Map Locations of contig_46241 (9669 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_46241

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62143 4 2316 bp MLOC_62143.1 Available Available LOC_Os07g32590.1, FRAME:-3, EVALUE:0.0, 13107.m03302 protein peptidase, M24 family protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_62143






Contig Sequence (9669 bp)

>contig_46241 9669 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATTATGTATGTGATATGTTATCGTGCTTGTGAAACGCTTAGATGCGCTTATTTCCATTT
TAGGGCCTCGTTCCCTAAATCGGAAAAGACCGCATCTTAGTCGTTACAATGCGAGACGCC
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GGCATGGTATCAAACGCCAGAGATTCTGGCGTCTGGTGGTCCAGGATCAGACGTCAAGGA
CTCTGACGTCTGGTACCAAACGCCAAGGGCCCTGGCGTCTGGATGACGTGGCACATATTA
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ATTTAATACGTAGAAGAAACGATCAAGTGATCTTCAATTTGATCTCTAATCCTGATTTTG
CTGAGAAGTTCATCCACAATCCAAATCAGTACTGGTATGAAAGAAAGAAGGGTAATACAT
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GTGTGTGTATATATCTTTCTCTCTCTCTCGCCATAAGTTGTGTCAAACTCCAATACAATG
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CTTAAGACCATCTTGAGTCACAAAAATAAACTAGAAATTGTTCTTTTGATTAAACCAGGG
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GAATTGTCGAGACACACGACCACTCCCAACAATGGGATCACAAGCAATGCAATATTATGT
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ATTTGCTACAAAAAGGGGGGTTTCATTAGTCTGCTGTATGCTTCAAACATCAACTGACTA
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GAGATAAAACTCATAGCTGTATAAATCCTTGGCAACAACTGCATGAGACAACATTACCCC
TGTCATTTGAAACCCAGCAACCTGTTCATATATTCCTGGCAATAATTTGTGATGACAACC
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TTTGTAAATTTAACCCTTAGCTTACAATAGCAAATTGTTTGCTATTTAGGATTCACAGAT
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CTCCAAACGATATCTAGGATCTGGATGCCAAACAAGCACAACCCACCAACCACCACATTT
ATACAGTATATATCTACATGCTCGGTGGAACTACAGCAGTGAACAGTTTGCTCTATGCAA
CTTAAGGGCCTGTCTGGAACGAGGGATGGTTTTTTGTATGGTAAACCTAGGAAAATTTCC
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AGTGCAAAGGGTTCTTTGTTAATTAGAGTGCACACCTAAACTCAGATCTACTGAAATGTA
ACCAACTCCTGAAGCAACATTTCAGCTTGAGTGTAGAAATGGCAAATTTGTAAGAACCGA
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TTAGAGAGCTGAAAGTTATCCTATATTAAGGGCCCATTCAGCTTACAGGATTTCTAAATC
AAAGAAATTGGAAAAGTAAAGGATTCGGATGCACTCTCGAGTCTCGACTTCAATCCTTAG
GAATTTTCCATGAGGTATCACCTAATGCTAAGAATCCTTAAGCCTTGTGCAATACAAGGC
GCTTAGGGAAGGTGATTAGAGAAATAAAGGAGTGTTTCTTTAAAGCACCGGTGCTTATTT
GTAGAGGGTAGACGCTTAATTTGGTGTCTCTCCTGTAGAAATAGGCACTGTTGCTTCAGA
AAAAAACTGGTTTCTTTTTCTAAGCATCTCTCTAAGCACCTAGCATTGTACAAGGCCTTA
GGAATTAAGACAATATGGACACAATCCTAAGGAATCTAGTACCTTCATTCTTATGAAACG
