Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_46721 (6674 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_46721

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62582 4 1260 bp MLOC_62582.3 Available Available LOC_Os06g48020.1, FRAME:-2, EVALUE:3e-141, 13106.m05103 protein peroxidase precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_62582






Contig Sequence (6674 bp)

>contig_46721 6674 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTTAGTTTGAACCGGGGCTAATATGGTTTTGGGCTTCGACCGAAAGACCCATTTTCTAC
TAGTGTGCACTATGCAGTAGCGAAGATAACATGTGTCGTGTTTCTGACTTTGTGTTGCGT
TCGCCATGATTAACTTTATTTTTGCAATTCTACATGAAACAAAGTTGTTGCCGAGTATTT
GGGCGTGTTCCGCCCTACAAACCATAGATCATTCCTCCCCTGGTGAACAAATTCGCAGGG
GGGAACCTCCAAATCTGACGGTCGACATGTATAGGGATCCTTTATAAGTTGCTAGCTAAT
TAACTAGTGTTATTGCTTCAGTTCCTGTTCGTGATGGTGATCGGTCATCACGGCTTAAGA
GTTGAGTTAGGTGTCAATGCTTGAGTCCTTATAATACCCCGCATAGATCATGTTGTTAAC
TGATATAATACCCCGCCGTCGGCACCATCGTTCATATGATTAGGACGGCCGGCCGCAACA
ACTAAATAACTAGTATTCTATTCGTTCCAAAATAAATGTCGTTGATTTGCAACGACACTT
ACATTGGGACACCGAGGGAGTACTTGCTACTCGGGATTGCTACATGATTTTGTTTTGTTT
TCTGTTCAAGGTTTTATTGTTGTCGTACATCGTCAAGACTCTGGGTTATCTGCATTGTGT
AGTAGCTAAGATAATATCATGTGTCATGTTTGTGACATTGTGTTGTGTTTGCCATGATTA
ATTTTATTTTCGCAATTCTACATGAAACACGGTTGTTGCTAAGTATTTGGGCGTGTTCCG
CCCTATAACCCGTGGATCATTCCTTCCCTATAGTGAACAAATTCGCAAGGGGGAACCTCC
CCATCTCACGTTCCACATGTATAGGGGTCCTTTCTAAGTTGCTAGCTAATTGACTAGTGT
TATTGCTTGAGTTCCTGTTCGTGATGGTGATCGATCATCACGGATTAAGAGTTGAGTTAG
GTGTCAACACTTGAGTCCGTATAATACCCCGTATAGATCATGTTGTTAACTGATATAACT
GCACGACACAGGTGGAGCTGGCTGATCTTTTTGAAGGATCAGTAGCATGGAATGAAAAGG
CTGGCTGATCATGGGATGCTATTGACCGGCCAATGTAGCGTTGGTTAATAAGGCCGCTCT
TAGTGCTCCACTGTGGCACCATCTTTTATGCAAAAATATCCCAACCAATATTACTCGCGC
GATCTTAATAAAAAGTAGGGTGTAGCTACTTACCAAGTATTGGAATCCATCAAGTAGAGA
GAGCGTGCTAGATGACCTTGTTGAGCATGATCATCACGTGTACATCATTAGGCAGCTAAG
ATTATGTTTGTTATTTCCTAGTCTTACAGATATCTCCCGATCCTTTCATTGTATAGGGGA
TATGGTTGAGATATCCTTGCCCATGTCCTCTATATATGCTAAGGCATACGATCAATGCAA
ATATTGACAACCTACAGACCTATTCAGCATGGCTCAAGAAAGCTACTACTAGCTAGTTTC
TCAAACAATAATAAAACTAAAAAAGAAAGTACATATACATAATACAAGCCATAAATGTTG
AATTGTCGATGTGGCACTAAGAGAGAGTTCTTCCTGCAGATTTGAGTGAGCTAAGTGTAT
GCGATGCTTTCATTTGTATCATAACAAGCTACTCTTGTCGCCGTCGGAGTGTACGTAACA
AGTCATGGTCGTGTCGACGTGTGATGCTTTTTCTCTCTATTTTGTCGTGCTCCTCTCTCC
CTTTCCCTCTCTCTTCCCATGACTAATGGTGCTGACGGTGAGATGAAAGTGCAGGCCCAT
ACCACGTGCTTCGACGAGGTGGAAATATGGGCCAAACAAGTTGGTCTTCTAGGCCGGGCT
ATGGGACGTGGACTGTGCTAAAATCTCAACATAAGAAGACTAACATGCTATAAGTTGGCA
