Map Locations of contig_45084 (13664 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_45084

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61081 1 1456 bp MLOC_61081.1 Available Available LOC_Os07g26660.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-130, 13107.m02644 protein aquaporin protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_61081






Contig Sequence (13664 bp)

>contig_45084 13664 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGGGGTGGGGGTCTTTTTTCTCGTTTGCACTCGCATGTGGTCTCTTTTGACAATCCCA
CTCGACAGGGGGTCCTTTTGGACAAATATTCTTTTTGTTGGGGTCACCTCCTTTGAAACT
AGATGACGCTCAGCCCATCTTCGTCGTGCCTTGCAACAGGGATGAAATTGTTTCATAATT
AAAATATAACAGAGTGTGTTAAACTTTGGAGATGTATCCATATCGATGAACCTCGTTAAC
AAATCTCGGTGTCGCGCTCGTATGATTGTTTGGTGTTCGGATGATCAACGGTGCGCCTCG
GATTTATTCTAACATTCTCTCTTTTCTGCCCTGTTTTCCGTCATAGCGTGATATTTCTCG
TTGGGGCCACCTCCTTCGCCGTACATTGCAATAGGGTTGAATTTTTTTCCATATTTAGAA
TATAATAGAGTGGGTTAAACTAACATACCCTATTGACACAAAACAACAAATAACTATAGA
GATCATTGTCAAATGTCCATTCAACTTGACAAATAAAAACTGACGTTGGAGGCGAGTGGC
AAGCTGAACGTATTCCTAGTTCAATAAGCTCTACATCCAGACCACATACCATTAATTGCT
AGTAGGGATAATTGTCGTTCTTCTCTTCCTCGTCCTTCTCTACATCTTCCACTCCTAGCC
TCTTTGCCAACCCATTTCGTTGGCGCTAACCAGCACCACGTCAACCTCAGTGCATTGTTC
AGTGACACCTCATCTCCTTCTTCCTCCTCCCTCGCTAGTTTTAGTCTCCTTCTTATTGAT
TTTCTAGAATACTCTTTTTTTGGAACACTCTTTCCTTCTCCAACACCATGGATTACTTGA
TGGCTTTAGTTCTTTTTTACTTCTTATTCTTGGATTCCTCAAAAAAACTTCTTATTCTTG
GAACACTCTTTCTCTCTACTATAGCATAAACCATCTGGCCAATGTTGTGTTGTGTTGTCC
TTCTCTATGAACGTTTCGGCAACCGTCAACGTGTGGACAACCTGCAGAGCATGATCGTCG
TCCATCTTGACGAACGCTAGATGACCCATGTCGTGAGCACATGATGGCCATTGTTCATGT
TGGCAAGCGGTGCTTGGCCGTGTAGCTGAGAGCGTGTTGATTGTCCTTGGCCACGAGGGC
TTTCAAAAATGATTAAAGCAATTAACCTTTTGCATGATTAATTAAGTACACAACAAATTA
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AAAATCCCTATTTTTAATTATCTACGGGCATAATTAATTGTCTACCTAATTAATTAAATT
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TGGATTGAGCACTCAATTTCCAATTTTTTTTGCATGAAATGGCTGCTACGTACGACGAGT
ATTGTAGAACACATTTTCTTAACGAATATCTTGATATTTGAATGAACACACTTGATTTGA
GAATGTAGTATGTCTGGCTCTGTATGACTCATAGGAAATATAATATGCATGACTACGTCC
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TCCATGGTGTCATGCATAGTATCTCTTTGCAAGGGCGCACGGCTACGTACGGCCATAAGA
AAAAACATATGTCATTTTTGTTGTATTAGAAAACTTATGATTGTTAATTAATAATACATA
