Map Locations of contig_45948 (10948 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45948

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61871 1 558 bp None Available Available None
MLOC_61872 1 608 bp MLOC_61872.1 Available Available None
MLOC_61870 3 1080 bp MLOC_61870.3 Available Available LOC_Os02g08544.1, FRAME:+1, EVALUE:3e-144, 13102.m00988 protein homeobox protein knotted-1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_61871






CDS Structure of MLOC_61872






CDS Structure of MLOC_61870






Contig Sequence (10948 bp)

>contig_45948 10948 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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TCTATGGCTTTCGCGCCCCTGCCCTTTATTTTTTTCCTGCGTTACCATGCCACCTGGTGC
CGTGCCTGCCTTGTTAGGGTGTGTGTATATGCTTCGTGTGAACAATTGGAATTCGGAATT
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GGAAGGGTCTGACTTTTAATAGCTGCTGTCTGTTGCGATGAATGAATAGTTAGGATGCTC
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TTCTTCCATTTTGTGTGCTTTTGTGGGCCACACATGTCAGAATTTTAATGTCATGTTTGA
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TGATGGGTCAGATGGTATGGGCTTTGGTCCCCTGATATTGACCGAGGGTGAACGGTCGTT
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AAATTCTTCGTTGCCTCATTCATGACATAATGTTGACCAAAAACTTCCTACCTCTTAGGG
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GTACCCTACTGTACGTGACACTACTATCTCCAAGCTTCATTTTGCTATTAGTTTCTGTGT
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GAAAAACCATATTTTTCCTTTTCCTTGACAAGCTTGCACATTCTTGTTTATGGCTTCCTT
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GAACGGAAGGGAGCATTGCATTGGTGTATGTACTTGTATATTCGATTCATCATGTAACAA
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CGTCAGATTACCTGATTCAGGCACTCATGTGATGGAAGCATTATTTGTGAGAAGAAACAC
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ATACATGCCTACCGCCAATGGGGCTACGAAGCGAGCCGTCAGTGTGGGGGTGGCATGCAC
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GTATACTATGTTGTCTATATCCAAAATATATTGGAGAAGTTCATTGTGGACAAATCTTAT
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ATTTTTTTGACATTTCCATTATTTTCTTTTATTTTTTTAACCGAAAAGGCGGTCCAGCGG
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AAACCTTGGTCAAAGTTAGTAATGGTGCACTTTGTATAGGTACATCATTACTATGTCAAC
TTAGTAATGACACATTTACCCGAAGTGCGACATTACTAAGTTTGACCCAGTCATACACAT
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ATACAAAGTACGCCATTACTATGTGTATGACTGGATCAAACCTTGGTCAAACTTAGTAAT
GTCGCATTTTTCACCTGGTGCGCCATTACTATTTTGGTCACTAATGACGCACCTACACAT
GGTGTGCCATTACTATTTAGTAATGGCGCACCACATGTATAGTCGTCATTAGTGTCCATA
TTGTCTATAGCTGTTTTTCTAGTAGTGATATTATACTCTTTTTATCTTCATGAGTTTATT
ATAGAAGTTCTCATAAAGGTTTTTAATGAGGTAATATCAACATGAGATCATATGTCCTAC
TTTCTGTTTTCCCCATCGGGATTTTTAAGAAAGTATATACGACATATTTATTGTCCTCTA
AACTCTATGGTTCTCACATATTGAGTTAATGAAGACAACAACTATTATATGCTGCATCAT
TTTTTTCTTATTTTTTTCAGTGGGTTTGAAGGAGTTTTAGCAACATATCAAACACTATAC
TCCTCACATTTTTTCCACAGGGTTTTCAGAGAAGACCTTTCGAGATTATGATATTTTTTA
AACAAGGATAGATTAAGTAGAGTGTTAAAACTTAATTAACATGTGTTAATTATGAGGGAA
TCTTCCCTTGTACCAACCGCAGAACCGCCGCGTGGGTTCATGCCATCTCTCCTGAACGGA
TGCCTCTTCAAGGCACCCCTTCTATCTGTATAAATATCTACAATCACCTAATGAAAGATC
AAGGATTTACTTTTATATGTCTGTGTTTTGTCTCTCGTTCTACTTTCCACGGTCCAAAAT
GAATCAGTAGAGCATCGTCCAATTATTTGGCGCCACCCTTGTTGCCCCGCTCTGTCTCTC
CGCCCTACTAGTTGACGACATATATTTTCCCCCACCAGCTGCTTTAATTTGGAGCGATCG
AATACCCTTGTTTTTCTTGCTAGCCTTCCACGCCCTCTCCGTCAGAATGAAAGCGCTCTT
CGACAATAGAATTGATCGCGAAATCCATTAGCCGATCCACGTGATCAATCGGTGTTGTAG
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CGATACAAATGAAACGTGAAACGTGACCAGCATCTTTAGCTATAAGTTACACACACACAG
CAAACATGGAGATGAAACGGCCGAAGACACACCGAACAAAGCATACGCATATGGCCGAGC
TACCAACAGATCTACGCGGCTGCGACGG