Map Locations of contig_46211 (8121 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_46211

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62116 2 3375 bp MLOC_62116.1 Available Available LOC_Os05g48960.4, FRAME:-3, EVALUE:2e-113, 13105.m10413 protein splicing factor U2AF, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_62116






Contig Sequence (8121 bp)

>contig_46211 8121 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTTGTTGCTACTGTTTTTCCGCGTGTCAAGTATTTGTTCCTATGTGCCCTCTCAAGGAC
ACACACACACTCTCCCATCCCACACACACTCATGTATGAGGCATAAGCTCATGGCTCTGC
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TTTATTTTCTTCCTCCCCATAATCCATTCCTCCTTTCAATTAAATAGATGTGCCCTCCGA
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TTTTAAAGTATGAGGTAAAAGATTCTTGCATGCATGTAGATGTAAATTCTATGAGAAAAG
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CAGCTCTATCGGGGTCTGAACAAAGCGATTGTTTCCGCACCTAAATATTGTTTCAGGAAT
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CGGGCAAATTGGTAGAAGAGTTAGAATACCTGAATTTTCCCCGCAAAAAAATGCGTAAAA
TTAAGCTGTCTGTGCTCATCTTCTTTATAAAACTTCGTATCCCCCTAAATACGTGCAAGG
TTAACAGGACACTATACGTAAGATTAATCTGGAGTCATTTGCTCGTGCATAAACGGCGCA
TAGTTGTCACAATCCAATCTTTTTAGAGTGATGAAATTCAGATATCGGCCGGCCTGGGTG
TGCCACAATGGCAAACCATCCACCAGAGAGGTAGGAAATCGAACGACCCAGTCTATGGTG
GAATCCATCCACAACGTAGAGAAGAGAATATCCTCAGCATCCACAGCTAACAGTCTTATA
TGCTACCGATAGCAAGGACATTCCAATCAAACAGAAAGGAACCAAAGTGCAACCAGCATG
GTTCGCACCACTTTCAGGCAGAAAAGTTAGAACAGACAGCGTCAGAAAAATGGGAAACAA
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TAGCGACTACAGAACGAAGTCCAATATATAGAAGAACGGCACAAGACGCACCCAGATGTG
ATAGTGGTCAGTATCCCTTACTTTGTCTCCCTTTCACGATTCCACTGTTCGATCTTGGCC
CTGCGCTCTTCGCTGTTCTCCCTCACAGGGCTTCTTGCACGCCTCGGAGGGCTGCCTCCA
TACCTACGCCTTCCTCCATCGTCATGCCTTTCATGCCTGCTGCTCCCACCCCTCCGTCCA
CCACCACCGCCACCACCACCACGACGGAAATCATCACGGCCACGATAGTCATCACGGTCA
CGACGCTCTCTCCTGTGGTGTGGGCTTGGGCTGCGGCTTCTTCCTCGTTGGGATCTCCTG
TAGCGCCCAAAGAGTTTCTTCCTGAGATCCTTGCCTATCTGCTTCACATGCATGAAATTG
CAGTGCCCACCACGAGTGCAGGTATTCTCCTCATACTGCCTGCAGGTCGCTTCACGGAAG
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GCCGTATGAGCTGCTGCTGCCTGATCCTCCTCTCTGAACTGGACATACACATTGCCTATC
ATGTGATCAGAAAGGTTGTCACAGACGTTGAGGGTCTCAATCTCACCAAACTTGCTCAGT
TCCTCAAAGATATCCTCATAAAAATCTTCAAAATGCTCCTGCATCTTGCGGGGATCTATC
GGCTGGCCTTGAGCATCAACCCCAGGGGTAATCATATCAGGGCGCTGATACATGTTCATG
