Map Locations of contig_45121 (10429 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_45121

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61110 4 1531 bp AK356093 Available Available None
MLOC_61111 2 2543 bp AK364612 Available Available None





CDS Structure of MLOC_61110






CDS Structure of MLOC_61111






Contig Sequence (10429 bp)

>contig_45121 10429 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGCACCGGCCGCACACCCCTGCGCCCGGGCCTGTCGTTATATCTCCATTGAACAGCGAG
CTGTAAGGTCAGGCAAGAAGATTTCACTACAGACACTATAATTATTACCCTGCTGTTTGC
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TTTCAATGGGCATTTTTTGAGTCACATTGATGTATTTAGTTATTATGCTAAATGAAAGTG
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TGTAACATTGAATATCCAATCATTTTGCAGCATATGGATCTTTTAGCATTGTGGAATCCT
TTGCTGATAAGCTTGTTTCAAGGTATGAACAGTATTTGTCAAGGTCGAAGAGTACTTTCT
CATTATTTGTAGCATTGATATGAATTGTAATGACACTGCAACGTGGCGTCTTTGTAACCC
TTTGTAGCTGCCCCTTGAATTTTGGTATCAGATCCCATGTAGGCATCTTTAAATGCAAAT
ATGCATGCTGAATACTGAATATGTCCTATATATGGAAGTAGTACGTCCTTATAGTTATAG
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GCCCACAAAAAGAACCACAGAATGCTTTTATTCATCTACCATAAGTATTTCAGTAGCATC
AGTTTGTTGAACATATCCTGTATTTCTGGATTGTGATTATTTTTGGCCCTCATCCTGTTA
TTACTGGTATATAAAGGTGCAGTAAAAATGTAAATAGTGATCTCAGGTGTGCTGTCCCGT
GATGATTTATTTAATTTGTGTATGTTATCTTTGAACCGAACCTATGCACCACAGTCCTTG
ATGGTTGCTCCTAGTAAGTTAGCATACTGGCATGGACTGTAGTGCCTGCTTTACTTCAGT
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CTCCTAGAAACTATTGTTGGTCATTATGTACTCTGTTTGTTTTGCAGTGTTCCTCTCTAT
TACCATGCGAAATTTGCTGTCCTTATATGGCTCCAGTTTCCTTCAAATGGTGTAAGTTAT
AAACCAACTATTTTTCCAAAAATGTTAATATCCTTTTTTATATTCCTACATCTATATGTG
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GACAGGAATACTCCTAGTTTTAGAAAACACGCAGTCATGCCCAAATCACTTTGATTTTCT
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TCCTTATTCCCCCCTAACTTTGGCCCGACCTCATCTTTACCCCTAAAAAAACCAGTGCTC
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TCTGACCTCTCTTTCTTTCACTTACATGTGGGACTATGCCTTCACCCCCTCTCCCTCTGG
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TGCATCCCCCGAGCGGGTTGACTTCCTGCAGCATGGCCCTCGAGCGGCTTGACTTCCTGC
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CCTCCTCCAGCAGACACCCCTCGGCAAGTGTCCAGCCGCCCCGAAACGCCGCCTGCCCCG
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GGACCATGGTTGCCTCCCTGTTGTGCTCCAGCACCTGCAGCTGTGCACACATCTCCCTCA
CCTCCGGCGGACCCCGTCAAGTGCAACCCCGCCTTGAAACCGTACAGTGCCACCGCATCT
TGTTGATTGCCTGAGCCGCCGCTGCACGCGCCTGTGCCGGGCCCGCCTCCGTCCATGGCC
AGTACCTCGTGCACTCCACTGCACCTGCAACACCTGCTCGCCCGACTGCACAGGAGTCTT
GGCCCGCAGCCATGGCACCGTCAGCTGCCGGCCATCTCAACAGCAGAGAGAGAATTTTGC
ATTTTCATTTTTTTGTTTATTTTATGTTTCTTTGTAGGCCCTACATGTAAGTTAAAGGAG
AGAGGTGTGAGAGAGTTCTGTTTTCATTTTTATTTTGATGGAGGTGGGTCGCACCCGTAA
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TCTACACTCTAAAGTACTGTATGCCTATATACATCCGTATGTAGTCCGTAGTGGAACCTC
TAAGAAGACTTATATTTAGGAACGGAAGGAGTAGAAGATAAATCTGAATGATCTGGTATA
ATTATTGTCCTTTGTCAGTACTAATAGATGTGTCCTTTTTTGTCCTTTCAGGGATCAAAG
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GTTTTAATGAATATATTACTAATGGACATGAAATTCTCAACAAAACCAGACGAAGTTTGT
GAGCAACCATGAAGATGAAATTCGTTTTGTAGAGAACATGGCCATCAGGGGTGCTACAAC
AGGTACAGAAAGAGAATTAGACCCTCTATGATTGACAGAAAAACAGCATGCTTGTGCAGA
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GTTTTGTTGTTTCCATCTTGCTAAATCCTTCATCATAAATTGATCTTAAATATTGATTGG
AAATTGATTTTGGTCATGGTATTATGCTTGCACGGCCATGGACATTGATCTCTGTTGGGC
