| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_45276
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
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| MLOC_61217 |
2 |
1269 bp |
MLOC_61217.1 |
Available |
Available |
LOC_Os01g15320.1, FRAME:+1, EVALUE:3e-31, 13101.m01693 protein RALFL9 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed |
CDS Structure of MLOC_61217
Contig Sequence (11378 bp)
>contig_45276 11378 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AACTTCTGGCGTTGTTGTCTGTGGGATAGCAAGAGCTGACCTATTCTTCGGGGCGCCCAG
TTAGCAGAGCTAATAAAAGACGTGGCATGTTTCTTAGATTGGCATAATACACATATGTTA
CAGAATTACAAGTTAAAATTTCACTTACCAAACATGCCACCTTTCAATCTCTGGTTCTCC
TTGCACGCGTGTGCTAGTTGAGTTTTTAACTTCTCAATTTATTCGGCGTGTCTCTGATTT
TCCGCCTTGAGCTCATTCTTTTCATCAAGACTCTCGGACAATACCCGACGGCCGGCCTCG
TGCTGTGATTCGGCATATCTTTGAGATTCTCTAGCCGCGTCCAGATATTTCTGCAGTTGA
CCTATTGACTCGACTGCTATAAGTCAATCTTTCATTAAAAAGGTGCCCGAAGCAATTCTG
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TTCGGCCTTCATAGCCGCCAACTGGGTTTGGTTCAACTCAAGGTCCTCGGACAATATTTT
GTTTTGTTTCCTCGAGGCCTACATCATGTCGCAATAATATTCAGACCCTTAACTCCGTCG
TCCCAACCAAATTAAGGCTCGGGGGCTGCTGCGTTAGGATTTGTGTTCGGTTATCAAAAC
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GTGTTATCAACCTTCAGCGAGAAAGTTAATATTGTGGGCCCCGTGATGCTTAGACTATCG
GGAATGCGTCATTGGCCGAATTGGTGTCAGTCGAACATTGATGGAGAGAAGAACTCACCC
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TCTATGTGGAGGACAGGTGGACCGCTTTATGACTAATACTGAAGGGCCGAACTCCAAGAC
GACACCGTTTTCAGGAAGGAAACCTTTGAAGCATTCGTGTGTGGTCCAAGTTAGTACAAT
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TGTCTATATAAACGAGATGGTTTTAGTTCATAGAGGACAGAATTATTATCGGACCCATCT
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TGGACCGCTCCAAGGCGATGCGGAGGGCCACCTCCTTGGAGTCGACATCCGAGCCATCGG
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AGCTCGGGCGTTTGAGATGGATTTAAGTGGTCCGGTTGGGTCATGTTTTTGTGACCACTC
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TCTTACTCCCGAAGGCCGGGGACGATACCTTTACATATATGGCGTGTCGATACGTTGCTC
TCTCTTTTTTGGGGGGCATGGATGTTGCCTCTTGTTATGTAAATTAATCTTGCTACGGTT
GTACGACATGTTAGGAGAGAAAAATGTACTCCTTTTGTTTCTATTTACTTTATATATTAG
AGTTGATTGAAGTCAAAAGTATATAAATATTGACCATAACATATTCATATTATATGAAAG
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TCTAAACTTTGTCAAAGTGTATAAAGCTTGACTTTGACCAAGGCTAGTATGCGGAGTAAA
TGAAAATGGAGGGAGTATGCTACTAATGGTATGACATAACTACTAGTATGACTAATTATT
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ATGTTACTATCCACTATGAAGGTATTCCTTCCTTTTCGATTTATACGGCTCATCTCAAAA
GTTTCAGATTTCCATTATATTAGGCTCAGTTTAAGCCCCACTGAGTTAAAAAGCATTGAA
TCCCACGCCACATTGAATAAATGGAGAATATTTGATTGGGCAGTTTTGTATCCATAAAAC
