| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
| No map location |  |
 |
Predicted Genes from contig_45518
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_61454 |
4 |
2469 bp |
MLOC_61454.3 |
Available |
Available |
LOC_Os05g45930.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13105.m04888 protein IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed |
| MLOC_61455 |
1 |
1586 bp |
MLOC_61455.1 |
Available |
Available |
LOC_Os05g45950.1, FRAME:+1, EVALUE:7e-110, 13105.m04890 protein outer mitochondrial membrane porin, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_61454
CDS Structure of MLOC_61455
Contig Sequence (9472 bp)
>contig_45518 9472 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGAGGGACTTCTTGTGTGGGGTGGAGTCCCCCGCGGACTGTTCCAGCCGCGGATCTCC
CCGCCCCCTTACCCTTTCCGTGCCTCCTTTGATCCGTTTCTGTTTATCTTTTTTTTTTCT
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GGTTTGGGTGGATGCCGCGGTTTCTGGAAGTTTTTCTCTGCTTGGCAATTGCCCGCGGTG
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GGCGGGCTTGGAGGCGGCTCCGATGGGGAAGTCCCCGGCCAAGTGGCTCAAGTCCGTGCT
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TGCTTATCTTTGATGTTGAAAAAATTCTTGTGTTAAAATGATCAGAAAAAGGGCAATAAT
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GTTCAAGTGTCTCTTTAATATGTTAACTATACCTTATTATTGTAGTTCAATTGGAAAAAT
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TGTTGTCTGGTTTTTGTGCTCGGTCATTGACCAAACACATGCCATCCTCCCATCTAGTTA
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GCTATAAAATATTGTGACAAACTGTTCCATGCCCAAATTTTGTATGAAATTCATATCCTT
TTTATTTGATTCTACAAAAGCAATCAGATAATTGACTAGTATTATCTTTATTTAGTTCCC
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TGTGAGCCAGTTTTCTGAATCGGGTCAAGGTTCCAAAGAATAATCATCAAATCCCATATT
TATTCTTTGTGCTGCATTTAAATGGTGTTTGCTACAGATGGCTGGATTGTGTATCGCATT
TGCCACTTGAGCTCAACTTGCCTTGTCCTAACACTAAATCCCTGTGCAGAGAGACCGATG
AAAGCCGAATGGAGACGGTGAAGACGCGGATCCTCCATTCCATTTGAGTAGTGCGGCGAC
GGACGTTTGGATGGACGGCAGTTTGCTCCTCTGATTGTTTTGCTTCTGATGTAAAAATGT
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CCTGTCTTGTATAGCTGAAGTTTGTTCCGCAGTTTGTTTTGGTTCGCCTTTGAAATACCG
TGCCTTGTTAAGTGAGATGGAGAGACAGACAGAGATGCTGATGCTAGCGAGTACCTGGGC
TGTTTGCTTGGTTGGTTGGTTTATTATCCCTGATGCGTTTTCTTAGCTGACAGTGAGTGT
GATCCATGACATAATTTGGTTATCAATCTCCTTCTGTTTCCCAGCTGCTTTTTCTTGTCA
CTGTTGATTTTCTTGTCATACCTGTGAGTGTGATGTTACCTCAGGATTAATATTTCCTTG
