| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_45520
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_61457 |
2 |
1394 bp |
MLOC_61457.1 |
Available |
Available |
LOC_Os02g36974.4, FRAME:-3, EVALUE:2e-173, 13102.m04047 protein 14-3-3 protein, putative, expressed |
| MLOC_61456 |
2 |
1072 bp |
MLOC_61456.1 |
Available |
Available |
LOC_Os01g04920.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13101.m00457 protein glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed |
CDS Structure of MLOC_61457
CDS Structure of MLOC_61456
Contig Sequence (12390 bp)
>contig_45520 12390 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGGCATTCCTGCTTAACCGCTCTTCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACATATGTCTA
TATACATCCATATGTAGTCTTCTAATGGAATCTCTAAAAAGACATATTTAGAAACGGAGG
AAGTAGCACTGCTGGTGAACCACCTTAAGCAAAGCTACCTGGTAGCGGCTAAACGATATC
TATATTCCCCTGCTGCAGATACATTCCAAGATATACGTTTAGCTGGCTCGTCGAGCCGAT
GTGGCAAGTCATCCGTAAGCCATCCACGTCCGCCCGCTTCATCTGCGATTTCTTCGAAAA
ACAGTCAACTTTTATGTGTCCAAAACACTGATCTGGTCCTGCTCTTCTCCACAGGGTTCC
TCCACAGAGCCGCTGATCTAACTTTGGTGCCGTCCGCTGCTATCAGCAAAGATTTCGAAA
CTGCCCATGTTATTTCAGGTTGGTTAATAATTCAGTCTGCTACACTACTACTCCATTACA
TTACATGTCATGACCTTCTTATGGTTTCTCCTCATGCTGATGATTTGGTTTGCATAATTG
TTCAGCTAACCGGATACGCCTCTGGAACAAAGGCGTCGATTCCGCCAGCTTCAACCCCAG
GTTCCGCAGCCATGAGATGCGCGTGAGGCTAAGGTGAAATCCCGCTTTCATTTCTTCTTG
AATGTTATGTGCTAGATGGGCTCAGATTAACTGCTGACACTTGTTATGTGTGATATGTTG
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AGAAGAATCTGGACTTCCTGAAAATGTGAGCAACATTCATACATTGCAATTCATGATTTC
ATTACTATGTTTACTTGCTTACTTTTCTTTTAACAAGCGTGAAGCTCCTACCCGAAATGA
AACGAATACCATTTCCCTATGTTGTGCCTTGCACTATGAGCAACTTCTCCCTGATCTTGG
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TGGGCCATATAGGACAGAGCTAGAGAAGATGTTCGAGGGGATGCCGGCGGTGTTTACCGG
GATGATGCAAGGGGAGGAGCTCTCGCAGGCGTATGCAAGCGGCGACGTCTTCGTGATGCC
CTCTGAGTCAGAAACACTTGGCCAAGTAGTCCTCGAGTCCATGTCGTCGGGTGTCCCTGT
GGTGGCCGTTCGTGCCGGCGGTATCCCTGACATTATCCCAGAGGACGTAGAGGGAAGGAC
GAGCTTCCTCTTCGCTCCGGGGGACCTCGACGACTGTGTTGGCAAGATTAGGCTGCTGTT
GACGGACGACGAGTTTAGGGGCGACATGGGGAGGGCCGCCAGGGCTGAGATGGAGAAGTG
CGACTGGAGGGCCGCATCCAAGATGATCCGCAACGAGTTCTACAGCTCGGCAATCGACTA
