Map Locations of contig_45518 (9472 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45518

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61454 4 2469 bp MLOC_61454.3 Available Available LOC_Os05g45930.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13105.m04888 protein IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed
MLOC_61455 1 1586 bp MLOC_61455.1 Available Available LOC_Os05g45950.1, FRAME:+1, EVALUE:7e-110, 13105.m04890 protein outer mitochondrial membrane porin, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_61454






CDS Structure of MLOC_61455






Contig Sequence (9472 bp)

>contig_45518 9472 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGAGGGACTTCTTGTGTGGGGTGGAGTCCCCCGCGGACTGTTCCAGCCGCGGATCTCC
CCGCCCCCTTACCCTTTCCGTGCCTCCTTTGATCCGTTTCTGTTTATCTTTTTTTTTTCT
TTTTTGAAATTATCAGTTGCCGTGGTTGCTTTCGCTGCGACAGTGCTCATGATCTTTGGG
GGTTTGGGTGGATGCCGCGGTTTCTGGAAGTTTTTCTCTGCTTGGCAATTGCCCGCGGTG
TAGATCTGCGCACTCACGTGTCCGGCGGTTCCGCTGCAGGGTCCTCAACCTCCGGCGCGC
GGCGGGCTTGGAGGCGGCTCCGATGGGGAAGTCCCCGGCCAAGTGGCTCAAGTCCGTGCT
CTTCGGGAAGAAGACCTCCAGGTCTGCCTCCGCCAAGGCCAAAGATTTATCGGTATGTCA
ATACTTGGAGGTCAAAATTGATTTTTTCCGAGGATTCCACGGAATTGCCTGCTATGTGAT
TGCAACTAGAGAGCAGAGATCTGCTGGCTGCAAATGATGCTTTTGTTGTTTCCCATGTGT
AGAAGGCCGGGAGCAACAGAGGGTATGTGGCTGTCGGAAAGGAGCCGGGGTTCTCGGAGA
GTTCCCCGGTGATCTCCGAGCCGGTGCTCGTTACCCCGCGCAACAATGACGCAGTGCCGG
AGGTTGGGAAGGGCGAGAATTCCAGCTCGCAAGGCGAGGCGGTTGTGCAGCACGAAGTGA
ACCATGATTTGGATAAGCAGAGCACTGGCGGGTCTGATGTGCTGTCCAATGATCCGGAGA
GGTTGAAGGAAGAACAAGCAGCCGTCAAGGCCCAAGCTGCCTTCCGTGGTTACCTGGTAA
TGCTTATCTTTGATGTTGAAAAAATTCTTGTGTTAAAATGATCAGAAAAAGGGCAATAAT
TTTTGTCATACCTCTGATTATTCATGATTTAATAGTGTTCCTATTCATTTGGATTCCTGT
GCACACAGTTCACACTCTTAATGATCTTATTAAGCTGCCATGAAAGAATTTCTTGCCATA
GCCACTTGGTCTGTTTCTGTTTTGCTTTACAACCATGCTAATTTTAGCCTCACATTGGTC
CAGGCACGTCGTGCTTTCCGTGCATTGAAAGGAATCATACGACTTCAGGCACTGATTCGT
GGCCATCTTGTAAGGAGGCAAGCTGCTTCAACTCTCCGTGCTACATGGTTGCTTGTGAAG
TTCCAAGCTATTGTTCGTGGTAGAAATGTCAGACTTTCTAGTGATGCAATTCAATTCAGT
TGGAAGCTTGCCGAGCAGACGTCTGTGGTAAATTCCTTGTTCATTCTAGTTCATTCAATA
