| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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| No map location |  |
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Predicted Genes from contig_46710
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_62570 |
5 |
1198 bp |
MLOC_62570.3 |
Available |
Available |
LOC_Os01g49900.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-142, 13101.m05194 protein peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial precursor protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_62570
Contig Sequence (13730 bp)
>contig_46710 13730 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCGCTGTAGCTAGGACTCTGCCCATTTCATTCGTACCCTACACATCTANNNTCAGGCTT
ATACCCACGACAGTACTAATTCACGAAGAAACAATCTTGTGCTAACTACTCACCCATAAA
GCATAGTCATATGAGATGATTCATTATAGTTGATCCAAAATCAAGACAAGCCACCGTGAA
GTATACCACACATGAAACCATAGGAGAGTGTGCATGTTTATCCCCATAAGTGCTTTGTTC
TCCAACGGTCCATAGCTATGTAAAAACAACTTGGAAAAATTGGCTCATTATCTTATTATA
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AATAGTGAGCATGTAAGTGAAATCTACCAAAAGGACCAAAAAAATATTAAAGCGACAAAA
CTTGTAGTAGGAAGAAGCACAATTCCTCATTTTATAACTAATTGTAATATTTATTCAGTC
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AAGCATAGCTTAGAAGCCAAAATAATGGCAGTGCAAAGAAATTAGGTAAAACCCATCTTC
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GGGAGCAACCATAGATGGTGGAAATCTGAAAATTAGAGCATAAAAGAGAAACAAAGAGGA
TGATGTGAACCAATGATGGATTAGTCTTGTATAGCTCGTGATCTACAAAGCAACAGGGCC
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GTGCAACTGCTCTCCTCCTACCCTCCATACGCAACTTGACCGGTGGCATGGGTGGGCTAG
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GTTTCGATGTGGCATACGCGAAAGAGCGTGCAATGTGTACTTCTTAATAGGTTTAATCTA
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TGACCACTTTAGTTAAAAGAATAATAATAAAAGTGGTATGCATTAGAAGTACTAGATCCC
GATTTGTAAGATATTCTCAATAACACAAAATAGAGAAAAGTTTTGATAAGTTTGCCTCTC
TAAGGGTAAAAAAGAGTTATGTCACTTGACTGCTGGATTACCTTTTTATATTATCTTGTT
TATCGGGCTATTAATATCATTCTCCATCGACGTAAGACTTGTGTTATATAGTTTTATGAT
ATAAATACTATATTTTACTTGTTGGTGACATTTGAAAACTCACTTCCCTATTTGTACCTA
