Map Locations of contig_45060 (9340 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_45060

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_61066 1 562 bp None Available Available None
MLOC_61067 1 1027 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_61066






CDS Structure of MLOC_61067






Contig Sequence (9340 bp)

>contig_45060 9340 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACCGTCGTGGTGCATGGATGGTGGAAGGCCGTTAGATTGTAATTTGTTGACTAATTGTG
TGATGGTGATTGGTGTTTGTTTTTTATGGGTGTAATAGCTGTGTGTACTTAAAAAAGTTC
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AAAGAAATCAAACATTAACTGCATTCATTGTGATTAGATCTTAGAGATCTCGGCTGATCC
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TTGTGATGGCTGTACAATTTTCGAAAATTATGACATTAATTGAAAGGTATATTTACATGA
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GCAGTGGTCTATTGCTAAAAATCCCCCAACATATGAAGAACCACCAATGCAATAAGACCA
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AAGAGAGAGAGAGGAGAGGGGCACCATGCATGTGTGGAGAGAGAAAAGAGAGTAGGATCA
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GTGACCAAAATGTTTGAATATCATCAATGAGGCGACAAAAATGGACATGGAGATTGAACG
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GTTCTACTCTGTCGCAGTGTCCTTCCTCTTTGTTCACAGTCTTCCTTTTTTTTTCAAGAA
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GTCATCCCACCATCGGTTCTGAATCACATTAATATGAGAAACTGCAGTGTCATGTGGTTT
GTCCTCTGTGCTATATGTATCAGCTTCAAAGCATCAACATCACCCTTGAGAGCAATCTGA
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AGATAACTTCATGAAGAAATGATTTTTTCCATACAAGACTTGTTATGATATACAACAACC
AAACCAAATAATATTAGCATCCATGTATGTTCTATTAGACCCAACACCGCAGAAAGATCT
GGAATGATGTATCTTGCGATGAATTGATGAACACCATTGTGTATACTACAAATTTATTTA
TTTTCTTAAAAAAGTGTGTCCTTTCTAAGAAGATTCATTCCAAATGGATCATTGCAAATT
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AAATCAAAAAACCACAAAGTTGATCCACTGACTAACTAAAAAGAGCAAAAATCGCACATG
CCTCATCTTTTTCATACAACTGATAAACTCTAAACATCTAGATAATCGTACGTGATCCAC
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GGCACCGTGGACTTCTTCGCCGTGATGGTCGTCGACAATCTTGGCCGTCATAAATCAGCC
GTCCCGCTCACTTCTCCGTCCCAGTTGCCGCTTCAAAGGAAGACGTTGGAGAGGACGGTG
CAGGGAGTTGGAAAACTACATAGCCACGTGTACATATGGAATTTTTCTTTACCCGCAAAA
AAAAACTCCAGTTCAGCACGCGCCGCGTTCTCGCATTAACAAGCTAATTAATGTCAGCAT
ATACAATATATTTTCATATATTCATATTTAGTGTTGTAGATGCGGACTGATTCCTCTACA
AGTTGATTACATAAATGAAATAAGTAAAAGCAAATATATTATGCAATTAATATATCCGTC
TCTGTGGGCGCCCGCGTACAGGTTTTTTCCTGGCATTCTGCGATATAAGTACGGCAACGC
AGTCCGGCACAAGAGCCAGCGAATCAGCGATGGCATCCTCCTCCTCTGCGGTCGTGGCTG
CTCTGATCCTCTGCATCCTCATCGCCCATGGCCATGGCTGCTTCGCCAAGCACCAAACGC
CTCATCCCGCGGCCAATTCCAGCTGGCTCGACGCCAAGGCGACATGGTATGGCAGACCGA
CCGGTGCCGGGCCGGACGACAACGGCGGCGCGTGCGGGTTCAAGAACGTCAACTTGCCAC
CCTTCTCCTCCATGACCTCCTGCGGCAACCAACCGCTCTTCAAGGACGGCAAGGGCTGCG
GCTCCTGCTACCAGGTATGATACGATCGACCAGCCTTACGCTATCACTAGTTTACTGCAC
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AAATATATGTCGTTGGAGTAGCTAATATTTTGATGCAGAGAGAGAGTATTACTTAGTTGC
GTGATGCATTCAGAGATATTTATATAAGACATATGAGTAGATGTGTGTATATTGAGCCTG