TCACCGTCATTAGCTGTGAAATCTTCTGTGAAACAACTTTTTTGAGGGAGAGCAGAATGT
CCAGCCTCGTTAGCCTGAACATTGTGTATGCAGTTTAGCCCTATTATGATGGGAAAAGAT
TTGTAGCACCTGGGTGCTCCACATCCCTATATGAACACTATGTTTAAAAAAATACCGGGT
AATTTAAAAAAAAACTCGCGGGTTTTGGGATATGAAACCTGGGTGTCTAATCTACTTCCG
TGTGAAATTTTGTGAAAAAATACAAGGAAACTCATCCTTGGCAAAAAAGACAATTTTTCT
ATGTATGAAAAAAAAACGGTTTGGAAGGATTTAGTTCCCACTTCATTTTCTTCGTCCTGG
ATGCATTTCCTGGTATTTTTCTATGATGTGAGTAGCTTGGGTGCCCAAGTTTGAGATCCC
AAGATTTCAGTTATTTTTTGAAATTTCCTGATATCTTTTGAATTTAGTTGTCGTATAGGG
GGGTGGAGCACCCATATGCTCCAGTGTATTTCCCCTATTATGATCGTGTTTTCTCGGTTA
TGTCCCACACGAAAATCACCGCCCTAAAACAACCTTGTTTGGGAAGAAAGGGGAGTACTA
AGGAGGCATCGAGGCGAGTGTAGTGAGGCCTGAGCACGCCCGTAAGTCCTCGGCCATGGA
CGAGCCATAGCCAGTGAAGATGAGTTCGAACTTGGAAGGTTGATGATTCACGGTGCAGAT
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ACTGACCCAAAACGATCATCTTTCTGCCCAAGAAACGGAGGAGAATGGACACCGCTGCAG
GCTGCAGCCTTCACCAACCACCCGCATCTTCTTCTCAGAACACGAGGCGTTTTTTTTCTT
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CGGCTTCATCTTTTTCTTGAAGAGAAAGAAGGTCGCCAGCGATAATCTCGACCCGCCCCG
CGGCAGATCAGGGCCGTCCATCTAAGCCCCACGGGGCGCGGCGATAAAACCAGAGCCCTC
CGTCCCATTCATCCCTCCCTCCCTCCCACACGGTCTCCGCCTCCCAAATCGCATTCCTCT
CCTCGCCGCGGAACCCCCCGCCGACGCCGCCGCCGCCGTCCTCCTCTCGCCATGGACGCC
CCCAAGCCCACCCCGGCCGCCGCTCCCGCCGGCGCCGCCGGCCCGGGGCTCTACGCCGAC
ATCGGCAAGAAGGCCAGAGGTAAGGACGCCTTGCCCTCTTCCCCACAGCCGCGCCCTCGA
TTCGGTGGCTTCGGTGATTGTTCGCCTCGCTGACGCTTGTTTTCTCCTCGGCTGGGATCT
GCAGATCTCCTCAACAGGGACTACACCACGGGCCAGAAGTTCACCTTTACCACCACCGCC
GCCAACGGAGCCGTGAGTGCCTCCCTCCCCCCGTTCCTTCCCGCTCCCATGCTACAGCTT
GTACTGTTACTCGTCTTGCTTCTATTAGAGTTTGGTTGCGGCGGCGCTTAGGAGGATAGT
GGGTTAGGGTTTAGGGTCGACTCGGGAGTGGTTTGGTTTTGCTTCAGTCCATGTTGGTGA
ATGGTTCCTGTAGCCAGTCCCCTGTCGAAGATTCGTTGTCGACATGTGGTGCGATTGGTA
TCGGATTTGCCTGTTTGTGTCTTGTTATTGTGACATTATTATTGTGTGGGTTTTGGGTTT
GGTGTGCTGCAGCTCTTCTGATTCGTGGCTGTAAGAGGGGTTTGTTACTTAGCGTGTCAG
GTTCCGCTTCAGGTTTTGTTGTTTACAGTGGATTGGATTGTCCGACACTATGCTTGCAGT
GTTTGGAGGTTAGTGTATTTTTTAGCTGTTTACAACGACATTTTTGCAGTTCGAAATGAA
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TGCTTGGTTGGTATTACCAATATCAGTTGGTTTTCAACCCTGTGGGTTTGCTCACATGGA
AGTGCCATGATTGTTGTAGTACCCGCATGACTTATCTAGGAAGTTTTTTTTATTGGATTT
GCATGTAATTTCAGTTTCTGTATATCTGATGAAGTTCTTGTGATGTGCCGTTGGTTCCTG
TTGTATTTGATTTGATACATTCAGCAATAACTTGGTCTTGAGTTGAAATAGTGTATCTAT
TGCTCCATACAATTTTATTTGCTTGGGCTAGAAGCTATATACTTGTTGAATTTTACCAAC
CAGTATCCAGTGAATTTATTTATAGCATTTGTAGATTAAAATGTTCTGTGTTATTGGTTC