TAATGATAATAATAAATGGCATAACAAGTAGAATTAACAATTTGTTATGAGGAATATCTG
ATTTTGTTTGGGAAGGTTATAGAGAAAAACCTTATGTCTCTCCTTTAGAAAGGTGATGCA
GCTTTTGAAGTCTTAATAACCTATTATTTACATGATTGAATTGAGTCGGTACCTGCCAAA
GCAAGCATGAAACAAGATCACCCCTTTAATGGAATTTGGATCTGTAACAGAAGGTTAAAA
AATCAGTGAAAAGGGGTGGTAAGAGGTGAGACAAAAAAAAACAGGACGAAGATAAACCCG
CGTAGCAGGCTATCAACTCCGGTCACCTCCCTCATGGCAGATAAGGAAACAACCACAAAA
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ATAGCCACACTTCTCATTTTCTTTCTCATATGCCTGGTCAGTTGCATGTGATTGGTGGAG
AGAAAGAGAGAGGAAAAAAAAGAATGAATAAAGAAAAAGAAAATGTGGTTTGGGATGGGA
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TTGAGATGGATATGAGGGTTCGCGGACAGCCCAGACATATAGAGATGATATGAAAGATCC
GGTTAGGGTCACTTTTTTTTCTCTCTTCTTTTTGGTCACTGACCGGGCATATCCGTAGAC
GTATGAGGGATCGTTTGAGGTGTTCAGCTATAGATGCTCTAAGCATGAACAAAAAACTCA
TTTTTTTTCCTAAATCTCTCATCCCCAAAAATCCTCACGTGAATCCCCACTTATTGAAAA
TATTTCTTCCGATTTCCTTCGCCATGGCTCGAGCTTTCATTTGCATGCCGCTCGCCCTTG
CCATTTTCCCTCTATATATTCTGTAGCCCCGGGCCATAGCCGGCACTCATCCTCTTTTGG
TCCCTTTCTCTTCTCCCCACCATTATCATGGCTTCCTCGCGCTCCAAAGCTCTCTGAAAC
AGGCTCATGTCGAAACAGAAGAAAGAGATGGGCACCATTGCTGCCGGCTGGCAGCCGGAG
ACCGAGGATGTCCTAATGGAGGATGCAAGCGACGATGAGCTGGCGCCACCCTCGTCGGTT
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GTGGAGAAGCAGTTTCGGGAGGTGCAGGTCGATGCTGCCTACAACCTCCATCGCCAGCAC
CGGCATGGAGAGGAGGAGCTCGACGCTGGCAGGGCAATCATGCTCGAATCCTACCACTTC
GCATGTCTGACCTGCCTCGACCACTGGTGGTATCGCTAATTTCAGGTGGAACGGGAGACG
CTTAGGGAGTTCGATAGAGACGGCAGACGAGGTGTTCGACAAGAGCGATGGCAAGGAGGA
CATCGTCGGCTTCACCCAGCCAGCTACCCGCCGCCACGATCATGAACTTGGCACATCCGT
GGGCGCCATCGGTAGGCCGCCGCCGCTTGGGTCCCTAGAAGGCTACAACTCTCCCCTCCT
CCTGACATCAAGCTTGGTGGACTGATAACCGTCGGCCAATTAGCTGCTCAAGCTACGGTG
GCGGGTGTTGCTGGGAATAAGTTGGAGAAGGCGAAGGCAAGTGTCAGGGCTTCAATTCTC
GAAGCTCATGGCAGTCCGGTGGGAAACGAGCGCATGCGATCATTTTAATTAGGAATTATA
CCCCTGGAGCCGGACGAGTTCACTTTTAGTTGAAGTATATCCGAAATATAATAAATTTTA
TTATGTTTATATTAAATCAAACGTGTTTGCATGAGTCCCTTTTGGTTTATTTAAAAATCC
GTCGTGTTTCAACGAATTTCGTACAGTTAGCTTAACTTATTATTAAAATATATGCATACA
GTGTTGAATGGCGGTCTCCATTATCTTATCCGTAGACACAGTCCAAACATAAGAAGGGAC
ATTCGTGGGAGAGAAATAATGACCGGACGTTGGACATGCCCTTAGTCCATATAGTGTCAC
GGTATTCTGTGTCAGCATGATATGTCAATATAAGTCATGTCATACTGGTATTGATCCTGT
TAATTAGGAATACAAATGTTTCCTTTCACTTGAGAGCGCTCTATCTGGTAGGAATAAGCC
ATTATAGTATGTCAAAGGACTGACCTATTAACTCTCATGAATGACCTATTACCTCACTCA
