC_Os07g42810.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13107.m04486 protein adaptor complexes medium subunit family domain containing protein, expressed |
CDS Structure of MLOC_62716
Contig Sequence (6900 bp)
>contig_46890 6900 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCACCGATCTAGGTTGGGTTCCAGGGCGGCAGCCTGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ACATCTTATGAATTAACAATATTACAAATGCTTGATGCCAGATTACAGAAGTTCTTCTGG
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TGACATTGACAGAACTCTGCATTTAGTAAGTACTACTGATATGATTTGTTTTGTCTTCCT
TTTTACTTCCAAATATGCACAGCAGCAAAATTTGACAATCATATTTACCAATGAGTAGAT
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CTTCCGCGTTACTGCACTAATTGAAGAAGCTGGCCCATCTAGGGTAAGGTATTTTGTGTT
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TATGTTACACAGGCTGAAGTTCTATTGAAAATACGGGCAGACTTTCCTGCGAATGTCACT
GCTAACACAATCACAGTACAGATGCCAGTACCCTCTTACACTATGAGGTTAGTTGCAGCT
TTATTTTGTCCTGTTGAGGTTGGACAAAGTGAAACATTAACTTCTGCTTTCTGATAATTG
GTTTAAGGGTTGCCTTGTGGATTACTTTGCAGGGCAAGTTTTGAACTGGAAGCTGGGGCA
GTTGGACAGACAACGGATTTTAAAGAAGGAACTAGGAGACTGGAGTGGAATCTAAAGAAG
GCAAGTTCCAAAAAGGATTTATCCTGAATTTGTTAGTCAATCTGCTGTGCTTTGCTGAAC
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TTCTCAGGAGACACATGGTATGCACTTGACTTCTAGCTGGCCTGTCTATGTTCTGAGTGG
CCGTTATACTATGTTTTTGTGACACGCATCTTTATGAACACAGGAAACCTCACAAAGGAA
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AGACCATCTGCTGCCACCTTTGTGCCAACACTAACCAGATTTAAGATTTTTCTTAGCTGT
TCTAGTATTTGATGTGTTTGAACAGCTAGTGGATCGATGTATAGCTTTTATGCTTCCTGA
ACACCACCTAAGCGACTGAACTATTCCCTTCCCCGCTGCAGGTCAGATATCTTCAGATAG
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TATTCTGAGCAGTGAATAAATTTCATGTTCGTCTGGTAATTACAAACTGAAACTTTTTTT
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CTTCGCCTCATGTACGCTACTAGAAGTTATTAAGTCAAAAACAACTAGAAGTAGAAAATA