CTGGCGGAAGCAACAGGCGGAGATTGTTCAGCCACTGCAATGGCTGGCGCAAATGTTCAT
GCCGACGCCGAACCAGGTCATCCGCGGCATCAAGCAATAGTGGTGGATCTTAGCCATGAT
CTAGGGAGGTGGGGGACTGGAAGATGGATGGACAATTCCATTGATTACTTGTAAATTCTT
GGTATATAGTGCAATGTCAATAGGTGAGAGATAGTTTCTGTTTTTCTATTGTGGAATTGG
GATACAGTTATTGCTTGTATTGTAATAGTGGAAATGTGAGCATGATCCATCACAGCATCA
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TAAACAGTGGAAATACTCCCTCCGTATCAAAATAATTGTCACAGATTTAGTACAAATTTA
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GACACTGTCGTCGCTATGCAAACCTTTTTTACAACTCATGATGATCATGGCATCATAAGA
TTTTGCATATCACCTGTAGAAAGCTATTGTATCTGGGTTTTATTTTCCTGAGGGACAAAG
CTATCTGGGTTAATATAACATAAACTAGTTGCAAATTTGTTGCTTACGTCTCCATTTCAA
AAGCTTTCCTTCAGTCCAGTCATATAATAACCAACTCCCGCCAACAAATCGCAAATCACA
AAACTGGCATGTCATTCCTTGAATCCAGTTGCAGAAAAGATATGTGCTTTAAGAACACCG
TGCACAGTGAAAAATGCATCGAAACTCCTCACATAACACGCGAACAAAGATTCAGCAAAG
TGGAAAGGGTTCAGAAGACGCCCTTCCTAAAGAAGAAAAGCAGATGAATAGACAAGGGGC
CACACAGACAAGAGCAGCAGAAATTTCTAGAACCACCAAAGTAACAGGAAGGTTCAACAA
GAGGCAATAACCAGTGCAGCCCGATAACCAAGCAAGGCAGGCAGCTACAAGCTTCCCTAT
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CTGAACAAGCAAGAAAGACAAGTTTCTGGACACATAGACAATGTTTACTGTCCATCTCCA
GATTCACCCTTGGGAGCATCCTTCATTTCTTCAGCAGCGTCCTCCTGCAGCCAAGCAAAG
CGAAATTTACATATTTAGAACTGGTTCAGTGAGAAGATAGGATGCAGATGATAAGGTATG
CTCGGGACGAAATGAAGTACCGAGATGTCGGAAGTCCACAGCGTCAGGTTATCACGGAGA
AGCTGCATGATCAAAGTGCTGTCCTTGTAGGACTCCTCGCTCAGTGAGTCCAATTCCGAG
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TATCTTGGAACACAAACATTTAGGCTTTGAAAAGCATACTACATCCATAATTTTCGTTGA
TCATCCTATGTGGAACAGTCATTATTTCTTTATCAGTCTTTCAGGTTCAACAACACCCGT
TATTTGCCTATCCAGCTGTATAGCGCCTAACACTGGTACCTTGTTAGCTAACACTTGTTA
CTCAATTGTTTGTCACAATTATCAAGCCCAAATATCAGATAAAACTGTATTGACTTTGAA
TCATCTCAGATCCACATATTCAGTTCAGATTACTGATAAATCATAAAGGACAAGCTCAGC
AGGTTATTTTAGAAAACAAACCTGCTTGGCGAGGTCGCAAGCACGGTCAGGAGAGTTGAG
GATCTCATAGTAGAACACCGAGAAGTTGAGTGCCAGCCCAAGCCTAATAGGATGAGTCGG
GGGCAGCTCTGCCAGTGCAATCTCCTGAAAGATTCAACATAAACTCAACTGAGCAAGAAA
TTCATCACCAAAGAATTAAACACGATAAATCATGCATGAAACCCAATAAAGTTCAATGTT
AGGACCATGAAATCCAGGTCAAGCAAACTACCTGAGCAGCTTTGTATGCCACCATGGTGT