ACAATGACATGCCTAAAAAAACATGTAAACTATTGCCTAGTGATGATACACTATCAATAG
AGTGATTGTTGATTGTTACTATTACAACCACATACTATACACCTTGTAACCTATGGTCAT
TTTAGGGGTCTAAAACATGTCAATATATGAATCCGTAGTCCAGACGAAAACGAATTTGAA
GAAAGATCGCTAATTGGATTAACTTCTCTGCTTGTGAAATTCGTAGTTTTTTTTTCCTTT
GAATGGTTTGGATTGCTTACCATACGAAGTAGTTTTGTTTTTAGAAGCCTTCAAAGAAAA
GGGTTTGTTTTTAGTAAGTGAAATAAGTCTTGTGTGTGGGGGGGTTGAATTGGGCCCAAT
TAAAACCTAACCTAAGAAGCCCAGCGTTCCTCCGAGTTCAGGCCCCTGTCCCATCCAAAT
TACTACTGGTGCCCAATTGGTGGTGCCGGCGACAGCGGCGGCGATGCAGCTGCTCTCCGG
CGCCTCGGCCTCCCGCTTCCCCTCGCCCCTCCCCTTGTTCGCGCGGGTAAGGCCTAGATG
TGTGTCGCGCTATTCCTCCGCCTCCGCTTGCCGGGCAGCCTCCTCGTCAGCTGCGCCCGT
CGGTGACGGCGGCGCGCGGAAGCCGTGGCTGTTCGTTGGGCTAGGGAACCCCGGGAAGAT
GTACCAGAGGACTCGCCACAACGTAAGCTTCCGTACATGCTCTATTCACTGTAAAATCCA
TCATTCTGCTCGGTGGGATTGTGGAATTATCCTAGTTACTCGTGGGTTGAAATGTTGAGA
AATGGTACATATTGGAGTTGGACGCCAAAATAGTTGCACGCTTTGATTAGTGAATGGTGA
GGACTTAGGCGGGCGGAGCCAGGATCTGGACATGAAGGGGGCGAAAAGCCAATGTTCACA
ACAGTCACTGAACATCACTACATCTTAAGTCCCGCGGTTGTGTCGTTGACAAATCTTCAA
AATATATATCTGGAACTAGAACAGAATGTTACATTTCTGCTAACTTAAATTGAGCTCTCC
AATCACTTGTGTTAAACAAATTGACTATTTTAATTTACCAATATAGACAATCATGTAATG
TCGAAGAAAACCGTCTTCATTCTGTTCAAAAACATGTTTTACTTGCTTAAAATAATACAA
CAGTCAAATCGCAAGTGAAGAAGCGAATTTTAGGTTTAGATGGTTGCAACCTTCCAGCGA
GATATGTGCAAGTTTAGACTCAAATTGAGCCCATTCTTGTCTAGAAAGGACTACAAGATA
CAAAAATCCACCATTGTGCATATATTAGACACATCAAATTACTCATATCATGGACCCAAA
AACGCACAAGTTGTCAAAAGCTCTATTTTGTACGCAATGCTAATTAACCAGACTAAGATC
ACAATTCATGAAGAAGAAAAATACCGATGCATAGCTGTACCTGCTGCCAGTATCTCCTAT
CCTGGTCATCTGGCTAGCGACCTCTAGCTGTATTCTGAATTTTTGATCATCTAATCTACT
TGCCTCTAATAATATCGGGACAGCAGACTGTAGACCAGTGGATGACATCGTCGTCCTGGA
GATCTGCCGCCATCGCAATGGTAAACGCCCTAGCAGGGCACGCATGACGGTGGATGGTAT
GAGCGGCATCCGGCGGCAGCGGCAAACGCCCTAAGCAGTTCGGCAGAACACACACATATA
TAGATCAATGAGTCGAATGGATCTAGTACTACATTCTAGGTTAGGCAAACCAATCAATAG
TCAGCCACAACTATGCGCTTACATGGATGGGCTATTGGGCTTTGGCCTTCTATATTCGAT
GTAGTGGGTTCAGTGAATAAACTTTTATGTGGGCTAATGACGCAATTAGCAACGGCAATT
AGCGTTGTACAGTATACATCCAGCAGAAAATGGTTGAGGGGGGCGAGCGATTGGCAGGGT
TCTAGCCCCTGCTCGGCCACCCTTGTCTCGGCATGAGCATGTGGTATATGATTGTAGGAA
CATGGTAGCAGCAGTTTTGTGAGTGTAAACCTGCTTTTTGTATTAGCTGGCCGATTGAAG
