Map Locations of contig_45870 (4232 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45870

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61795 1 799 bp AK372562 Available Available None





CDS Structure of MLOC_61795






Contig Sequence (4232 bp)

>contig_45870 4232 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCATGATAGGTCTTCGTGCCTGTAGGAAATTTTTGTTTCCCATGCGACGTTCCCCAACAA
ATATGCATGTATTTCCCTCTTAAAAAATCATCAGTTTGATATCAAAATTTTATGAAAAAA
TCTCGCAGCACGTGGATATCAGATCCATCTAAAAAACCTAAAAAAATTCTCAAACAGAGA
AAGAAAAAAGTATTACTTCCATCTTCCAAAAATAATATTTTTTCTCAGAAGAAAGAAAAG
GTCACACTTTCATCTTCCAAAAAAAACTCCAAAGAAATCAAAAAAAAAATCACCACGGCC
AACCAGCATGCACCATGTGGCCATGCGAGTTGGTCACCCTTCTCCCGCATGTTAATGTCG
TTAATGAGTACCCATGAATTACGATGTTGAAGGGCCGGCATGGCTCAGCAACCGTGGAGG
GAGAAGGAGGCGGCAACACGATCTGGGTTAGCCATGGTGGGGTGGTGGACTTGGTAGTGG
TAGCAACGGTGACGACGAGGCATAGGCATGTGTAGATGGCACAAGGTAGTGCGCGGTGAC
GGCAATGGGTGGGTGTGGGATGGAGGCAGAGCGAGAGAGGAATAGTGAGCCAAGGAGAGA
GAATGAGAGAGACAAAGAGGCGCCAGGCGAGGTAAGAGGAAGGACCGCCCGGGGCGCGTG
GTGCGCGGGCGTGTGTGGCCGCCAAGTTGAAGCCACTTATCGCAGTATCTGCATGCAGGC
ACGGATGGTCCAACTGTTGAGTTTCAAAATAGGTTGGATTTTATCGTATTTGTGTTTTGA
ATTCTAAATGAACTCCAACCACGTTAAATGTTAGTGGCTTCCAAGGAAGATCTTAGAGGT
TACTGCCTTTGTATATAGAGTTTGGCAAGTTATCATATGAGTTTTCAAGAATTTTGGATG
AAAAGAAAGGGGTTTGGTTTGAAATTTAGACCCAAACTATATATTGAGTTTTGAACAAGC
TTGACCACCAAATTTGAGTAACTTCCAGCCGGTTTTAGGCCCAGTTCCTTAAAGCAAGTT
TGATGTACATGAATTAGTACACAATCCCTCCATTTGGACCAAGTCCGGATTCAAATTGAA
TTTTGAAATTAAGCATGGCTCAAGTTCGCGCATATACTAGGTTTTTAGAGTTGTAAACTT
TTTAGCTGTTTTGCGTTCCTATGTTTTTGACTGGCTTTGACTCATAAATTCGAACTATTT
CTTGACAGAATTTGGACTTGGTTTCTAAAGTAAACTTAAAGGCAGCTTTTGAACTACAAG
TTTGGTATTGACACTTTTGAGAGTATCCATACTTAACCTCTTCATTTTAAGCTATTTCCA
AAAGGGTTTTGTATAGTTTAAGCTAGTCATTTTTCATAGTTTTTACGGTGTGGTTTACAA
TTGACTTTTCATCCTCAAGTTTATGCATGCCATGGTCATGAGTATCAATGAAATTCAAGT
ATAAAACTTGGATATTAAAATAGTCACGTTAGAAGTGTCACAGTATACACGACATATCTA
CACATCTCTATCCCTCAAATTGTGAAGTACACACCAACTCGTCTTTCTGTTCGTGCCCTA
GCACCCCCCGCTACACGCATCTCCTCCTCCTCGACATGTGCCATCGGTGCGCATGTTGTC
CATAAGCATGTGAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCAGTGGATGCATAGTCGCTGACCTC
CTCCTTAGTTTGTAAGGTGTTGCACCACCGCCACCACTCCTTCTCGTCCCCGAGTTACTG
TGCTGCCAATTTCCACCTCCCATGCCACTAAGCCATCGCTGCATTATATCCTTGTTAACT
CTCATATGCACGTATTTTATAACCATAAATATCTCATCTATCACATGAATTATGTATCAC
AAACATCGAATATACATGAAAACCTACACATATTCCACTTTAGTTTTGGTTTGAGAGTAT
