| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_46174
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_62075 |
2 |
872 bp |
AK376117 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_62075
Contig Sequence (10260 bp)
>contig_46174 10260 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAATCCACATATACTGTAACAGGTTTCTCCTCCCACTAACAGTAAGCTCCAAACCCCCCT
AACTGATCTGGAAATGGTATGGTTGGGTTGGGTTGGGCTGGCCGGGTTTGTATATGATCA
ATTGCACTTGCTTGAGGTCTATCTGGATGACGTGCTTGTAAGCAAAACACCTATTTATAT
GCTTGTTATAGTTGAACTACCAAATGGTATGGGCTTTAAGCGCTACTGTTCAGTACCGTA
TATTATGATGGCATATGATTGCAAGTTGCAACATGATCACTAAAGCTTTGCTTTCTCATA
CTATGTTTGCAGAGAGCACTTTTCGATGAAGGTTGCATCTATGTTGGTGTGCCTCCTCTT
TACAAGGTTTGGTCATGACCCGGAAGCTTGAAATTTGGAATAAATAGTTGATCTTAAGTT
CGTACTTGATATTAGTGTTTTTGTGTTAGGTTGAGCGTGGGAAACAAGTGCACTACTGCT
ATGATGAGGCTGATCTTAAAGATCTAGTCAACACCTTTCCTACAAATGCTTCTTATAATA
CCCAGAGGTTCAAAGGTATAGTGTTTCAACCCATAAAACTAAAAACACAACTATGAATAT
CCAAGGGAACCCATCCAACTAAAGACACAACTATGAATATCCAAGGGAAAAATGACTGAC
TAGAAGTACGGGGAGCAATATTCTCGTACATGCTTGTATGACATGCATGCCCTGTTCAAG
AATTCGTCCAGTTAACTTGTCGATTAATCCCTACTCACAGGGTCACCGAGTAGCCGATTA
ACTGATAAATCGCCCGATTAATGGATTAAATGGCTGATTAACTTGTCGATTAGCCCATTA
ATCCCCTACTCACCAGCTAACCGAGCAGTTACTAGTTAACGATTTCCTCAACAATGCATG
CATGTGCATTTTTTGATGGCATGTGTTTCTGTTATTTTGATGGCAGATATTTACTGTGTC
CTCTTATCCTGGTTTCTAAATAGGTTTGGGCGAGATGATGCCCTTGCAATTATGGGAAAC
GACAATGGATCCTGAAAGGAGGCTGTTGAAGCAGCTAACGGTCGAAGATGCTGTAGAGGC
CAATGTTGTGTTTTCATCTCTTATGGGTGCTCGGGTAAGCAACCGGTGAACTTTCCAAGT
ACTCGTTCTTCTTGTGAGTTTACATAACATTTCACTTTGACGCTGCACCATTCTATTTCA
GGTTGAATACAGGAAGGAACTAATACAGAAGGCCGCAAGCATTGTCAACCTAGATCACCT
TGACATCTGAGAGCGTTAAACAAGGTTGACCATTGTGTATGATATAGAAGACCACAACTT
GCCACCCATTCGACACAGATCAAGTTGTTTTGGTGCTAGTTTAGTATCACTCTAGCTAGA
ATGGAGAAACGGGTCGATCCCCTGGTGCTTGTAACATGAATGGTGCGTTCATTTGTTGAC
ACGCTGTACCCAACTCAGCTTGAAGCGGGGGTTAAACCGCAATATCACGGGAAGTGGTCA
AGTTGCTCAGGCAGATGGCAACTCATCAAATCCATACAGTAGTTGAATTCCTGTTACTTT
TGGGCCGTGCTCCAGTTTATCGACCCAGTCATGCATAGTTTTCTTCACATGGGGGTATCT
AGGCTGCTCTAACCAGACTCGTTCAGAACCGGTGCTTACTAAGTAGTCGAGTCGACAGTA
TTGCCCCATTTGACCACTACATGAGATAAGGTTAATGGGATCAGTCGACGCATGCTATCC
ATACTTGATTTTGTCACCAAACAAAGATTAGCCAAACCGACTGTCTTGGTTTGTTTCCTA
