Map Locations of contig_44798 (10290 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_44798

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_60802 7 1605 bp MLOC_60802.1 Available Available LOC_Os01g66850.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-167, 13101.m42769 protein pectinacetylesterase domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_60802






Contig Sequence (10290 bp)

>contig_44798 10290 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATAGTTCTCTGTATATATACGTGTATATTGTAACGTACCCTTGGTACATCATCTATAAAT
ATATGTGATAGGCCACCCCTAGAGGGTTGAGCCAGTTCCCCCAAACCCTTCGTTTAACAA
CGTATGTACGAAGCGATCATTGATGAACTCATGGGAAAAGAACTCGCCAATGCTACACAA
GTCATACTTAATTTATTAGCACTAGTAGAAAAAGGACCTATAGTCCCGGTTCCCAACTCC
CTTTAGTTCCGGTTGTGTCACAACCGGGAGTAAAGGTCTTCGAGGCTAGAAAAAAATAAT
GCCTCCTACCAATGCAAATGGGGGATTCAAACTCAAGACCTCATGTGTAATGCCCTACAC
AGCTTACCATCCCACCTACACAGAATATGTGATTTTAAATGGGATGCTTTCCTTTTGAAC
TAGCCTATGAAGGACCTTTAGTCCGGATTGGTGTTATCAGCCGGGACTAAAGGGTCCTTT
AGTCCGGATTGGTAATACCAACCGGGACTAAAGGGTTAGTGTTATCAATCAGGATTAAAG
GATCAAGCCCTTTAATCATGGTTGGTGACACCAACCGGGACTAAAGATGACAGTGCCGTC
CGTCCGCTCCTAGCCGTTCGAACCAAGACTAATGCTCGCGTTAGTCCCAGTTCGTAAAGC
GGTCGGGACTATTACTCAATCGAGGCTAGGACGAAAGCCTTGTTTCTACTCTATAGGCTA
ATATAAATTGAGCAATTGCCATTAGTACAAAAATCGCATCCTTGACTACAATTGTTAGTT
ATGAACGAGAACCATGATAAAATGAAGAGAAAAAACATATCATATTTCTACACATTTCAG
ACACTCCTTACAGGCTGTTCTGCTGGTGGGCTAGCAACGATACTACATTGTGACGATTTT
GGTGCACGATTTTCTCACAAGGTTTCGGTTAAATGCCTTGCTGATGCTGGGCTTATTCTT
GACGTGTAAGAATCTTGAAAAAAAAAGTAAGCCACTATCATGTTATCTGAACTAAAGCAC
CACTTTTTTTTCTAACAGAAAGGATATATGTGGACAAAGGTCCTTTCGATCTCTCTTTGA
TGGAGTATTTCACCTCCAGGTTAGCCATTGGACATGTTTAAAAATTTAAACACATTCCTT
TTTTTTTGACAAGTTTTCCTTTTTGCACTTCTCTAAAACATGACTATCTAGATAAAATAA
AACATGACTATATTTAGATAAAATAAAACATGACTATTAGAAAAAGCTTTCTAAAACTCT
TGATTTTGCAAGTGGTTAGTGATGCAACAGTCGGTAAAACACGAAATATTTTTCCACCCA