AATGCCATACATAGGAAAAAATCCTATGGGAATCCTCCAAAAATCCTGCAAACCGAATGA
GCCCTAAGATTCGAGAACAAGGTCTTGTTTATCCTTGATTCTCTTCGGCGTATATGTGGA
TACTTTTGTTGTCTAAGTTTTCAGAAAGAATCATCTAACATATAACAAACATAGTATCTG
TTGAAGTGTATATGTGGATTGTTTAGCCCTTTCAATGAGTTCAGACTTTTGGTTGCGCTG
GCTAGTGCATGAAGCTTAACATGGCATCAGAGCGTAAGGTCTTGAGTTCAAGTCCTGGCT
TTCGCAGTTTATTCAGAAATTGCTGCCGCGTCCCCTACTTGTCCACGTATAGGCCTCTTG
AGCCATACCTCTGAGTCTGTCGACGTGTTGACTTTCCGCGTCACACGTGAGAGGGGGCGT
TGAAGTGTATATGTGGATTGTTTAGCCCTTTTCATGAGTTCAGATTGTTGGTTGCGTTAG
CTAGTGCATGAAGCTTAACAGTATCATGTAGAAAAAATACCTTATTTTCTTGCCGATTTT
TCTGTAGTTTACACCGTCCCTGCAGACAGAAATACCCTTCTCCAAGCATTCTTCAGCTGC
CTGAACCAAATAAAGATCATTTGGTTTCGTGTTCTAATGGATGGAAGAACTTTTTTTTTT
GATAAAAAAGAAGATAGTGTATCGTCCAAATGTAAAAAAGGTCCTTTCAGAACATTAAGC
CTCAAAATTATATCTATAAAGTAGAACAAATACTACAGGGATTTGTTAAAATCAAACATG
CCTTCGGACAAAAGCACCGTAAAACTCACATTAGTGCAAACTGTTACTGAATGGCTATGT
ATTGTGGATGAAATACCTAACAAAGCAATAATAGCTTACCTTTAGGAAATGCTTGATAGA
TTCATCCGCTTCTCCGCATACAAATGTTCTGGAAGTTCCGCCATGGTACCCCTGAAAAGA
ATGGTACGAATCGTGTTAAAACTAGGGAATGTGTCAGTAAAATCCGACTCTATGCCAAAC
ATACCAACTAAGCATATGCATAATCTTAGGAGAGAGAACTTACATTTAGGAACACATTTA
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CTGTGTTGAATCAGGTAGTCCATGGCAGACACACTCATTTACTGATGTGCAGATACTTTT
AGGAAATCCACCATAGCCAAGTGGAGAAGGATAAGCACCCGCCTCAACTATCATATGATG
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TGTTATGACGTGTACACTGCAGAGTCTTCAGATGATTTAGATACAAAAGGATTCTAGTTA
TGTATGAAAAAAAGAATATACCTTAACCAATGTTCCCGCAAAGTCCAGTACACGGGCAGC
AAGTTTGCAAGCAGCTCTCATCCCAGTGATACCTTCTGCGTTGTGTATTTGGCGCACTGC
GGGTAGTTCTTGCGGTATGTTTGCACCCACATAAGAAGGTCTTGGAATGTGTTCTGGTAC
AGGAAGTTGGGGATAGACCTTTCCACGCCTCAAAGGCGGCCTCTTCTTTAACTTCACTGA
GCTTTCCTCTTGTGTCCTTCAAATGTGTAAGGGTGTTTACGGAGTCATCAAATAAGAACA
GAAGGTTAGCTGTATACTGACTTAGAGCTCCAGAGCAAGGTACTCTAGATGTCACACTAA
GTGTGAAATCTAAGGTCAAGACCAATGGCTACGGCTATTGCTAAATCCTGACGACATGAT
AAAAGAAGCGACAACAGAAGCTTAAGCACAGCGTAGTAGTAACGGAAATCGTACTTTTGT
AGCTCCATCAGCTCTTCTTCAACCCCATCAACCCAAGTAAGTCCGCCAGCCACGACAAAG
CAGCGCTTTGGCGTTATTGCTTTACCTACAGCAAGACAGCAAAAAAGAATCAGCTACGAA
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CAGTAGAACAAACCACCCAAGCAATTAAGCTGAGCAGGCTCCTTACCCAAACAAGAAGAG
GGCGTCCGAGGATCTCTTCGATTGATGGTGCACTTTGAGACGAACGGGGGAGCCGACGGC
AGGAGGAATGTGTGGGTTCCGGCCGGCCGGGGTGGTACAGGAACGCCGGAACACGACGCT
CCAGGTGACATGGCCATGGGGATTCGCACGGCGTCGGTGGAGGTGTCGTGGTCGAGGACA
CGGAGCCGGGGCGGCCGTGTTCGAGGAAGAGGAGACCGGCGGGTACAAGGGAAGAGGAGT
GCAGCAGAGAGAGGGGATGTGCGTTGAGGATGAGACGCCGCCGGCACCGGGAGGTTTCGG
CTTTCGGCTATGCGTGTTTTTTTTTCCAGCGCCAGCAGAAGAGGAGAAAAAAAATACCAC
ACTTGTTTAACCCAATAATTACAGGAGAAGAAAAAAAAACACTTAGTTTTTTTGGGGCAA
CGCGCCACCACGGGTGGGTTATTTCCAACGATCCACCACCTTCACAGCTGTTTGATTATC