TCTCAGCAGCATCCTTCCTCTCAGTTCCACTCTTGAACTCTGCAAGGTACCTATAAAAAT
ACATTCAACCAGGGAATCAGTTTAATATGCAATGAAGAAAGCATGCAGTGATTCTAAGCT
GCTCGCTAGTGTAATACCTGTAGTAATCACCCTTCATCTTCAGGTAGAAGACCTTGGACT
CTGGAGCGGTAGATGAGGGGACAAGGTGGGAATCAAGAAGCTTGAGGATACCATCACAAA
TCTTAGTGAGCTCAACTTCAATCTTTCCACGGTAATCCTTGATGAGTGTGACACGGTCCT
CGTTGCCACGGCTCTCTTCCTTCTGCTCGATGGAGGAAATGATGCGCCACGAGGCACGGC
GGGCACCAATAACATTCTTGTAAGCAACTGATAGAAGGTTGCGCTCTTCGACGGTGAGCT
CCTCGGAGTCAACTGTCTTGGCCACCTTCTCCATGAACTCAACCATCTCCTCGTACCTCT
CAGCCTGCTCTGCAAGCTTAGCCATGTACACATTCTCCTCACGGGAAAGCTCAGCAGGCT
GCGCCATCTTCAGTGTCTCTGGTTTCTAATGGTCACCGAAGGTCAATCTGGAGTATTTGG
GAGAAATTTCAGTTAGCTAAATGACAGATACCATGTCATTACAACTAGCACATGAAGCTT
AAATCTAGCCATTGCTACTCAGGTAAATTAGCTCGCCACTTCAATCACACGATTTAACAT
TGCTCAAAATCTTTAAAGCGAGAATTTTACACAATGATTCAAACCAACTTAGCCAACATA
CTATATATACTGACAGATCAAAATCAAGCAACCAGAATCTAGAACACACAGATTTGGGGC
CATTTCTCCCCGAAGCGATTCCATGTGCCATGGGTATGGCACCCCGTTTGTCTGTCCGGT
GACGCTTCTACTAAACTACCACCAACCCATCAGTACCCATACACCTATCCACATTCCGAG
GTGACTTTATGACATATCAGTACCCATACACTTGTCCATATTAGAACAGCATAACCCAAC
CACCTTGCAGTTCCACTACATCTCTGTCATGTCTCTTATCAATCAGCCAAACTTCCTGTG
CTCTCTCTTGTCCAGACTAGCTGTTAGGCAAACCAGCTGGATCAACCGCACTGCCCGCCT
CCACCCTTATCGCTGCCATCACCCTCGTCTTTCTTCTTAGGAGGGGGGCGGCTAGGCATG
TTCTGAAAGAAGCCGATCGAGAAGAGCGACAGCGACAGCTGGACCTGGTCCCGGCCCAGC
CTGGCAGGAGGCTGCTGCCGCCTCCCCCTTCCCTGCGCGGGCGGCGCACCAGCACGGCGC
CTCTGGATGGGGCGGATGGAGACGGCGTGCAGGCGGCGGAATCCGCCGAGCGAGAGCACG
ACGGCGCGGAGCTGCTGCTCGGAGAAGCCGAGGTCGGTCCACTCGCGCACGCAGGCCGCC
TCCCAGAGCCGCTCGTCCTGCGCGAGGGCCCGCCAGCCCCGGCTCACGCACGCCGCCGAG
GCCAGCGTCCGCGCCTCCGCCCGCCGCAGCACCTCGAACATCAGGTCCTCCCCCAGGTAC
GGCACGTCTCCCCCGTCCGGCGCAGGACCCGGCGGCTGTGGCGGAGGCTGCGGGGAGGAG
GAGGTGGTCGCCTCGTCGGCCCGGCTCGAGCTCGCCGTCCGCTGCTGCTTCTTGGCTGGC
TCGCTGGATCCGCCGCCTCCGCCGGAACCGGAGCCGGAACCGGGGGGAGGAGCCCAGGGG
TCGCGCCCGCCCGGGGAGCCGGAGGGGCACTTCATGGCGGAGCGGAGAGGGGTCGATCTA
CTCGATCCTCGCCGGATCCGCTCGAGCGGGCGGGGGACGGGGAGGGGTCGAGCGCCTGCG
GACACGACGGGGCGGATCTAGATCTAGAATGGTGCGGCCGTTCGTAGGAGGTCCCCTAGC
GGGAGGGATTTGGATAGGAGAATCGCTGGGGGAAGGGAAGCTCGTCCGTACCTCGAGCAA
GACGGGCGGCTGTCGACGGCGGAGGAGCTGCGGCGTCGGCGGGCGGTGGCGCGGCGCAGC
TGGGGAGGGAAGGGGAGGTTGGTGGGTGGGAGGTCAGGAGGAGTTGGAGGAGAGGAATGG
