Map Locations of contig_45259 (14701 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45259

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61203 1 1120 bp AK361199 Available Available None





CDS Structure of MLOC_61203






Contig Sequence (14701 bp)

>contig_45259 14701 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGTAGAGCCCCTCCGTGATGAGTTTTCCCTCCGGCGGAGTACCGGAGAAGGCCTCGAGA
TGGGATCTAGCGAGAACACAGGCTTGTGGCGGTGAAAAAAGTATTTCATTGACTCTCTTG
AGGGTTTTGGAATATTNNTTAATTTATAGTGGAGGAGGTAGGGCAAATGGAGCGTGGAGG
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TTGGCCTGCAAGTTCTAGGTGAACCTTATATTCAATAAAAAATCCTCAAAAAATTTCGGG
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ATCCCTTCCCCACTTTTCCATTTTCTTTGCATCCCCCTCTTCAGATTCGGATGCGGTTCT
CTTCCGTGTCAAAGCTGCTTGTTCTTGCTCAATCCCCGATGCACATCCGTCAAGATTGTT
CATTTCTGCACCCAATCAGTACAGTAACAGCATAGGAGCTCTCAAGTGGATCCTCCTCAA
TGATCCTCAACCTAGCAGGGATTCTCCATCTCTGCCTCAAGAATTACTCACTCGAAGGGC
AATGTATGTTGAAGCTATCTTTAATTATTAGTTAAGTAATCAACCAGGAAGATCACGTTT
TGATCTTATCCAGTAGCATGTTCAGGGAATACTAAGTGTCGAACCTTGTTGGCCATGTTT
GCATCATGTATGCCTTAGAGTTCCCTAGTCAGCGCTTAGTCAAATGACAATGTAATAATT
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AAGCTGAATTTTAAGGAGCGGAGTAGTCCCAAACATGCCCATACTCTTTGAGAATTACTC
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GTTATGTCATAAATAATAGTACATTTTTCCTCTGAAAGTCTTTGATTCAATTCCCCTGTG
ATCAATAAGTTTAAATTCTGCCCTGAAAGGCACTCGCCGAATTGCTATCCCACCAAGTTA
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AATCGAGGTGTGGTTCCATTTTAATGCATTGAATTTACAATCATAACCAAATCAAACAAG
CCAAATCGAAGTGCCACCCAAAAACTTCCCCAGTTCACACCACGCTTTGGTTCACGTACC
CCCACTACCATTATTAAATGCAACAACGGCTACCCTTACTTAGGTGTTCGAAAGTACTTC
CTCCGTCCAGGTGCATAGGGCATCTAACAAAAATCGGTATTCCAAATATATAAGTCAAAA
TACGTTAAAGGAGTTTCTTGTTTTCCGTTTTCATTAATTTTCATTTTGCATGCTGCTATT
TTCATTGGCTCATGCATTAAATATCATTTTCATGTTGCTCTTTAGGAATTAATGACATGA
AAAACAAACCTAGTGATTGGCCCCTGACAATTTTCCAAGTGGGCCAAATATGATTCATTA
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CAGCTCCTTAGATGCCCTATGCACCTTGACGGGGGAGTACATTTATCACTTAATGGACCC
ACCAAGGATGGTACTTCTTTCGTCTCAGTTTATAAGTCATTTTACGAAAACAAAATAATC
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TCTCATTTTCCTCTCTGTCTTGGTCGCGGTGCATAACCTAAGATGACTTATAAACCGAGA