TTCATCCAGCCGATCCACATGTGGGGCTTCGGCCGGGCATCCAGTAATTTCTGAAACGAC
ACTCGAGTTTCTGAAACAATCGCTTTGTTGCAGTTTTTTTTCACACGCACTTCGGCTGTG
CACCCGATAATTTCTTAGACAACGCTCGAGTTTCTGAAATAATCGCTTTGTTGTAGTATT
TTTCTTTGCGCGCGCTTCGGCTGGGCACCCGGTAATTCCTGAGACAACGCTCGAGTTTCT
GAAACAATAGCTTTGTTACAAAAAAATCATTCCTCTTTCTGCAACAGTGGACGTATTGCA
GAAACAATCGCTTTGTTGCAAAAAATAAATTTTCAACCCATTAATTCCTAAAACAAAGGT
CGAGTTTCAGAAACAATCGCTTTGTTACAGAATTATTTTCCTTCCTCTTTCTGCAATAGT
GCCCGTGTTTGCAGAAACAAATTTCTGAAACAATGAACGGGTTGCAGAAACTGTTGAAAG
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AGCCACGTGACGGAAGAGCAAGGAGATGATATTTCTTGTTTTCATCCGACTGACGGAAAT
CTTTTCCCTTTTTTTGCCGGTGTAAAGAGTTTTATTTCCATATACTAGGGTTACAACCGA
GAGGCAAAAGTTCCTCGATGCATGGTGATCCATGATATAGCCATACAACAATCACACTAT
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ATGGAATAAACTCAGAATGTATCATAAGATGTTTAATCTCAGCTACAAATGTCCATATGC
CGACCAGGACAGGTTGTCACCGGTTAGGGATGTTAATGCCTTCGAGGACTCTGATTGGAC
AATTATAGGGACATCACTATATTGAGCCGTTAGTGCCATACCCTGCATTAGTGCATGCAA
CTCAGCCTCTAGTGTGTCGTTGCAATTAAACAGGCAACGATACGCAGCAAAAATCACACT
TCCATCATGTCTCCTTAATATCATGCCGGCTACCGCCGAGCCATCCACCGAAGAGAAGGC
CCCATCAACAGATAGTGCAACCTGATTTGTCGGTGGTGGTGACCATGGTAGCGTGTTCGA
AACCACTACATCACGAGTAGTCTGACCATCCTCCATTAGCTACATGCACGCTTCCTCGCG
AGCGGGCGTCTCACGCATCGTTCGATCGCGCGAGATTAGGCATGCCTCGTCTGTCGCGAC
CAGGTGCCCATCAGATGTGTGTTCATGCGGTTTTTTTTTTGCTTCCGGCATCCGACTCAG
TGCTTCCATCGTATTCTTCTCCTTCATCTCATTGTCGCGGCTACGCGGGCGATTGCCAGA
TCTGGAATCGTGGCGGAGACGGGGAAACCGGACACTACAAGGACGGCAAGGGAACGGGAG
GTGCAGTCGACGACGAGCATCCTTGGCCACGGTGACGAGCGACACGACACGGGCATAGGT
ATGATCCCCTTCGCTTCGCCATTTCTCTCCCCCGCCGGCATGGCCTTCATTTCATGGCTA
ATTCCTGGTAGTTCCTAGCATTGGATGAGTAGATCCGGGAGGAAATCCATAGTCTACATG
AGTTTTGTTTGAACTTGTGCACAGGGGTTCACTTAAGCCGCCACCCCCTTCATGTCCCCA
ATTGCTGAAGAGTTCCACCTAGGGTTTATTGGTTAGATCTTATTATTTTGGTTCCCAGTT
GTTGCTAGGGTTTATAGTCGAGATTTTGATAGTGGAGAACGAGATTTTAGAGGTGTGGAC
GAGTTTTTAGAGGTAGGGAATAATTTTCTCATATGTGATGCTATTATTTAGTCACCCAAG
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GGGTAGTCAGATGCTTAGTGTTTGTTATATTTCTGTATTCAGATAATTAGTGTTTTTTGT
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TTTTATTTTTGTGCACTCTGAACTAAGGACATGGAAGAAATGATCATTTTTTTGCTTCAT
TGTACTTGGTAAATGTAGAGAAAGTTGGAATCCAGACGACCATCGCGTATGTAGTAATTG
TTGTTGCATGCTCTAATGGTGGTTTATGAACTTGTTTTTTTGTTTATTCATTAGGTCTTT
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TGTATTATCGTTCTTGAATGATGTATATGCATTTATATGATGCTTTATATCTTTTTTGAA
ACTAACTTATTAACTCAGTGTCTAGTGTCAGATGTTGTTTTCTACGTGTTTTTGGCTTTT
CAGGAANNNNNNNNNNAACGAAGTCCAAATGCAACGAAACTTTTTGACGTTTTTTTCTGA
ACAAAACTATGACCTGGAAGCTTTGGAAGGAGGCCAGACACCACACGAGGTGGTGCCAAG
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