ATATTGTCTTTGTGATGGGCTGTTAACCTGTTGTTGATTAACACATTTTTTTAATCATGG
TGGTTATCAGAAATTTCATCTTATACTATTTCAGTATGACAGTATCCGTATCTGGATGGT
CATCTAGAGCAATCACTACTTTTTGGGTAAAGAATTTGGAAGAACAGCTAAATGTCCTAG
CAAGATACTTGTTTATCCAAGGTCATTATGCTATAAAAGTATATATTACGAAGGGTACTG
CACTTTATAGGCAGCAAAATTTGTTATTCTACACTGTTTGTCATTTGGTTTAAGTTTGCT
CTTGTTTCATACTTTGTTGTATAGATTTGAATTGCACATAACTTCTATGTACTCCCTCTG
TTTCTTTTTAGTCTGCATATAAGATTTGGTCAAAGTCAAGTGATACAAAGTTTGACCAAA
TATATATCAAAAAATGTCAACATCTATAATACTAAACCTATATGCTATGAAAATTAATAT
TATGGTGCATCTACTAATATTGATTCAATATTATAAATGTTGATATTTTATTCTATAAAT
TTAGTCAAAGTTTATGAAGTTTGACTTTGACCAAATCTTATATGCGGACTAAAAAGAAAC
GGAGGGAGTACAACATCTCTATTGAAGTTAAGGTCTTATCCATTTTTTCACAGGTTGGAT
TTGAGATGATTGATGCTATAGCAGAAGCAGAGGGTGTATCACTCAGCGGTATGCAGTTCA
AGGCAATGGTTGGCAAAGGTAATATTACCACCAAAGTTTTCAGGATAATCTATACCTGAT
TATTTAACATGACTAGATAAATGTTACTCCTTTTAAATTCTGTAGGCGCAGTTAGACATT
TGTAAAATTCTTTGTAATCATTCAGGTCGTATTGGAGATGTTCCTATCATGCTTGCCAAG
CCGCAAACGTTTATGAATGCAAGCGGTGAGTCTGTAAGTATAATGCTTGGAAAACAAACT
TGAAACTACTTCCGTTGTTCCTTTGTTTGACACCATGAATTGTACAGGTTGGGCAGCTGG
TTTCATATTTCAAGATACCACTTAATCAAGTTGTTGTGGTAAATGTTAATCTTGATTTGG
TTACTTGTATAATAGATTGATATAATTTGGTTCCAACATCTTTCGTCTCTTCTCTGCAGA
TGTACGATGATCTGGATTTACCCTTCGCGAAATTGCGTCTACTGCCAAAAGGTGGACATG
GCGGGCATAATGGGTACTCCAGTCTTTTCTACTTCTTTAATGAAACACATTTCCTGTATA
CATACATTACCTATTGTCCCGTCCTTTGTTTTACGAACTATAGGTGAAAGCCTTATGAAT
TTGGAGGCATATAATCGCTAAGCACTCTTAAGTTTAACTAAGCAAAAAACATAGAATAAT
CATACACTTTTTGCATCTGTTCTTTGAACTCAGTGAAATGTAATTGCATTGTGATCTTAA
AAAATGATTATGAGTTGTAAGGTTCCGGGCTGTGATGATGTTATGTAAGAGTACATGGTC
CACCCAATGCTAATTTAGTGAAATGATTCCTGTGATCTCTTAATTAAGAGGTTTTGAATT
AGGAAGATAATGTATCATTTTGCTTGGTCTTTAAGCCAATTGGAGATATAAGACCTATGA
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CTCTGCCTAAGCCTAGTACCCAACAGACAAAATGCAGCAGGCGAACGTAACTAGCATGCT
GACATATGTACATTTTTTTTTAAAGATCCAGCATCGCCGGCATTCATTGATAATAGCAGG
AAGCAACGGAAACAACAAGGTGGTGAAGGTCCTAGGACCAAAAGATCCGAAGATCAAAGA
AAAAGAAAAATAGCAGCCCTAAAAAGCTGCAGCCCAACACTCCGAAACAACCCACACTAG
GCAGCGCAGCTCCGACTTTGACGGTGAACAATGGTGGAAAACAAGGCGAGGTTGTCGTCA