TGGAGGGAGTATTTAAGTTGTAAAATAATTTCAACATTAAATGACCTGATCTGGCTAGAG
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ATCGCGTATTCAGTAAAAAAATTGCAGTATGCATCGGTCGGACGATTTACTGCTTTTGAC
CGTTTTTCCGACAGCTGCGGCCCGCTTTCACCGTACGTGGCCTAACAGCTAGGCAACGAC
GCCGTCACGTGCAAATGCCTTTTCCCACTCGCGTCGGACAGACCGAGCGACTGTGTCGCG
CCACTCCACACTCCTTTCCCTCGCTTCTTTGTTCCTCTCTCACTCTCGCAACCTCCCTCA
GCCTCCTCTCCGCTCGCCACCGGCTGCCAGTGTGTCTTGGAGCGACGGCGAGAGCACTGA
GGACTCCGACGTGTAGTTCATTGCTTTCTACGACTCCCCTATTAAGGTCTGTTCGTTCGA
CCAGGACTGGGTTTAGGGTTTCGATTTATTCTTTTGAGGATTAGGGTTTGTGTGCCTCCA
GATCGATTTGAACAAGTCTTTTGTTTACCAGATCCCAGCTACAATCGATGGCCCATTGTA
CACTAGTGCTATTGAGGATTTGGGGGTGATGTGCGAGCATGGCAAGACAGGGAAGAAATG
TGTATCATTTGAGGGGGTAGCAGTGGGAGGAGGTTCATTTCTTGTGTTGTAGAAGTAAGT
TAGCAAAATTGGTGTTTAGTAATTCTGTTCTAAAAATAATTCTGTTCTAGGGTTCATAGT
TCATGTTCATTGTCCTTAGATACTGTTTATTGTTCATACTCACTGTTCATTTTATGGATG
AAATGGAAATGCCCACTATAATTGTTGTTTAGTCTGAAAATGAAGATGCTCCAATCATTT
GTTGTTTAGTTGGCTTGATCTAACTAAATCTGCACCTTAACTGTAACTTTAACTTTAACT
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TGACAATTGTGGATTAGTACAGTGGGTGGATGAGAAGTGGCCAGATCATCTCCAGAATGC
TCTTCATAAATCGTGGCGTATGTATGAGTATAGCAAGCATGACAGTAGGATTGCATGCCT
AGAACATTCAGCTGCTTTGCACAATATTACAAAACAAAAAAATGAGTTGCAGAAGACTTA
TGAGAAGCTTGTTAAAGATGTGAACAACCTCTTGGATTCCTAGGATAATCTGCCTCAGGT
AAATCACCAGAATGATGCTCAGAGGCCACAGATAAATCACCAGAATGATGGTGAGAGCAG
CATGGAAAAGGATGCTGAGATCAACAAATTGAAGGCAGTTGTTGACCAGTTGAAGTTCAT
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AAAGATGAGCACTAATAACAGGACTCTGAAGTGGTGCTGGGTTGATTTGAAGAAAGAGAA
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CATGCACGAAGACTGCATATGTATATATAGTAGTAGAAAAAATAAGGTTCCAAGCGACCA
TTACAACACGTGTTATTTGTTAGGCCTTGTTTGGTTGTAGTGGATCTAATCTTCTAATGG
AAGTAATCCACTTAGGGATTAAATTGATACCCTCTTGTCACCAATCCATGCATACCAATC
CCCTCTCTTTTAAGATGTCGTTTGGCTCTCTTGGACCAAGGAGCAGCAACGGAAATGAGC
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CCCGACTGGGTCGGCCCAGTTTTGTTTTTTTCTGTTATTTTTCCCCTTCTCTGTTTATTT
TCTTTTTCTGGTTCGTTTATTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTATTTGGAAGAAAAAAATTTG
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TTCAAGCACGAACGTTCTTTGAATTTTGAGAACAAATTTTGAAACCGATATTTTTTTTAA