CAATTTCCCTCAATCAGAGTAATTTCAGCCATGTTTTGTTGTCCTTCATCATTTTCACCA
TGCCTTAATATTTTGAACTACAGACAATCTTTTCATCAGCTTAGTACTGTATACTGCAAT
GCCTTTTTTATGCTATCTTGCTTCTTAGAATTATGCTCACAAGTTTACATTCCTAGCCTC
GTACCTGCAATTTCACCATGCTGCCCCATATCTTTTACATTAAGAAGTTGACAGCTGAAG
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GCCAGACACACCTAGGAGTTGAAACCTGAGCTTGGTTGCCACCCCGCAAGATGTGTCTGA
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TTATTTTCATACGCTGTTGGATTGCCAATACTCTTGTTATCATGCTTCGTGCAAATTGCA
GCCATGCTTCTATTGCATAGTTAGCCAATTACCTCTCTATAAGAAAGTTACCCAAACACT
CTGCAAAAAAATGTACACTGCCTGATCATATGATTTATGTATGTATGGTGGTGACGCTGT
GGGCGATCTTAAGAGAGGAGAGCCTTTCATGAGGATATTTTTTATTGCCTTTTGCAAACA
CACAAGTTCATCACCGCTTTCTTGAATAACATACGGTATCATCCGACAAACAGAAGCATA
ATGTGTAGGCCATTACAGTGGTTACCCCCACCACTGGAGCATGTGAAGATATGTGCTGAT
GCGTTGGTTTTGAATGAGAGTAGGGATGCTGTTGCACTGGTCTGTTAGGATCTACCTTTA
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GGAGGATCTATATGTTCAAAAGATTCAAGTAGCGTTTGATTGCAAGAATGTGGTGGATGA
TATCAAACATGCATCGTCGCACATCACACAGCTATTTTTTTCATGAATATCATAGCCCGT
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ACAATCTCGCTAGGCTTGCACTTACATTTGGGTTTAGTCGCCATGTCTAGCTAGGGCTTG
CACTTACATTTGGGTTTAGTCCCCGTGTCTAGCTAGGGCTTGCATTTACATTTGGGTTTA
GTCGCCGTGTCTAGCTAGGCCAATCTGGAGATCTCAATTTCATTTTCTAAATGTTTTTAC
TATTTGAATAAAGCCTAGCGAGAATTTCTCAAAAAACAAAAACAAATGTACACTGCCTGC
TGCGGATCATCTTACCTCGAATGTACGCTAGCAGTTGCAGTTCAAAGTCTAAATATGCTC
AACGATCCCATGTCATGGTAGTTGAAACTCGCTTTGCCCTAGAACTGTTCGTTCAACGCC
AATGACCGAACCGCCGGCGCATTTTCTTGTTGGGAGGCGGCTACTTTATTCGTCATCTCT
GACCAGGGCGTTGGTTGAACACGGAGAGACACATGTGGAGCAACCATGGTACGTCCTTGT
TCAAAATGCCGCCGAGTGAGTGAATATTCAACTTTGAACCAACGTTCTTTATTGAGCCAA
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CGATAATTTCGACTTTCATTGGCATACGATTTTTACCTCTAATGCGAAGTCAAAACTACG
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TCCATGAAGCCTTAATTTTGAATTTTTTTTCAATCTTTTAAGTAAAATAAGTTCTGAAAA
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AACGTTCTTATATTATGACGGAAGGAGTATGACTTTAGGTATATGTGTATTTTTTTCAGA
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ATAGGCAGGCATGATACAAATCATTCACAGCTCTGACAAAGATAAACATCATCTGTAGAC
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TATCCTCAACTGCTTTCAGCTACAAATCTGTCTGTGACGGGATGCTTTGTTTGTTTCAAC
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GGGACGGCTGCTGGGTGGGAGGCAGAGTGCCCCAAGGTACTGTGATTCCCAGTCGAGGAG
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TTGAAGCCAATGCGCAGAAGCAGCTCCGCCGTTGTTCATGGCAGATGGTGACCCAGGAGG
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GAGCTCATCTTCATCATGCGCGAAGAAGCAGATGCGGCGGGCGCAAGCAGCTCCCTCCTT
GCAGAGCCTGGTGCGGTACTGTGTCGGGTGCAGCCAGCTCTCAAACACGCCATGGGAGAA
CTCACAGTTGTCGCCGCTGGGGCAGCCACCGGGGCGCCGGAAGTTGGGGCAAGGCACGGC
AGTGTAGGGGTGCTTGCGAGGGTCACGGCGGCGTGCGTTTTCGCCGGGGTGCACGAAGGG
GCACTCGGTCCAGTCATGCGAGTAAGCACGGGAGCACGGACGCACCTTGAAAGCAAACAT
GCGGAACTCGTCCGAGGCATAGACGCTGCTCTTGATGTCTGGCAGCGTCGGATCCACCGG
GTACTCCTTCTTGGCGCGATCCACGGTGATGGGAGACAGCGACGACGAGCGCGACGACGG
CGACCTGTTGCCCTCGTCATCTGGCGAGGACGAAAGCGGCGGCGACGACGCCCCAGAAGC
CGCCGAGGTGGCGACGGCGAGGGCCCGGCGGCGGCCAAGAAGTATCTCGAGATCGCCCAG
GGCATCTGCCGAGGCCGGAGGAGCCCGGACGACGTCTGCCGGGACGCGGCCGGTGGAGTC
GGCAGTAGCTGGGTCCGCGCCGGCGTCCAGAAGCATCTTGACGACCTGGACGGCGTTGCA
GGAGCCGCCGGAGGCGGCACAGTGAAGCGGGGTGAAGCCGTCGCCGCCAGGCCGACGAGC
AACATCAACCCAGCCGGTGCGGCCGAGCAGCAGCGAGACGACCCGCGCGCTGCCGTAGGT
GGCCGCCACCATGAGCGGCGTGCGCGGCTCGTACGCCTTGCTCCGGCCATACCAGAGCCC
GACGTCATCGGCCAGCTCCGCCGGCACACCGCCACACACCTCGGGCGCG