Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_45335 (5109 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45335

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61274 1 488 bp MLOC_61274.1 Available Available None
MLOC_61276 2 1665 bp MLOC_61276.1 Available Available None
MLOC_61275 1 278 bp None Available Available None
MLOC_61273 2 1429 bp AK369044 Available Available None





CDS Structure of MLOC_61274






CDS Structure of MLOC_61276






CDS Structure of MLOC_61275






CDS Structure of MLOC_61273






Contig Sequence (5109 bp)

>contig_45335 5109 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTTTGGGATGGAGGGAGTAATATAGTAACTGAACGAACGCTGAGATCCCTTAATTTTGA
ACTTTATGATAGTTGGTAGTTTAATCTTGCGTGCTTAGAAATTCGAATGATACTTCAAAA
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TGTCATTTATAGTAAGAACCACATGAGGCATTTTTATTAAGAAGAAACAACCCAGACACA
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GTACTCTGCTTAGAACTTTTATGCACCATGATCTGTGTTTATGTCACCATTACATCGTTA
TTACTGACAGAATCGTGTTTTTAAACAGGCCCCTGGCGATGGACAGTTGTAGTGCTACTC
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AGATCCAAACACGCAATTGACTCCCGTTACCAGCTAGAAGAATTGCAGAGTTCTAAAAAA
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TTGACGATGGAGCATCGAGGCCGCGGATGATGGGTGGGTCGTGCTGGATGATGGCGCTGC
CCTCATGCACGGCCGAATTTTTTCTTGCTTTGACCCATGCGATCGCCATTGACAGTCTGA
ATATGTCAGTACATCACTATCTCCCGGTCTCTGCACTTGTACGCTGCACTAGTGCTCTGC
ATCTTCTAGTGAGGAGTCGCAGTTTAATTTAAGTAACCACCATGCTCTGTACTAGGAGTA
CTAGTATAGTTAGCACGGCGTACGTGATGCTACATCCTGAATCTACGACTGCATAGCGCC
GACATGGTTCGTCCAACGTAGTACGCACATCTACCACGGCATTATGTCCGGGCGGTGGCG
CGCGTGTATTCCCACGGCCAGGGAGGAAATGATTTCTGCGTGCGGGTGCACGTGCAGGGG
GGAAACAAACAACACAGGACAGGACAGAAAGGAGCTGAGCAGAGCAGAGCATTGCTAGAA
ATTTCCACCGCAAATTCGGTTCCAGGCGCGGGAATCGGCGACCCACGCCGCGCGCACGCA
CTCCGGCGACCGATGTCCGTTGGAGCAAGGCAAATGCGCAGAGTTAGAGGGTGCTTGGAT
ACGTTTTAGTCCCATGATTAAAAGTAGTGAGACTAAAATTTGCTAGCCCCACTCATGCTT
GGATCCAAGTACTAAAGAGACTAAAATCAAGTTAATGAGTATTTATTATCCTTCAAACCC
TCCAATCCA