TGTGGAGGAAACTGGCGGCTGGCTGGCTGGCTGATGATAATGGTCTCCCTCCTCGGGCCA
GCTGGACTGGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGTCTACCGAGCTGGACCGCGTGGGCGG
GCTGGACGACGACGGGGTGAGCGGACCGATTTATAAGCCTGCTCGCTGCAACCAGACTCC
ACCTCCTCCAATTATTTTTAACATTTCCCGCGCAGGTCCCTTGCTGGACTTATGTTCGCG
CCCCTCGTTTGTCCCGGAGCTTACAACTAGGTCCGTTTTGTGGCGTTCTTGCGTGCACTG
CGGCCCCTGAGCCAGACCTTAATTTCTTACGTGTTGGTCCCTGCTTTCAGCTTCGCTTGC
AAACCGGACATACAGTTTTCTTATCTGCCCAGCCGTTTCCCTCCTATGGTCTACTTGTTA
GTTTTTTCTTTTTCTTTTCGTGTGTCTTTGGGTGCTGCTCTTTTCGTGATTTTACTGTTT
TAGTGAACGTGCATGAGACCCGAAGAAAATAATACAATACTGAACGGCATATGTTTTCAG
TATTAGATCACGTCCATCACGATAGGCGGTATTGGTTTGGCACAAGATTTTTTTAACACA
AATGATGTTGCTCTATTACGAGGGGCAACACTTCACAACCGCCACACGCCCACAACTCCG
GCCTTCTTTCCTCTCTCTACATCTCTCTCTCTCTCTCGATATGTGGCGCAATTACATAGC
GGCATGTGCCCCAATTGAACACCCGAGACAAACGACACAAATAACCAAGTTATAGACCAA
GATGACAGAAAGAGTTGTCTGGTTGATGACGCACGGGATACACATCTCAAAACCGAGAGA
TTTCTAATTCTAGGGAGCTAAATAGCATCTTTAGCAGATTCCTCGAAAACTATATCTGAT
GGGAATTTCAAACTACTTTGGTGTTGCGGGGCAGCACACCATTAATATCAATAACATGGA
TCTTGATGGTGTGCGTACCAAGTGGTAGCACGCCACCGGTAACAGAAAGCATTAGTGCAG
GTAGGAACACATCGCTACATAATTTTTAGGCATAAAAAAATACTGTCGCTGCACCGCTAT
TCTAGCGAAATGGCTATTTTTTGTTGTTGTGGCAACATTTTGATCCATTTGGCACCAAAA
TGAGAAATTTTTCAGTTTAACATTAATAGCATATATAACATGCTCAATAAGGTACTAACA
TAGCATGACTATGAGCTGTTATGTCGTGCCACATTGTGCTTACATATGGGCCCATTTGTC
AGTTTTGGCATCAGGAAGTGCTAAGGTGGCGATCAATGTGATTTGCCAAAAAAAAAAACT
TTACACATGGTGCATATTGCAAATTAGAAAAATGGAAAACCATCTTTCCTACAAATGATG
ACAGTCGTGGTGGTTACGTGCCATTAACTCAATGAAATTCGCTAGGTCGGAGTCAGTTAG
CCATGATACAATTTTAGTCCCGGGACATTATAGACTTTTGAACAGACAAATGAAATAATA
AGCTTAGGCGATAGAAGCCAAAAAAAATAGACTAATTTCGCAACGATTTATATTCAATGT
TATTTTTGTGAGCAACTAAGTTTAACCTTAACTAGGCCCACTTGTAGCAAATTATACGAC
TGAGTAAAGGGTGCCCATGGTTTTAAAAACTCGATCGGACTAGCGAGGCGACCTGAAAAA
TGGTGAACCACTGTCTTGCCTTTAAGGTCTACCGGTCTTTAGTTAGAACCCACAAAATAT
TCAAACTAGGGTGCATCAAAAAGGAATCAAACAACTAGCCTTCATCAAGGCATGCTAAAG
GTCCAATAACCAACTATGCTAATAACAATTTGAAATTTATTAATGGTTTAGATATAATAT
TACGTGTATACATTTTATGTGAGGTCAAATTTTAAAAAATTACCTTATGTATTTCGGTAT
TTCGTCGCAAATGAACCAATGGTCCTACCAGTAAAAATCTAAACCGACAACCTCACCGGT
TCAATTGTCAGTTTGTTTTTTGAAACTACGAGTGTGACGTGTTGTTTCCTTATTGTACGA