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TGAGAATAAAATTTGGAAAAGGAGAACAATTTTGAGAAAAACCCCGGAAAAATTTGAATC
AGCGGTCAAATTTTTAAAGCAAGAACATTTTTGGAATTTTAAGAACAAATTTTGAAACTA
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ACAAATTTGAAAGCGTGAACAAATTTTAAAGCACGAATTGTTTTAGCATTTTGAGAACAA
ATTATGAAAGCGAGAACAATTTTTAAAAAATGCAAACAAATTTGGAAGCATGAACAATTT
TTTAATACACAAACATTTCTTGAATCTTGAGAACAAAATTTTGAAAAGGAGAAAAAAATT
GAAAAACCTCAAACAAAATTGAAAGAGCGAACAATTTTTAAAGAACGAATAATTTTGGAA
TTTTGAAAAAAAAATTGAAACCGAGAACAATTTAAGAAAACGTGAACCAATTTGGAAGCG
CGAACAATTTTTGAAATACACAAAAATTTTGGAAAACAAAAACACTTTCTTAGTCTATAA
ACAAATTTGAAAACAGGAGCATTTTACAACCATATAACTTTGTTTTTGTAAGTAAAAATA
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TTTTAAAAGAGGAACATTTTTTGAACTTACGTACATTTTTTGAAACGGCAAATGTTTTTT
TAGAAAATGAAGAATATTTTTCAAACGTCCCGAACATTTTAAAATCATGAATAGTTTTAG
AATTGGCGAACAAAGTTTTAACAAGTTTTCAATTTGTGAACAAATTTTCAAAAAAGATAT
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GAAAAGAATATTTTTAAACTTTGGTGAACATTTTTCAAAAATGTCAGACATTTTTCGAAA
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GGACATTTTTATAAAATCAAGTACATTTTCTGAATTTCAAGATTTTTTTTAAAACATGAA
CTTAGGTTAAAGATATAACCATAGAAAAAAGAAAAAACACTAGGAGAAAAACGAAAAAAG
AAAAAAAAAAGAAAAAAGCGAAACCGAAAAAGGACAAAAAATGAAGCTGAAACCGGAACT
GCCTGCAGAGAGAGACGGGCCGGCCCAGTTTTTCGCGCCCCTGTGCGTTTCTCCGACTAT
TTGACGCAAAAAGCGTCAAATAGGGTTTTTATTGTTCCCCGCCAGAATTAACCACGTGGA
TTGGACTGCGATCCCGGACGATCCATTTGGATTGTACCCTAACCAAACAAGGGTGAGAGT
CTGAGAGAGAGATCAGAGAAGAGAAAGAGCAGAAACTAGCCGGAGACAGAAAAAGCAAGC
AAGAAAAACGACCACAGGGAGAGTGTGCCACGGTCCACCGTGATTATACTTTTTTATAAG
TGGTCCACCGTGATTACATACTACGTGTATATCAATGGCGGTGACAAAATATAACACTAT
GAAACGCAAAATCCACTTACAAGCTTTACAACCGGTTCAATCAAAGCCAAGATAATCAAC
ATAACAGTGTTCACATCACACATCAAACTAAGGCTCCACAGGACCACAGATACAGATAAC
AGCAGCAGCACCACCACCGGTGATCAGGCGAGGATCATGCACTCAGGCAGAGGAGCCTTT
GAGCTTCTTGGCGATGCCGGCGAAGTACTTACCCTGGTGGAAGGCGTGCTCCAGCTCCAT
CTCCGACGGCCACCTCGACCCGTCCCCGGCGAACGTGCCGGCCCCGTACGGGCTGCCGCC
CTGCACCTTGTCCATGTCGAACATCTTGGCGCCGAACGTGTACCCCACCGGCACGAACAC
CATGCCGTGGTGGGTCAGCTGGGTCACTGCTGTCAGCGGCGTCGTCTCCTGCCCGCCGCC
CTGGGTGCCCGTGCTGAAGAACACGCCCGCCGGCTTGCCGGCCAGGCTCTGCTCCCTCCA
CAGCCCGCCCGTCGCGTCGAAGAACGCCTTCATCTGCGCCGCCATCATGCCGAACCTCGT
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CTTAGCAACATGACCATACATGGAGTAGTACCTGTCAAAATTTGGTAATGATTTTACTTC