AACTAGACCACTGGATCAGAAATAAAGGATGGTCCATAATAGTTGGGACCATCTTAAAAT
TTACCACATCAAAAATTCCATACACACCACTTCAAAATGGATCTCTTTGAGACAGAACAC
AGGTTTCATTGTCATCATTCCTTCTCTAGAGGCACCATCATCATCATCCCTAAACTCTGA
AAAAAGACTACGACTTCGCCATAGACGATTGTCGGCACAACCCGCACTGTAGCGGAAACG
TGAAGAGCACAACTGCAACTATGAAAATCAGACACGAATGATCGCCAAACGGGTCATCTG
GAATCACTCATCGTATACCGCAGGGACCCGCCTCCGCAGTTTCGACTCCACGTCAACAAA
AAACCGAGACAATCTAGACTCTGACGAATCGAAGAACTCTGCAGGACAGAATCATACACG
ACTGATGCCACGAAAGATCGCCAAATGGGTCACCTTGAACGAGCCATTGTATACCGCATG
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CGACGGAGAAGACCCGACTACCGCAATCATTGCCGCATTGCCGACATCGCTTCCGCCATC
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TTGCCGATGTCGAGCTCGGAGACGAAGCCCCAAACAGGTAAATCATGAATAATCAATCAA
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TACATTTATTACCCGGTGATCAAGTGTATCATGTGTATGCACTCATCATCGTTGGTGCTA
TTTCTCTCTATAATATATGGTGCTCCTGCCGGTTTCTCCTTGAAAAAAATAAATAGATTA
AGACCGGCTGGACAATATAGGAAGCCTCCAAAGAGGGAACTGATCAAGGAGGAAATGATG
GAGGGCCGGGGCACGTGCTGCAGGCGTCCACGCAACCTGCAGCGGCAGCAGCTCTGAGCC
TCTGAGAGTGAGAGGGCATTCTCGCCAGCTCAGCGTCGTTTAAGTCGGCAGTGCCAGTGC
AGTGTGCGCAGCTGGTCCTCTCCACAGCTACGCCAGACGGTTTTACGCGTTGGTCGAAAT
TCAATATATTCCAACTTGACTAGCTAGAACAAATATTTACGGCTTACATGTATCTTTGAA
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CTTAAAGAATATATAAAAGTGTCGATTGTGTATGATACCACATCCGTAATGCCGTACATA
TGGATAGCCAGATTGATAGTACCATTGATCTCTACTCATATATATTGTGACTTTTAATTA
TTCAAAATGAAATTGTGTGTTAATAGATTATAGACTGGGTTTGGTGGGTCGTGCGTGCCA
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TGAGACTATTGTGTACCCCACGGCCAGGGTATTGTGATTGATGATAGAGCAGTAATCCTA
ATGATAATGTGCTACTCTTTGCTGGATCCTTGTATTACTTGATTGCAGTGGCGATTCCAC
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CATTTAGACTTGTCCAGAATCAATTCTGGATGTTATACGTTTGTTTAAATATGAATACAC
AGTTTTTTAGGGTTGGCATGAAATGATAGATTGCTATGACCCAACCATGAACTAAAAGGT
CCAGTCAATTACCTTCTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGATCTTTTAGAGATTTTATT
ATGGACTACATATGAAACAAAATGAATGAATCTATACTTTAAAATATGTCTATATATATG
TATGTAGTTTATAATGAAATCCTTAAAATGTCTTATATTTTAGAACGGAGGTGGTATAAA
CTTGCGATGCCATAATTAACACCACATCACAGATGAGAATATACATGAAGACTTTTCAGA
TGCCTAAGGAAAATATCACCCATTACCAATGCGATTTTGTAGAACATATATACCATCTAG
GCACATAATCGAGACCACCGAATGATTGATACTATCCTAGTTGTCGAAGACTAACCAACT
AGTAAGAGACAAATCAATTTGTAACGAAGCTAGACATGTAAAATTATACCTTGTACTCCC