TACCCTTCTTGGTGTGCTTGATAATGGGTCACTGACTATGTTGTTTAACGATTATAAAAT
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GATCTAATCAAGAGAATTAATTATGTTATTGTATTTTATTATTTGTGAATCACTCTCTTG
AATAAATAAATGAACTTACTGTATTATTGCCATGGTGTGTTAAGTTATGGTCATTTTTGT
TTTCTCAATAGTTATGGCTGCAAACGCAAAATTTCTTTGTCAATGTTTCTAAACAAATAT
GTAGTGCTGTGTGTCAAAACCTTTCAGTGTTGTACTAACTCTCGTTTTCATCTTTCTAGA
CAATTACTAGTTCAAGCACAAAGAAAAATGAAGCTATCTTGAGCGACCTCCAGACCCAGG
TGAAGATTAAGAATTTCACAGTGGATGTGAAAGCAACTTCAGACTCAAGTGTGAGTTCTT
TTCGTCTCCCTTTGTACTTGTCACTCGCCTAATACAATGTCTTCCATTGATGTTTACATC
TCCTGAAATCGGAGGCCCCAGTTACTATATCAGTTACATTAGTTTTTCCCTTTTACCAGG
TTGTAACTACAATCACTATTCCTGAGCTGTGCAAACCAGGTTTGAAGGGAGTTCTTTCTC
TTCCTTTCCCCTATCAGAAGTCTACCCCTGGGAAGGTATTATCACCTTTTACTTTTGTAT
CAGAGTGTTGAACTATCTTTCTGATCTCCTCTTAGTGTGCATATGAATTCTTGCTAACTA
TGGCTGCAAACATTGCTTTTGTATTACCAATTCTCACTTTTGTAGCTTGATTGATAAATA
TTTAGAATTAATCTGAATTCTCGTGGTCTCAGGCTGAACTCCAATACTTGCATCCCCATC
TTGGCATCAACGGCAGTGTTGGCCTGAATCCAAACCCTCTTGTTAACATTTCTGGTGTAA
TTGGGACTAAGGCTCTTGCTTTTGGTCTTGATGTTGCATTTGATACTGCCTCTGGGGACT
TCACCAAGTACAATGCTGGAATGAGCCATACTAACCAAGATCTTACTGCTTCGTTGATGC
TGTAAGTTGTTTCTTCCAGTGTTTTGGTGTACTGTTAGCTTTGCTAGATCTGTGGTTGTT
TGATTTCTGATCTTAACATGTCGTTTACATTCTACAATTCCCAATTGCCCTTACCAGTCT
TTATTGTTAGCTTCTGAATCCGATTATTTTATTGCCAAAGGAGGGTCAAAGTGCACCTGT
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AAATGTGGTACTTATGGTATTTAATCATCAAATTCAGGAACAACAAGGGAAACACCCTGG
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GCTTCTCGAGCAACGAGAACACCATCACCGTGGGGACGCAGCACGAGCTGGACCCCCTGA
CCACCCTTAAGGGGCGCTACAACAACTTTGGCATCGCAAGTGCGCTCATCCAGCACGCGT
GGAGGCCCAAGTCTGTCATCACCTTCTCCACCGAGGTTGATACCAAGGCCGTTGAGAAGA
GCCCCAAGTTCGGGCTGGCCCTGTCACTCAAGCCCTGATGTGGGATTTGCGGGTGCATTA
GGATGCTAGCATTTTGGTACCATCAGCTCTTGGTCCAGTGAACAAAGCTTGGACGGACGG
AACTTGTAATGCCCAACTTTGGTGATGCGACAAACTTATCTGTCGTTTTTAGCCTGCTAC
CCGAGGGGTTTCTACCCAGTTGATATGTGCTACTGGCCGTTATGCACGAGCGTATGTGTT
TGCTTTATTGCGATGTCGTGAAATCTGAATGCCACTTGGATGTGATATGTGTTTGTGTTT
GCTTTGGTATTTATTGCGAGGTCGTGAAATCGGAATGCCACTTGGATGTGATATGTGTTT
GTGTTTGCTTTAGGTCTTTTATTCTGCAAAATGCTTCTCAGAGAAATCACAAGTGAACAA
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AATAGAGGGAGTAGTTTGATCTTGAGTTAATAAGTAACATTTTTCTAAACAGCACACAAA
GTATAATACTAGGGCTTTGGAGGCGGTTCTCTGATACAGTCCAGCACCGGTTTTACTTTC
CAACTGTATACAACATAAACCATGTGTGCCAACCCGCCTTCTGTAAAGAGAATTAGTATG
CATCGTCTAACTGAACCTACGTTCCTTGTGTTTTTAAACTTGTACTCCCTCC