Map Locations of contig_46834 (13802 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_46834

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62667 6 2361 bp MLOC_62667.3 Available Available LOC_Os02g07760.2, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13102.m00888 protein aldehyde dehydrogenase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_62667






Contig Sequence (13802 bp)

>contig_46834 13802 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGTCTCACGATGGCTTCGTTTCAGACCACTGATAGTAAGCGTTTCCCAAGCCAAAGTGGC
AAACTGCTTGCTAATGCCCGAGTTAATTAACTAATAAAATGGTTGAGCATGTTCAGTCGA
AATTGATTTCCTTGCTTGTCTGCATGGCGCTGCATAGATATTTTATTTTATTTTATTTTA
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TGCGGTCCACGCCGGCCCGCGAATTTTGGCCGACGTCGGGGAGGTTGGGAGGTCGCCATC
GCACAAATTTTCCTAAACCAGCTCAACAGGCCACGTGTAAAGCGCTCGTGCAAATAAGAC
ACAGAGACCCGGCCACACAACAGGTGCAGGTGTTCGTGTCACTCGTCCCTTCCTTCAGAT
GGCGATGGCGATGCGACGCGCGGCGGCGCTCGGCGCCCGCCACATCCTAGCCGCCTCCGG
CTCCGCCTCCTCCCGCGTCGCCAGCCGCCGCCACGTACGCCCTCTCTCCCCCCACCCCAC
TCGCCTGCGCTCCTTCATACCCCTCGCGCCCCCCCGGCGGTGGTGCTCGGTGGGTCGTGT
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GTCGACGCCTACGACGGGAAGACCATCGAGGTACCGTCCCTCCCTCCGTCCGTCTCACTG
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GATTACTGCTGTGCCCAGTCCAGCTGTTACTTTGTGGAAAACGCGTGGGAGTTGGAAATT
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GCTTGGACTTTGATCCCATTCCTACTTTCCTAGGACGTTAGCGCCATTGAAACTTTCCTC
CTGCTTGATATAGTTTGGAGCTATGAGTAATTCTTTGGTATGGTTGTGTTCTGTCTTAGC
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TTAAGCTTGTAAGTTTGCTGTTTAGGTTATTTCTGTAAAGAGCGCTGAACAGTATGAATA
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AAACAGCTGATGCAATAGCTTCTGCTCACACTACATTTTATAGTATGTAAAAACACATTA
GTGTATTCACTTTTAATACTTGAATACTGACCAAATAATGTTTTGCAAGTGCCATAGTTA
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GAAGATCAGCATTGGAACACCATGAATCAAGTGAACTTCCGTTCACATGTCACATACCAC
AATCAACTAATATCTTCTGTGTATCAGAAAATGCTTCCATTCTGGCTTAGTTGTTCTATT
ACCATATATAGTAATTTAATAATAAAAATCGGAACTACTATACTGTCTCCATATTAGGTG
AATGTGTGATGGTTGTTTTGTTTCTGGTAGAACAGAGGAGTTGTACTTCGTAGTAGACCA
AGTACATCTTGTAGAATCCCAAAGGTAATCCTCTAGTTTATTACTACAAGCTCTAAAGGC
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TAAAAGCTTATTTTGCTAAAGCATTGGCAACTTTCTTGTTTTGGAAATGCTTGTTTAAAA
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ATTGTGCGTTTCCTGTTGTTGTTTGCCTTTGCTAAATATTTGTATGTCTAATAATATTTT
TCTTTGCATACTTCATTATAGTTGATTTTCCATTTACCACTTGCAATTTTCTTTGTTTGT