TAACTCGTGCACTGCAAATGCAGATAAGGTGCTTAAACTCGGACCACCCTGCGTGCTCCG
GTGTGCCGAAGACGGTGATCATCACAGACATGAACTACGACCCAGTCTCCCGCTACCACT
TCGACCTCAGTGGCACCGCCTTCGGAGCCATGGCCAAGTACGGACGCAACGACGAGCTCC
GCCACGCCGGCATTATCAACATGCAGTTCAAGAGGTACCACACCCACCTACATCATTGAG
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AGGGGTCGAACCCGTTCTACATGGCAATCCTGGTGGAATACGAGAATGGCGATGGCGATG
TGAAGCAGCTGGACATCATGGAGTCGCGACCAGGTGCTACCAATGGCGGCAAGATGACTC
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ACCACCCCATGCGGGGGCCATTCTCGTTGCGCGTCACCAACGAGTCCGGGAAGACGCTCG
TCGCCGACCAGGTCATCCCCGGCGATTGGAAGCCTAACAAAACCTACAGCTCCCTTGTCC
AGTTTCATTAATTGATCCATCCATCCATATATATGAAACTAATGAAAAGGGGAGTGCCCT
CATTTGAAAAGTAATAATATGATACATGCGTGTCTGTGTGTGCCTATGTAGCAGGCTGAG
ACGTCGCCTGTGATGTCCGGTTGCATGTGTGTCCGTCCATCGTGTAATTCATGTGCTTAT
ATATCTATCCATATCAATTAATGTTGTGCATTTCCTTATTTGGGTAATGTTATACAATGT
GTGTATCGATCTCTATCTATGCCAATTACTATTATTTGTGTGGATGCATCCGGACGTATT
TGTATACGACAGAGATATTTGAGGTATGTGTAGCCTATAACGCCGTGCAATGCAAATCCA
GATAAGGGGCTTGAGATCAGACCACCTTGTGTCCTATGGTGTGCCGGAGACGGTGATCAT
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TGACAGCGTGACCTGCCACCTGCCCAAGGAATTAATCCTTCTAACCATTGATTAACACTA
GTGTTTAGTACTAGTTTCATGGACTAGCCCGGGCAGCCGCCCAGGGTCGCTGGGAGGTGG
CTCCGCCACTGACATGAACTACTACCTGGTCTGCTGGTACCACTTCCACCTCAGTGGCAC
CGGCTTCAGAGCCATGGCCAAGGACGGCCGCAACGACGAGCTCCGCCACGCTTACATTAT
CAACATGCAGTTCAAGAGGTATCACAACCACCTACCTATAACGCTAGTCAACATCATAAT
CATCATCTTATCTTATCGATATCGAGAGCTAGACGATATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTT
TTTGAAAAGAAGGAAACGAGCCCCCGGCCTCTGCANNNNNNNNTGCATGCAGCCATATTA
TTAAAGATGATTGAAAATAGCGTCTGATGTCCACAGAGCTCCACAACTCAAGGTGCCAAA
GAAAATGAAATTCTAAAAACAGCCACAGCCGGTGCATCTAAAAGTAGACTACGATGCCTA
TACACCTAGCCTANTATTAGCACGCCATCCAAATCGGTTGAAGATAACCCGTGCAGCCAT
CTCCCATCGGTTGCACCCAATATCCATAAGCCCCCTGGAATCCGCATGGCTGAGTAACGA
TCACGTACGGATCCAAGACGTTCTTGCCATTAAAAATCATATCATTTCTAGTATTTCATA
TAGCCCAAAACAAAGCACATATCCCAATTCCGATAAGTTTCGGTATTTTAACGTCAACTC
CGTTGAGCCACGTTGTAAATATTGAGCTAATACATGTAGGTGGGATGATATTAAAAGCTA
TTTGAATAGTTCTCCATCAGAATTTTGCAAGAGGGCGTTCTATAAAAAGGTGTCTTATTG
TTTCATGTTGCTCACAATAGCAACAATTAGATCTACCTCTCCATCGACGTTTAATTAAGT
TATCTTTGGTTAATATGACACCTTTGTGTATAAACCCCATGAAAATTTTAATCCTGAGCG
GCACTTTGTGTTCCAAATCTGTAATGATCTCGATAATATTCCCGTATTAATCAGATCCAA
GTACATGGACTTTACTGTGAATACACCATTCGCAGTTATAATCCACCGAACATTATCCGT
GTGGTTTGATAATAGCACCTGCATCAATCTCCTAACCAGATGCAACCATGCATCCCAGCG
AGCTCCCACTAAAGCACGTCTGAACTGCATATTAAGAGGGACCAATTCTAGTACCATGGT
ATATAGTCCTCTTTACGTTGTGCAATATTGTATAACAAGGTGTATTGAAGTGCAAGAGGT
GTATCCCCAAGCCAAGCATCTTCCCAAAACCTTGTTGAGGTACCATTACCAACTATAAAT
TTCACCTTCGGGAAAAAGGTCACCTTTATCTTCATTAACCCTTTCCAAAAAGGTGAGTCA
TTTGGTCTAGATGTAACCTGAGCAAAAGTTTTAGAATGTAGGTATTTATTCTTCAGTATT
TGAATCCACATTCCTTCAGANNNNGTGGATAACCTATATAGCCATTTGCTAAGCAAGCAT
ATGTTTTTCACTTCCAAATCTTCAATGCCTAAACCCCCCTGGTCTTTGGGTCTACATATA
ATATCCCAACGCGCCAATCTGTATTTCTTCTTAGCTTCATCACTTTGCCAGAAGAAACGA
GATCGATAGAAATCTAGTCTTTTTCGTACCCCTACTGGTA