Map Locations of contig_46873 (8597 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_46873

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62700 3 1850 bp MLOC_62700.1 Available Available LOC_Os08g43170.1, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13108.m04673 protein hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_62700






Contig Sequence (8597 bp)

>contig_46873 8597 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATCAGGGTGCGCCCTGTTGGCTTGGCACCAACAGGTGCCCCCCTATGGTATATTTTTGCT
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CCATCTCGCGATCCCTCCTCCCGCTCTGTGCTTCCGCGGGCGCTCCCAGTGGCTGGGCTG
GCTCGCAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGTGTGTGACGTGAGAGAGTTCGTGTGACT
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GTCCTCGTTTCTTCCTCCGTCACGCACACGTCCTTCCCCTTCTTCCCCACTTTCTTTCCC
CCTGCAACCGTTATCATGCCACATCGTTGGTGGTCGGCTTGCCACCCCTCTTCTCGTCTC
CTTCAGCGAGTGTACACCTCCTCTCTCCTCTCTCCCTACCGAAGCTCGGGGACTGCTTGC
TCAAACCGTTCACTCGTGAAGCTGTGACCCGCTGCGGCATATGCTGGAATCATACTACAC
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TGAAAAAAGTTGCAACCAGACATATAAGAAGCTGCAAGCGGTCATTGTCATGACAGAATG
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TGCAGCAAATCATGTCACCGGATGTAGCTTTTTTCATTGCCGGTTGTAGCAAAAATCGCA
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AGCAAATTGTGATGCCGGTTGAAGCATGTAGCAAAAATCGATGTTAGTTCCAGCATCCTA
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GGTGGCTGTGCGCGCGGGACCGGGTTAATGGCATCCTCGTCGGGGATGGGCACCGTTCGC
CGGGGCCGATGGTCGTTGCCGCTCGCCGGGGCTGCGCACAATCATAGCTCGCCGTGGTCG
CTCGTCTGCTGCAAGTTGCAAGGGTCGTAGACGCGCGATGCTGTGAGCGACGGCAGCGGC
AAGCGCGGAGTCCACCATTGACGGAAGTTGGCTAGCTGCGGCCGCCTCATATCTCGTCGT
TGACTTCTTCTATGCATGCGCGGTGTGGGGTTGTTTATTTTTTACCAAACGGGCAACGCA
GATCCAATGGTTACAACAACTCCAATTAAATGATGCAGGATGGACCGGCCTAAGCTGGAG
CGCCGGTGCGCCGGCGCCCAGTACTGCCCTTTTAAAACCTTTTCTGCAGCTTTTTATATA
GGTCCTTGCTAACTTCCGAACAATCGGAATATTGCAATAGGTCCGAGCAAACGATGCATT
CTTCACTAATCATGCTAACTAATTCTGCACTAGGCACTAAACATCTAGATTATTTTCTTT
TATTTGCTAATTTTGTACTATTTTATTAGAAAAATACCGTGAAGCATACTTTAAAAGATG
CATGCATGCATATAAAACAAAAATGATGATGTCAGCAAAGATTTTATTAAAAATTAAAAT
TTACAATGTTTTGTAGTTCAAGCCAGCGTTTTGATGAAAAACCGTTTTCACATAAAAGAT
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GATACTAGCAGCGCTACTCGTAAGTTTAGTAGCAGCACTTGCTTATAGAAAGCGTCGCTG
CTAATATTTTTCAACGCTACTGCTAACGTTTACTATCAGAATGCATCATCATCGACAATA
TTAGCAGTATTCAGAATATTCACAATGCATCATCATCATCGACAACATTAACAGTATTCA
GAATATTTTCAAGCTCT