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TATGTTACTTTGTACTATGAAGATAGTAACTAAAATTAATGTCGTATATGCACAACACTA
GAGTAGTACTTCCTCAATCCCAAAATAAGGTCACAGATTTTGTACTAAATTAGTATAAAT
TTTGTACTAGATCTATGACACTTATTTTAGGACAGAGGGAAGTATAAGTTACTCCACACT
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TAGCGCCACCGCTTCCGGTCCCCTGCGTCTCTCTTGCCTTGTACGCTTCTCCTTCCCCTG
GCACGCGAAATCCATCCTTGCCTCGCTCAGAATCGCTTAGTGCGTGCCAAATCCAAGCTT
TAAAGCCTCCATCTTCCCCCAAATCCCAATCACTCTCGAACCCTAGAATAGCCGTCGACG
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GCCACTGGCACATCACCTCGTCCCGCCACCACACGATCCCGAACTAGGCGCCTCGATTCC
TCCACAGCCACCAAAGGCAGCGGCGGCCTCTGCACCATGCTGGCTCTACCAGATGCAGGG
CCCCTTGTGGTACACGAATCTGGATGATTTGAATCCAGAAGCATGGTTTGTGTTTGCTCC
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TATGAGGTCGATTATTTGATCATCTAGTATTATCTCGGCACGGGAGTGGATTCTCATCCA
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AGAATAAACCTCTTTTGGTAATATTATTGGTTGTTTCTTGGTTGAATAATTCAAACGATC
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AGAGGATGTTCAGTGCTGATGACGAAGTGGCGCAACGTTTTACTCTAGTTGATGATAAAG
AGGAACGCCCACCGGGTGGCAAGATAGCTAAGAAACAGCGGAAAGAAAAAACAAACGACG
AAGGTTCTATTATAGATCTTGAAATGAGCTTAGCAGGTTTGTAGATGCTCGGAATGCAGC
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GGCTCGGAAGCTTGCATGCCTTGCAGAAAAAGATCACAAGGAGTCAGTCATGCTAGAAAC
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CTATTGGCATTGATCTTTGTTCAAATTGTTCGCTACTGAAATTGTTGACATTTAGCTGCA
ATACATGACTGTTGAGCATATATGGAGTAGGTCTCAAAATAATCATCACAATTAGTCACG
ACGGGATATTGATATTTGCATGTTACTATTCTTTTTTTTCTTCTTCATGTAACACTGAGG
ATTAACATGATATCTTACGTGTACTTTATTCCAGGACGATGCTATGATATGGTGATTGTT
GGAGTGGCTGGAGGTTGTTGATGCAAATGGATTAGATGTTCCTTTGTGTTGAAGGTTGAA
CCTATGGCCATCAAGATCAAAATAAATGGGTGGTTTGTGAGAGATCTTACCTATGTTTAG
TTTATATTTTCTTATGAAGACTCAAGTAATGTCATGGTGCTATGTGCCATCAGTTTGTTG
ATTATATTCGTCCAGTTGTTTGTCGAGGGTGTTTTTTTATGTTTGGTTAACGCTTCCCTA
TGCAGACTTAAGTAATTGTTTAAGTGTATTATCATCGGCTTGTGTACATTTGTTTGATGT
TGCTCATTAATTTGGCTGAATTTTATATTTGTATGCTGATTGAGAAATTAGATGGCCACA
AAAATGCAACTTACATTGAATCACAGTAGGTGACATGCATAGTATTTATTGCAATCAGTT
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TAGCACATTTCAACATGTACGATAGTTGATTAAAAAAGTGTACCACTTATTACTGGTCCA
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TTGTTTACCTTCTCTCATTTTCTTTTTTCTCTAACTAAACACAAATATACTATTTTATTT
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TTCTAGCTTGTCCATCTGACACCCCATCACGTTTATTATTTGATGTACCACGAAGGTGCG
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CGTCCCCAGTGTCGCACACGGTTAACCTCCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCTCCATGGG
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GCATAAAGATGGGAGAATTACTCCAATTCTTCCTTTTCAATTCTCGACGGGCACCTGCTC