TGTGATTGATGCCACTTTGTACTAGATGCCACTGGGTTTCTTCCCGATCTCATTTTTTTT
GCCAATTTATTTATAATGTAAGACTGCCTTGCCAACAAAGAGCGAACCGAGGTAGTTTCA
ATTGTATAACTTAATATGCTTCTCGCTCTTAAACATGTGATCAGGTTATGCTAGCTAGTT
CGTTAGCTGAAATAATGGTGTTCCTAGTGTTTCTTCCATACAGAGCTTATTAAGAGCATC
CACACCCCCATGTTTATGATCAACTCTGGGTATGATCCAGCACGGGTAATTTGAAAATTT
CTTCTTCTCATTCTTCTTTCCACTTTGCTATTGAATTTTTCACCATTTCATCGATTATTC
TTCACCATAGATACGAAATGTTATCATACCAGCTTCATCGGCGCCTGATAAGTCGTGGTT
GAGTTCCAAGGATAATATTCGGAATTGCAATTCCACACAAATTGAAGTCCTTGATGGTTA
GCTTAGCTTGTCAATCAGCTTGTTTTTCCTCTCTCATTGAGCACCAGTGTTTTTTCTGTT
CCCGAAACACCAAATATCACCCTCCCACATCGATAGGGATTAAGGACCACGATGGCTAAT
GCATTGAAGGTTGTTAAAGATAAAGAGGACTGGGGATTTTTCATCGACTAGTGTTTCACT
CATTGCCAAACGGTCCTTGACATCTCTTGGAACTCAGCGATATCTCCGAGGCTTGTAAAT
AAAGTAGGGAGTACAAAATCCACTGTTAAATCACATTATTTGCTATCCCACTTTGTTGCT
TGGATTGATATAGGTTCCATTACCATTTTGTATATGGAGTGGACCATTGCACAGGCTATT
GGATATTGGCACCGTGGAAGCAAGCAAGGAGTCAAAGAGATTGACTGCAAGTACCCGTGC
AACCCAACATGCAATAGTCAGTTGCCTGCATGATTTGTTAGTACATTGGATTGGTCGAGG
TTTACTATGTAAAGAGTCAGGAAAGAAGCAGCAAAAATAAAAACAATCATCATATTCTAT
ATGCAATCAAAGTGAAAAGTAATGATCATATGTAATAAAAGAAGTGCCGTTAGATCAATG
ACAATGTATCGAGTGAAAATGTCCATGGAGCGAAAATATATATTTGTATTTCAAGCACCA
AATCAGTATGGACATTTTCCAAAAAATGAGGAGTCGTTTGATTAGTCTATCTATCTATCT
ATATACCTATATATATTATCTACTAAAAGTAGTTGACTGGGCAACCAGAAAAACAGAATT
ACGCTAGAAAATCCCACAAAAAGCAGTAACAAAGTGTAGCCATTGTATGTACATAATATC
AGCTAGTATGTGGTCCCGTATGAACACAACCGAGATCTGATCAGTAAAAGGCTAAGGATA
ATGATGCTCTAGTCTCATTCAGTTTTCTATAACCAATGCAAATCAGTAACAGTTCTTTGT
GGACCAACTTCACTATTTTCATTGGGAACAATAGTTAAACTTCCCTTCTTAGGATGCAAT
GAACATGAGTTGCACACTTACTATCAGGATCTTTAGTTATTGCAGGGACCGGTTAATCAT
AATAATGATGATTATGATGTGGCATACAATCTTGTAATCTTCGGGCCAGTGCTGCCATGC
TGAGATGAACTAATTAATCTTTTTTTGGAGCTAATCCTTACTGTTGTTGATGTGCTAGCC
CATCATGTCTTCATAATTCCGACTGCCTGGCGTTGCAAGTCGGTTCTGTGAGATGTAGCC
CAGGTTGATCCCTTCCTCTCCAACTGCTTTGGCGACCGGAGACGAGACGAGAGAGGTGCT