TCACGAGGCAATCGAAACAAACAAGATATCAGGCTACCCGGTAGCCTGAGCTCTAAACGG
CATTTTTGGATCAATATATTGATAGATAGATAGCATACCGATTATAAAAGAAGAAAAGAT
AGGTAGATTACTCTGAATATTGTACATAATAAACTACTAAAGTGAAGGGATTAGATTCAC
TTTTTTAAGTAAAGCAAATCATTATTCCAACGATTTTACTGCTCATTTATTTTCCAACAC
TGCTAAGCTAGTGCAGTTCCACGGGTCGTTCAGCCTTAGTTTGGGTACCCGTAGTCACGG
TGTATCTCGCCGTCAGCGGCCGTCTTGACCCTGACCCTGTCGAGCTTCGTCATGGCGATG
ACGAAGTCGGAGAAGAAGGTGCCCTGGTTGGCCGCGTAGAAGTCCACAATGTGTGGTCGA
GCTCCTGTTCAACAAAGTATCTGAAAGCCTCAACAATTCTTGCCTGAACAAACTGGTCTA
CACCGGATCACGATGAGAAATCATCCGAGACGGCAGCATACCATGCAGACGGTAGACCTG
ATAAAAGAACAACAGCGCCACTTGTTGAGCTGTTTAGGGATGTTTGAGAGACAAAAGGCG
GGCGAACTTTGTTAGTTTATCGATAACCACAAGGATCACATCAAAACCCCAAGGCTTGGG
TAAGACTTCCACGAAATCCCATATGTGTGTGTGCCATGGATCTGGGGGTATGACTTGTGG
CTGAACCAGTCCTGGCTTACGGCAATGCTCTGGTTTATTCATTGTTTGTTTTGAGTGTTG
ACCAAGCAAAAAGCTTATTCACGCGGAGCTAGGTTGCCAGCACGCTCGAGTGAGCTCCAC
ATGGCATTCAAAAATGTCATCTAAAAAATACACCGAGTACATCACTTAGCTTCTTTCTTC
TCATTCCTCCTTTGCATGTATGTGGCGCATTAATGATCACGGTTAACAAAAAGAAAAGTT
AAAATGCAAAGTAGTCATTAATTTTTACCTTGATACCTGTAATCTGAGTTTCTTGCCTTA
TATAAGGAAATGGAGGGAGTATTATGTTGGACGAGTTCTTATGCTCAGATCTGTTCTTCT
CTTAACCTATGAAATGGTGAAATTGTTATTTTAACAATGGGTAAATCTTGTTTTCTCTTG
ATTATGGATTATGAAATTAAAAATGGCAAGCTAAATCATCACATAGAAGTGCAGTTATGA
GCGGGTCCCGTGTTCCGATATATTTACTACACTGCAAAATTCAGTCATTTGGCTAAATCA
TCACAGGATATTACCAAAGGCAAAATCGTATTTTCAAATCAACTGACGGTAGTGGCATAT
ATATGTGTACGTGGTGCAATATTTCAGTGACATATTTGCGAGAGGAAAATTTGGAATGGC
ATATGAGGGTATGGGTAAACTTTCAATGGCATATATGGGATTGACCCTTAAACATTTTAT
AGTCCACCATTTATAGACAGCGATATGTTGAGACAATGAGAAATCTTCTGAGGCCATACA
AGTATCTAATTTGGATACCGACAGTCACGGCGTATCTCGCCGTCAGCGGCCGTCTTGACC
CCTACCCTGCCAAGCTTTGTCATGGCGACGCTAAAGTCATAGAAGAAGATGCCCTGGTTG
GACGCGTAGTAGTCTACGGTGCTGCGTGATCTCTCGTCTGTGTACAACACCTGGTCGGAG
CCCAGGAGGCCCCTGCCGTTCTGCAGGTGCTGGAAGTACAAGTTGTCAAATCCCACCGGT
GTCACGTCGTCCAGGAATGCGAAGTTTTGCCTGGCACAGGTGCCCTGGAGCTGCGCGTCA
AAGCTTGGGTTCATGCTCGGGTCCTTGCCCCTGGTCCTGTGCTGGAAGAAGCTGCAGTCC
GCCGCGCCCAAGGTGTGGGCACCTGAGGGGGTGGTAGATGATGGTGAACAACTGGTTGGC
CGACGTGATCAGATTCACAAGTTGATGACATTTTTTCAGCTGAATCACGTACCTGATAAT
GCGATCATGTCGGCCTGGGAGAGGCCCAAGGTTGAGAAGAAGGCATTGAGGCTGTCGAGG
TTGTCGTCGCCGTGCGGGAGCGTTACGTTGTTCGTCGTCGAGATCTTCCCATCGTACCTG
CCCAGCTCCACCGTGTAGTTCGGCCCTCCGCTCTGCAACACATTGGTTCATGCATGGCCG
TCTCATGGCGAAGGAAGATGGTGGTCCAACTACTGCATTTTATTTGGAATAACTGGCCAT
TGCGCAAAAGCTAGACGTGTTATGTGCTAAACTGATTTTGTTGATAACAATGTGCTATAG
TGTGAGTTAGTACTAAATTTGGACGTCAATTCAGCGTCACTCTAAAGCTATAGTAGTACT
CCCTCCGTCCCAAAATNNNNNNNNNNNNNNTAGTACAATTTTATACTAGAGCTAATACAA
