Map Locations of contig_46536 (11840 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_46536

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62411 1 1970 bp AK354787 Available Available None





CDS Structure of MLOC_62411






Contig Sequence (11840 bp)

>contig_46536 11840 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTATGCATGCACCGCTGCAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTCTGCCAGCTAGTACTGCCTCCG
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GATCTTAACCATCCATGTTCTGTTTCCTGTAGAGTGATGCGTACCAGGCAACAGGGTGCT
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CTTTGTGTGCCGACACAATGTAGGATCCGAAGGAGGGTCACTGGTGGATGCAGTTTGGTA
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CGCAGATGGGCAGCGGGCACTTCCCGGAGGAAGGGTTCGGCAAGTCGAGCTACTTCAAAA
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CCCTAGTGACTGAGTGAGAGCGAGTGTGCACCATTGGAAGTGTAGTGTGGTGCACCATCC
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AGGTGTCATGTGAATGGGTCCTGCCTCCTGATTTTTCTTTTCTTTTCTTCTTCCTGTTTC
CCTGTGTCAATCAAGGCTTCTGAAGAGAAGCATGGCATGTGGATGTGGTGGTGCACCAGT
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GTTTGTTTTCCAACAAAGCTGTTGCCTGCGCCCATGCTGCTTTGTTTGTCCCAGCTTGGC
CGCCCGGGGCAGAGCGGCCATGCACTCACCCACGCACCGCCCGCAATCAAATGTGCATGT
CTGACTGTGCGTGTCATGGGAAGATGCTGGAAATCATGTGCTGCTACCACGGATCCCCAC
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TCGTCACCTTGCCGTTCGTCGCTCAACTTGCGCGGTGGCGGCAGCACCGGCGAGCTGTCT
GCGGCGTTTTCCGGTGCAACATTTTTTGCTGCGCATTTCGTTGATCGGCCATCTAATCTG
TGATCTACGGGCGGCACTGCAAGGACGAAGGGTTGGAGTTTGGTAGGGGTGCACGGTACG
GGCGGGCAGTAATTCTGAGTCATGTGTTGGTGGGCTCTCTCTCATCTGACGAGAGATCTC
CAAGGCAGCGTGGATTGGAAGGCGATGGGCAGATGGGGTCACTCGCATCCGGTCATTCAT
GCTCAGATTTCAGATTTCAGATGATGATGATGATGCGCTAGAGGAGGCAGACACGGGCTG
GAGGAGGCGCTCACGTGCCCAGCGGTACGCCGGTAGTACCGGTGACCAATGTACCGTCGT
TGTGCTCTACCGACCTCTGAAAATGATGCCTGGTGTGAGCAGAATACTGGCGTACGCCAT
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TGTCTCCCTAAATTAGTTCAAATGTTTTTCGTGATCATCTACACAAAAAAGAAATCCCTT
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CAGCTAATTAGTATTCTCTTATACTACTTCTATATGCATGCGTAGTGTGAATGCTATTTT
TCAACTCATCTCATAACCAATCAATAACCACCTAGATTCGAGAGAATTTCCAAACACGCC
TTCTAAATCGTGACGGAGGGAGTACTGTGACGGATTCTATAACAGAGACTGAGTATATTG
TCGCTTTATAAACAACAATAGATGTTGATGAATCAAAAGTTCACTTATGAATTTGGTATG
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GCCCAGAACTAAGGTATGGCGGCTGCCATACGTTTCCCTCCGGGGGAATCAAACCATCAT
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GGTCTGGTGGTATAAGAGATTCCCCTCTCGTCATGTGGGCTGGTGCAACAAGATGATTAA
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ATCATATTTGTGTTGCCGACGATGGCTTTAGTGCTCACACAACGAAAACACGATTGAATA
TACAGTCACTCGGAATAAGATGAAAAATATGTTGTTTCTCCCCACGAGGTTTTTCAAAGG
TGAGCATGTGTGGTTAACGATGTTTTGTTTCCTCTCAATTTGGTTTTAATTTAATGGATG
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GATTCTACATATTTTTTTAATCAAATTTCATATATAACATGTTAAAATCGAAGTGACGGT
TTAAAAGATATGGATAATTTTGTTTTAGATAAAATTTGGATTGATTAACTGAAAAGTTAG
GTTTCTTTTGTTAAAATACGAAGTGCGGGTTGATTACCTGAAACATCAGAGGGTTTTGTG
AACAATGCAAAAAACGATTCGCTTTCTGGCTTAAAATTCGGACTACGGGTTGATTTCAGG
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GACTGCGGGTTGATTAACTGACAACGGAAAAAACGTTTTCCTAAAAATGCCACGACGGAC
GACCAGATACCATATTTGCTTTATTATTAATAGCAAAATGGCCCGTGCGTTGCCACGGAA
GAAAAAAAACAAAATCTTCAACGATAATGAACACATTATGATCACATATCATCGCTTGAT
TTAGAAATTTTGTACACAAATGCAAGAAATTGGTTCTTCTTTTAAATTTATTCACAATGT
AAGCAATCTTTACATTTTCAAAAATCTTGGTAACTCAAAGAATTACTCTGAATTTCAAGA
TTTTTTTTAGAAAACATACAATAATAATCCGATGCATCCAACAATTAATTATTCAAAATT
CACACAGGTATATTGTCACA