TGGTGCAGCCATATATACATAGTAGTTGTAGGTTTACCATTTCCCGGGTGGATCCAAGCA
GAGGTTGCATTGGACCAGATTATTTTTCCTTCTCTTAATTTTGGGTCCTCCTTGTAAAAG
ACAAAGGGACTAGTCTATAATTCTGCTGGAACTCTTTGTGAACCGTATTGTATCCCTGGT
TCTTGTTTATTGCAGTGTGTGTGGGTCCTTAGGGGATTCTTTGCCACGTTCCAAAAAAAG
AAAAAGAATAAAACACCCGACTGGCACATTGATATCTATCCATACTAGCTTGTCCAACTG
CTCACTGATTGATATTTGATCCTGACCGGCCTCCATCCAAGGATCACCATCATACAGCTT
GATCGCTCTTAGTGCATTCATTCATACCAAGAAAATGACTTACCAGCAGCCCTTCTCTCT
CCTACTTAAGCAAGAGGGTATTGGAGCATTCAAACCGTGGAGCTTGAGCAAGAAGATATG
GCGCCAAGCAACGTACCAGCGGCACTGCTCCGGCTCCTGCTGCTGGCCACTTCCGGCCTT
CTCGGTCCAATGCTATCTGGCGCAGCGCCGGTCGAGCCCGTTGAGGTCAGCCTCCTCGCC
GGCGCACAGGAAAAGGGAGCAGTGTGCTTGGACGGGACCCCGCCGGGGTACCACCTGCAG
AGAGGCTCCGGTGGTGGATCCGGCAGCTGGCTCATCCATCTAGAGGTCCGTAGTGTCATC
CATCCCTATATATATAACTAATACTCCCTCCGTCCCATATATTAAGTGTCCAAAACGTTC
GTATATTATGGGATGGAGGGAGTACTGTTTAATTTTTCTATATCGCTATCTTTTTTCATG
TCTCATATGAATTAGCAATAACAAAAACAACATCAACAAAGAGCTAGTGTCACGGCCCTT
CTCGTAGGCATTGTCTTGGAGTCATCTTGATTGCAGGGTTATGCCGCCGCTTAGTGCGGG
GATGTTGGGGTGTTGGCCCTAGGTCAGTGTGGCGTGGCCTCTTGTTTAGCAATGTTGACG
GTTTCAAGCGGAGTTGGGTCACAGCTGGTTTGATAGTCAGTTTCTTCAAGTGTGTTTCAG
TGCATCACCGTGCCTTTGCAAAGTCAAAGCTGCAGAGGAGGAGCCCTGGTGGTGACGATG
ACATGAGATTGGTGATGGGTTGCTAAGGTCATTCGGTGCAAGCTTAGTGCTTTTTTCGTG
CAATGTTCTTTGTCAGAGTTATCTAGTCACTGACGTGTGTAATCGATTGCTTGGTATAGG
AAGGCATGGGTCTCGGCACCTGTTGCCGTGATATATTCGTTGGTGGTATGGTGAAGTCAG
AGTCGTTGGCTAATGGAATTATGCGATTATACTTGATGACAGCTTCACGACGGTGTGTGT
GTCTTCATGTGGCATGTGGGTAGCCAAGTTGGCCGGTGTTGCCTTATATGTTATAAAGTA
GAGATGCATCTATTGATGCAGAGGCCGGGGCTAAGCCTCCTTTTAAAAAAAAAGTAGAGT
GTTGTGATAGTTTCCGTCCGTTTCCCACTAATTAACTGGGAAGCTCCACTTCTTATTAAT
TAGTTAATGAGATGATGTATAGGTTTAGCCCTTCGTTTTGATAAAACAAAAAAGATCATG
TCTCGGCATAAAATTTCCATGTCTCACCATTATTAGCCACCATCCATCCACATATTGCCA
TGTTTTTATTTATCATGTCCCACACAAGTTAATTAGCCAGCAAAAAAGAGGAATATTAGA
TTGGTGACGGGATCTTGTAACGTTCTTAACAACACAATATTTCGATATATACACAGAACA