TTACTTCTTTATGTCGACCCGCAAGAAACAAGACATAATGATATATCTTTGTCAAATAAA
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GCTAACAAAAGGAATAAAGGACATCATGAACCAACTAGTCTATTACCCACCGCACAAATG
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AAAGTTGTACTAACTTTGAGACATTTATTTTGAGGGAGGAAGTATATAACTACTCCCTCC
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GCTTCTAGATGCCTACTTTTTGGTAGTTGGGAAATCCCATTCAGCAAGCAAAATTTAAAA
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TTATGGTTTCTAATAGATGTGACTTCAAAGAAAGACGAGTGATGATAATTGATAGAGAAA
TGCTGCTTGCCAATAGCACGATGCATCCATTGCACCAAGGACTGAACACTCAAAGATGCT
TGAAGACTCTAGTACTGTAGTTCGATTATGACCAAGAGTGGCATTCTTCAAATGCTGATT
TAGGTTCTCATCCTTTCAGGATTAATTGTGTCATATTCCAATATTAAGAAGGCCAGCGGA
CTTGCGCATACTTTTTTGATAATTACTTTTGTGCTTCAAATAAGCTTTGTTGAGGCAGAC
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GAACACTACTACAAGCAAAGATCCAACACAGGAGACAGTGGGGTTGTAGTGGGAAATCAA
CAGCAACAGAAAAATGTCCTTTTAATCGCGGTGCTGCAACTGACAAATTTGCATATGTAA
GCTGAAAGAAGGCCACCAAAATTTTAATCAACCTAAGACTATTTTTTAATAAACCCATTC
TTTTAATAAGAAAGCATATCATTTCAAATAAGGAAGAAACTCATAAATTTATTTTAAAAC
GAGGGAAGGGGTAAACTAAAATTTGATTAAACATTTAGGCCAGTTCTCACCTAATACACA
AGTTCCACATCGTACAAAACAAATTAGATTTGCATCACACTGATGATATTATGATTTCCA
TCCTATTTAAATCACAAAAGCTTCCATTTTATCTTTCTTGCTTTAAAAGGAGCTGTGCTC
TATCATATAATAGGATATACTACTACATCGCACTAGAAACCCGAGCATCATATGCAGCCA
TGACCCATGAGTAGCTATCCCTATTAGTTGGTGGGAACAGGGTAAATGGTAAAGCAATTT
CCGCATATTCTGCTAGTATGAAATTCATATAGGAAACGTAGCCCAAAGCAAGCAACTAGG
GACAGTCAACAACCTTGGTGCTATTCTTCAGAAAGTTGGTAATCAAGGTGTTGCTGACTG
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CGGATAGCAGAGAGGTGCGCGTTTCACACGACAGGGAGGAAAAATATTCAGGTAAAGGGA
CAGCTGCAGGATTATTAGTGCAGGATCAGGTCCCCGTCCATATCCGGCATCGATCCCATC
ACGGACCACCAGACCCACCACCGATGAAATCCACCCTGACTCCATGATTGATGATGCCCC
CATACATACAGCTAATAATCTCTGCGGCTCTGAACCCTGCACCTGGACTGAACTGTGACC
CGGATGATCATCAAAACTAGAGGTACAACCCTTCTAGATGGAGGCATCGACGGGGGGAGA
GGGTCTCCGAAGAAGAACTGTACACTAATGGTCTGTGGTTGCTGCCGGGACATACGTTTC
AATCCGATAAAGAAGGGCTCTACACAGAATCATCAACTATCTCTGATATTAACAACGTCT
AGAAATAAGTACCATGCACACGAGACGAGAGTGAATTGTAACGCGGGGGTTAACGAAACA
GTTGGTTTAGAGGGAGGGAGCGGGTGCTTACACGACGTAGACCTTGACCGCCATGGGAGG
CGCGTGGGAGCTCCGCGGATCTGAGATCTGGTAGGAGGAGGAGGACGGCTCCGGTTGTTT
