Map Locations of contig_46144 (7809 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_46144

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_62048 3 2891 bp MLOC_62048.1 Available Available LOC_Os01g41190.2, FRAME:+2, EVALUE:8e-180, 13101.m15047 protein glycine-rich protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_62048






Contig Sequence (7809 bp)

>contig_46144 7809 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATCTGGGTGGTTCCAAACAGGGCCTTAGTCTTGTCCCAGACATATGCTGATATTTTTGT
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TCCTAAATTATATTAGGTACTGGCATTTTTTGGTTCTTTAACTTTCAAAGTTAAATGTGT
TTTAAGCGACTTGGAGGTTGGATACCTGAGTTAACTGTGATTTATGTTGTGGCAGGTCTT
ATAGATGCCTCTGCTCGTGCTGTAGTTATCTGATGGGGGTCGCTTCGCAGCAGAGCAGGG
GTTGCATTTGTTGCTTGAGTTGTGGTAAGCCTGTTTTTCAAGAGCAGCACTTGAGAAATG
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TGGTCGAAATGTCTAATTCTTTGGTGGCATCTGAAGATGTGAGCCGTTGTTGAAGAGAGG
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TTTTCTTCTTGGTTGGTGGTTGATCTTCTCGTATGCCTACTATTGCTTGCATGATGCATA
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GGCATGGCGCAGACTGTGGCCCTGAAGGTGTCGATGCACTGCCATGGCTGTGCGAGGAAG
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GCTCTTTCCCGGTCCACTGTGTGGTGATCGCATTTTTTTTTGATGAAAACGATGAGCACA
TCCCTCTCCCCCCATCCTCTTCTTATAACGCTCAATCTGTATCCCGAAAACAGAAAAATC
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CATGCATGCAATGATGTCACCAAGATTTCTTTTGATTTTGAAATTTAAAAAGTTTTATCN
NNNNNNNNGTTAATTCAATCGATGATCCGCTTTCACTATTGACTTTCTTTCGACGAGTTC
TTCGAAACTAGATCCCATGTCGACATGTTTCGTCTACTATTTTTTTCATCCATACTTGCC
ACATTTTTTGACCCCACTTGTTATATTATTAACCACTTACTTGCCTGAAAAAAATAACTT
AATTGACACTTTTAATGTTTTTTCGTATAAAACCATGTAACACTTTTCATTATACATGAT
ATAAAAGCATTGTCATAGGTTGTGTTTGTCAATTTAAATATGCAAACTTGTCATATTTAT
ATACAACTTTGCAAAAAAAAAAAACTATTTTGTGTGTTTGTTAGTTTAACTATATCGAGT
TATCATATTTATAAACGATGATCAAAAAAGATTTTTTGTGGTCACCGATTTTAAATATGT
TGAGTTGTCATATTTTTACGCGTAATCGCCTAAAGAAATTGTTTGTGCTTGTCATTTTGA
TTATGTCTAGATGTCATATTTATACGCAGTTTTTAAAAAATTTGGCGATTAAGTTATTTT
TTATCAGAC