AGCACAATAGTAGGTGATATGGTTGGCCTGTTATGGATGCGAGAGCAGCGATCGCCATGA
CGACAAGCTCCAATCTTGAAGTAAAATGGACAGTTGACCCTGTCTTTCTCTGTACCAAAT
ATCGAAGCCAAGTGTTCCGCCATTGTTTGGAATCAGTCAAGCTGACCACAAGCCTGCAAA
GTCAAATGTTTAGTGATGATCATCAAAACACATGTTAGCAGTGCTCCGGTATGCATAAGG
CTGTCAGACTTTAAAAGAGCAGCACCTTGCGTAATCAACCTTTAAATTAATGCCTACGCG
TTTCATAGATTCCTGACCTAAAACTAACTGAAGCATGATTTGTTTTAAAACTTAAAAGGA
GAAAAGGTAGAGTGAAACAGTGATCAAAATTTGTGATGTTGCAAGAGCTGCTAACTGATG
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AAATGCCTTGTGCATAACTAGTCTTAAACAGGTGCTATACTATTTGAGAGACTCTGTTTC
AGATGTTTTTCCAAGTGGATGAAGCTCTAATAGCACGCCCTACTTTTATCTATATCTTTA
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AGGAGCAGGAACTAGGGCCTGCAGCACAAAGCATCAACTAATCCATACTGCATCTTATGA
CCTAATCTGCACCGACTCAAAACTGTTAATATTAGAACATGCAGGATATTAAATAAATCA
TATACAGGTTACAATGTTTTTTCAAATGAAGCCATTATCTATGTCATAAGGGTGTTATTT
GACCTAAAATACGACTGCGTTCAGTTAGTTAAAACTAAAGGACGAACCCCTGCAACTGCA
TAATAAACAAGATAATTTTTAAGAACTAAGATGCTTAGTGCCTCTGTCCCTGCAACTGCA
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CTTCCTTCTCAGGTAGGCCATGCTATATCCGTCCAAAAAGAATTCTATTTCGTCCATTTA
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GGTGAAAATTCCAGAGTCGCATTTCACAGACTGTCACAGCTATTAAGTGCCACATATATA
AAACCAGCTACAAGATTGGTCCAGTAATTGGATTCTCAGAGAATTATTTGAAACTTTGCA
AGCTTCTTCCTTTTAATTATTATGTGATTGAGAAGTTATCTCTTACAGCACCATGGTGCA
ACATATATCTCTCCTACAGAGAGAGCTGGCTAGGAAAAAAGAAGCGACACCCCCAGACAG
CTAGACCTACTGGGCAAGGTTTGTGTGTAAAACAAAATTATGGTTGTTATCACTAGCAAC
ACAATTGATACATACCAGTTTCATGTCCAACAATTGAATTTCTGTGTTGCAAAGAAAAGA
AAGTTGATAAAGCCCCGCTTGGAATAGGGGTAAATTTATACACCCGTATTACTTCTACAA
GTGTATATCACCAGCCATGTGTGATTTTCAACCGGAAATGAAAACGACCGATTGAGGTCT
GTATCTTTTACAGGTGTAGAAGTGTGGAAAACGACAATCCAATCAGGCCCTAAGGGGTGG
TTCCGCCCGCGATTTTTGTACCCCCAGACGCGAACGTGTTATTATACCCCCAGCTACATA
CCCAAAACTCTTTTGATGTATGGGCTAGCGCAGGCGCCAACGGCTTGGCAATCATGATTT
CTGAGAGATAGAACTCTTTTGATGTATTGGGGAGGAGCAGCCCCAACCTCTCACTGCTCC
AGTTCTTTGGGCCCGCGCCGACCTGCGTAGGCGTGGCTCTTGTAACCGAAAACTGTACTT
TTTCAACTCTCCTATCGATGCAATGATAGGTAATCTTTGCGTATTCGCGAAAAAAAAAAC
ATACCCAAAACGAGGGCCTACACCGAGATGACAATTCAAAGAGGGGTTGTTCCACACGCA
AATCCGCGAGGTCGGGCCGATTCAGTAGCAATATTATGGCTGTGACAGAGTCCTCTACAC
GGATCTGTTATTTTTCCTACTTCCCCGAATCCAAAATCGAGTGTACGAATCGGCCGATTC
GCGGGGTCGAATCGAAAAGAGGTGGCGTCGAGATCTGGTAAAGCGAGGGGAGAAGGGTTA
GGGTTTTGGAGGGGGGGTGGG