AATGGGTTCGAGGGGGAAGGGAAGGGAACGGAGGCAGTGGGCAGTGATGGGAGATGGGAA
GGAAGGCCGGGAGCATTTATAGGCCGGCGGGGTTGCCGTGCCGGTTGACCTCGGAGGTGA
GGTCCCAAGTCCCAACCAACGAGTGAGTACTACAACCCCTGCCAAGCGGATCCGGGCACT
GCCACTTGTGTGTGTGTGAGTGACCGCTGCTGAGTCACGTGCCGCTCATCCCTGGCCTCC
GATTTACTCCCTCTGTTCCTAAATAGTTGTGGTTGGGTAGAACTAGATTAGTTTTCCCTA
ACAACAAATATTATGGTATAGAGGAAGTAGTATTTATTTATCTATTTTGGACAGACGGCC
TCAAAACTTATTTACGCTGTACGTGTTTTTTAGGCGGACACTTATTTATACTTGCAACGG
CTATTTTGTTTCTAGTGCTGTCTTTGCCATATTTTTTTAAAATGATAGTTATCCTGCATT
CATTAAGGAAAACCGAACTAAAATCAGATTGTCCAGTTAAGTATGAAAAACTCTCATCAT
CATGCATGAGGGGGCTGCTCGTCTTCGTATGATTCTGGATCAATTTGTGGAGGCTACGGG
CTTCGGATTAACTTCACCAAAAGCATGATGGTGCTGGTCCATGTCAAGCTAACGGTCAAG
GAGCTGTTTTTTTGAGCTCTCGGATGTGTTGTTGGATCCTTCCCCCAGCCCTACCTCGGC
TTGCCCTTGTCTTGGGAGAAGTTGAGATTCACTCACTTCCCTCGCCTGTGGGGCACCTTG
TGCTGATAAACGACGTTCTGGACGCCTTGTCCACGTATGTCATGGCGGCTCTGCTTCTTC
CGTCAGCTCTGATCCGAGAACTGGACGCCCTGCGGCGTGCTTTCCTATGGAACGTGGCGG
ATAGGGCTTCTGGAGCTCAATGTTTAGTGGTGTGGGATCAGGTGTGTCGTGCTAGGTCGG
AGGGTGGTCTGGAGGTGCGCAACCTTGCCACTCAGAACGAATGTCTCCTGCTGAAGATGA
TCCATCGTCTGCACTTCGCTCCTCATTCACGGTGGGTTGCCTGGGTGTGGACCGTCGGTA
ATGGGTGCTTGCTTCTGGTGCGTGGTGAACACGCGCTGGGGGGACACATGGGGTCCTTGC
CCGGCTGCTCCCCCTGTAACGCGCTCTCTCCATTGTCGACGTGGGGGACGAGCGCGTTTG
CTCCTTCTGGAAGGACCGCCGGTTTCCATGCGGGGATCTAGCCACGACATTCCCTGCTCT
CTTCTCGCACTCCATGGACGTCGAGGTTACGGTGTGACAGGTGCATGAAGAGGGGTTGGG
CGGCTTCCTAGTCATGCGTCTCACGAGCACGGGGTTGTGTGGACTGTGTGGAATCACTGG
CCCGATCAGCTGGTTCTCTGTGGAATCACTGGCCCGATCAGCTGGTTCTGTGGTACAGTC
TACGGGTGAATTTTCCATGCTTTGCTACTGGCAATTATGGAAACACCGGAATGTTGTCGT
GTTTTACGGGTAGCCTCCCTCTCTTGCTCGGGCCCTCAGCTGCTGCTGTGAAGTTGCACT
GTTGTGGCGGGGTAGGCTGCATGGGGACAATCAATCTCATGTTGAAACTTGGCTGGTGGC
TCTCTCGCCTTAGTTTCGTTTTCGAGGATTCATTCCCCACCCTCCTCTCTCTCACCCCCG
TTATAACCGTTGAGAGGCACACATAAAAAAGCTCATGCACACCACTCCAAAGAGGGTCTC
GACGAGACANNNNNNGGGCGTCATCGTCATCACTCCTCCCCAAGAGGCGTCATCGCCATC
TCTACACTCTGAGCAAACGACTCTGACTCCGATGTAGGTGATCGTCGACTCAACCCACCT
GCAGAGGACACATGAAGCTGCATGAAGAGCTATGCCATTATCTCAACCACCTGCGGCCAG
TCGACGCAACTCCTGGCCGCAACTCCGACCTTGACGAAGAACTCTGAAGGACAAAATCAG
GCACGACTGGCGCCACGGGAGATCACCAAACGGGCTACCTGCAGCCAGTCATCGTATACC
ACAGGGCCCCGCCACCGCAATTTCGACTCCATAGCAACAAACAAATCAAGGTAAAACCGT