TCCGTCCGGAAATACTTGTCCTAAAAATGTACAAAATTGATGTATCTATAACTAAAATAA
GTCTAGATACATCTATTTTTAGGACAAGTATTTCCAGACGGAGGGAGTATTATATACACA
TAAGAATGTGGGGCAACCTGGAACTATGCAGAGCTGACTCATATTTTGGATATTGCTGCG
GATTACAATTTTGACCACTATTTTGGATGTTGTGGTATATGCCAAATAACACTAGAAATT
ATAAATATGCAAGTTTCCACTCTACATATTTGAAATAATATCCCCTCCTTCTCAAAATAT
AAAGCATATACAATTTGTTTTAGTCAAATTCTCTAAACTTTGATCATGCTTATACAGAGA
AAAATATCAACACACCGGTTTTTATCAGTGGCATGCTATGACCCAACCATGAACTAAAAG
GTCCAGTTAATTACCTACTACAAACTTGTGATGCCATAATTAACACCACATCGCAGATGA
TAATATACATGAGGACTTTTCAGATGCCTAAGAGCATCTCTAGTAGACCCCGTATAACTC
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CCCGTAAACGACTCCGACCTAAAAAATTTTTTGAGGGGCACGGTAAAAAGCTCCTCCCGA
TATGCAAAAATATAGTTTTTGCGTCCGCTTCTACGATGCCCTCTATCGAGAAAAAGCAGT
TGGCGGGAGCCCAACTGCTACGGAAACTTTCGCACGTCCGCCATCCATGTTCACTGTGCG
CCGCCCCGGATGTCGCCCCACCCGTCCCCAGATACGCCCCGCTTGTCTTGGCGGCCGCCC
TGCTCGTCCTGGCCGGATTCGGCGTCGGCGACGGAAGCTCGGGGATGGGAGCTAGCTAGC
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ATTCATGGACGGAGGAGCTAGCTAGCTAGCTACCTGGGTGGATTCAGGGACCCGAGCTAG
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TACAATTTAAGTTGAAGTGGTCTGTTCGGCCCCAGCTCGAACTGACCCTTATAACGCGTT
TTCCACAAACTGAAAACGCGGTTTACAGTTTTGCGTATTAAGGGGTCTGCTAGAGATGCT
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ACACAATCAATATCACCGAATGATTGATACTATCCTAGTTGTCGAAGACTAACAGACTAC
TAAGATACAATTCAATTTGTAACCAAGCTAGACATATGTAAAATTATACCTTGTATTATA
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AATTATAAATATCCAAGTTTCCTCTTTACATATTTGAAATAATATCCCCTCCTTCTCAAA
ATATAAATCATATACAATTTTTTTAGTCAAATTATCTAAACTTTGATCATGCTTATACAG
AGAAAAATATCAACATCCACATCAATACCAAATCAGTATGATTATATCTATCAGTTGTGT
GTATGTTGATAACTTTTCTTGTAAATTTGGCCAAATTTAAAAAATTACGTACGCAAGAGA
TTTTGAAACTATATTGGGTATTGTAGTACGCCAATACCGAAAATTACCAATGCACGGGAG
TATATGTGTAAATAACGTGAGGAATGATAATGTTCTAAAGATACTTTTTGTCACTCACCA
CATACCATTTCCAGAGTAAAATGAATCCAAATTTTGTCACTCACCACCTCGTATGGCACG
AAAAAAAAGTGTGTCACGAAACAATTTTGCCCTGATTTTTTTTAAGCAACTTTAGTTATT
CGAGGATGACAACTTTAGTTGTGAAGCATGACAACTTCCTGTTTGAATGGCAGGTTTCAG
ATTTTTTTGGATTTGTGTCTTTCTTTGGCAATTTTAATTGTAAAAAACTTCATGACGGTG
TTGTTTCGTGTTATACGCGTGTAACTTGTCATTTGGCTAAGAAAATACAACCTACTTCTC
AAAACATAGTTGTAGTTTTTTTTGTGTTAAGTCAAATTCTCTAAATGATCAAACTTACGC
AGTGAAAATATCAACATATACAAAAATACCAAATCTGTACTAGGACATCTATCATTTGCT