TGCCGCCCAAATTATGTTTGGCATCAAGCACATGCCGCCCACTCCACATCTTTTTTTGAT
CAAAAGATGCTTTCCTAAATGCATGATGGGGATGTTTAGCAAGTGGACTCATGATAGGAT
AATTATTAGTTGACATGTATACTTTCTCAACTGAAAACACACAGGGAGGAGGCTGGTGCA
GCACACTCAAGGATTGTTCCGGTCGCAGAATGTCTGTTCTTGGTTCATCAAACTTCATGA
AACCACTACAGTTTGCCGGTCATGGGATTTTTGACAGTGATGAGATATATAATCCTGGTA
ATTACTGGTGCTTCACATCCAGTCCACTCGCTGTCTATTTGTTCCATCTGTTTCCATGCC
TTCTTACCGTTTGTACGTTTGCGTAGGTGATTTTGTAATCTGTTTGCTATGTCCTTGCAC
TAATTTTGATCATCGCATTATTAGATTTCTACAACTGGAACAAAGTCTATGTACGGTATT
GCGATGGGGCATCATTTGCCGGGGATGCAGAAGGTCAAGCGCAGGTGACTTTCTAGATCG
TGGTTCGGTGTTGTTGTTTTGGTCGCTAGAGGTAATTCTCTGTTGGCAATGGTTCAGGAT
GGAACCACAGTTTACTTCAGAGGGTTGCGCATCTATGAAGCAATTACTGACGAACTCATG
CAAAAAGGCCTCGTCAATGCTACACAGGTCGTACTTGATTTACCAAGTTCATCGAATACC
AAGAACCGTTTGTACAAAAATATTCTGCGTGACAACCATTAGTTGTGACAATAACCATGT
GAAATGAAAAAAAAACTCATAATTCTACAGATTTCAGGTGCTCTTTACAGGTTGTTCTGC
CGGAGGTCTAGCCACGATACTGCACTGCGATGATTTTAGTGCACGGTTTCCTCAGCAGGT
TTCAGTTAAATGCTTTGCGGATGCTGGGTTTTTTCTTGACGTGTAAGAGTCCTGAAAATA
AATACAATCCACTAGCATTGTACGTGAACTAAAGTACCACTCTTTTCTAGCAGAAAGGAT
ATATCTGGAGAAAGGTCCTTTTGGTCTTTATACAACCGAGTTGTGCAGCTCCAGGTTAGC
TGCCGAGCTTGCTTGAGACTTTGAAGGATATGTCCTATTTATAATTATCAAACCTTCCAG
CCATCTTCTAATTTTTGATGCACTTCTCTAAAACATGCATACAATAATAAGATTTGTAAT
ACTCTAGTTTTTTCACGTGGTCCTTCTTGTGCAACACTGAAAAAAAAATCTATCCTTGTG
ATTGATGTCATTCGTTAATAAATACCATTAGTGATTTTTCTCCCCTTCTTTTGCTAACTT
AATTTCAGAATGTTAGACAAGTGTTGCACAAGGACTGCCTTGCCAACAAGGAGCCAACTG
AGGTAGTTTCCGTTGTATAATTTGATTTGCTCCTCACACTTACGCATGTCATCACCCGAT
TATGCTGGTAAGTTCGTTAGCTGAAATGTTGCTCCTAGTGTTTCTTCCCCACAGAGATTA
TTAAGAGCATCCGCACCCCCATGTTTATTCTCAACTCTGCGTATGATTCATGGCAGGTAT
TTTTCAACATTTTCTTATTATTATTCTTTTATCCACTTATGTGTATTGATATTCTCACTG
TTTTATATGTGGTTCTTCCCCATAGATACAGAACGTTCTCCTACCGAGTTCATCTTCTCC
AGAAAAGTCATGGTTGAGTTGCAAGGATAATATCGGAAACTGCAACTCAACCCAAATTGA
AGTTCTTGATGGTTGGCTAAGCTTGTCAATCTGCTTCCTTTTACTTTCTCAATCATCACC