CCCGGTATACTATTCATCATGAGAGCAAATGAGTGCTCCTTTTTATTTGTATAACTTTAT
AATCTTATTGAACATGGATGTTCATGATTTTATTAGTGTTTTATGTGCGGAACACATAAT
GTGAGATATGGTTAAACTAAAAAAAAAAGTTTTCAACCTTTCATTAAGACCATGAAAACA
ATACAATGTCACTTGTGTACTTAACAGACAGATTGTCATGATTATCCTTCAAGTGTCATA
AGGCTTTTGCAACTGGTTTGCATACAAATGTTAAATTCACCTCATCGGCTTATCATTGTA
GTTCAAGTGTCTCTTTAATATGTTAACTATACCTTATTATTGTAGTTCAATTGGAAAAAT
GATTTCAGTTTTTTTCACATTAGATATCTATATACTAAAGACAATATGGTTGAGGGTTAA
CTTGCATACTATTCAGTTGTAACCGGACTAAGGGACTTTGTTATGCTTCTTATCAGAACC
AAAACAAGAGCTCTTTGTTGCTATTGCATTGAAGATAAAGCTATATATCTGTACATTGAA
CATTAGGATCACTAGGACAAAGCTATTCAGATGACACGGATGTTTCTATATACTTTTAAA
TGACTGCCCTTTTGGTTCAGTTTAACCAAACAATAACACTACAATGCCAATTGTGAACAT
TGTGGTCAGGTTCTTGGATCTTTTAAATGCTTTCATTTTTGTTTGTACGTAAGGTTGAGC
AAACTGAAAATATTTGCATGTCTTTCCGCTAAAAAACAATATTTGGTATCTTTACAAAAT
TCTAAATATACAATTCTTGTCTTTCCGCTAAAAAACTATCCTTGCCTTTTCTCAGGGTGC
TAAACCAGATGCATGGAGGGAAAGGTTTGCTTCAAACGCATTTGCTCGTAAGGTATACAT
GTTCAACATCTACAGTAGTTATTTGAGGGATGGATATATACAAAACAAATTATCCTGACC
TGTTGTCTGGTTTTTGTGCTCGGTCATTGACCAAACACATGCCATCCTCCCATCTAGTTA
TTTTGCTGTCTTTCTGCAAATTAACCTTTTTCTTTGTATATGTTGCAGCTTCTGGCTTCA
CCGATTCTGGTAGAGGCTCTTCACTTTCAGTATGATGAGAGGGATCCCAATTCAGCCTTC
AACTGGTTAGAGAGATGGACCATATGTCGTGTCTGGAAACCCATTTACCAGACGAAGAGA
AGTGCTATTGCTGATGCCAAACCTCAGACAAAGAGGGCCAGCTATGCGATGGAAACAGAA
TCAGGGAAATTAAAACGCAATGCTCGGAAGAGTTCTGCAATGTCAGTTGAGTCCGCCCCT
CAAACAAACATGCCATTGGAAACTGAAAAACCAAGAAGGAACCCAAGGAAGTTCACTAGC
ACTCCTGCTGATTCAGTGCCTGATAGCCAGTTAACTGAACTTGAGAAGGTTAAGCGTAGC
CTTCGGAAGGTAACTAATTCCATGGCCGAAGCCTCAAAGGTATCTAGTCCTGCAACTGAT
ACCCCTGACTACCCAGAGGTCCAATGTGAGAAACCACAACGTACTGCACAGGAAGTTCCA
GTTTATCCTGAGATTCAAGAACCTCACCATGATGATCTGTTGGAAAATGCAAAGGTTGAT
ATCTTTGTACCTGATTACACACCTGAAGTGGAGGTTACTCCATACGCAGTCACCACTGAA
GAAAAAGTTGATGAGCCAACTGTTGTTGCTACAGCAGTTGAAGTTATGCCTCTGCAAGAC
ATTGACAATGAAGAAAATGCTTTGGTGAATGATGCGGAGCAGAGATCCAGAGAAGAACCT
CTATCTGCCGAAAGCCTGAAAGGTGGTAACAGGAGGTCTTCGTTCTCAACGAAGCCAGAG
TACCCAGAGAACGGTGGCTCGAAAAACTCTCCAGCTGTGCCCAGCTACATGGCTGCAACA
AAATCTGCAAAGGCGAAGCTGCGTGGACAGATATCACCCAGACTTAGCGCTGATTCAACA
GAAAAAACTGTCTACACACGCCGCCATTCCCTCCCTTCCCCTGCCAATGGTAAGCAGAAT
