Map Locations of contig_45938 (6946 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_45938

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61856 4 1351 bp AK249062.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_61856






Contig Sequence (6946 bp)

>contig_45938 6946 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTAGCTCTTTCCATCAGTTCAGACTTTNNNNNNNNNNTTCCATCAGTTCAGACTTTTGGT
TGCGTNNNNNNNNNNATGAAGCTTAACATGGTATCAGAGACCAAGGTATTGAGTTCAAGT
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CTAGTGCATGAAGCTTAACATGGTATCAGAGCCCAAGGTCTTGAGTTCAAGTCCTGTCTT
TTGCAGTTTATTCAAAAATTGCTGCCGCCCCCTATGTGTCCACGTATATGCCTCTTAAGC
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GTGCATGAAGCTTAACAAGTGAACACTTAAACTGATCTTGTGGTTAGTTTCTCAAGAGCT
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ACCTTTGTATGTGCTGTGCCCTGATAATGATCTGATTCTTTTCATACGTACATGCTAACA
CAGATGAAAGCATCACTCATTGAACCTGCAGCAAAGCCTTACTGATAATTAGTTGTCTTC
ATTTTTGTGTCTCAGGAACAATCAGTTTCAGCTATCATTTCCTCTGCAGGAAATATGCTA
CCTCAGGTTCAGTTACTTGTTACAATTGCATCCAAAAAGATTTACTCTCTGTTTTGGTGT
TTTATCACCTTTTTTTACAAGGTTTCAAATAGCTAGCTATGACCGCGCTATAGCGTTTTT
GAACCCTAGATGCTATCTGATAGGCATATTCATTATTTCTTATATTCTAGTGTTTGAATT
GACGATTGTTTTCACTAGTTTTACTGTGACCTGCGAAAACTGCAATTTTAAACCTTGTTT
TTAAAAATGATCTGGGAGCAGTATGAATAGAAAAAGTGCTTTTGAAGCAACAGTGTTACT
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AATGGAATCGTGAACTGTGTGCTCGCACTTGTTGATCATCTTTAGTGCACAATTTGGGGG
GGGGGGGGTATTAAATTAGGAACAATTGTAACCTCCTAATCCAACCTTATTCATAGGGGG
AAACATCCAGCTGGAAAAGTGTCATGTGCTTGTCATTGTAAACATATAACCATAACGTAG
AATCTGATATCACTGTTTGCCACGTGTTCTACGGTCGGATCATGCTAGTTTCCTGTTGCA
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GTTTTATGTGTTGATTGTCCTGAGACTTAATTTTTGATGTTGTGCACCGAGATGAAAATC
ATTTTGAATCATCCTAGCTCTAGCATATATAAGAGCATGCACAAATGGAGATTGAGCATG
ATATGCATTTTGTTCCTCATTGAAAATCCCAAATCAACCGGAATGAAGTAAAGAAATAAG
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TGTGGTAGTAAATAATGTATTACCAGATTATTTTTTCCGCATCTTTCCATCTGCACTAAC
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GTGTAGAGGTAGACATGAAAGTAGACAAACAGGAAGCTAAAGATTCAGGAAAACCTAACA
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CATGTACAGGTGTACGATATGCAGAAAACCTCTTATACAACGGGGTAGATATGAAAGGCT
ACATGGCTACATAAATAGTACTCTAACACCCCCTCAAACTCATGGTGGATAAACATCACC
GAGTTTGGAGAGATAGAAGCCATGATGTGGTCTAGTTTGGGCCTTCGTAAAGAAATCCCC
CAATTGTAACTCGAAGGCACATACTGAAGAGCAATAACCTGATCCTGCACACCAGCGCAC
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