CAACACCTGAGATGTATCGGCTCGTCTCGTGATCCAATGTGCACGCACCGCCACGATCGA
ACCATCCATCGATACTTGTACTCCAAAACGATGGATTCGGTGACGTGCTCGGGCCGATCA
TACGGCGGCAATCTTGATCTCGATCCGGACCAACCAACGATCGCTGTTACGCCACAGTGC
CACACCGACGCGACGCAAACGCGCCATCTCTCCTCTCCTCTCCCTCCATCTCTCTTTCCT
TCTCTTCTCACCTACTGCGGCCGTCCCGCCATTGCCATATAACCCACCACCCCATCGCAC
CCCTCACACACGCCCACAGCTACACACATCGCCACGGTCTTCTTGGTTCCTCCGTCCACA
GCCAGCCAGCTCCGCTCCACCACCTGAAGCCAAATGGCGAAGCTGCTACCAGCCGCAGTC
GCGTTCCTCCTGGCCCTCGCCGCCGCGGCGGCGCTGGCCCCGTCCTCGGCCTCAGCGTTC
ACGACGACCGTGAACGGCGCCGGAGAGCTTGGCCTTGGCGGCGCAGCGGCCGTGGTGATG
CGCCGGGGCGGGCGGACGTGCAGGGGCACGGTGGGCGAGTGCATGGAGTACTTCGGCGTG
GACGGCGAGGGCGAGGGCGAGGTGGCGGCCATGGCCGGCAAGCGGCGGGTGCTGCAGGGC
GGGAGCGGGTACATCGGCTACGACGCGCTACGGCGGGACAACGTGCCGTGCTCGGAGCGC
GGGGCCTCGTACTACAACTGCCAGCCCGGCGCCGAGGCCAACCCCTACTCCCGCGGATGC
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CATGCCTCATCAACTAGCAGTACTAGTAGTACTATCTATCTGTAATGTAACGTAACGTAA
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TGATCAATCGTACTGTACGTATCACTGGGGGAGGCATGGTTAATTATTGTGTCATTTGTG
TCTATTTGGGTGAAAGTAATTATGCTTACGCATTTTGGTGCATCTGATTTCGGTTGTGCC
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TGTGCTTCTCTGCCATGGCTTTTCTCCAGTTTCTTGATTGAGCTGTAGGTGGCAGAGAAA
TTTTCTGTGAGCCTGACATGCCAATTCGCGGATGCTTGTCTGAAAAGAAACATCAATATC
TCTCGAGTTGAGCTGTCTTTTCTGAATACATTTACTTTTCTCCTTTCTGCTCCCTCGTTG
TTTCTGGTTGGCCAATCTTTTATCAGTGCTCTGAATTAGTAGTATTTGTTTCGTGCGCCA
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GGTTCAAACGGGTTGGTGAAAGTGGAGCTTCTTTGGACACTTAAATTATTCCTTGTACGC
TTTAAAACGATTCATTTGTTAGCACCAACACACAGTGTCACAGTAGTTGGGCTGTCATGT
TCCATCCTACGGCTACGTGCAACAGTGCGGCCAATGACTCCGTTGACACACGAAAACGTC
ACGTGTACCCTCGATCTCGGAGGTGATGTACCGCAGCTTACATCGAAGGAGATCCGACCG
ACAGCGTGATACGCAAGACAGTCGGCGGATGCTTTTAAAGACCCGAAGCCCCACACGTTC
GGAAGGGACCCCATCAGGAAGGGCGGTGGCTATAGGCTGCCCTAAGTCGGCCTGGCCGTC
CCTAGGGCCTCGTGGATCATTGTCCTACAAACGAAGAACGAACGAAGAATGAGAAAGAAG
AAGAACAAGGGAGAGAGATAAAGGTAAAGGTAAAAAGTAGNNNNTTGATTTGTTTGATTG
TGTGTTGTTTCAATCGGGCGTCACCTCCACCATATACAAGTGGCGGCTGGACTTACCGTA
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GGGTCAAACAGCTCGCGCGACACATCAGACAGCTTGTATGATCCCTCGCGTGACCTCCGC
CATCCATCACACAGTTGTGTGATCCCTCGCGCCATCCATCAATCCCTCACGCCATATTTT
GCCTTGTGGTAGGGCCGTACTCCGATGTCTCTAACTTTTGCATACGATCCCAAATCGACA
TGATTTTTATATCGAAATCGATTGTTTCGACGAGACGAAGAAAGTTCCTATTGAACATTT
TTCCATATGAGGCTGTCTTGTGGGCTTAATCGGCNNNNNNNNNNTCTGAATATGAAATCT
CAGCACTTGGAACACAGTTTCGGCCTTCGAGATGAGATCGGACAACGATGTCCCAAACCT
AAAAAATGTTCATTTCAACACCACAATGTTTTTCATGTGGAGCACTTCTTCATTTGAATC
CATCAAAATAAGATTTTCTTCCATGTCAAAATCTGATGTCAACACATACCCTCTTGTTTT
TCGGCAAAGCTTGTGTGCCGAAAAATAACTTGCACATGACTATGAAATTTATAAATGAAA
ATGAAAATGAAAATGAAGTAGTTAATGGGAGGGCTACC