TTATTGTCCTTTACGTTTTTGTAGCTTGGAGCAAACTCACTGCAAGTGAAAGGAGCAAGG
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GTATTACCTGGACATTTCTTCTCACTATGTATTTCCACAAAAGGCATGACCTACTTATGT
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CCCTTGGGGAGGTACTTGCTGAAGTCATGCACTGACAATAGTTAGTTGGAGCTTGTAATT
ATCTAGGGTTATGGTAGACTAATTTGTTGCTAATCATATATTCAGGTGAACTATGGTGCA
AGTTTCATAGAATTTTTTGCTGAGGAAGCAAAGCGTGTGTATGGTGATATTATTCCCCCA
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GTTCATTTTCTTGTTCAAGTGCAGTAAACCTGTGCTTTTATTTTTCTAATATTAGTTTAT
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TAGCTGCAGCAGACCTTGCTCTTCAAGCTGGAATACCAGCTGTAATTCTCTCGGGTTCTC
TATTATTCCAGTATTATTTGTGTACGAGTGTATTTATTCTGTTTCCATATGTACTTGTCG
AAGATCACTAAATTTCTGTAACGAAATCTCCATATTCATGGTATGGGTACAGTTACCGAG
AAAATTCTGTTACTAGATTTCTGGGATGCTTTACTCGTTTTGAGAAGTATAACTGTTAAA
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TGAACCAAATCATATTTTCCCATCTTTTACTTGCACCTGCCAAGTTGTTTCATTGTTAAC
GGAAGGTTTTATTCATCACAGTTAATTTTTCATCGTCTATTTCTGTGAGTATATTCATGA
CACCTGCTTCAATCATATTCTTCATCTAGGGTGTACTAAATGTTGTGATGGGTAATGCTC
CTGAGATAGGTGATGAACTAATGCAGAGCACACAGGTTTTATTTCCTTCCCTTTCTTTCA
GTATTAATTATCTAGTATGTTTTTCTGCAAGTATTTTTTTAGATATGTTAAATCATATAA
ATTGTGGTGTACATGATCACATGTTTTCCTATTTATAGGTCAGAAAGATTACGTTCACGG
GTTCAACAGCTGTTGGCAAAAAACTGATGGCTGGATCAGCAAACACCGTGAAAAAGGTAT
GTACTGAGATACTACTTGAGGAGAAATTACTGTACCTCTGAAGTTTAAAGTTCTTGTGCA
TCTTTAGAGCTTTCTACTCCCAAGAACACATCCAATATTCGCAAGCTGTTGTATCGATTT
CGTTTGGTGACATATTGCAATAACTAACCTTGTTTCAGATGAACATGTAAGATATCTGTG
CAGAAGGGCTCAGCATACCAGGAGTGGCTCAGTGCTTCTGGTCACACTAGCCCTTATCTA
CTTTTCATAAAATTTGTCTGTCTGGTTTAGGCCCTAATACCATACTGCATGCAATTCAGC
CTGGAATATATATATATATATATCTCAGTATTAGATATGCCCCAAACGTCAATCTAGAAG
GTCTCAAACCTTACCAAATAAATGGTCCAAAAACTACCAGATCTCTTGAACTACCCTGGT
TGTGTTTTTCTGGTCCTGTGCCAGTTTCAAAACTTGCTATTCAGTCAATTCAGCATGGAT
ATCATCTAATTCTTTAGGGTTAACTTCCTTTATTTTAGTTAGAATGTTTCTACAAAAAGC
TTTTATTGTTTCATTTCAGTGTGATACCATCAATGTTGATATTCGCAAGAAAAATTCTCA
TGTAGGTTTCTTTGGAGCTTGGTGGGAATGCACCTTGCATTGTTTTCGATGATGCAGATA
TTGATGTTGCCGTTAAAGGCAGTGTAAGTAAAAATATTGCTTTTCCTCACTTCTAGAACT
ATTTTCGGGTCTTGTATTTCCACTAACATACATACCAAAAAGATCATGATTATCTCTAGG
TGGAGACGAACATCATAATTGATATGATGAGCTTGTACCTTATTTCTAAGACTTTAGCTA
ATTGATTACTGGGGCCTGTTTCGTGGTTTTAAAGAGCGATCTTGAAAACGCTCAGTTTTC
TTAGGTCAATGCATGCATATGTATGTCTGTCTCTTGACTTCCTTTTTTTTCCTGAGCTGC
AACTTAGAAACATAATGTGGGCTAAACACATGTCGCTTTCTCACTCTTTCCCAACATATA
GTATGATAGAAATTTAGTGTTGGGTTGGTATCCAGGTTGTGCAGCTGCTTTGCCAGGGAA
TGCACATATCCCTGTTACTTTTCTAGAGGATAACACCACCATATGGCAAAAACAAACATG