GTTCAATATTTGTATAAATTCGGGTTCAAACCAAGGACACACACACACAACCACTTTGAA
GATGATCGAGCTCGATGAGATAGACCATGGCAAAGACGGCCTTGGATTGGCCTGGCTATG
CCCAACGTGAAGTTTTGAGAACATATATAGAAGGATTTAAATAGATTTAAATGGAATCAA
CTCCAAACTCATCAATGTATGAAAGTTTGAAGCAAAGATGACGGCCTCTAAAATGTTCTT
CGCGTCCATGGCCCACATGCTTCCATAAGACTACTCATGATAAATTCTTGACTAGAGTGA
AGTTGATCTTGTTCCTCAGTTAATTGGCATATTATGATTTATGAGTGTTACTTAATATAA
TATCAACCTAGATTGTTTAGCACGTTCTTGTGGTAATAGTCATACGGTCATATTAGTGGT
GTGTTTATGTCATTCTCATAATCCAAGAAAGATATAGAACATGCTGCTTGAGTCCATTTC
ACCAATGTACTACTACCTCTAGCTAAAAAATTAGAGTGATCCGAGATTTTGAAATCAAAC
TATCTTAATGATTTTAATCTTGAACAACCTTAATATCAAAAGAACTGCCAGGTATATAAA
AATAACAAGGAAAAAGCTGGCATGAGAAAGAAGGGAAGCAAAAAAAAAATCCCAAGATCG
ATCTTATAGTTTAATACTCCCTTCTTTTTATTTACTCCACATATTAGCTTTGGTCAAAGT
CGGGCTTCGTAAATTTTACCAAAATTCATAGACAAAAATATTAACATATATATTATTATA
ATAACAGATCAGTACTGTTAGATTCATTATTGAATCAATTTCACATAATATAAATTTGTT
ATGGTAAATATTTCTATTTTTTTCTATAGACTTGGTCAAACTTTACGTGGTTTGACTCCA
ATCAACTCTGATATGCGGAGTAAATAAAAACGAGGGAAGTATGTTACCCTTTATTCATTA
CAATTATATTAGAAAATCCAAATCAGTATGTGTCAAGAAGAAACGACACTTATTTTTGAA
CTCGTACGGAGTTCCATAGTATTTGTAGTTGATAAGTTCACATGGATGTCTACCAAGGAT
AGTCCGACCATGAGATTGTCACCTCGAATTCAGCACCATTGACACCAACAAGACGTTCCG
TATGCAGGCCGTCGATGGCAGTTTTGAACTCAAGCTTGCCTCTAACAATTTCATCTCCGG
ATCCACCGCGACGAAGGTCAAGCTCAATCGTCAGCGGCATGTGCAGCGGCAAGGCGAGTG
CATGCCTCGCCAACGGAACCGGCTCCCCGGGTCGCACGTGCACTCCCTGCTTGTTAGCGG
CCTCCTTGTAGAAGAGCACGCAACCGACGTCGAACAGCTTGCTGCGAGCAACGATCCTGC
CGACGAGAACCTCTTCGTCTCGGGACTGCAGGCGAGAAAGCTTCACGTCGACCCGGCCTT
GGATGCCATTGCTTAGGACGGCGTATATCACCTCCGCGGGGCCGTAGCCTGTGCGGACAG
TCTCCGATATGGCCCTGTTGTAGTTAGAGAAGTCGCCGCCAATGGTGTCGCAGACTATCC
TCGCGGTGTTCTCTTCCTCCTCCTCGTCGGCTTGTCCGTCATGGAGGTCGAGGCTGAAGA
CAATTGGACTGTATGCCGAGGTGGCCACCGATGGCCCAGTGAGCACGATGTTACCCTGGT
TCAATTCGGTAGAAGAATGCATGGATGAAGAAAGTGGTTTATGCTCCCTTTTATCTTTTT
TCTCACACGGAACGTAAGAAGATAAAAAGGAATCAGGATCACTACTTAATGAAATCATCA
ACGGCTCAAATTTATAATATACTCTTATCTTTAATGTGAAAAGAGGAGGTAAGAAGGCCA
TGTTAAAACTGTTCATCAATTAATACTACCACTAGACCGGTTTAAATTGACAGACATAGG
AAGAAACAAATTAAACGACATATAGATTGACAAGCTTCTGTGCAGATTCAGGGATGCAAG
ACCTTGTTAATCAGCTGTACTAGCATTCTCTGGGAAAAAAAAGTAGCCAGATTTTCTTTG
AACAAAAGCTGTGACTAAGCATGATATGGATTGAGGATTTAATGATTTTATTATCACGCC
TAAGACGAGATTTCTGAAACTAACAGGTTCGTCCAGCTTCTGAGTTCTGAACCGGCCAGC
CCGCCCCCTTGCTTGTGTTCAGACAGTAGCAGTACTCCAGCAATTAAGAAGAAAGGGGAT
CTAGATGGAACGGAATTGCACAGTACCTGGCTGTCGCAGCTGGTTTGCTGCGAGGCGTGT
TCTTCTTCCGGGCTGTAAATGAAGTCGCTGCT