Map Locations of contig_45498 (9491 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45498

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61441 4 2989 bp AK373056 Available Available None
MLOC_61443 2 758 bp MLOC_61443.2 Available Available LOC_Os02g33170.1, FRAME:-3, EVALUE:4e-32, 13102.m03594 protein POEI29 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, putative, expressed
MLOC_61442 1 376 bp MLOC_61442.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_61441






CDS Structure of MLOC_61443






CDS Structure of MLOC_61442






Contig Sequence (9491 bp)

>contig_45498 9491 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAGTTCTGTCCTAGGAAGACCAATATGGTAGATGATACTCTTGCTAGAAATGTTGTAACC
ACTCGAACTATTAAGTGGTTTGAGGAACCCTCGGGTTTCCTTGTCGATGTATTAGCAAAC
GATGTAACACTCCTTTCTTATGAAATATAAAGGCCATCCTGGCCTTCCCCGTTAAAAAAA
AACCCATCAATATACCAAGTTTCTTTTATTATGTTTATTCTGCATATAGTGAAAGTTTGG
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ACAAATATACTTTTACATACCATGGCAAAATTACTTTACGGATGATGGCAAAGATACTTT
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TGGCAAATTTGTTTCGTGAGACTTTTAAAAATAATAATAATTTTGCACCAGCTTTTACAA
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AATGTTTGTAACACGCTTGAAAAATAAATCGATGTTGACCTACGAACAGAGAAGACAGAG
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GAGCAGGCGGGGCGGAGCAGCAGCTCCGGGCCTGGAGGCGAGCGGGCGGAGCGGACTCTC
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ATTGCACTACTGATTCTAGCGATTCATAGATGATTTTAGACAATCAAATCGAGTCTTTTA
AGCTTTTGATTTTTCAAACCCAAAATCACCAAAGCGAAAAGAACTGGGTCTAAAACGGTT
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GTGTAATTGCCTAGTTGGTCACTAAATCTGCAGTTCTTTGAGGTTGGTCAAATCTGTAGC
TTTATTATACACTTGGTCCGTAAATCTGTGTGTGAAGCTTCTTTAAATTCATAATTTTGG
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TTTAGACACTTATTTCACTGTTACTCTAGTTATTCTGCAATGTTTGATACCAATGCATTA
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CGAGATCGAATAGTTAAATCTTGAAAAAGTAAGTTATGAATCAATTATGACATGAGAATA
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TGTTTCAGAAAATTACATATTTACAGCATCCATTTCCATATTTTAGCTATTAACAGCTCT
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ATGGCATGAAAGAGTGGAGCTGTTGCAAGCAAAGAAGCCATGATTTTAGCTTATTTTTGG
CTATTCCTGGGTAAGGATCTTCTCTCCTCCCATGGCAGGCAGTGGCAGAATAGTTATGTA
TGTTGTGTTGTGCATGGTGTCATTGATACAAATTAGGGATGCAAGTACAAATTATTAGTG
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GTTTCTGTAAGGTACTACCGTCTTATAAGGAGAATGTTGTATGCATTTATTTGGATTCAC
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GTAATTTAACTTGTTTGGCCCAGTCAATATCATTGCGCTACATCACTATATGGCCGAATA
AACATCTGCTTGCAGTTCAGAGTTTAGACTGAACTGGCTCTCACTTATCTTATTGGTTCA
TTTTACTGAGTGAGCGCAGTAAAATGTACACAAGATATTTCTATGTTAGTGCTTTGGCTA
CTTCACCACCCTCTGTTAAATCATCTTGAATTGGCTGAAGAAAGTTATTCCACTTTTCAG
