Map Locations of contig_45539 (7658 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_45539

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61471 16 2668 bp MLOC_61471.2 Available Available LOC_Os05g45890.2, FRAME:+2, EVALUE:3e-176, 13105.m04883 protein tRNAHis guanylyltransferase family protein, expressed





CDS Structure of MLOC_61471






Contig Sequence (7658 bp)

>contig_45539 7658 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATCCTCCGTTTGTTCTTTTTTTTTTCTCTCTTCCTGATTTTTGGATTTGATGAGCGCTT
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CGTCCTCCATGCGAACCCAGAGGCTTGCCGCATGAAGGTTGCACTCCATGATCAACACCC
ACTCATTGTAGTTCGAGTGCAGGAGCACTGGGAAGGTGGTGTGCACACTACCAATGACTA
CGGTTTCTCGCACGATCTCCCTAACCACGACCTCACCGCCACGACCGTGCCTGGACCGGC
TGTGCCATCGCCGTTCCCGCGGAGTCGGCGACTGGGAGTCGTCCTGTGATGTATGCTATT
TGAAACCACCCGACATGGCTACCGCAGCCTCAGGCTTTCATACTACTTGTTAGCCCAAAA
AACTACAGAGTAGCTAGCTACCAAGGATCGGACGAAGTCGAGGAAACAATATAGGAGCTA
GTACGAACTAATAGGACACTTCTTGTATTCTGAGCACACACACTGATACAAGGAGCTCAC
GTGTGGTGGTACTACTAATCGAAACTAGCTAACTTCTTTCACTGGATGGGAATGGAATGG
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GAGGAAGACGAGGGATGTTACCAAATCAAGTGCATCAAGGACGGAACAAACCAACTCTTG
GTGAAGAACGAGGAGATTAAGNNTAGATGGCGGGAGTACTTTGACAAGATGTTCAATGGG
GAGAGTGAGAGCTCTACCATTGATCTGGACGACTCCTTTGATGATACTAGCATGCGTTTT
GTGCGGCGTGTCCAGGAGTCGGAGGTCAAGGAGGCTTTAAAGAGGATGAAATGGGCAAGG
CGATGGGCCCTGATTATATCCCCAATGAGGGGTGGAGAGGCCTCAGGGACATAGCGATAG
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