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TTGAAAAGTAAGGAAAACATTTGAGCTAAGATATTATGTGTAAACAAGAGGAAGTATAAA
TTACTAAACATTGTCCTTTCATTGCACTAGCTACCGTTTTGGTTGATAATTAATTATTAC
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TCCATATCGACATGGCCGCTGCACAGCAGGGCAAGCATAGTAGAGACGCCCATGGTAGCA
ACGACACCAAGGACTACCTCGACCCTCCCGCGGTCCGGCTGTTCGACGCCGGTGAGCTGG
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ACGTCTCCATCGCCACCGTGATCGGCCACAAGCGCCAGACGGACGCGGACGCGTGCAGCG
GCGCCGGCGTGCTGGGCATCGCGTGGGCCTTCGGCGGCATGATCGCCGTCCTCGTCTACT
GCACCGCCGGCATCTCCGGCGGCCACGTCAACCCCGCCGTGACGTTCGGGCTGCTGCTGG
CGAGGAAGCTGTCGCTCCCCCGCGCCTTGCTCTACACGTCGGCGCAGTGCCTCGGCGCCA
TCTGCGGCGCGGCGATGGTCAGGACCGTGCACGGCGCGCAGCACTACGAGCTCTACGGCG
GCGGCGCCAACGAGGTCGCGCCGGGGTACTCGAAGGCGGGGGGCCTGCTGGCCGAGGCGG
CCGGCACCTTCCTCCTCGTGTACACCGTGTTCTCGGCGACCGACCCGAAGCGCATGGCGC
GGGACACCCATGTGCCGGTGCTGGCGCCGCTGCTCATCGGCTTCGCGGTCGTGGTGGCGC
ACCTGGCCACCATCCCCGTCACCGGCACCGGGATCAACCCGGCGAGGAGCCTGGGTGCCG
CCGTGGTGTACAACAACAGCAAGGCGTGGCGCGAGCAGTGGATCTTCTGGGTTGGGCCAT
TCTCCGGCGCCGCCGTGGCCATGGCGTACCACCAGTACGTCCTCAGGGGCGGCGCCGCCG
CCAAGCCACACTTCAACTTCGACAACGGATTCCGACGCCTCGGCTGTTGATGGAGCCACA
GCAAGAGATGATGGTAATCAGTCTGAAAGAGAGCTTTTCTTGACTGGTTGATTGATGTTT
TTTTTGACACGCTGTAAATTTGTACTTACTAAATAAAAAACCATGAACAAGCAGTAACTA
CGCTTAGCTCTGAACAAGCAAAGCCAAATCATCCTTGAGATTTTTCTGAATCTGTAGAGA
TTAGGGATCCTGTCCATGAAAATGTAGGCATTCAAGCAAATTCAGATAGTACTTGTTATC
ACAGCCAATACTTTCTTTGTCAGAATTCGAAGCAATTTATGTGTCAAGACTATGTCAATT
TCTTGGAGGGGCAATTTTCACAGCCAATGCTTTGTTTGTCAGAACTTCACATGTGTTTCT
GAAGTAGAAATTGTCATGCATGTGTATGCTCTGAACAACTTGCCCTTAAAAACGTTCGCA
ATTGCCATGCTTCCCAGCAAATGTTCGCTGCTTAAGACCTTGTTCGGTTCCTTCAGAATT
GAAAGGGTTTGGAGGGGATTGGGAGGGATTAAATCTTCTACAAGTCAAATTCCACCTCAA
GGCGTGCAAATTATTGGTAGAATTGACCGAACAAGCCCTAAGAGGGTCTAATATTATTGG
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ATGGCAGTTAGAAAGAACACCTGATGCTTTCTCCGGGCACACGATTATACTCCCTCCGTT
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NNNNNNNNNNNNNGATTCACTCATTTTGCTCCGTATTTAATCTATAGTGAAATCTCTAAA
ATGTCTTATATTAAGGAACGGAGGGAGTACAAGCCATGCATGTTGTGTGTCTCCAAGAAA
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GTGGTGGATTTTGGGGGTGTACTCAGTTAGACGTCGACGAAGTGGAGTTCCTTGAGGAAT
TGCTGGACATTAGGGAGCTGCATGCGGGGCCGTGTGAGGTGGTTGGCGATTTTAACCTAA
TCGTCAATCCGGAGGACAAGAGCAACACCGCGATCAATAGAAGAATGATGTCCCGCTTCC
