Map Locations of contig_457587 (7313 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_457587

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61688 1 1383 bp AK362278 Available Available None
MLOC_61689 1 589 bp MLOC_61689.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_61688






CDS Structure of MLOC_61689






Contig Sequence (7313 bp)

>contig_457587 7313 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCAAAGACTAGGCTGATGGCAAAAAACTGTTTTCCAGTAGTGAGAGTGAAATCTTCATG
GGCAATGTCATTCCCTTAGCTTGTTCCAAGCTTATAGAATCACTAACCAATTCTATGAAG
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GGCATTCCCTTAAATTGTGCTGCATCATCCCCTCCTCTTCGGAGAAAATCCCAACACAAT
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GCCATCGTGCCCTTGCTTTTGTCGACTAGAACAAGCTCCAGTCCCATGATAGACACAACT
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GCCTGTTGTGCGTCACTTTGTACCCCATGTCGTGGTTGCACATGCCCACAAAACCTTGAA
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GAGGCGATGATCATTGAGTTTCCCATGAAGTGCCACGGGCCGCCTTGGGTCAGAGTCTCC
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TCCTCCTCCTCAAGACGACGTCATCGAGCTCATGCTCCTCCAAAGCGAGCTCCTTCACGA
GTTCCTCGATCTTGGCCTGGCGGCCTACTACAGAAGTCTCACCTTGGTTCGCCATGGTCC
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TTAGGAACGACGGTATACACTCGTTCGCTAACGAACGACTCACATTTTTTTAGTCTAAAC
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GGCGACCGCCGTCAAAAGAGTGCATACCTTGCTAAACTGCGAGCTTCAAAGTTTGAGCTC
CTAAACTCGTGACTAAATCTACATAAATCAAAAGTCCAATACTTGGGCTTCGTGGGTAAA
TGTTTGCTTTCGTCGAACATGGTCCAATACTTGGGCTTCAAGAAACCAAACCCTAGACAC
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CCTCCTCCTCGCGCGATCCGCCCTTCCAGAGCCTCCTGGTAGAGGCGGCGCCAGCGCTCC
GGCGGCCATGGCGCTCGCCTTCGACGAGTACGGGCGACCCTTCATCATCCTCCGGGAGCA
GGAGAAGAAGTCGCGGCTGCAGGGGCTCGATGCGCAGAAGGCCAACATCGCCGCCGGCAA
GTCCGTCGCGCGCATCCTCCGCACCTCCCTCGGCCCCAAGGGCATGGATAAGATGCTCCA
GTCCCCCGACGGCGACGTCACCATCAGTAATACCCGCTCACTCCCGTTCTCCAAGTTTTA
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AGTCTTATGGTAGTGAGATCTAGCTGTTTTTGGGACGCCCCTTGCTTTCGCGCTGTTGTT
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TCTCTATCTAGTGGCTACGAGCGTGCTGTGAGTTTTACTGCTGCAAATGTTATGCTGAGG
TGCCACCATCCTGTGTGGATCTGGAGATCCGGTTGTGTTCTTTAGCACCTCATTCATTGT
GCTTACGTACTTGATTAATTTATCTGATGCTTTGTTTACTGACCATCTTTCTACATGGAT
TTTCAGCCAATGATGGGGCAACCATCCTGGAGCTAATGGATGTTGACAACCAGATTGCGA
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TTGTGGTCATGGCTGGGTCGCTCCTGGAGCAGGCTGAGAAACTGCTAGAACGTGGTATTC
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TCTTTTATATGTCAGCTGTTTTAGAACTGAGTTATAAGATATTACCTCCGTTCCAATTAG
TTGTCTTTGATTTGTCTTGATATGGATTTACCTAACACTAAAATATGTCTAAATACATCT
GTATCTAGACAAATCTAAGACAACTAATTCAGGATGGAGGTAGTATTATTTTGGCTTGAA
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TCCCTTTGTTTTGTGAGAACAAAATTTAAGGACAATTTACTTGCCTACAGTTTTGGAGAA
