Map Locations of contig_44979 (9909 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_44979

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_60990 3 1386 bp MLOC_60990.1 Available Available LOC_Os07g44780.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-140, 13107.m04714 protein GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_60990






Contig Sequence (9909 bp)

>contig_44979 9909 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACTTGAAACAGACTTAAGAAAACAAAGCATATAGGATTTTATGCATATTATTTGTTGCAA
ATTTGTTCTTCAATATGCAATCCATAATTTATTTTCTTTCCCACATTTTTTTTGCATTGA
GTACTTGAGATACCTAAGGTCGCTGTTATATAAACATATTAGTCTGTACAGTTAGTTTCA
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ACTCTTGTATAATTACAGAGTGCGTTCGTTGGTTGGGACCAACCATGGACCGGATACCTC
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GGGTCGTTCAAGGTTCTTTCCCTTATTTTTTATTTTTCCTGCAGTAAACTATATGTTGAT
CCTGAGGTGCTTCCGAAGATCAGGTTGACTTGAAACAGTAACTGATTCAATACTTGGTCC
GAAAATTTCACAATATGACTTTGTAAATAAATGATATGGCATTCAGTGTGCACTTAGATT
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TCTTCAATTTCTATGTATCCTTATCCGATTTCGGTAAGAACTCATGCATTTTTTGTTTTC
ATCTTTGAAAACCAGTATGTTTATGGCTTTATGCAACGCTCGCTTTGTTCAGATAATGGC
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ACCTACATATGAACCTTACCAATCCATAAAAATATCGAATGACAAATAAGAGCTAGCTTA
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CTTCAACCAACTTTTTAATATTTTCGTAAAGGACATGTCTATGATTAAGTATAGTCGGCA
GGGGTCTTTCTGCAAAAACATATGACACATGTCACCTGACATGCGGGCCAGGTCTGTCAG
ATACGTGGTCAATACGCGTTTATATGCCTGTCATTCCGTATTGCAACAATTAGTCTCTGA
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TGTGGTAGTGCCCTGCAATTATCTCAACTATACATGTTTGATATTTTGGATTTTGATATA
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ATATTTTGAAACAGTTTATTTAAAAAAAACATTAACGGCGTAGCAAAACGCATCCAACCC
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GGGTGGTCGCGGCGGAGCTTCTCGAGCTTGGCTTCCAGCATGTGGTTGTGGACGAGGATG
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GGCCTGACCCATTCGAGGGTCTTGTTCTGCAAGAAGGGGTGGTTGTAGTCGTTGAGGCCG
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GCTCTGGTTTTGTTATCTTCTGTTTGTGGTACACGTTACCTTGGTCCGTGGAGGCGACCA
TGGCGAGCACTTTCTTGAACCAGCCGATCTGGACGCCGAGGGAGTAAGGGGGGATCGGGC
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TGGCGGCCGCAACCGCAAAATTGGCGCCGTACCGGAATTCCTCCGCCGGTAGCTTCCTGG
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ATTATCATGCATCATGCATGTAAGTACTAAGTAGATGTCGACGTGTCGTCCAAACACTTA
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AAATATATCACTTCACTGTGACTTGATTAAATCTCAGTCCAAGACCTAACCACAACCTTA
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TGACGTGTGAAGAATTAATTAGGGAATTAATCGATCGATTGATCGATGACGCGCAGTTGA
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TATTAGTATTTAAATTAACAATACAAGAATAGAAACTAGAATACACATGTTCGACACGAT
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ATTATTTGCGGCTGGTGGATCTTTAAAATCTGAAAATAAAATTTCGTGCGGCAGAAGAAC
ACAAGCAGTAGGACTAGAATGCATCCATACATAGTTGATTTTTAACATATACTAGACCGA
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TCGCACGCCTTCGCAAGCCCCCGTCATACACGAAGGCATCGATTTCCTCGTCTCAACGGC
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CCTCCGCCTTTCTCTTCACCGCACGGAGTGGCGGGAGCTCCTCCGGCTCCCTGTTCACCG