AGTTTTCTTCTCGACGTGTGTACGCTCGATGTTGACCGCAGTCACGTGCCGGTAGATATA
CGCGAGCTCCGCTGCAAGCACTGGTGCCTATAGAAGACCAATGTCTGTAGCCAGTGGCGG
ATCCAGTATCTTTATGTTGGATGCTCATACTAACAATAATTTGGACACAAATAAAGAGCT
GACGTTTCAGGGAGGCCACCCAAGCGAATGAATTGTTAGAAATTTGCACACAGAAATTGG
ATGTACCAGAGAGCATTCCCTAGGAAAAACGCTCAATAGTTTTTCTGAAATATATTATGT
GCCTGAAAATTGCTTTTGGAGGCCGAGCTCCATGGAGGCCCGCATTTGCAAAATTTAAAA
TTCATATTGTTATATTTCCATTCTTTTTGATAAAATATAGAAATACATGAAGGCATAATG
TACATGTGTGTGAATTTTCAAGATGAAATACGTTGATTTTTTTTAAAGTGAGGCTTTTCA
ACCCATGATACTATTCATTCCTTAAAGTCCACAAATTTGTTTTTCTATACATTTTGCATT
TTAATGTGTTCATCCTGAATTTGTACACACATATACATTTCATCCTTGTATACTTTCATA
TTTTTTTTAGATTTTTACGAAACCATGAAGTTTGAATTTTGATTTTTTTATAAAAAAAAT
CAGGCTCCATGGAGCCCAATCACCAAGATGCCCCAATGTTATATGCCAATTGCAACAAAT
ATGAGACTGGCAAGAAGTACAATGTGAATAGCCCAACGCTAACAACGTCATAAGTCAAAC
TTACAAAAATTGCAATAGAAATAATTCATCGATGAAATAAGATCATTACAACACCAATAC
TTACTTTTGCATTGCCATTTGCCAAGTTATGTCATCCTCACTTCTCATGCATGACAAAAC
ATCATCACTTGCTTGCAAGATAATAAGTCGCTCAATAAATGTTAATAAGCAATAATTTTG
ATAGGGCAATTATTCTTGTAAAGGATGCTGAAGTACCCGCCTCCTCGTGACATTAGCGCC
CTTGCGGCGCTGCGCGTCGTCCGATCTATGTGCGCCTCATGCCGGTGCCTGCCCGACACC
CTCCTCGCCATTCGATCTAGTTTTCCTTGCCTCACCTCTTCATCGGTTTCGGGATCCAAG
ACGCGTGGGTTGCTGGCACACTCGGGGCCACATTTCTATCGTGTATTCTACCATTCCTCT
CTGTGTGCAGTTCTGGTGATGAGTAAGAGCGGACGTCGTTCTGTCCTAAGGGTGAATGGG
AGGCGGGTAAACGGAGGAGGTTGATCAGTGTGTGTTGTGTCATTTTTTTCACCGATGTGG
TAGGCAGTGTGTACCCAGCTCGGTCTGTGGTGTCTCAATGTTTCACAAACTTGGCCAACT
AAGACTGCCCCGTGAGGTGATGGTTGAGGAGGGTACTTGGTTTGCACTAATCAGAGTTTC
CAAGTCGACCATGTGTGACATTTGTCGGGCCCAGTGTGCACGGGTTTCCCTTGATGGGAC
CGTTGGGAGGCTATTTGGCTTGTGTAAGTCGGGATGTCCCGGGTCGAAGATCGCTAGGAC
GTGCTTCGTGGTTAGTTGGTTCTCCACCGCTTGTCCGTTGCGTTGCACATGCAGTGGGTG
CATTAGTACAATGCTTTTTTTTCTCTTATTTGTACATTGCTGCCATGTGTTGTTGCTTAT
TTGGATGCCCTTTTCTAGCTACTGGCCCCATGCTGTTTTGGATGTTCTTTCCTGTTAGTG
GCCCCATGTATACATGTCTCGACTCGTGTGGTTGGCTTAAATGTCTTGCTTGCCTCCATG
GTCCCTTGCTCACACTTCTTTTGCTTGCTGCTTTATGCCGCACGTCAGGCACCATGCACA
CTAACCTACCTCTCGCTTCGCTTTTCAGCTCCCGCTTCGTCCAACTTTGTCGTAGGTGGT
GTTGTTGGTTTGCGTCTTCCTTGCTTCATTGGCCGCCATGCCAGTTTTCTCTTCCCATTG
GTAGTGGCTTGGATATTTTGCCACTTGCTTGTTCACATATATGTTGCCTTCTCTCACCGT
CCCTCTCATCTTTGTGTTTGTAGGCGTTTGGGTTGGTTGCTTTGTTCCTCGGTTCTGAAC
GTTCCTCGCCTTCGCTTTACATGCTGACCGAGGTTCGGGTTTGGTTTCCCTCTTACCCAT