TCGCACTCGCCGCGTACACAAAGGCCAATCCATCCTGGTACTAAAGAGGCAGCGAAAGTC
GACAAGTCTATGCTGTCATCAAGAGACGCAGCCGGTAAGTAGTAGAGGATCTGTGGATAA
TACTCATGTTTACATTAGTAACATTATTTCATGCCTTATCAAACTTTCTTATCTTTAGTA
TGCATAATATGTTTTTGCCTACTTCAAAGATGATATGTTTACATTAGTAACACTGTTTCA
TGCCTTGTCAGACTTCTTATCTTCAGTATGCATAATATGTTTTTGCTACTTCAAAGATAA
TTAGGTTGTTGGAAGAAGCCAAATTATTGTTATATGCATCATATTCTCTTGTCTTTGTTT
GCTATAAAATATTGTGACAAACTGTTCCATGCCCAAATTTTGTATGAAATTCATATCCTT
TTTATTTGATTCTACAAAAGCAATCAGATAATTGACTAGTATTATCTTTATTTAGTTCCC
ACTATAGTAAGCAGATAAACCAACTGAGCTGTTCCCTAAGATCACTCGGAGCGAATAGCA
TGTGAGCCAGTTTTCTGAATCGGGTCAAGGTTCCAAAGAATAATCATCAAATCCCATATT
TATTCTTTGTGCTGCATTTAAATGGTGTTTGCTACAGATGGCTGGATTGTGTATCGCATT
TGCCACTTGAGCTCAACTTGCCTTGTCCTAACACTAAATCCCTGTGCAGAGAGACCGATG
AAAGCCGAATGGAGACGGTGAAGACGCGGATCCTCCATTCCATTTGAGTAGTGCGGCGAC
GGACGTTTGGATGGACGGCAGTTTGCTCCTCTGATTGTTTTGCTTCTGATGTAAAAATGT
CCTCTCTAGTCTGCTGCCGCGACAACAACGGACCGGCTTAATTTGTTGTTGGTGTTGCCT
ACCTCTACCTGGTGCCGAGTTGGAGAGTTATTTTTATAGGGTTTTGCGACGGTCCTGCTG
CCTGTCTTGTATAGCTGAAGTTTGTTCCGCAGTTTGTTTTGGTTCGCCTTTGAAATACCG
TGCCTTGTTAAGTGAGATGGAGAGACAGACAGAGATGCTGATGCTAGCGAGTACCTGGGC
TGTTTGCTTGGTTGGTTGGTTTATTATCCCTGATGCGTTTTCTTAGCTGACAGTGAGTGT
GATCCATGACATAATTTGGTTATCAATCTCCTTCTGTTTCCCAGCTGCTTTTTCTTGTCA
CTGTTGATTTTCTTGTCATACCTGTGAGTGTGATGTTACCTCAGGATTAATATTTCCTTG
TCACCGTCATTAGCTGTGAAATCTTCTGTGAAACAACTTTTTTGAGGGAGAGCAGAATGT
CCAGCCTCGTTAGCCTGAACATTGTGTATGCAGTTTAGCCCTATTATGATGGGAAAAGAT
TTGTAGCACCTGGGTGCTCCACATCCCTATATGAACACTATGTTTAAAAAAATACCGGGT
AATTTAAAAAAAAACTCGCGGGTTTTGGGATATGAAACCTGGGTGTCTAATCTACTTCCG
TGTGAAATTTTGTGAAAAAATACAAGGAAACTCATCCTTGGCAAAAAAGACAATTTTTCT
ATGTATGAAAAAAAAACGGTTTGGAAGGATTTAGTTCCCACTTCATTTTCTTCGTCCTGG
ATGCATTTCCTGGTATTTTTCTATGATGTGAGTAGCTTGGGTGCCCAAGTTTGAGATCCC
AAGATTTCAGTTATTTTTTGAAATTTCCTGATATCTTTTGAATTTAGTTGTCGTATAGGG
GGGTGGAGCACCCATATGCTCCAGTGTATTTCCCCTATTATGATCGTGTTTTCTCGGTTA
TGTCCCACACGAAAATCACCGCCCTAAAACAACCTTGTTTGGGAAGAAAGGGGAGTACTA
AGGAGGCATCGAGGCGAGTGTAGTGAGGCCTGAGCACGCCCGTAAGTCCTCGGCCATGGA
CGAGCCATAGCCAGTGAAGATGAGTTCGAACTTGGAAGGTTGATGATTCACGGTGCAGAT
TCGTCATGGGAAGTCCGTTGGTGTGGGATGGCGTCGCCAACACGAAAATGGCCCCAATCG