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TTCCCATTTCAGCTAACAGACTATTGAAATGTGTAAATTCTATCATTTTGATCATAATAT
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AGACATGTGTATGTGCAAACAGGATATTGGTGCAAGAAGGTATACTGATCATTTATGTCA
TATATGTGTTATCGGTGCCTCTTTTGTTCTGTTAAGAATGCAAGTTGCATCTGTAGGTAT
CTACGAAAAATTCGCAAGTGCATTTGTCAAGGCTGTTCAGAGCTTGCAAGTCGGTAATGG
GCTAGAAGAGAGTACATCACAGGTATATAAAGTGTTTAATCCCCTGTGTTATATATTGAG
CTACAAAATTTGAGCTATGTGTTTCTTGTGTTAGTTGCTTGGACACTGTTTTCTCATGCT
GTATGAGTTATAAGAATACCTAATTTGACAGTACTTGGGGTCTCTTTAGATTAAAGGATT
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TGCCTTCATACGCTCCAATTCTATCTGATATCTAGCAAGAGGTTAGACCACATGGAAAAT
TACTTGCATCAACCTTCTCTCTCCTCCTCCAAATTCCTACAAAATTCTTGTGGAGCACCC
TGAGAGCCACTTTTCTAGATTCATGTGTTTTTGTTCCCTGACAAAGAAGTTGCCGAAACC
ACCAACTATTGAGGTTGATTTTGCGCAACACCTACTCTACAGGTTTATTGTACGAAACAC
CACCTATTAGTGTAATCTGTTGCAGGTAGATCTAATCCATCGTTTGGCTCTGTTGACATG
ATCCCTGGGGGCCCCGCTCATAAGTGCACACATGGAAGAAACCCAGGCTGGACGACAGGT
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CTACAAAAATGCTAAAAAAATCAGTAAATTATAATTATTTCACTACTTATGTGGGATATT
TCAGCTCATTTGGACAACAGGTTTGAATTCTATCAGCATCTGGACACTTAGGCAAGAAAG
AAATCATGCCATAATTAAGTCTAGCCATGTCCAGTCTAACATTGTAAAAATCATGAAGCA
GGGAAAGTGAGTCCTCACTGATCAAATCCTAGAAATGCTGATAAAAATCTAACAAAGCCA
CTTCAACATGGGTCATGGCTGTCTTCCTGAAGGGTCCTTGTAGGTTCCGTAAGTTGTGGG
TACAACCCTCTTGAAATGGTCAACAAGGTATGCCTGCCAGTCGTCAGTTGCATCCGGTAG
CGTGCCGGCTTGCCCTGGGAGATATTTGCTGTTTTAGTTGACTCAACTCAAAACCTGACA
GATGCCACAAGCCATGGGATCTCAATCCTACGTGTTTTCTATTCCTTAATTTAATTTATA
GAATTCTGTCTTTCAAAGAGACCCTTGTGAATCATGATTGAACTTCGTGCTGCATCATAA
TGGATAATACTTGTGATCTGCTATGTTCTTTTCTTTTTGGTACCTCATGTCAGGTTTTAC
AGTTTCTTTCACATGCAGGGTCCTCTAATCAATGAAGCTGCCGTTCAAAAGGTTCATATT
TTGCACTTGCAATGTCCCGAAATATTTTATGTAGCAATCCTCACATGTTTTACTTTTTGG
TCTGTTCTCCTGTAGGTAGAGAAGTTTGTAGGTGATGCTACTTCAAAGGTAATTTCAAAT
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TGGACCATTTCCTGGGCCCAGCTGGATTGTTGGTAACATTTCCTAAAAGGTGAATCAGAA
AGTTAAGTGGTTGAGGAACCACAGTTTTCCTGAATCTTGACTCTGGTTCATCCCACCTAA
CTGTAAATTAACTGGTTGAGGAACCACAGTTTTCCTGAATCTTGACTCTGGTTTATCACC
CACACACTAACAAGCAACAATTCTATACCAAGATGCTTGTCTGATAATTCTATACCAAAT
CTGCAACATAACCTGCAACTGCATGTAAACTGTAAATTATCTCCTTATCTCCTTGGTCCT
GTAGGGAGCCAACGTCATGCTCGGTGGTAAAAGACACAGCCTCGGGATGACCTTTTATGA
GCCAACTGTGGTAGGGAACGTAAGCAATGATATGCTTCTTTTCAGGTAAAGTATGAATTT
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TTATGTGGCCCAAGATCACTTGTAACGTTTTAGGAGTTTCTTTCTGTAGACTGAAACCGT
