Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_45548 (6081 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45548

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61475 1 1266 bp MLOC_61475.1 Available Available LOC_Os11g14270.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-31, 13111.m01462 protein transposon protein, putative, unclassified
MLOC_61476 1 1253 bp MLOC_61476.1 Available Available None
MLOC_61474 2 3032 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_61475






CDS Structure of MLOC_61476






CDS Structure of MLOC_61474






Contig Sequence (6081 bp)

>contig_45548 6081 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGAGTCCTTATTAGTCTATATTTACTTTCCTTGCACCTCAAGTCATGTGTAATANNNNNA
TGCCCCTTGGGCCTTCAATACAGATAAGTTGCTTTCCTAACAGTATCGAAGTTCAAGATG
AGATGAGAGGATCATGTCACTGCAGTTTAAAAAAAGATCATGGGCAGCCTGGCACGAAAA
AGATAGGCGGGGCGGCTCAGGCTTTGACTTAACTAGTACAAGAAGCCTGGCCTGGCCCGA
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TTCTCTCGCGACCCCAAGCCTCTCTCTCGCACGACCGGATGCCGCCGCCGCCGCCGTTGA
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GCTGCCGCCACCGATCTACCCTACCGCCGCCACCACCGATCTACCCCGCAGCCGGTCTTC
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TTCTCGGATCCAGAGTAATGATTAGAAAATACAGGTGATAACACTTCGAAGAACGACAGG
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TAAGCATCCCACTTATAACTTCAGAACTAACGCAAGTTGGCAAATTCTTTTCTAAACACT
AAATCCAGATTTTTAGCAAAAAAACGAGATTACTGTTGATTATTATCTCCACTGCCTTAT
AAACTGGAGTTGGTGGTCGTGACGGTGAGTTCACTCCCTACTCCATCCCAATCTCCCTCA
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AACCTTCCTCATCCATCTAGAACACACCAACTCTTCCAGTTTGAAAAAAAAAGGAACAGA
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CAACTTAATCAAACCACCAAGCGACCAGCTCACTCAGGCGCAGTGTTGGTTGTTGTGTAC
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GCCCAGGCCACTGCCTGGGGCGTACCCAAATTTCTCGGCCTATATTTATAGAAAAAAATT
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TCCCCAACCCCGCGGCTGCGATGAACGTGCTAGTGCCGCCCGTACTCACGAGTCAGGAAC
CCTAAGCCATCACCCCGCCACTGCGCCGCCCACCTCCCGACGCCAGTCGCTGACAGTTCA
TCTCCATCCAGCAGCGCCCCAGCCACCCCCGGCTTCCTTCCTTCCAGCTTCCAGCGCCCC
CTGTTCCAGTGCTGCTCGCTGCCGCTGCTGCCCCGCCCCGCCAGTCGTCGGCGCCAGGTC
CGGCAAGGGTACGAGGTGGCGAGCCGGCGACCCCGGCTAGGGCGCGAGGCTGCAGCCTGT
AGGCTGCCCAGCGACCGGCAAGGTCATGGGCAAGGTAGACCATGAGTTTGGCCACATTCA
GTCCACAATTCCACATTTTTCATTTCATTTTGATGCCCTGTTTTTGTTCGTAGTTTTGTA
GATGCCAGATTGTTTGATTTTAGTTGCTATATGCCATTGTATGTCTACTTTTAGATGTAG
AAACCGATGTCACATTGAGGAATTTTTGTTTCTTTAAATGTTTACAGGAAAGCAAGATGA
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TAAAGTTTTTAATCAACATGTTGGCAAGCATGATAGCGCTCATAATAAATCTAGGCAACA
TTATGAGGATTTCAAAAATCAAAGACAAAATCTGCCACATGTGTTTGATAGGGGTTCTCA
GAAGCAAGAAGAAGAATACAAAGCTCGTCTCTTGGTTATATTGAGTATTGTCAAATTCGT
GATACTACAAGCTCTTGCTTTTCGTGGTCATGATGAGTCTACTAGCTCAATGAATAAGGG
TAACTTTAAAGAGTTGTTGGACTTGTTCATAAAGAAAGGCCCACAGGTTATCGCACACGT
AAAGGCGTTTTGCCTCGTTCTAGAAGTAAGTTTTCACATTTTGCATCTATTATTAACTAG
TTTTATCTTCTATATTATGCACTAATTTGCATTTGAAAATTGATGATTGAAGGTTTAGCT
TCTTCTGCTATTGAAGATGTTGTCATGGGAGGCTCAGATCAACCAATCCTTTGATTTGGT
ATAAATCTTTTGTATCATCTATCTATGCTATATGTTGTCTTTTGATTTGTCTTGCTTTAT
TGTCGACCCATCATGGAACAAATGCTGCCACTGAATTTTATGTTTGGTTTCTTATTAGTT
ATGCAACATAGATTAACTTTTGTATGCCTTCAAACTAGAGTTTTTTCTGAGTATTTTTTA
GCCCTTTGTTTCTCGCCTGGGGCGTCAGACAATCCTGGGTCCGCCACTGCTAGTTACTAC
CCTCTGTTTCTAAGGGGCTGTTTGGTTCCCACCCTAAGGTTGCCACGCCTAACCTTAGTC
ATGCCATAATACCTTAGACATGTGTTTGGTTCATTGCCACATTTGTGACTTGCCACACTT
TTCTAGTTATATGGTCCACAT