AGTTGAGACAGTTATTTTGAGACGGAGGGAGTACATGCCAAGCTTTTGCTTTATTATGGC
TGGATGCTTTCTGCTATGCCTTTGTTATGGTTCAACGCTTTGTTGCTATACTTGGCTGTA
TGCCAGTGTTTACTTTGTTATGGCTGTCAAGTATACATGATATATCATATATGTATGCAT
GTCAATTGTCAAGTTTATCTGTATATATGATATTAATTTGTTTCACTATAGCTTGGTTAT
CGATTTTCATAGCTTTTGGCTAGACCAACACTACCTGGAAGACGGACTCTCTTGCGGCGA
GGGCGATTATATCGGCACAGGACACCTTATAACGGCACTGAGGGTCGCTGTCCACGGCGG
CCTTGGCATCCAGGATCGTCTGGAAGCCCTCCGGCTTCAGCGAATAGTCGTCGCCGGTCG
GGCTGACGATCATCACCGACGCGTCACAGCCCTGCACGCTTGCAAGTGCCGGTGAGTCTT
GCCCATAGCCATCGATTACTTGCGTCAATGTGTAGCACATATACCATGACGGCGCAGTCG
TGGAAGAAGAGCCTGAGGGTGGCGGGCGCGGAGATGGGGGACTTGGCCATGGACTGCTTA
ACGGAGTCCCGGACAATGCCCTCCAGGTTGGGGCAGACGCCGGCGTAGTAGTCCGGCCGA
AGCTGCGCCGCCGCGAACGACGAGAGGATGGCGACTTCGGCGAGGACGACGATGGCGGCG
AGTGAGGCTAACGCCCCGAGGTTCGCCATGGAATGGATCGACCCTTCAAGCAACTGCTTT
TTTTTTTGTTAAGAGTGCTGCTTTGCGTGATCTTCTACGAGAAGCACTACAAGAAACTGA
TGGTGAATTCCACCCTACTCCAGCATATATATCCCACGGTCGATCGGAGCCGCGCGTGCG
TCCACCCGCAGGCGTGACTAAAGCAAAACTGCAACGAAGCTCACTCCAAGTACGATTGCT
TGTCACGCCACGATTACGCTGGACCCTTACTGAAGGTGACAACTGGATTTCTCTTTTCTC
TAGAACATACTTTCAAAACCCTTCAAAAGAACGTACTTTCAAACTGCCCGCGTCGTCGCC
GCCAAAAGTGTTCACCAAACATACTTCCAAATTGCATGTGCCCACTTCAAAATCTGTCTC
ATGTGATAACGTACTACCTCTATAAAACGTCTTATATTACTTTACGGAGGGAGTACAAGT
TAAGCAGGATTTCTTTAGTGCAGGTTTCGTTCGTGGATCGGAATGATAAAGACACGAGGT
TTTGGAAAGATGCGTGGTGCATGGACAGCATTGCCCTGCCTTGTTAATACGTTGACGGCA
GGTAACAGATCCACATGTATGAACCAGATGTCTTATGTCCGGTATATACCGTGTTCATTC
TTTGTATGCCGGGATGGTCAAAGAGTGTTACATGTCTCACACAAAATACATTTGGAAACT
CAAAGTAACCACTATAAAAAAATCAATATGTTGGCGACGAAAAACTGGCCAGTGCACATA
TGGCAAGACAGTGAAAGGTGTTTTACTATAACCACGATAAATCAACACACCACTTATTTT
CTCATGTCCTTTCACTCGGTTATTATAGCGCACAATTCATGTAAATTTAACCTTCCACCA
TGGGCGAGCATAACAAGCATGCTCCGGAGCTTGTTACCACATACTCACACTAAGCATAAA
GCCTAGATCCATCTAAGAGTATGTGTTTTATGTTGGAAAAAATATGGAATTGTCATAACG
TTTTCTTAAACAGACGCCTCGTGCAGGCGCTCCACAAGGCGCGCGCGTCGACGACAACCT
GCAGGATTCGCACGGTGTCGAAGGCCCCGGAGTGCCGCCGCCAACTCGTCGTGTCATGTT
GATCGTCATATATGGCACACTGTTGTGACTCATATTACTGCAACAAAATTGTGGATGACC
CAAGGCCGCACGGAATGGTGTGCGGGAGTTAGGCCAACCAAGATAGTAGAGTACATTGGG
CTAGGCATCTAAGCCCATAGTCTAATTCTCAAATAATAACTAACGAGGGCAGGATTTGCT
TAGTAAAAGACGGTTGTTTGATTTGGTAACCCACCTAAATCATTCATGTGTATTAAAAAT
GTTTGTGAAAACTAAAAAATGTTTATCATGTGTATTAAAAATGTTTGTTAAAACTAAAAA
ATGTCACATTTCAAAGAATAAAGTACGTGACAATTAAAAAATGTTAATGTAGCTCAAAAA
AATGTTCCATGCATTAAAATGTACTCCCTTCGTTCCTAAAAATAAGTCTTTTAAGAGATT
TCACTAGGAGTCTACATACGGAACAAAATGAATGAANNNNNACTTTAAAGTATGTCTATA
TAAATCCGTATGTA