GGAGCTCCAGTGATATGGCTCCAATTTGCTGGCAAACCTGAAAACGATGCCTTATGTCTT
ACAGTACTGTTTTTGTAACGTAATCAATGTTCCAGCTTTAATCATTGCCTCCTCTCATTC
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TAGACATAACTAATCACATTCTCTACCACGGTGTAGATGTGCCACAGGGAAGCATACAAC
TGAGAAACCAGTCACAAAAGCTGTTTCTCTTAACTCCTCAAAGGCAACCCCACCAAAGTC
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GGGTTTCTTTTGTTCTGACCATGGTGAGTTTGTGTCTTTGAACACTTCACAAATTCAAAA
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CACCAATGTATTTTTAGGATCACAGCCCAAGGCACAAAAACCAGTTGCTGTAAATGGTAC
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ACGAATTTATGGAGATACCTCCATGCACAAAGGGGTGGCACAATGCTGATGCTGTGTGAG
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CTAGTTTATTTCTGGAGAACTATGCTTGGAAGTGTGACCTGATATTCAGGAATGAGCCTG
CTTGAGTGTGCTCTGAGTAATTACTGTCGAAATCTCATGTGGTGTTTCATGTAATCTGTA
ATCGGAACTTGAAACCATATGTGGACACTGAATTTAGTAACCGAGCTTTGCCATTTTTCA
AGTAAAATGTGCTGCTGCTTGGGTGAGCTCTGAGTAATTACCTTGAAATCTCATGGGATG
TTCAAAAATTAATCTGGAAGTGGTACTTGAAACTATGTGTGGACACTCAATTTAGTACTC
CCTCCCTTTAATACTCCCTCTGTCCAAAATTACTTGTTGCCAAAATGGATGTATCAGAAC
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GAGTACAACACTTTGCTGTGATAAGTAACGGGAGTAACTAAACTATGTTTCGAAGTTAAA
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GCCGCCGTCGACGCCGCTGCACTCCACCGCCACGACCACACCTGGCAGATAGATGTACGT
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TCGAGGCATGTGACGGAGCCGCGGAGGGTCTGGCACGAGAGCGCGCCGAGCTGGGAGAGC
ACGACGGCGAGGAGGAGGCGGCGGCGGCTGCGAGCTCAGAGAAGAGGGAGACGATGAGCC
ATGGCCACTCGCTGCAAAGTTGCCGTGCCAATGTGCAAGGATAGTGGTGCCTCTGCGTGC
GTTATTTGTACTGGTACCGTGGTACGAGGAGGAGGATATGAACAGGGCGCGCATTGAGTG
CGCGCACGCTGGGGCAGCTGGGAGATATCAGGCGAGACATGGAAATCCTTTTTTGTTTCG
TTTATTATTAGGCCAACTCCAACACACTACCTGAGATGGTTCGCCTTCATCCGTTTGAGG
TAGAACGACATAAAATTCGACCCAACGCGTGGAAGCAAACGGATATTTGTTCGTTTTTTC
GTCCGCTTTCGTTCCGTCCATGTCTCAAATTTGTGTCGTGTTTGCGTCAAAACGGACATG
TGCGGACCGGCGGTGACGAGTGTCCTTGTCCTCCCTTGACCCGTTCATAGGGACACAGCC
GCCCATTTTTCTTCTCCTCTCCCCTCCCCTCCCCTCCAGCTGCCCTCCGTCCCCCGACCC
CAGCCATAGCCGCCGCCGGCAAAATTCTCGGCCTCCTCGCTGTCCAGCCCGGCCGATGCC
AGCACGGCTGCCGGATTTGTGACTCTTTTGCCCCACTCTCTAGCCTATGTGCCGACGGCT
ATCCATAGATCAACAATATCCAACAATAACGTTTATTTTTTTAGAATCGAAGAATAAAAG
TGCAAACTTGAGAATCCATAGATCAACAATGAAGACATAAAAACGATATAGTGGAAAAGG
TTATGAAAGTTGGATATCTTTTAAAATATTTAATTTTAGTTCTTGTTTTCTTGGTATTGC
TTTTCTAGAGAAGAATTGATGAATGTATTTTCAATGTATCAAAATATTGTTGTTGAAATA
AATAAAAAAGCTAAAAGAAATGTATACAAGCGAGCAAGAGTCCGCGTGCGCAAAAAAAAT
GGCCGGGCGCGTTTCATTGCTCTGTTCAAATGGATAAAATTTAAATAAAATAGACGTCGG
TTTGATATCGTGCGTTGGAGTTGATCTTAGAGCATCTTCAACAGACGCGGGTGGGCACGG
CGCGCAATCTTCTTACATCATGCACAAAGGTTTTTTTACGTCCGAGTAGGCGGTTGCTTC
ATCGAATGCTTTAAATTTTAGCGCGCCGATGTAGCGCTTCAGCAGGCGCGCTGCTCATAT
TTCAACCATAATTCATCGTATATAAAAACCACTCCGCGTCGATAGTTCTGTTGGAATTAT
CCCCTAGAGGCAATAATAAATATAGTCATTATTATAATTCCTGTATCAAGATAACCGATT
ATTATCCATGC