ACTGACCCAAAACGATCATCTTTCTGCCCAAGAAACGGAGGAGAATGGACACCGCTGCAG
GCTGCAGCCTTCACCAACCACCCGCATCTTCTTCTCAGAACACGAGGCGTTTTTTTTCTT
CTAAAAAAAACAAAAACAAAACACGAGGCTCATCGCATCGCATCAGTCATCCGCGTACGG
CGGCTTCATCTTTTTCTTGAAGAGAAAGAAGGTCGCCAGCGATAATCTCGACCCGCCCCG
CGGCAGATCAGGGCCGTCCATCTAAGCCCCACGGGGCGCGGCGATAAAACCAGAGCCCTC
CGTCCCATTCATCCCTCCCTCCCTCCCACACGGTCTCCGCCTCCCAAATCGCATTCCTCT
CCTCGCCGCGGAACCCCCCGCCGACGCCGCCGCCGCCGTCCTCCTCTCGCCATGGACGCC
CCCAAGCCCACCCCGGCCGCCGCTCCCGCCGGCGCCGCCGGCCCGGGGCTCTACGCCGAC
ATCGGCAAGAAGGCCAGAGGTAAGGACGCCTTGCCCTCTTCCCCACAGCCGCGCCCTCGA
TTCGGTGGCTTCGGTGATTGTTCGCCTCGCTGACGCTTGTTTTCTCCTCGGCTGGGATCT
GCAGATCTCCTCAACAGGGACTACACCACGGGCCAGAAGTTCACCTTTACCACCACCGCC
GCCAACGGAGCCGTGAGTGCCTCCCTCCCCCCGTTCCTTCCCGCTCCCATGCTACAGCTT
GTACTGTTACTCGTCTTGCTTCTATTAGAGTTTGGTTGCGGCGGCGCTTAGGAGGATAGT
GGGTTAGGGTTTAGGGTCGACTCGGGAGTGGTTTGGTTTTGCTTCAGTCCATGTTGGTGA
ATGGTTCCTGTAGCCAGTCCCCTGTCGAAGATTCGTTGTCGACATGTGGTGCGATTGGTA
TCGGATTTGCCTGTTTGTGTCTTGTTATTGTGACATTATTATTGTGTGGGTTTTGGGTTT
GGTGTGCTGCAGCTCTTCTGATTCGTGGCTGTAAGAGGGGTTTGTTACTTAGCGTGTCAG
GTTCCGCTTCAGGTTTTGTTGTTTACAGTGGATTGGATTGTCCGACACTATGCTTGCAGT
GTTTGGAGGTTAGTGTATTTTTTAGCTGTTTACAACGACATTTTTGCAGTTCGAAATGAA
CTGCAGAAATCTCTTATATCAGTGCACAGAGGTAGTGGCAGATGAATTCTGTTCCATCAT
TGCTTGGTTGGTATTACCAATATCAGTTGGTTTTCAACCCTGTGGGTTTGCTCACATGGA
AGTGCCATGATTGTTGTAGTACCCGCATGACTTATCTAGGAAGTTTTTTTTATTGGATTT
GCATGTAATTTCAGTTTCTGTATATCTGATGAAGTTCTTGTGATGTGCCGTTGGTTCCTG
TTGTATTTGATTTGATACATTCAGCAATAACTTGGTCTTGAGTTGAAATAGTGTATCTAT
TGCTCCATACAATTTTATTTGCTTGGGCTAGAAGCTATATACTTGTTGAATTTTACCAAC
CAGTATCCAGTGAATTTATTTATAGCATTTGTAGATTAAAATGTTCTGTGTTATTGGTTC
TACCCTTCTTGGTGTGCTTGATAATGGGTCACTGACTATGTTGTTTAACGATTATAAAAT
CCTGATGGGGACTGAACTAAGATGCTTTCAGTTATGTTTTCGTGTTGGCACACCTAGCAT
GATCTAATCAAGAGAATTAATTATGTTATTGTATTTTATTATTTGTGAATCACTCTCTTG
AATAAATAAATGAACTTACTGTATTATTGCCATGGTGTGTTAAGTTATGGTCATTTTTGT
TTTCTCAATAGTTATGGCTGCAAACGCAAAATTTCTTTGTCAATGTTTCTAAACAAATAT
GTAGTGCTGTGTGTCAAAACCTTTCAGTGTTGTACTAACTCTCGTTTTCATCTTTCTAGA
CAATTACTAGTTCAAGCACAAAGAAAAATGAAGCTATCTTGAGCGACCTCCAGACCCAGG
TGAAGATTAAGAATTTCACAGTGGATGTGAAAGCAACTTCAGACTCAAGTGTGAGTTCTT