TTTGTCGTTGCTTATTTATTCATGGGACTTTTGTGTTATTGTTTTTGTTATTTTAGTGGA
GGTGGCCGCGGTGAGATCCGTTGAAAGCGTAGACATGGTGATTTTAGTTTCGCTATGAAT
AGGTCCCTGCTTTTGTTGCAATCAACGATTGTTTACGACAAAGTCATGTTGGAGCTTTCC
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TTTACAAACTTTCACCAAGTTTAGAAAAAATTGTATTTATATATATGATACGAAATATAT
ATAATACGAAAAACATGTCTTATGATGTATCTAATAATCTGTATTTAGTAGTCAAGATGT
ATATTTTTTTTCTACAAACTTAGTCAAAGTTCGTAAAATTTGACTTCCTAAAAAATCTAT
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TTATTTTTGTCATTTTAGTGAAGGTGCCCTGCCGACACTTCACACACGTGACACGTCAAT
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GACCTTGTACACCTCAAATGAACAACAAGAATAACTAAGTCGTAGGCATGCCAAGATGAA
AAGAAATGGTGTCCCATCGATGGTAAATGGGATTCAGATCTCAAAACGAAATATGGAAAA
TTTGTGATAGCGTATTTGTTATAGTTGGCAGTTGTTCACTAATAAATTTATATAGTAGCT
AACTAGTAACTAGTCAAACAACACTGTATTTTTGATAGCTATTGATTATGAAGAAAGCGG
AGACAAACAAGACATCGCAAACGGATTAAAACTTATATGAGTGAAATGGAAAATAATTTA
TTCTAAATTTTTTAATTATGTTTTAAGACAGGTGATGTCTAGATTTTAATCAATCAAGTC
GTTGTAGTATAGTGGTAAGTATTCCCGCCTGTCACGCGGGTGACCCGGGTTCGACCCCCG
GCAACGGCGCTTTTTTTTGCTTCAGCAAAGAAACAGGTTACTGAACCTCATCCTCCTCTG
TACACTGTACTACACGTCTACGCGCACGCACGCCAGTCTGCATTCTCCGATAGCCAATCC
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AGCAGATCCAATTTTGCTCTATCAAATATCAGTGTGGTGATTGCTTGTGACTAATTTTGG
GCTCCGAAAGGAAAAGATGGCGTGTTTCTAATGTTGTGTCAAAAATTTACTTTTGCCGAC
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CTAACTTTCATGCCTCCGTTAGTAGATGATGTCGCTACAGCTCCAGAAGTGAAGCTCCTT
TTCGCTACGGTCGACAAGATGAACCCACGTATGCCTATTTAAGAGAACCGACTCTGGGCT
GTGAGGGCGTCTCTAGGAGATCCTTCAAAACTTATATTCGAGGCGAAAATTTGCTGATTA
AAACCTATCTGGCATATCACTAAACCAATAATCTTTAGAAAATATAGCTTTTCATCTCTT
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TGGAGTGAAAGAAATGCACGGGTGTTCCGACATAAGAGTGTGCCACCGACTGTCCTACTT
ACCGACATCGTCAATGAGGCCAAGTTTTGGGTTACCGAGGGCGCAAAGAAATTAGGGAAT
ATTTTTGTGGGCGAGTAGTTGTCATGCCGATTTTGTGGGTGTGTTGTAAAAACTCTAAAC
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TAACTTTTTGTGAAGACTTGGAGGGTTGTATTCCATGGTTTCATTATTTTGGGTGGTTCT
TGTTGATCTCATCTTGTGATTAGTTTCGGTTTGTTTCCATCTGTTAGGGACTTGTTAGCG
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TGAATGAAAGAAAAAACTTCTAGGGATATTTACGCGGTCACCTGACATTTCTCTGGGCAC