CTTCGTTTGGCCATTCTTACTCATCGTGCTCTTTTTTCCTGTACGTGTTTGGAGGCCCAT
GTTTGTTGTTTGGCTGTATCTATTTCAGGGCCCTATGTCTTCTGTTTCGGGTAGTACAAA
TAATCTGCTTGTGTTGTGTCAAAGGGCTGACATGTAATCAAGACAGGGCATCTGCGTGCA
AAACAAGAACAAAATCACACTCGAAAACACAACAAGCATACCTTGTTCTCAAAAGGGTCG
AGATCAAGCATTTCCTTGAGAGTCTTCACAACCGTCTCTTCGCGAACACACAATGACCAC
TCCTGCTTCGTATGAATAAAGACAGCTGGATGTGCAAGCCGTGTGCCTAGAAGAATGTAA
TTGGAAGTAACTAAGTAGGTGCACCTAGGAAAACAAGATGGCTCATGCATGTGCAACCTA
AAATACCATAGGAAGGTATCCCATGCCGCGCCTGTGACCCATGCACCATGGACTTCCGAG
GAAAACCAAACGGGTGGGGTAGCCATAAAGATCGAATGACACGAAGGATGCCAAGGAGGC
ATCGGTGCGAGACCAACGCGAGACGGGTGGCGTCGAGGGCACTTTCGGCTGACAATGCCC
CCAGGAGGTAGTACTCCAACATCCTTTATAGGCGTAATTTGGCACTCACATTTTATTACC
ACATAACCCTCACAAACCAAAACACCATCACACTTTTTAGCACTTATAGTGAATCCTTGC
TATTGTTGCGTTTACCATTTCCTTCAGCTCCTCGTGGCATCGAGACTTCTACTTACTGAA
GAGATCTACAATTCACCACTACATTTGTGGGACATCAAGACTCTTTTCTTGGGCCATTGT
CGGGGCGTAGCACTCTTGGAAAGTTGAAAGTGCTAAGGAAGTCATTCATAACACATGTTG
TTTTCTACTCCCTCTGTTTCTAANNNNNNGTCTTTTTAGAGGTTTCATTAGGAAATTACA
TACGGATGTATATAGACATATTTTAAAGTGTAGGTTCATTTATTTTCATCCGTATGTGGT
CTCTTAGTGGAATCTCTAAAAGGACTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTATTTTATTTTTG
TTTGTTACTTTTGTGGTTATGGCTTCATATTTTAGTCATGAGTTATTTGATAAACCATTG
CTAGTAACTTTTATGCAAGCTTCCCATTCATGATAGAGAGAGACCTGATAGTTCTCGTGG
AGGATGTTTTAATAATTGAAGTGTTAAACAAGGTTGGAATCTTTTAAATACTATTACTAC
AAACAATCATGCATGGGTATGGGAAAAGGTAACAAGGGAGACCAATCTTCTAAGTATGAA
TCCGTTAAGTCTTTTTTTTTAAATTAATGATTTTAATCTTGTTAGTACCAATTATGTTTG
ATTGCGAAGTACTTGTTAATATCCTTGATTCTTTTGCCTCTCGCATTAGAATTCCTAGAT
CTAGTTGGGAACAATATCATGAACCATTTAGAGATGCTCCTAATAGTAATAATTATTTTG
AGAATTGTTTTTGTGTGAGCAGTGTTAAAGATGTGGAACCTGGTGAGTATGTTGAAAAAC
CACCCTTTCCTGTGAAAAATCAGAGAACATGTGCTAGCTTTGACTGCTAAGTGTACAAGT
AATAATAAATGTACTACTTCTTATGAACAAATAGAGGCACAACCTGAATTTTCTATGATT
AAAGATGTTAGGATCCTAAAGAGGAAATTGTGTGTTTAATGGAACATGCTCCTAAATATG
TAATCCAAATGAGCCATCGCAGGTTTGGAACACGTGTAATTTTTGTTACCATTGACACTC
ATAGTTATCTTGGTATATGTGATATTGGTGCAAGCATTAGTGTTATTCCTTTATATTTAT
ATAGATATTTTTTCAAGGATATACCACCTAATGCCGTTATACAAGTTGCGATAGATCCTA
TGTTATCTCTTAGGAATTATGAAAATTGTTGATGCCTTATGTGGTAGAAGTAAGTACCCT
ACATATTTCCTTGTGCTGGCTTGGAAACGATATAACTTTTGTCCTATTTTGTTTGGTAGA