GAAGCTCTTGCTGTTGTTTGGAACACTAAATAATATATATTCTTCTTTGATAGAATTCAG
GAATACAATGATCAATGATTTGAACATTGTCGAAGATAAGGCAGGATGGGGCATGTTCAT
TGATTCATGCTTCACTCACTGCCAAACGCTCTTTCGCATCTCTTGGAATTCACCAACATC
CCCAAGGCTTGGAAATAAGGCAGGGAGTTCAAAATTCTACTAGAAACTCAAATTATCAGT
GTTATCTTTGATGCACCATATTGTCGCTTGGATTGATATAATTTTGTTACCATTTGTTGA
GCAGAACATTGCAAAAGTTGTTGGAGATTGGTACTTTGGAAGGAGCCAAGGAGTGAAAGA
GATTGACTGCCAGTATCCGTGCAACCCAACATGCAATAGCCTCCCACCTCCATGATTTGC
TACTACCCCCTCCGACCCATATTAATTGACGCTGTCTTAGTAGGAAGTTGTACTAAAACA
TCATCAGTTAATATGGATTATTGGAGGGAGTATACTGGATTGTGTTAATATTTACTATGT
AAAGATTCAAGAAAAACAATTCTTCATATTGAATTGTCCATCACAGAGAAAAACAATGAT
CACACATAATGAAAATAAGTATGGCAGGTGGGTGACAACGCATGGACTAATTTTTTTTAA
AATAATTTATATTTCAAGTAAACTATCATTGGAAATTTTCCCAAAAAGATGACTTATTTT
GTTAATTCGTCAAATGTTGCTTCAAAATTTTTATTCATGTTTATTTTTGTCCGAAGAAAG
TAGGGAATAGCAGAAAAACGTATAAAAAACTCATTTTGAACAACCGCCATCTCAATTTGT
CCTCTATTTTTTAGGAGATGTTCAGTTTCTTCTCAATATTTTTAAATTTTGTGTGTTTAG
TGAACTGAGATTTAGTCATGTTTGTAAGAATGAACGCAAGCAGGTAATACTCCACTTATA
TACTATCAAATTCAAGAGGGCAGCTTGGTGATGGCCACCCCCAACGTACCTCACTGTCAT
GACAGACATTTGTTGTCTGTCCATCTTCCACTTCCCCAATGACTAGCTTTCATAGGCTTT
AATAAAATATTCAACACTTAAGCTTCCCACTACATCATATCAAACTTACAATTTTTATCA
AATTTCGAAAGATATTGCCATTATCCTAGGATATGAGCTTTCATCTACTTTTGGTTTCCA
ACTTTTAGAAATCTAATTAGAGCAACTCCAACCGGGCGACCCATTTCATCCGTCACAGTC
TGTTTGGGTCGCCACGGACAAAAATGGAGGCCCAGCGCACCGACCCATTCCCAAAACGCG
TCCGTTCCCCGTCCGTACGGACCCATTTCAGACCCAAATTTGGGGTTGAAATGCATCGGC
GCGGACGTGAAGCGGATGCAGCGCGCGCCCTCTCATGTCCGCGCCCGTCCACATGTGGCG
CCCTGTCAATAACACGGGACGTCTTTATTAACGACGACCGCTCATCACGGGCCCACGCGC
TAGTGACCCCAGGCGTCCTTTTTAATCCGAGCATGCGGGAGGGGGGGGTCAGCCTCATCA
TCTTCCAGAAGTCGTCCCCATCTAGCCACCCGCTACTCCCTCGCCGGCGACAAACCCTAG
CGACCACCATGGGTTTCTTCTCTAGCTCGAGCTCTGACAAAGACAAGGGCAAGTCCCCCG
CCGTACCGGTTCACATGCTCCCCTCGCCGGCGTCTTCCCGTCTGCCGCGACAGTGGATCA
GTGTACTAATGCACCAGGCGAGGTGGCACTGGGAGCACCGCACCCCCTCCCTTGTCCCGA