TTTCTGGTGTCATTTTAATTGCAGATGTTACTGTCTTGTACTCTTGTCCCGTTGTCACTT
GAACTAATTATGTACAATAATATCAACTGTCCTTGACCTCCACTGAAATCTGTTTCAAAT
AACTTGCTGTTGAGTAAATGAAAAGTGTGAATGCAATAATTCCACGCTCTAGCCTTTGCT
TTATTGCCTTGCAGGATGTTAAGTTGTTGTCACATGCCACTGTGGTATGTCTTTGCATAG
TCATGTGACTCATCTTTTTAACTCTTTCTTAGTGTTAGCGTTGGTCTGTGTGCATGGTGG
GTTGATGATATAGTTAAATGTGTAATGGATGGAGTATTTATGTATCAGTACATTTTACAT
AGGTTATTTCAAGCTTTCTGATCCGTCCAATTATTCTCTTTCTACAGTGTTAGCCGTTGT
AAGCGGGCTCTAGCTGAGATTGCTGTCAAAGCAGTCCTTGCCGTCGCTGATTTGGAAAGG
AAGGATGTAAATTTGGACTTGATTAAAGTGGAAGGTAAGGTTGGTGGGAAGCTAGAGGAT
ACCGAGCTAGTACAAGGAATCATTGTTGACAAAGATATGAGCCACCCTCAAATGCCAAAG
AGAATTGAGGATGCTCACATTGCCATTCTCACCTGCCCATTTGAGCCCCCGAAGCCTAAG
ACCAAGCATAAGGTTGACATTGACACTGTAGAGAAATTCCAGACACTGCGTGGGCAAGAG
CAGAAATACTTCGATGACATGGTTCAGAAATGCAAGGTAAAAGCCTATAAAGGACAAACC
GTTTATATATTGTGGAGTAGCTTGTTTTTGTATGCTTGGTTTGTGATGTGTGCTCTTTTA
CAATAATACATTATTATTAAATACCCTTAGGCTGCAAAAAACACTTCCTACCTCCTGTTA
TTAACATTTATGTTACTTATGTTATGCTATACGAAGTGTATGCACATCAATTTGTTTTTT
ATGTTCAGTGTATGATTTGCTCAAAACATAATTGCGTACCTATGTATGTTTTATAGGATG
TTGGTGCAACCCTAGTTATTTGTCAATGGGGGTTTGATGATGAAGCCAATCATTTACTAA
TGCAAAGGGAGCTGCCGGCTGTCAGATGGGTTGGTGGTGTTGAATTAGAATTAATTGCCA
TTGCGACAGGTAACCTACCTCTCTTCATGTGATTCTAAAATATATTTTAAGGCAGTACAT
AACATTTGAGAACTGACTGCAGGTGGGAGGATTGTTCCAAGGTTCCAAGAGTTGACTACC
GAAAAGCTTGGGAAGGTATAACCTGATCTGTATATATCTTTTTTTTTCAAACAAGTAATA
TGCATGCATTTGTTGTTAGGGTTCAACAAAGAGTGAATATAACCGTGTGTGGGTTTCTGA
GGGTGACTATTCACCACTGTTTGATATGCGGAATGTTTATCTTCAACCCTAATTCAACCA
TCATGAAAACACCATGTGAACGCCTTGTTAATTTGAATGGCATATGATGTATTGTTTGAA
CTTTGAATGGCATATGCTTGGTAGCCATCTTAATTTGCTTTGTAAAGCATAAGATTTATG
TTTGTTTGCTTGTGCTGCTTAAATAGGCCGGATTAGTCCGAGAGAAGTCATTTGGAACAA
CAAAAGATCGGATGCTTTACATCGAGAAGTGTGCCAATTCCAAAGCTGTAACTATTTTCA
TCCGCGGTGGTATGTTCTGATGTATATGTCTTCTTGTTTCTCATATTGCACATGAATGTT
CAGTGCTTTGTTGGGCCAAGGAAGCACCATCCCACCAACCGTGAATCTGTTCGAGACACA
CTTTACAGTTCATACTGGATAGAATGGAATACTGGATAGAATGGATATTGTTATATAACA
ATTGGCAGTATTCGTACTTCAAATTTTTAAAGCAATGGTCTTGGATGAAACTTTTAATGC
ATGTTGACTCCATACTAGATCGTACCGATTGTTGATTGTAATACATGTGAAATAATTCTT
GTTTCCCACTACAGCTGAAGAAATGACCACATGTTTTTAATGTTGATTATATTTTATTGT
ACTTGCCATACCTCAAGATGGCTCATAAAATGATACCAGTGAACTGCATTTTTTTCTTAA
TTTATGCCATGAGCCATCCAAAGTTGTCCAATAGACCCTCAAATGTTGATCTGGGTGATG
TAGGAGTCTGTTGGCAACTAATCCACATCACTGAGCTATATGTTCAATACCACCCTCCAA
ACCACTGCATGGGTTTAGTATAACTCCTTCCCAGTTTGGAGCTCACTTGGTTATGTAGTT
CTGGGCTTAGTAAGGGTGTGTTTGGTTTGTGCCCACAGTTGCCCTGTCAAAAAAGTTGGC
TAGAATTTTTTTTGGTTGAGGTTTTGCCGTGCCAAACTGTTGGTATCCATCCAAACAAAA
AGCCAATGCTTTTGTTGATGACGGAAAAACTCGTAAGGTACACTTTGGTCACAATCTGAA
CATAACCTAAGCACCTCTGTTGTTCACGATAATGTCTATTTTTCTTGTGGAATTGGTATA
CAGTCATATATCATTACATTAAATTCATCTGTACTACTCCCTCCGTCACGGTTTAGAAGG
CATGCTTGGAAAATCTCTCGGACCAAGGTAGTCATCGATTGGTTGTGAGATGT