CCCTTTTTACACTCGGCTAGTGATGCAATTGATTGTTTAAATAAAAACACTATAGTTAAA
TTTGGTGATGATCAAGTCGAATTCAATTTCTCTAGGTTTGGTAATCAACCAAATATTCTT
GATAATAATATGAAAGATGATTTTGCACAAATTACTTCAATAGGAATTTCTTCAACTCAC
CCACTGGAACATTTTTTGATAGACCATGAAAGTTTTATTAATGATAAAGAGAGAAGAGAC
ATTAATGATACTTTTCACTTCCAACAAGCACTCTTGAAATTTAATATTCCACTTGATCCT
TTGGGGAAGCCTTAACCCCCTTCAAAGAGAGATCCAGTGTTAGAATTGAAACCTCTACCG
GAAACACTTCAATACACTTACCTGGATGAAAAGAAAGTCTATCATGCTATTTTCAATGCT
AATCTTTTAGGGCATAAAAAGCAAGATTATTGGAGGTACTGAGAGCACACATGGTTGCTA
TTTGTTATACTGCATATGGTCTTAAAGGAATCAACCCATCTTTATGCACTCATAAAATTC
ATATGGAATCAGATGCAAAACCTGTTGTTGACCATTAGCATCGCTTGAATCCTAAAATGA
TACAAGTGGTAAAAACTAAAATTCTTAAATTCTTGGAAGCATGTGTTATTTATCACATCT
CTCACAGTAAGTGGGAAAGTCTCGTTCATTGTGTCCATAAGAAGGGAGGTTTAATTGTTG
TGCCTACTGAAAAAACGAACTTATTTATCAAAGGACCGTTACTGATTATAGGATGTGCAT
TGATTATAAAAATTAAATAGGGCTAGAAAGGATCATTGTCCTTTGTTTTTATTGATAAAA
TGTTAGAAAAGTTTCCAAGCATACATATTTTTGTTACCTCTGATGGTTATTCTAGTTTCT
CTCAAATACTTGTTTCTCATGAGGTTCAGGAGCAAAATAATTTTACTTGTCCTTTTAAAA
CTTATGTTTATAGAGTATGCCTTTTGGTTTGTGTAATGCACCTGCTACATTTCAAAAATT
CATGACTGCCATGTTTTCAGACTTTGTTGAACAAATTGTGGATGTCTCCATGAACGATTT
TTCTGTTTATGGCTTTCGATAATTGTTTGTACAACCCTAACAAGTTTTGCAGCAGATTGA
ATATACAAACCTAGTCTTGAATTGGGACAACTGCAATTTCATGGTGAATAAAGGTATTAA
TCTTGGTCACAATTTTTTTGAAAAACGTATTGAGATTGGTAGAGTTAAGATAAAAGCTAC
GGAGAAAATATCATATCCTAGGGATATAAGAGGTATAAGAAGTTCTCTTAGTCATGTTGA
TTTTTATAGAAGATTTATTAAAGAGTTTTTCAAAATATCTAGGCCTCTTATCGATTTGTT
ACAAACATATGTGTCCTTCTCTTTTGATGATGATTCTCATTGATGCCGCAAGGGAAACAA
AACCTAAGTAAAAAAACAAAATAGATAGGTCCCCACTCCTCTTGCTGCCAACGATGCCAT
CAGACGGGAGAGACAAGGGGAAGTGAGATCGCGTGGAGCAAACCTTTGGCACACCGCCTA
GGGTTGGGAACATGTTTAGTGTTTTTTGCAGGGTCGGGGAGGTGGGTGGGTACATGTTTA
GTTTTGGCCTTTCGCAAACAAGAAAAAAACATATATTACTACTTCATCTTTGTGGGGAAA
ACCCGCACTTGATCTTAGATAGAAGATTGAGTACTCTAAAAAAATATATAGATAAAAGGC
CATGAAAGGTATTTTTTCTAGAGGATGTGTAAGTCTTTCACCAACTAGTAACAATCAAAT
GTTTCCGCAAAAGCAAACCGAATCTGGCTTAGATGGCTAAGTTTTTTGTTGTGGAACTAA
CCGTCAGGTTAAAGTTCTATATTTGATATTGTTGCTTGCATTTTCCTAACTTATCTTAGG
CTTTCCAGCAATGTTCATTCAGTGAAAGAAGATGTATTCGCCGACTAGTGAAGCATTTGT
AGTGATTTTGTCTATCTTAAGATGATATGCTCAGTTTCTCGAAGATACTTAAAAAATAGA
CTTTTTGTGTATGTATTAATAATAATAAATGTATGTATATATGTATGGAGGGTTTACATC
TTTATTGTGTGTAGAAAAATGTTCCAAGAAAGAAAAAGAACAGAGACATCCAGTCAAGCT