CTACGGGTCACCAAACGAACCGCCTGTCACGCTTCATCGTATACCACCGGTCCCCACCGC
GGCTTCGACTTCACAGCAACAGACATTCGAGGCACACCCAGGACACGCCGAAGAAGAAGA
GCCGGCTACCAGGACCAAGGCCATGCCTCCGATATTGCTCATAGCCGTCATAGTTGCCAC
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GTGCCCTAAAGAGGGAAACGACGTTGAAGACAACGCCACCGCCCGACCCTGTAGCAGGTA
GGTACTGGGCCTTCACCCGAAGGACTTGATCCGAAAGAACTGGCTATGAGATTTCCAGCG
ACGCCTCCAAGAAGGATAGCGGCGCCCGCAGGCGCCGTCGCCGTCGGCCGATGAGCACCG
GCCAGGCTTTCACCCGAGCAGCCACTCCCGCGCAGCAGGCCGAGGTTGACCCGTACCTTC
ATTGGATCGCGCACACCCCAGACAGCGAGCACGCCACCGCTGTGCAGGGCCACCAACAAG
CCTTTCGGCGACGGGCTTGCAAAGACCAGATCGGGTCCTGCACCCCGCATCCAGCTGCGG
CCGGAGCCTCCCTTCTCCAACAAGCGGCAACCGGGCACTACCAGCAGCCGGTAGTGCCCC
TCCCGGGCCGCCAGCAACAGTAGACCTGGCAGATACAGGCCTCCCTGCACCAGACTGCCC
CGGCGCGCCTGCAGAACCTCCTTGCAGCGCGGCCTCGCCCGCTGCAGCCCTTGTGTGCCG
CCCCGCTCCCTCCAACGCCGGGTCCCGCGCCTCTGTGCCGCACTGCATCACCTTAGATCC
ACACTGCGCCGCATCACCCCGTCTTGCGCATGCCCGTCGTGCCTCAGAGCGTGCCACGAA
CCACCCCCGCCTCGTTCGCACTGCAGGAGGCCACCGTGAGCCCGCCGTCGCATTGTCCTC
CTTGCGGGTCACCAGATCTGCGCCGGAGCCGCGCCCGCTCGCTGCCGCACGCCTGATCCA
TGTCGGAGCCGCGCCCACTTGCTGTCGCACGCCAGATCCGTGCCTAGGCCACCACCGCCC
GCACCCTCCGCGCACAGGCCATCTCCGCGTGTGCCCGCCACGCCTAGTCGGCGCGAACCT
GCTGTGGCTCGCCAGCCAGCTCCCGCCGGGACCCGACGCATCGCCACGTCAGATCCGCCC
GCGCACCTCCGAGAGGGACGCCCCGCTTCCACCCTCCCTGAAGCCTGATTGGGCTTTGCC
GGCGGGCTCCTCGGGCGACGGCGAGGTGAGGGGGACGGTGGCGGCGCCGGAGTGGCTCCC
CCCATGTTGCCAGAGAGAGGCGACGTGGGGGTCTCACGCACGATAACTGTCGACAAAAGA
AAAATCTCTACATCCCGCTCGAACCAAATTCATTTGTACATTTGTTTCTCCCTCGTTTAC
TCATATATAGATCTTATTACTCACAGCAAAAAATGTAAAAGTAATATTTTTTATCCTTGT
GAACCTTTCCTTTGTTATTGTTCTGGGAAGAGCTTGGAAGAACCTAACAAAATAGTTGCA
GTGAACTGGGATTCTTTCTTGTATTTTTTGTTTTGACAAGAGCTATTTTCTCTTTGCATC
CGTCCACCATCTAAAGGATGAGAAGCATTATCAACCATCTCAAACAAAATCGTGATTTTC
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CCATTGTCTGAAATATTCTTGCTGATATTTTTGCAGGCATTGGACGACCACCTGGGAAGA
TGGATCCTGCCAACTTTGTTCTCAGGCCATTCACCAAAAAAGAACAAGAAGAGGTTTGGA
ATGCTTGATAGGAATTTGAAATATTTGATACTTACCGCTTGTCTGTCATGCTTAGGCATC
ATTCACCTATCCAGTGTATATTCTTTTCAAAAAATGATCTTTATATTGTTTCAAGTGCGA