GCTCCAAGCAGAATCTGCTAGAACTAAAAGAGTTATATCTTAACGGGAGGCGCTACACCT
GGTCTAATGAGCGCGGCCATGCAACGTTGGAAACGATTGACCACGTCTTGGACACCATGG
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ATTGCCCATTACTACTGGACCTGCATGCAGATTTTCACGCTGGGAAACGGTTCTGTTTTG
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TGCCGTCGAAAGGCAACCCCTTTGTGGTTCTAGACAACAAGTTGCGCGTGACAGCTAGGA
AACTGCATAGTTGGAGCGACCGGTGGATCGGGAATATCAAAATTCAGATTGCAATCCTGC
TCGAGATCATCAAGCAGCTCGATGGGGCTATGGAAGGGAGAGAGCTATCTCCAGCCGAGA
TCGGACTATGGAGGGTGCTTAAACGCAAACTGCTTGGGTTGTGCTCGCTAGAAAGGTCTT
AACAAGCATGCCGATCCATGGTCCATAGTCGAAACCGAGCTGCTAGCTAGGCGAAGATTT
GCATTTAAGAGGCGTCCAACTTCGCAAAATGCAGGGAGCCATAGTGAGCAGATCAACTCC
TCACAAAGCCGCATGCATGTGGACTTGGCTGAATACACACCCCATGATGTGCTAGGCCAA
GCAAAGGCATCCTGAGATTGTCCTTCATGTTGAAGGGTAGCGATGGCATGGCGCAACTGC
GTTGTAGCAGCTGCAATTGTGCCATGAAAGGCGTTTTTCATGGCACAACTGCAGCTGATG
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TGGTAATCGATTTTATGGCCTCCATAGCTATATCAAATAACATCGGCGAGATGGGATCTA
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AATTCAAACATGAGAGAGAGATATATATATAGAGAGAGAGAGTTGAAGGAACGTGAGATG
TTAAATGTCAAGTTTAAGAAGAACAGCTTGGTTCTTCCTCGGGTAATTTTTCTGGCCACC
TGTTGCATCAAAAGGACATTGTCGTGAAGATTGCACCTTGGATGAACACATATTGGTTCA
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TTTTCTTTGGAGTTATGATAATGAGTGTACAACTAATGATGTCCTTCAATTACAGCTTAA
GCTATGCTGCCGTGATGCCAAGTGCTCTCTGTTCCAGAATATAAGGTGTATTGTTTATTG
TTTTTTAGTATAAATCAACCATTTAAATGTTTGATCAAGATTATAGAATAAACTAGCATT
ACCTGCAATACCAAATAGATCAAATGTGAAACTACTTTTCATGATGTTCAAATGATGCCA
ATTTTGTATTCTGGATATTGATATATTTTTCTAAAAACTTGATCAAACATGACCTCATTT
GACTTAAAAAAATACATCTTGTATAAAATAAACAAAGAGAATATGAAGCAATTTCCTTCA
TAGCTACTTCATCCGCCCCATGATATAATAACATTTTTGGAACTATGTTAGCTTGAGAAA
CACTTTTATATTATGAGCGGAGGGAGTGAGTTTACAGTTAAATATTTTGTTTAAGATCTG
ACGACACAATCAATTTTTCATTACAACATTTGTGCAAATCAACATAATTTAGTGACAAGA
TTTATTAGTGAAGCCTCTACAGGAGAAAAGAGTATACCCACGGCAAAGCATTTTATTAGT
TTTCATTTATTATTATCACTAGTACAAATGCCCGTGCATTGCACCGGGCAAGAAAAATAT
ACAGAACATCTTTGTTATGTCATTATGCGGCATTAATTGTAATAAATATGTATAATAATG
TTAAATGTTTTCTTTTAAAATATTAGGTATGTTGCTTACATAAAAAATGGATGATTTTTT
TTATAATAGTTATAATTTTCATTTGTTTATACCGTTGACGTGGAGGAGAATGCGCACGGG
AAATATCGTTTATACCAACCAGGTTACGTAAATGTGACACTTCCATTTGTTTTCTCTTTT
GAGTTCAAGAAGACAAACGATTCTTCAAAGGGACCTATTTTGAA