Map Locations of contig_46511 (8820 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_46511

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62385 1 275 bp MLOC_62385.1 Available Available None
MLOC_62384 10 2213 bp AK376001 Available Available None





CDS Structure of MLOC_62385






CDS Structure of MLOC_62384






Contig Sequence (8820 bp)

>contig_46511 8820 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTACTCTAAGCATGGTGTGCGATGTTAAATGTTAACATGTACAATGACCTCTCTGTTGAG
ATTTTTACTTAACAATGTGAAGATTATTTGATATCCACTTCATTATGGCTTCCTAAGACT
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AAAACATGTATCCAAATATATTCAGGGCAACTCATGCTTCCATAGTATTTTCAGAAATGT
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GAATCAAAGTGAAGTCTACACCGTGATGCAAACACATCATTTGTTTTGAATATTCTTTTT
GAGTGGTCGGCATTTGTTTTGATATACATTTAGGCATTTGTTTTGATGGACATAGTTTTC
GTTGAATTAAATGTTTTGATAGGCACTTAGAGCTAAAGTGCGACAAGTCACCCAAGGGGA
TGACAATACACAATTCTTTCATATGATTGCGAATGGCAAGCATCGCAAGAAGATAATTTT
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CGATTATTACAGGCAGTTGTTTGGGGCCCTTGAGGATAGTTTTGTCTCCTTAGACGAAGC
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GGATGGCTTCCAGGCTGAGTTTTACAAAAGGTGTTGGCATATTATTAAGGGGGATTTGAT
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TCTTCTTAACGTTTGTTTTAAAATATTTACTAAGGTGGGGACTAACAGGCTCACGGAGAT
TGCACATAGAGTGGTGCAACCTACTCAAACAGCCTTCATGCCGGACTGAAACATCCTTGA
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GGCTTTGCGGTTGAAATGATTCGATCAATCATGGAGAAAGCAGGTAGAGTCTTTCACGCA
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GACCATCCTGATCGGAAGAGCTAAAGGAAGTGGCCAAGTAGGTGGTCTTGTCCCTCATCT
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CATACCTATTCACCATCGCAAGCTCTCTAACAAGGAATGTGAATGTATTGAAGATCGATT
TGAAAAGAAACTAAGCTGCTGGAAAGGAAAGCTTATGTCATATGGAGGCCGACTAATTCT
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AAAGTGAAATCAGCCTTCTTCCATAGGACAAAATATATTGTTGGTAATGGTACTTCTACG
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AACATTCAATTCAGAAGAACTTTAACGGGAAACCGTTGGGAAGCCTGGCTCCATCTTGTG
AGAAGATTGATGGATGTCCACCTTTCTCAACAGCCAGATCAGGTATACTGGAAACTAACC
AAGAATGGAGTGTTCTCGGTAAAATCCATGTATTTGGATATGATTAACTCGGTCTTTATC
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TCTAGAAGATGTAGCTTCTATGATCATGATGAATCTATCAAACACCTCTTTCTTGACTGT
CCATTGGCCAAAAGTTTATGGTGGTCCGTCCATATAGCTTTTAATATTGCTCCTCCTTCT
AGCATCCACACGTTATTTGGGACGTGGCTAAATGGAGTTGATATAGAAACCGCGAGACAC
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TTTAACAGAACAACAAATTTTCATTTCTTGCAGGTTATCTTCCGAGCCACTACGTTAATC
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TAGCGGATACCAAGGCAAGATGAGTCTATAGGCTAATAAATGAAAGATTCAATGTTATTA
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TACTTTATGTTACTCCCCATTGCGAGTAGTTAAGGCCCCCCTCCCTCCCTCAAGGTCACA
GAACGAAAAACGCAACTGCCGCCTGTACTCCAAAAAAGCTAGGGTTCCTGCCTCTCGTAG
GCGTCGCCGCAGGTCCACCTCGTCTCCGGTGGTCCTATGGCCATGGGATGTGGTGGATCC
TGCCAAGGGCCGGCGGGAGGGCTTCGTTTTTAGTCGTTTCTTTCAGTTTTGTTAGGGTTT
CTATCCTACTCAGGACGACGAGACGGTGGCGGCTTTCTGGAGATGGAATAAAGGTCTCCC
CGTCTATCCCCGAGATGATGGACGTGTGGAGGTGTGTCTCTCGCGGATCTATTTTTGATG
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