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CTTGGATGCAATAAGAATAATGACACTTGAAGGATTCAACAAGAGCGCTACTTTCGTGAA
CACCGCCCAATCATCCGAAATGCTGAATAGATGACAAACCAATTGATTCATTTTTTGTGC
CAAAGGGATTTGAGTTCAAGTGATGAATTAAAGTTAAGGAACTAGATAGGGGTTTTCAGT
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CTAGTACTGTATGCAAATTAAGAAGCATATTTTCTGCAAATCGACAGACATATACTTTTT
TTTAAACAAGTTCTGTGAGGGAGTACATAGTTTTCCTTGTATATACTCACGTCAATTGAG
CGATCTCGGTTGTTGCCCTCCCCAATGTACGTACAATATCTTCTAACTTTACAAATTAAG
AAGCATATTAGTCTGCAAATTGACAGACGTATACTTTTGTAAATAACAAACCATGTACTC
CCTCCGTCTCAAAATAAGTGACTTAAAAATAATTCAGTTTTGTATTAACTTTAGTATAAA
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CTCTTATTTTGAGAGGGAGGGTGTACATACTCATGCGGATTGAGCGACCTCGGTTGTTGA
CCTCCACTCACTGAATTGGGCGAAAAAGAAAAGAACATGAAATGAAATGACATGAAAGAA
AAGAAAAGAAAATGGGACCAACACTCGGTGTCCATTTCGTTCTCCTGCCAGCGGTATGTC
TGACTGAAAACATCACGAGAAGCCGGATGGAGGCGCCCAACGTCGTTCGCACTGTAGGTG
CGCTGCGGCACATCCCCCGGATGCGACCACCTGTGGTGGCCGTGAGCCCGGGGCCCTTGA
CGTTTCCCTCCAGCCATCCAAAATCGATCCTCAACGGCGCCCTCGGTTCCATTCTCCACG
TTCTAAATGTTTGGGATAATCTCTCGTCTTCGTTCGATTTTCCACGTTTCGTTTTGCCTT
ATCGGCTCTGCCAGAAGTCACAGCTCAGGTACCTTTTGCCCAGCTGAAGCATCGGCCGCG
GCCGCGAGACCGGATATTCGATGAGCCTTTGGTCCTTCGGGAGCGGCGATCTTGGTTGGG
CACCAGATTCAGAGTGAAGGGGTGAAAGTACGTAGACATTATCAGGGAAATACACTTTTG
TTCTTGATTTTATATGCATCCCATATGAAGATTTTTTAAATAATTAGTTAAAAGTCAAAA
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TGAAAAAAAGCCAACATTGACTTCTGGGCAAAAAAATAAAATTTATTTGCTATTATAGAT
CACTATTCATACTATTTTAATCAGATTTTTTTCTTTTAAAAATAAGTCAAAATGCATTTT
TCTTTTTGTGAAATTTTTCTCGCAAGTACAATGAAAGTTCAAGTTTATTTAAAAAATATG
TTTAGAGTTTTCAATTTTTTTATTGAATTAATTTTCTTTTTATATATAGGGTGTATATAC
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GTTTCAAACCACACAAGAGGGTAATAATAATAATTGTTTTAAAAGGAAAAAAGAAATACT
ATGAATTCTTGCCTTCCTGTTTAGTTGGCACTATAATTTATTTCCTTATTTGTGAAAGTG
AAAGTTAGTACTAGCCCTAAATATCTTTGGGCATCTCCGACGGTGTCTCGTAAATCAGAC
ACGCTATTCGTTTGTGGTCCGTCACAGACTATTCAACCTTGTCCATCAATTGTTTGGACA
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CGGACACAATAGTTTTTAATTAATATTTGGATTTTTTGACATAAAACAAAAGTAAAAAAC
TATTGTGTCCCATGTCCGCTCTGTGTCTACGCTTTTGCCACATGTGGGCTTCTGTCTCCC