GTCTCAATACAGCCGATGTCGTCTTAAAAGTTGTGCTAACAGCAGGTACATTGTACCTGG
CCGCCTCGGCAGCAAGGCGCATATTGAGCTAGATTCATCCTTACATTAGTAGAACAGAAC
CACTCATATATGTCGCCAAAGTACTTGGCTTGAGCGAACATGGCTTTCCTTTCGGTACAA
GTACACGGCAATTTGTAGGAGTACGTACTTTGTATGTTACCACAATCAGGTCTTTGTTCG
CAATAGGACGCTGTCGTTCGCTAGAGTTTTCTTGCTATGTTACCCGACAGCTTAGCATCA
TTTTTTCATGCGAAAAGCCTAAAAGAACATATATTAGGTATTTCCTTTATTTTTGTATAC
AAGGTCATAAACTCATATTAGGGCATCTTCAACAGTTTGTTGGTTAGCTTGTTGGTAAAA
TATGTCATGTCATCAATCAACATCTTGACATACAACTACTCCAATAGGTTGTATCTAGTT
TGCTCAATAGGATGTGAGATAATAAATAAGACGCTCTCTCATTCTACATTGAAGCTTGTG
CAAGGGTGTTAGTTAATTTACATACAATCTTGCACTCTTTCCTCATTTATTGTATGACAC
ATCATCAGAAATTCTATGTGTCAAAATATATCGTGTTGGTTAATTTACATACAATCTTGC
GCTCTTTCGTCATTTATTGCATGACACATCATAAAAAATTCTATGTGTCAAAATCTATCA
AATTGGAGATGTTGACACATAGGATTTTTGATGATGTGTCATGCAATAAATGAGGAAAGA
GAGCAAGATTATATGTAAATTAATCAACACCCTTGCACAAGCTCCAATGTAGAATGAGAG
AGCACCTTATTTATTATCTCACATCCTATTAGGCAAACTAGATACAATCTATTGGAGTAA
TTGTATGTTAAGGTGTTGGTTGATGACATGACATATTTTACCAACAAAATGTTGGAGATG
CCCGTAACAAAGCAAAAGTTATTGCCTCTAAGTCAATGTTGTAATACACCTTCTCTCCTT
CTTTGTCGTGTAAATTAATGTGTATTTTTTCTTTCATACACACCAAACCAATGATCTCAC
TCCGGCGTGCATGCAAGGGATAATTAATGTCCTCATTTGTTAATACTACTACGAAGCAAA
CAACATTAATATTGCATCGATTAGTGTTAGTGGCCTTGTATTTTTGTAAATTATAATTTT
AATAGTGATCTTGTATATAAAAATGTAGGAAGTATCACACATTCTTAAAGAACACCTAAA
GTAAAAAAAATCAAATCTTTAGAGTTGTCGAAGTCTTCTCTCTCGTATATCCATTGACGC
CGCGTTGTGAGCAAACCTTGTTGTCGTCTTTGGGCCTCCTTCTTAGCGAAGTAATTTGTT
TAAATCCATGTGCGTGTAAAACAATAATAGCAAAAATGTCATTGGTATAGGCCAGCAAAC
ACCAATAACCATGGTTTGTGTAGCAAATCACCGCCCAAAGAGAAAACGACGAAGAGAGCC
TGTAGAACAACCCAGTTTTGGTCAAACAGAGTTGGGCAACACAAACCTCACATGCTCTTC
GACATGGCCATGGTTGGTCAATCTTTGCATGTCAGAACCAGAGCCGAAGGACCAAGATGC
ACAATCTTGTTGTCCGCTCCGCAGAACAGCGCAACTACGAGAAACCTAAAGGAGAAAGCC
AAACCCGAAAACCAGATGTAAGGACACACCATTTTGCATGCCCCACTCCACGATACGAGG
AATCATCACTGAAACAATGATGAGGCAAGCGACCTTATTCCAAGCCACTGACGACACCAC
CGTTTCGTCACCGCCAAACGACGGCCTAGCTAATGCCCCAAGAGGAAGAAACTATGACTC
CATTCAAACGATCGGGACCTTCCCGCACAACCCCATCGACGAAAACAGAGAAGGAGAGGG
AGATCATCGTGTTGGAAATATGCCCTAGNNNNAATAATAAATTGGTTATTATTATTTTCC
TTGTTCATGATAATCGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNGGGTACATAGACAACACACTCTCCCTACTAAGACTCTAGTTGACTAGCTCGTTG