TTCGTCTCCCTTTGTACTTGTCACTCGCCTAATACAATGTCTTCCATTGATGTTTACATC
TCCTGAAATCGGAGGCCCCAGTTACTATATCAGTTACATTAGTTTTTCCCTTTTACCAGG
TTGTAACTACAATCACTATTCCTGAGCTGTGCAAACCAGGTTTGAAGGGAGTTCTTTCTC
TTCCTTTCCCCTATCAGAAGTCTACCCCTGGGAAGGTATTATCACCTTTTACTTTTGTAT
CAGAGTGTTGAACTATCTTTCTGATCTCCTCTTAGTGTGCATATGAATTCTTGCTAACTA
TGGCTGCAAACATTGCTTTTGTATTACCAATTCTCACTTTTGTAGCTTGATTGATAAATA
TTTAGAATTAATCTGAATTCTCGTGGTCTCAGGCTGAACTCCAATACTTGCATCCCCATC
TTGGCATCAACGGCAGTGTTGGCCTGAATCCAAACCCTCTTGTTAACATTTCTGGTGTAA
TTGGGACTAAGGCTCTTGCTTTTGGTCTTGATGTTGCATTTGATACTGCCTCTGGGGACT
TCACCAAGTACAATGCTGGAATGAGCCATACTAACCAAGATCTTACTGCTTCGTTGATGC
TGTAAGTTGTTTCTTCCAGTGTTTTGGTGTACTGTTAGCTTTGCTAGATCTGTGGTTGTT
TGATTTCTGATCTTAACATGTCGTTTACATTCTACAATTCCCAATTGCCCTTACCAGTCT
TTATTGTTAGCTTCTGAATCCGATTATTTTATTGCCAAAGGAGGGTCAAAGTGCACCTGT
TTCTGTCTTTGCATGATCTTCTGCATGATGCAACGCCAATTTGGCCTATAGAGTATTCGT
AAATGTGGTACTTATGGTATTTAATCATCAAATTCAGGAACAACAAGGGAAACACCCTGG
CTGCTTCCTACTACCACCAGGTGCAGCTCACCACTGCTGTGGGAGCAGAGATCGCTCACA
GCTTCTCGAGCAACGAGAACACCATCACCGTGGGGACGCAGCACGAGCTGGACCCCCTGA
CCACCCTTAAGGGGCGCTACAACAACTTTGGCATCGCAAGTGCGCTCATCCAGCACGCGT
GGAGGCCCAAGTCTGTCATCACCTTCTCCACCGAGGTTGATACCAAGGCCGTTGAGAAGA
GCCCCAAGTTCGGGCTGGCCCTGTCACTCAAGCCCTGATGTGGGATTTGCGGGTGCATTA
GGATGCTAGCATTTTGGTACCATCAGCTCTTGGTCCAGTGAACAAAGCTTGGACGGACGG
AACTTGTAATGCCCAACTTTGGTGATGCGACAAACTTATCTGTCGTTTTTAGCCTGCTAC
CCGAGGGGTTTCTACCCAGTTGATATGTGCTACTGGCCGTTATGCACGAGCGTATGTGTT
TGCTTTATTGCGATGTCGTGAAATCTGAATGCCACTTGGATGTGATATGTGTTTGTGTTT
GCTTTGGTATTTATTGCGAGGTCGTGAAATCGGAATGCCACTTGGATGTGATATGTGTTT
GTGTTTGCTTTAGGTCTTTTATTCTGCAAAATGCTTCTCAGAGAAATCACAAGTGAACAA
TCAGACAAACCACTTTTACCTATGGTTGATTCGATCTACCCATTTGTTATCACACATATA
TTTGCTAGATGTAGACAGTTATTCATGTTGGGGATTGTTCTCCAACGTTAGAATTTTATG
TTACGACTTGCATTTCCTTGCAGCAATGACTTTTGCTGTACAGCACACTGCCCTTCAGGA
CTCGTCAACCATAAAATGTATAACTAACTAGGAGTATATAACTGCCGAAACGGCTTATAG
AATAGAGGGAGTAGTTTGATCTTGAGTTAATAAGTAACATTTTTCTAAACAGCACACAAA
GTATAATACTAGGGCTTTGGAGGCGGTTCTCTGATACAGTCCAGCACCGGTTTTACTTTC
CAACTGTATACAACATAAACCATGTGTGCCAACCCGCCTTCTGTAAAGAGAATTAGTATG
CATCGTCTAACTGAACCTACGTTCCTTGTGTTTTTAAACTTGTACTCCCTCC