TAGTAGAGAATGATATGACGAAATTACTATTCCGATCTTCTCAGCGATCTTTGTCACAAA
TTGAACTCGACATCGAAGTATTTCACAATCTGATCCTTTTGGCAATGCCATAGCCCGTGA
AGTTACTTCCCAACATAGAAACATCGAGCTAGATAGCGTTTTTCTGCCCTTGTCCATTGC
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CGCCATTGACCCTGACGTTTCTCTGTAGGCTTTGGCGTTGCTGCCCTACATAGAAGCTCT
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CGTGCTCGGCCTGGCAGTGGGCGGGCAGAAACACTACCTAGCTGGGCCTTTCTATGTCAG
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CGAGTTCAGTTTGTGACAAAGATTGCTGAAAAGGTCAGAACAGTGATTTCGGCCAGAATG
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AGGTGGCGCCATTCGGTGGGGTTAAGCAGTCTGGCCTTGGGCGGGAAGGATCAAAATATG
GCATGGATGACTTCCTGGAGGTTGGCACACACAACTCTCTAAACCGTTTCCCGACTTTAA
TCGATGCTCATTTGCTTGACCGTGGTTGCAGATTAAGTATGTATGCATGGGCAACCTGGG
TTGATGCTTGAAGTTGGCCTTCGCTTCCACCTGAATGAAGAAGGATCGAGAACCTACCGG
GGCCAAGTACGCTGATAAGCGCGGATAGCTCTGCAGGCGTAAGGTGTAAGATGGAACGAA
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ATAAGTTCGAGTGAAGAGGGAACACAGTTTGCTTGGAATAAAGAGAATAGGCCGTGTCCG
AATAAACGGGTTGTAATGAGTTGTAAATGAATGAAACGTGAAGCACGGCTTCGTCTCTGA
ACTTTGGTACTCTCCTACTAATAATCATCACGTCGTTCACTTGGTGCAGAGAGCAGGTCC
TCTCAGATGGTTATATAGTGATGCTGCATTCTGTGTTTCTGGCGACTGTTGTTCCTGGAA
GTCAGTTGTACCCCTGTATCACCAAAGTGTAACAGATCATGAGTAGCGTATATATCCTGC
AAGTAGCAGTTGGTCCACGTGATATTTCAACCATCGATGCCTCCAATTGTGGTGTTTGAA
ACAAAAACTATTCTGTACCATGAACACGGAACTGAAGACTGCATTTAGTAGTAGTAACAA
TTTGGTAGTACTGTCAATGTTGCTATTCGGGCTAAACTGGTGGTCGAACCGGAACACGTA
CGTTGGTACTTGGTAGTATAGTAAGACGGAGTGGGTAGTGGCCATATAGTAAGTACTGCT
CCTTTTTTTTTTTGCGAGGGAAATACTGCTCCTAAACGCCTGTTTGGCAAGCAGGAATTT
CGCAGAAACCACTTCCACATGCCGCATGAGCCAACGAGATCTCTCACATTCTGAACAAAC
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CAGCTAGATCGAGTGATGAGTGCAGACCCTGGGCAGGCAGTAAGAATGGGCCGGGCCAGC
GGCAGCACGAACGTATGGTGTACTCAGATTTGGTCTTATAATTTGTTCTAAAAAAGTGTA
TTTTTATCTTTCCGATACACTTTAAAGTAAAAAAGAAATGATTCTCTCTCATTATACGGC
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TGGGGGTTAGATAATTAAAGAGTAGAGAGATGGTGGCTTGCACATTTTCAATGTGTTTTT
TACTTCATTTTATAATTTGTTCTAAAATATCTATATGTACATTTTTCATCGAACAGCTAC
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AGGAAGGAAGGAATAAACGAAGCTTCCTCCCTCGATCTCCCTCGTCAAACAAGCAATGGC
CGGCTGGCTGGCCATGGCTAGGCAGTAGGCACGCACCTTTACCTTTTGGTTCGCCCCGCT
CTCCTCCTCCAAAGACCAAAATCCAAAGGGCGGCAGCAAAAGGGCGCTTGTCTCTTGCAG
AGGGGTGGGGCCCACAGACCGGGGGCGAACCCGAGGCGAGCCGGCCCGGGCCACCAGGGG
CCTGGCCCGCGGGCCGCTTTGCTTTGGTGAAACCCAAGATGATTTGCCTCGGGAGTTGAG
CGCGCGCGCTCTCTATCTCTCTCTTGCGTAGCAGCAGCAGCATGCACGAGCTTTTGGAAC
