Map Locations of contig_45560 (10259 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45560

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61486 1 736 bp MLOC_61486.1 Available Available LOC_Os01g64180.3, FRAME:-1, EVALUE:4e-13, 13101.m06907 protein expressed protein
MLOC_61487 1 1180 bp MLOC_61487.1 Available Available LOC_Os01g64190.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-27, 13101.m06908 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_61486






CDS Structure of MLOC_61487






Contig Sequence (10259 bp)

>contig_45560 10259 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGCGGGGGCCGGGCGCGGGCGGCCGCGGCGGCGAGGCGACGTCCGCGATGACCGTCTCG
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TCGACCTGCGGCATCGCCCACCGCCACCAGCTACGTACGCACCCACCTCCCCCGCCCCGT
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CGGGGCAGGGGGAGGGGCGGATGCATCAGAGGCTGTCGAATGGTGGTGCCACCTCTGAAA
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CTATGTTTGTAGAGAAAATATTGACATATCAATACCAAATACTTAGAATACGACAACATA
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ACCACAAGAAGTCGCGCTAAACTGATACGTGACCAGGTGAACACTAACTTAAGTTTACCT
TGTAACTTTGATGGCACAACTATACTTTCATCTTCGTTGTTGTTGATTCAACTTAGGTAT
CACATGGAAGAAATCCAACATCCTATAAGCTCTTGAAGGAACCGGTTTGGAGACAAGTTT
GAAAAAAACAAGTTTCAAGTGAAGTTGATGCTGTCAGTTTTTACCTCCGATGTCTCGTTG
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AAATTTACTTTCCAATGCAAGGAAACCTCACATCATTTGTAGTTTTGAGTCAAAAGTTAT
AGTCATTCTCGTGAAAGGTGTCCATGTTGTGAAGGTTTCACAGATTTTCGAGGAGCTCTC
CAACAACTCCTAAAGTTAATTGCTTATTCTCCCAAGGAAGCCATGCAAACCTGATTACTT
TTGAAGTTTTTCACACCTAGCTAAGGAGGGTTGTCCCTGTTGGGGAATGTTGCATGGGAA
NNNNNNNNNTTCCTACGCACACGAAGACCTATGCACATCTACGAGTGGAGATTTGGATC