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AGGGGGGTATTGCGGCGATGGGGAATATGATTTTGCCCCGTATGGCGGCCGTGGACCCAT
AGATATACTGGGGGTGGGGGGTTCCGGTCCACTATGAACATTTTTACGGGTCGGGTCGAC
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AGCCCAATAGCCCAACGTGCCCTAGACTTATTTTTTTGCAAGAACAAACTTAGTCTTGAA
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CCTCCACCGCCTCTCACCATCATCTCGTGCTAGCTGACCCCGCTCCAACTTATTGTATCC
CATACCGGTGTGCTACTAGGGACGTGTTTGGTTGCATGCATACCCTCAGCCAAGACTGTG
GGGGAAGGAATTGGTCTGTCTATTTGCGTGGCCCGCATCCAAATCTTGGCCCGCACGAAC
CCTAAGGAAGTGCTCTGCCAGACCCGCTAGGAACGACTGAATCGACAATTTCCAGCAAGT
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TGGGAGCGATGACACGTCTATGAAAAAGCGGTACGATGAATTCACGTCACACCCCTCCGA
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TCTCGAGGTTTACCTCTCACCCGAATCCACCTCGACGACGAGGTAAGCAACGCAACTATT
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CCTCCTCCACAGCTCCTCCGACGGTGTGTGTAAGTTCAATCACCCCCACTCCTCTACTAG
TTATAGCTAAATCTGGCGATGTGTGGGGTTAGATCTTCCGATCTGTTTGACTATGATATT
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TAGATGTTTATGGATGGATGCTTAGATGTGTGGTATGCTAGTGTGCAAGTGTTGAACAGG
ATCATCCATATGTGTCCATGATTAATGATGTGTTCTATTGTGTTGATTCATGGTATGATT
TGATGGATTTATTACTGCTGTCTTGAACTAGATCATCCATGTGTGCATGTGTTACTATTA
GTTCATACTTACTATTAGTTCATATTGTTCATGTGCAATCTGTTGTCCAACATTTACTGC
TAGTTCATATTGTCGATTTGTAGTGTGGTGTATTGTTGATGATGCTTATGTATGTTGGGC
ATGAGCACGCAAGAGTTTACACTGGCACTCGTGCCAGTTCTCGGTGTCCTACGTTGAGGT
CTCTCAGCCTAACATTGACCACGTGCCTCTTGTTGAGAGGCTTACGAGGTGCCTCCTACG
GTTCCTTCATTTGTATTGGCTCAACCCAATGTTGTAGCTCATGTTGTTGCTCTAACGGTG
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GGGGACAGAGCATGATACTTGTGTTATGCGTTGGGTTTTTCCCCGAAGAGGAGGGAAAGA
TGCATCAAAGTATAGATAAGTATTTCCGTCAGTGAGAACCAAGGTTATAGAACCAATAGG
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GGAACTCAATATAACCTCATGAATAATCTCAACATATACCCACAATTCATAGGATCCCAA
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CCTCCTTGATTGACCCCCCTCCGACACGGCACCAGAACAAGGCTCCAGATGGGCACTGAT
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GAGAAAAAATATACCAAAGGGGGGCCACCTGTTGGTGTCAAGCAAACATGGCACGCTAAC
CCCCCTGGGCGCGCCTAATGGCTTAGGTCCACCTCCCAGGTTCACTGACCTCCCTCGTTT
GCTATAGTTGGGCTTTGACCTATAAAAAAATAATAAGATAATTTTTGGGACGAAGCGCAG
CCGTCTCAGGGAGGAAACCTAGGCAGAGGCCCTTTTTCTCTCCAACAGGGCGATTCTGCC
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TTCATGGGATGACCAATCTTCATCAACATATACCCATCTCTCTAAACCCTAATTCATCTC
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ATTACGTCTTGTAGTTGATGCTAGTTGGTCTTGGTGCAAGATAGTATGTTCAGATGCTTA
TTCATAATTATTACACCTCTGAACTTCAACATGGTGATGATTTGTGAGTAGTNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTATAAGTAATAATGTGAAGTTGGTATGCATGTG
ATCTTGTCATGATATGTATGTTGTTGCTTTTCTTAGTGGTGTCATGTGAAGGTCGATTAC
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GGGTTATTAGAGTTACAGAAGCTTAAACCCTAGTTTATGTGTTATTTCATAAAGGGGCTG
ATTTGGATCCANNNNNNNTTCATAAAGGGGCTGATTTGGATCCACNNNNNNNTCATAAAG
GGGCTGATTTGGATCCACATGTNNNNNNNTATGGTTAGATTTGTCTTAATTCTTGTTTCG
TACTTGCGTATGCTTGTGAGAGGGGGTAATCATAAGTGGGTTTATTTTTCAAGTAGGAAC
AACAGCTTAGAACTGGTCCACGCACATATCAAATTATCAAAGTAACGAATGCGAATCAAC
TCAACATGATGAACATGACTAGAAATAAATTCCCATGTGTCCTCAGGAGCGCTTTCTTTC
ATATAAGAGTATTTTCAGGCATGTCCTTTGCTACAAAAGGATTGGGTTATCTTGCTGCAC
ACTTCCTACTATTGTTAGTTGGCACTTGTTACGAATTATCTTGCTACAGAACTATCTATC
ACTATTACT