TTGCTCCTGCTTCAGTGTATGGCTCAGGAAGAAGCTTCCTTTGAAGTCTCTGCGTCTCGT
CGTTCGTTCGCCAAATAAAGGGCAACCCTAGGGTACTGGGCTTCAGTAGCTAATTAATTA
ACCTGCATCTGCTTCCGTTGCTTACCCTTTTTATGTTTGCTAAAGGCAGGGGGATGCGCA
TAGGCTGAAATGCACTTACAGGACAGTAAGGGCATCTCCAACAGTTTGTTGGTTAGCTTT
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GCATGACACATCATTAAAAATCCTATGTGTTAAAATTACCAACAACTATCTTACAACCAT
TGGAGATGCCCTAAGTAGGAGATGCGGTGATCTACGTGCTGACTGCAATGCAGGGAGTAT
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GTATCATAGGTAGTATCATGCATATTAACGGGGCAATTTTGATGAGGTGTCATAGAATTA
AATGAAGAAAAAGAGAGAGTTGAGTATCATATCATGATNNNNNNNCATATTAAATGATGT
GTTACTATGTGTCTTGCATGACAATAAATAAACTATCCTTGATATGAACATATGATACTA
TGCATTACGGATGCGGTATCATAGACTAGTATCATATGCATGATACTAACATATGATGCT
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TTGGCTATAAATAACGTGTCATCATCATATAGCCAACAATTGGCTATACTATTAACCATG
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TTGTATTTCATCGAAAAAAGACCAAAGTTCAGTGGCCTATATGCCAAACATTTGACACTC
AACTTCTTTTTTTTTTGGCATAGGCTGGCTTTGCCCTGAAGATTTGCATACAGTACGTAA
CATTTGGACATGAACATGTCTTTTTTGTTTTGTTTTTGCGTTTGCACGTGAACATATATG
ATCCTATGTGAATTCTATCACTCTACTTAATTTAATAAAAAATAACACTGATGAGTTTTG
TGAAAACTAATGAGACTGTATTCTCTCTTGTTTTATTGTAGGGTGTCCACAGATTTGAAG
TTGCAAACCTCAGATTTGTATTCATTGTATTGATTTTATATATTGCATTCAATTTTCTAA
ACTTATGTTGTGGACATGGGCATATTTGTTTTTTTTTAAAACTTTACTATCAATATATTT
TAAAATGTTCAGATTAATTAGACACTTCAAGTAAGGAACCCAAACTACGCACTTTCATCA
TCATCATCAAAAACAAGTCGAAACCTTGTCATGTCCAGAGCCGTCGCCTCCTATCCCAAG
AAATGTTTGGGTTCCTCCTCCCGTCGACACTGTCGTTGGTCCGCATCGTCTCCCGTGGCC
TTAGGGCCATGGAGGCGTGGTGGATCCCGACCCTTTCTGGTGAGAGGGCTCCGCTTAGAT
GTTTATTTGAGTTTTGTTAGGGTTTGTATTCTGCCCAGGAAGGCAAAACTATGGTGACTC
CTTGCAAATGGAATAAGGTTTTCCCCGGCTTTCCCGATCGCGCTTCTAGCATTGTTAATG
GACGTGTGGAGGTATGTCTCCGATGGATCCGTCTTTGGTGGATTTTCTTAGATCTGATCG
TCGCTCGTCTATGTTTCATGTGTCTTTAAGTTGGATCCTTCCGATCTACACTACGCTTTG
CCGGCGCCGGTTGTTGTTTTGGTGGGCTGGTCCTATGAGGACTTAGCATGATGACTTCTC
GAGTGCCTATAATAATGTTTACCCGACTCCGGTGAGGGAGGGGCAATGATAGTGGCACAC
CTTTGGCTTGTTTTAGTGTTTGTAGTCGACACTAGGTGGTCTACGGATCCAAATGTAATT
TTAATCATTTCTAATTTTCATCGTACCGCCATGATTGAAGATGAATAGATCAGAAGTTTT
TTCTCAAAAATAAAATAAATTAGGCACTTCAAGTATATATGCATAAATTTGTTGTAAAAA
CTACTTCTATGTACAAGATCTCAGCATACATATGTTCAGACATACTGGTACACATTCCTT
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GAAAAATAAAATACAAAAAACAAATGCTAACAATGGCGGATGAATAAAAACAAAGAAGCC
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AAGAAAAGGAGTCGGGACTAGGGGCAAGAGCACGGTTGGCATGCGGGGGGGGGGGGGGGG
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