TGTCATGCTGCCGCACAACTGGCATTTGGATCCGAAGAGGATCCCAGTGCCAGCGGTGCC
ACGGTCGGCGCGGGCGCATGTGAAGGAGGTGAGGCACCGACGGCAGTAGTTGACGTCAGA
GCAACGATGCAACCCCATGTACGCTGCAGTCTCTTCCGAATGGGAGGCTTGGTTTGCGTG
GCATGAGGAGCAACGTTGACGTGGCGTTTGAGACATGGTGGCTAGACCATCGCCACCCCT
CGTCGTGCGTGAAGAGGACCGAGAGGTGGAGGCCGTGTACCATAATGCGCTGACGGCCGT
CCTGCATGCAAGCGAGGAGGAAGCACACCTCAAGGAGGAGGAGGAGAAGGCGGCTTACCA
GGCGCGGATGGCGGAGGCCATGGCGGTCTCCGCTGCCAGCGACTGCATTGTGCCGCCGCT
GGCCCCATTGTCCGCTGCCATGGCCGAGCCAGGGCCGCTGGCTTTCAAGCCCGAGCAGTA
TGTCTCGGATGGGGTGGTGCGCGAGTGGGTCAACGCGCCACCTGTTTGGTTGGGTGCAAC
GCCGGAGCGCGAGGCCGAAGCTAAGGAGGAGGAGCGCCGTGCTACCCTGCCAGCGCCGGT
GCAGTCACCGATGAACGACGTCACCGCCTCCTGGGAGACGACCTTCCCCTGGGCTGGCCC
GGCGCCGACGCTCGTCAACCTCACCGGCCCCGACGACGACGACGATAAGGACGCCTAGGG
CATCGTGCCTCCTTGTTTTTAGCTTACTTAATTTTTCTATTTAATGCAATGTGAACTTGT
GGGACTATCGCCGACCCTTGAGGCCAACATTAATATTTAATTAACATTTTTTGTATATTT
TCAATTTTTTTTCACGTCGCCTAAAAATAGGTTATTGTCGTGTTGGGCGCAAGCGTCGAC
CCAATTACAAAAGCGGATATGGATGTCCGCCGGATCGATCCAAACGGAGAAAATACCGAC
AAACCACGTGTCCGTTTGGGTCATGCGGTTGGAGTTACTCTTATATGCCTTCACCGTTAC
CCTAATTCGATGCTAGAAAATCAAAGGAAGACACTTGTTGATGACACCACCTGTTTTATC
CTAACAAATATAGTTGCCTTTTCAGTTTTTAGTAGCCTTTTTAAAATGTATATTAATAAA
AAAAACATAAATGAGCTCGGAATTACATCATATCAAACTTTCTGAAAGTTTGATCATAAT
TGGAAAATATTAACATCATCTTTCCAAAATTAGAGATATCAACTCCATGGGGCCAATTTT
TAGAAAAAAAAAATCACATGTTTCTATCATGCTAACACAAAATTTGTAGAAACTGAGTAT
GATTTTTTTGCAAATTCAACTTCCAAAAAATTGATGGAGAACTTGTAGAAATTTGAGGAT
GAAACATTTCACCCGCGGCCATGAAAATGTAGCCAAATACTAAATACAGATGAACATTTG
ATTTTATTGGCGCTTCATAGAAATTCTGGGTTGAGTACATAATTACTACAAGTATGCCTT
TTTACACTGGTATAAATCATACATCATTTTCCACATATCGAACTCTCTAGTCTTAGACAC
AAGTACGAATGTAGTGTCCCATGCATACGATGCCTAGAGTACAAACATTAGTGCTACAAA
CAGATGAAGAATTGATCATGTAAACATAGATTATTTTTGTTAGTTACATCTTAGGTAGAC
ACACATTCACTATCAAATTATCTATAATATAGTTTATTAAACACACACACTATCAGGAAC
GATTTTAGCACTAGTAGAAAACGGGCCTTT