CGAGCCGCCTCTTGTTTTCGCCGTCCATGTCGCCATCGCCAACTCCATAAATTTCAATTG
TGACTTATATTAAAACAAACAATTATATAATTTAAATATTAGCAACGATTCAATATTCAT
ATCAACATTTTAAATTTTAAATTACGAATATTTAGTTATACAAACATTTGCTTAAACTAC
ATACTTATGAGTTATAGAAATGTGTGTATAATTATGGAAATGTTTCTATAACTAGTAATA
TTAAAAATTATAGTTTTAATTTTTTTTTGTATTCTCTAAAATTATACAATCATTTTTATA
ATTGGTAGACATTATTTAGAATATATTAGTATTTTTAAAATAATACGTGAATATTTTTTC
ATTTAATCTAAGAGTGTATATTAAAATGTTTTAATTTACTAATCATCATTTATATGTACG
ATATTTACAATCCATGTGCTTTAGGTGAGAGCTGCCATTTGACTTATTCAAAGATTTATT
AGAGCAAGATGGGCTTAACATATTTGATTGCTGCGACGGGTAGAATTTAGATTTTGAGTG
TTTTAATTAGAGTATATGCTGGTACCCTAAAAGCGAGAGAGTACAAAATTTCAATCAAGA
TGAAATCTATTGGGTTATATGGTTCGAGCTACTGCCTGGCATCTAATTATCATTTTTATT
TTTTTGTTTAGTGTTCCCTGTTTGTTTTACCTGTACGGGGTTAGAATAGAATTAATGTTA
GTTCTACCTCACTTTAACTTGTCTGTTTTTACCTTTCGGTCTGGGTTTTGTCTCATGTAA
CCTGAAAAATCACAAGCATAATACTGGATGCCCATCCCTTTTTGCCCATTCGTTCCTAAT
TTACTTTTTCATCCGACTTTTATGAGTTAGCAATTTCAATTATGAGTTCACGGAGGAACT
CTAGAAATGTATTTTCTCATTAAGTTACAAAGAAATTTCTGTTATTTGCACGTTGCTTAA
CCTTGTTTCGATGCGTTTTTTATGTGGTTGAAGTAATATGTTGCTCCGATGGTCGAAGAT
TTTTGACCAGCGCTCTCGTCTTGGTTGTGCACGCCATGGTGATTTCGGCTTTGGTATGTC
CTTTATCTCCTCTTCGTGTTTTCACCTAGATAAAGAAATCCACTGCATAGGTTGGTGATT
AATGTAGCGAGGGACAACACATAACTTACGATAATTTAGCATGCTACCACATCATTTAAA
TCTTAACCTTGTTCATCGAGATATTCTTGTGGTGTAAATAATATGTTGCCTTGATAATCG
AAGACTCTACCTCGATGCTCCCTCGTGGTGCGCACGCCTTGTCGTGTCGTGCCATGACTG
TTTGAGTGCTGGTGATGGTATGCCCTTTACCTCCTCTCCCTGTGCCATGTGATTTGGTAG
CGCGTAAAAAATACAATAACTTCAACATAATTAGTATAAATGAAACACACTAGGCAAGCT
AAATTTGTGATTCGCGTTAGGATGGCCGTTAGTTGAATCCACTCCTTTGCATGACTAGAC
ATTTTCACAATACGCCCCTAAACCTTGCTCAGTGTTGCTTGAGTCCATGTTGTGATGTAG
TATATGTAGGCATTATATAATTTGTCTATAGTTTTTTTGTCTCTCTTAGCTTGTTTGAGT
TGGTTGTTTAAATACTACTTCCGTCGTTCCAAAATAAGTGTCTCAACTTTATATTAGCTC
AAGTATAAAATTATACTAAGCTTGAGACATTTATTTAGAAATGAAGGGAGTATTAAATAT
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TGTTTTTTTTGTCAGTGACACAATAACGAATGCCCATCTCTTTCCTTCTGAATGCCTCAA
CCAAATTTGCCACACAGCTTGATAGGTATGATAGAATGCCACACCTTAAGGCAACCTCAA
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GGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGGTG