Map Locations of contig_46293 (7294 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_46293

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62204 1 2205 bp None Available Available None
MLOC_62203 1 1760 bp AK248873.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_62204






CDS Structure of MLOC_62203






Contig Sequence (7294 bp)

>contig_46293 7294 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTGAAATCGCAAACTTCATTTCTTTTTTTGCGTAATTTAATTCATGCTTAGCATGGTGCA
GTTTATCGTTGCTGTGAGACTGTGTTATGATATTTGTCAAAGATTTATGCGCACAATGCT
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TGAAAAAACTTGTCTAGCAGCCATTTTGAGGTATGAGTTGTAATCAACAATCTCGTCCCT
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GAAAGACCAGAATACAACCAGCAGCAGTGAAGGAAGAATGTAAGGAACTGATTAAGTGTT
TGTCCAAATGATGTTCTGAGAATTTCGTCTGACAAAACCTGAATAATACAATCTGATGGC
TGCTGAAGCCAAATCCTATCCAGTTCATGAGAAACCCCTTCTCTAGCTAAAACATGGGCT
ACTTTATTTCCCGATCTTCTAACCCAGGTAACTCTAACATCCTCGATGATTGGACCTAGA
ACTGAAAGATTGGTCCCCAAGTCATTTAACATTGTTATAATTTCTTTATTATCCAGCTCC
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CCTCAGCAAGTTCAGGGTTAGATACTCTTTGGAAAAACCAGGACGCACCACCCCTAAACG
CCCCAATATGATTGCGTAGTGCCACTCCGCTGGCCCCTCTATCCTTCAGCTTCGACAGTG
CTCCGTCCGCATTTACCTTGAGCCTACCAGGATCAGGTGAAGACCATCGTACATCAAGTA
CTGGCTGATGGATCTTCTCCCGACGTTCGTGAATTGACGCCCACTCCAAAACACGAGGGA
ACACCGATTCAACAACAGTTTTAGGGTTGGCAACCTTCTTACCTTCCCTTGTCTCATTCC
TCGCCAACCACAAACCATACAATGCCTGAATCATCACCTCTTTCTCCTGCTCGCAAGCAT
CAGCCAACCAATGCATCAACTATGCCGCAAGCTCATTAGGAGGCCCCTCCAATATCGGTG
GGATCGCCACTGAGGCCCCTTTCTCTGAACTTAGCACTTTCCAAAACATAGGAGAATACG
GACAGGTCCAGAAATGATGCAACACAGTTTTTTCTCTTCCACAAGCACAACAAAATACTC
CTGGCTTGATCTTGCGTGTAAGTAACTCAACGCCTACTGCCAAACCATTCTGAATGAGGC
GCCACAAATGTATCTTGGCCTTTCCATGGGCATTTATATTCCAAAGTGACAACCAACTCT
TGTGCTTGTTTACTGACGAGGAGGACTCTGCCGTCCAGTTTTAGTCCTCCTCAGCACCAT
GCACAAGTGGTAAGCAGATCTCATAGAGAATTGCCCAGATTTCATGAAGTTCCAAGCAAG
AACGTCGCTGCACGCCGGCCCTCCAATGGCCACTTGCTTTATATCACACGCATCATCAGC
AGTAAACATTGTGTCAACTTTTGTTTCATCCCAGCCAGTGCCCTCTGTGTTCATAAGATC
ACATACCCAGGCAATGCCTTGCATGAAAGTTTGTCCAAGAGGTTTGGGGCTGTCCGCTCT
AGGGATCCGGTTCGCATGATGAGTACTAATCGAAGCTCCATCACCAATCCGCCAGATGAC
CCCTTCCCCCGGCAAGTCTCTCCCATGCAAAATACTCCAGAAGGTATAGGACGCTCCTGT
CGGGTAGGTTGCACTCATAATGGAGCAGTCGCTAAAATACCTAGCCTTCTGTACCCGAGC
ACAACATTGATGAGGGGTATTGCAGAATTCGCCACGCTTGCTTCGCCAACAACGCTTGGT
TGAAGGCTTCAAAATTTCTGAAACCCATCCACCCATCTCTATTTTGAAGACACATTTTTT
TCCAGGAGACCCAAAGCACTTTCCTTTCACCTTGGACTGCACCTCACCAGAATTTCGACG
AGACCGAAGTCAGGTTCTGGCATATCTTCTTTGTGAGTTGAAAACAACTCATGGTAAAAT
TAGGTGTTGATTGTAGTCCCGATTTCACAAGTACCTCACGCGCCGCTTTGGACAAACCTT
GCCCCGTCCAGCCGTATACTTTCCCCGAGGAACTCTTCCTAACATATTTGAAAACACCAT
CCTTTGATTTACCAACCATTGTTGGGAGACCCAAGTACCTCTCACTCAGTGCTTCCAATT
CAATTCCTATGGTTTGCTTAAGAGCAACCTTCTCATCCTCCTTGCACCCTTTCTCAAAGA
AAATAGATGATTTATGGAGGCTCAGTTCCTGTCTAGAGGCTCCTCGGTATATTAACAGAA
TTTCCTTAAGATCCTGAAGGTTGCTTTGTGATCCTTCCAAGAAAACAACACTATCATCCA
CAAACAAAAGGTGACTAAGATTGGGGCTAATGCTCCCAAAGTTAACACCCTTGATGATAT
TTTCCTTTTGGGCATTCTTAAGCAGAGCTGAGAATCCTTCCACACAAAATAGGAACAAGT
AAGGTGAGAGCGGATCCCCTTGTCGAAGGCCTCTCAATGGGGTGAAGCTGCGAGAGGCCA
CGCAGCCAGCACGTGCATGAAAAAACTTGTCCCACGCGTGGGAGTTTTGGCTCGTGGTGC
CAAATGTGTGCTAAAAAGCCACATGCCTTTAGGCCCGCAAAATGCTAGAACTTCCTTCCA
TTGCACCTTCTTACCCATCTCTTCCAGCGCACCGCTGCCGCCGCGCCTTCTTCCCCGCCT
CTTCATGCGTCCCGTTGTCATCGTCCCTTCCTCATCGTCAGTTAAAAAGCCGCGCGCCTC
TATGCCCGCAAAATGCCAGAACTTCCTCCCATCGTGCCTTCTTCCCCGCCTCTTCTAGCG
CACCGCTGCCGTCGCGCCTTCTCCCCCGCCTCTTCTAGCGCCCGTTGCCGTCGCCCCTTC
CTCATCATCGGTTCCAGCGTGGCCCCGCCATGCCACCGCGTCCCCGGAGCAGCTCGGGCT
ATCATGGCGTCTGCCTCCGCCCTTCCGGCGTGTATTACACGGAGATTCGCTCCTACGATA
CACGGTTCAGGCTCGGAACTTCCGACACTGCTCATGAGACCGCCCCGCGCGTACGAAGCG
GCGGCGTGGCGCCTCGTGCGGCCTCCGTCGTAGACGAACTTCTCCGACGTGTGGACGCAC
TAGCACGCGAAAGTGTTGGGGAACGACGCATGGG