GGACACGCCGAAGAAGAGTCGACTACCGCAACCATTGTCGTGTCGCCGACATCGCTCCAC
CATCATCGTTGCCACAGAAGCCTGGACGCCACACCCATCGCCAACCGCCATCCACCGGTC
CTGCTCATCGGCACCAAGCTCCCAAGACGAAGCCCCCAAGAGAGAATACGACACCAAGAC
GCTGCCATCGTCCAATCACAGATCAAGGTTTCCCCCGGAGAGGCCGAAATGACCATATCC
GTGCCGGAGGGATGGGAGAATAAAGCAACGATGCCTCCAAAAAGAACAACGATGTTTACA
GCCACCGCCATCACTGGTCGCAACACGAGGCCAAGACATGGTTTGCCATCTTCTTATGGT
TGTCCCGTTTAACTGGACTGTTTCTGTGGATTTTGCCACTTGTGCTCCTCAATCGTGAAT
GTTCAACAGGTTCATCCGTGGGCCAAAACTATTTATTTTTGGCAAGCCGGGCTCAAAGTT
TATTTATATTCTCTATTTAGGTGCATATCGATTAGCCCTTCAAATTCTTTGTAATTCCAT
CATTAGCTCTTCAAAAAAAGAAATTATCTCTCCCCTGATTGCATGCATCTCTTATTATAA
AAAGAAAAAAAAAGAATCTCTCATGATTGTGTGTATCTCTTACTTTCCTAGCTTAAATGA
TTTTATCGTCTCTAATCAATGATTTGGTCAAGGTTAATTTTGTCTTAACATGTGTATAAT
TATGCGCCTTGGTCATCGTGCCGAAAATAGTACACCTTACATAAAGAAATAGAGGGAGTA
TATGATTGGTGTTTAAAAAAAATAAAGCGTATTTTTTTGTGGGGAGAAAAATATAGATTT
GGTACAATTTCTTGGGTAGTCAATTGTCAAAAGCTCACATCCATTCATACAAGTATACAA
ACGCATCTTTGGTATGTGTCTGTGTCCGTGGCTAAGATATTATAAATTGTCTGTTTTGTT
TTCTATTTTGTAGTAGTCTCTCCATTTCACAATATAGTACGTCCGCACTTTTTGTGATCT
AAATTTGATCATACATTTAACCAACAAGATTGATTGTGGCGTAAGCAAAAATTCATGTTA
AAAACAAATATGAATTCAATGATATAATTTTGTTGCCGCCGCAGTCGATCTCGTTAGTAA
AATCTACGATCAAACTTAGATCTCGAAAAGTGAGGACGCATTACATTGTGAAATGAAAGG
AGTAGCTACCATGTAAACATCCTTGTCTAAGAGAAGCCCATGGACTGACTGTTTGTTTTG
TCTTTGAGTTTGTACCAAAAGATAGTACATGCATTTAAGTATCAATTTGTTTCCTATTTT
TTGTAACTGAAGACAAGATAGTGTATTAATGGAAAAAATGGTGTCGCTAATGACAAACTA
ACAACGCTGATTGACATGCGTACTTTTTTTTGCAAAAAATGACCCAGGTCTACTAAAAGG
TTCATAAGTGTAACATTGGGTTGTCTTTGTAATAGACCATGCAAAAGAGTACGCTAAAAG
GATTTTTGACCCTTGTGTCTATTTATTTTTCTTATAAGTAACCGGCTCCGAAGACTGCTA
CTATTTTGGGTCTTTCTGGGTTTTCGATAATAAATTATTTTATTTTTCCTTGGAATTTGC
CCAAGTATAAGTTTTGCCCATTAACTCAAATATTAGACACCCATGGTTCCTTGACTCCAA
CATTAGAAATCCTTATTCCCTCAAACTTCTAAATTCTTTATGGTTTCTTCGTTTGCTCTT
CCCATTTTAGGGATGGCATGATGGCAATGTCGTACCTATGCCAACCAAGTCAAAACTCAA
AACTGAAAACAATCAAAAAATGGAAAACACGTATAAAAGTGGGGAAACAAAGAAATTAGG
TGAAGTCGTTAATTACCACTTTAGTAAAGTTACCAAAGTTTTTAGGAATTCCAAAAATAC
ACAAAAAATAAATAACATAAATAAACATGGAATTCATTAACATTCGAATCATTCCCTTTT
ATAGATTTTACATGTTTTCAAGTTTTAATAGCCTTTTCCTAAAATATTTGTAACTTTTGT
ATATATAGACATGTGAACCTTAAAACTTATTTTAGATTTAGTCATGTCACTAGTGGAAAA
CGGGCCTTNNGCCTGGACCCTTTAGTCCCGGCCTCTCTCTGGGCCGGGACTAAAGGCCCG
G