morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_46790
Source Contig contig_46790
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_46790 (8800 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
		No map location
Predicted Genes from contig_46790

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_62635	1	156 bp	None	Available	Available	None
MLOC_62634	4	1393 bp	MLOC_62634.1	Available	Available	LOC_Os12g43940.1, FRAME:+1, EVALUE:6e-31, 13112.m04633 protein ankyrin repeat domain-containing protein, putative, expressed
CDS Structure of MLOC_62635

CDS Structure of MLOC_62634

Contig Sequence (8800 bp)

>contig_46790 8800 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTACCAAACCCACCTTAAGGAGAAGCTGTGCTTTCAAACATTCTGACAAATGACACATT
TCATGTGTATCATTTGTTTCTACCTAAGAGTTTTCTATTGTTTCGTAGATTTATTTATTT
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GAGTATTGCCTCGAGTAGAACTTTTTAGTTCCAGAGAGTATGTCCTTATTTTATGCAATG
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AAAGAGACCAACATGTTCAAAAATCAAAGGCGGTGCAAGGGGCATAAAGAGGAGTTCCAC
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