ATGTCCTACGCTCCTCGCCGGATGTTGGTACGTTTGTGTCTCACCTCCTACCATTACAGT
CCGTCCCTAGTTGTTGAAGGTCGTCACCTAGCCGTCGACGATGTCGGTGAAGGTGAGGTC
AACGATCGAGCAGGACGGACCCGTCTCCTAGTCGTTGCGCTCCCGCACAAACGACGTGGA
CGATGCAAATGACGCCTTATTGTCGATGTTGGCATTGTTTTCGTTCGCCACTGACCGTCC
TATCGCAACATTGGCTTCTACCTGGACGTAACGCTGCCACCGCATGTGTCGGGCGACCCG
GGTGTTGTGCACGGACTTGAAGAGCACCCGATGCTAGTCGACGAAGCATGGGTCCTCCGC
GATTGTGACACCATGTTCTTCCACCACCCTTCACAGGTCCTAGTCATTGTGTCGGCAGAC
ATTGAAGGAGGAGGAAAGCACATGTGCCAGAGGAGAGATCTACCGGAGATGTGGCTCTTA
GGTAATGCGGGTTGTATCATGGGCGGACGTGGTTTAAAAAAGCAGACCATGATGGGCATG
GCAAGCGGCATAGATTTTTTGAAACGCGGTCCCTTAGGACCCGATTCATTAAAAAGATCG
AAGAGAATTGCCCGGTTAATTAATGGAAACCCGGGCTAAAACCGTTAGAACATGTCCACA
AAGAAGACACACGGCCGACCTGGCACTCACAAGACTCACACACACCACCGAGGAAATGAC
ATTGTCAAGGTTGCCTGCAATGTCATCGTCATCACCTTTCCCGAGCAAGCGACTCCGACT
TCGTTGCTGACAACCCATCAAGACCCCTCCGAACGAACGGTACACAGGAACCCTGCCGGC
CGAGGCCAAGCAATCAACTGCACGCGTCAAGGACGAGGCAGCTGCGACTTTGACGAGCCT
TGTAGGAGAAAAGGAGCACGCCTTGCACCGACATAGTCCGAACTGCCCATCTTGTCGTCG
TTGTTGCAGTATTGCTAAGTGACATAGGTTTGAATTCGAGCACCGAAGTGTGTTTCCTAG
ACGTCTCACATGTTCAATGTCGGGCAGGCAAATGAAAGGACGCCTGACTTCAATGCAGTA
GGAAGTTGTTGTGCCGTCCCATTCGACCACGTTGTTCTATGCTAGCATTGAACATGTGTA
GAGAGCGGTCGGACGCAGCGCATGCAACTCTTTGGGCCATGCGCCTATCAACTACATTGA
TCGGTCGCGTCCGCTCTGCCCCGACATGAATGTGGAGCCCAAAGTGAAGGCATGGTTGAA
GTGGTTGCACAAGAGAGGCTTTTGGGTAGATAGTGTTATCACACACGTGCGTGGCAGAGG
TCCGGATGCCTGCAACCTCCCTTGGTTTGGTGCCAGTTTGCGGGAATTCGGACGCGCGGG
CGCATCTTAAGATGTATGTCGCACCACATTAGATGACAAAAATGATTCAGCTGTGTGTGC
ATTTCGAGGGACGCCGATGGAGATGCCCTTAGGGCATCTCAATGCAAACCATCAAATCGC
CCACAAATGTCCGGATCAGGTTGTTCAGACGCACTTTGACATCCAACACGGTATCCCATT
TGTCTGTGTACGTGTTCGGCTATACAAAACTCCACAAACCAGCTTGAGCTTTGAGGGCGT
ACGGTCTGCCGACGGTATGCATCTGACGCCTCGATCTCACCATAAACCCCTCTCCTCGTG
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TATCAAGACTCTGACATCATCCACACCGCACCACTCCTCTTTGCTTTGGCGCCGCCCACA
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CGCTCTCCAGGGCCATCGACCTCCACGGTGGTTGGCTCCTCTAAGAAAGAGGAGACCGTC
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ACAATTTCTGCTTGTTCCATGATATTTTGGTGACATTGTTATATGTTTTG
