| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_44773
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_60780 |
7 |
2638 bp |
MLOC_60780.1 |
Available |
Available |
LOC_Os06g41590.3, FRAME:+1, EVALUE:1e-171, 13106.m04343 protein YIF1B, putative, expressed |
| MLOC_60782 |
1 |
335 bp |
MLOC_60782.1 |
Available |
Available |
LOC_Os06g41510.1, FRAME:-3, EVALUE:2e-52, 13106.m04333 protein D-mannose binding lectin family protein |
| MLOC_60783 |
2 |
908 bp |
MLOC_60783.1 |
Available |
Available |
LOC_Os06g41560.1, FRAME:-3, EVALUE:3e-108, 13106.m04338 protein receptor-like protein kinase, putative, expressed |
| MLOC_60781 |
1 |
279 bp |
MLOC_60781.1 |
Available |
Available |
LOC_Os06g41510.1, FRAME:-1, EVALUE:1e-41, 13106.m04333 protein D-mannose binding lectin family protein |
CDS Structure of MLOC_60780
CDS Structure of MLOC_60782
CDS Structure of MLOC_60783
CDS Structure of MLOC_60781
Contig Sequence (11527 bp)
>contig_44773 11527 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTATATAAGAGTAATGGTGGGCTATATTGTCAGGATTCTAAGGGATGCAGTTAAAGTGG
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GGCAGGCCTACTACTTCACAGGCGGATCCTTTTCAAAGTGCTTTGTATGGAGCTGGACCT
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TTGAAGGGTAGAGATTAACTTTTGTGATGCACTATTTTATATCTCTAGAGGAAAACAGTG
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GTTGGTTTATGCAAGTCATCCTCATTAAAGCTCTACTTTACTCACTGGGAAGTGGTGAAT
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TGCTGGTCCGCATCTTCTGGAGCTACTCATACTATTTTGTGCTGCCGTGGTTCTGTATCT
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CTTGCTTAAGTTCTTTGCCATGTCACGGTGCTTTGAAGTGACTTGGTACTGCCTATGTGA
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TGTCTCTGATTTATGAACTTATATTAGTTAATCTTTGGCTGAATATCCATGAAACATCCG
GATGGGTTTCCCTGAATTATGACTCATTGCTCTTATGAGAAATGCCCAACCAAGTTCAGT
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TTGACCGAAGAGGTCAACGGCGATGAACTGTTGGAGCTTGTAGGAGCAGGTAGAGTGTCT
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TTCTGCTCAATGCACCAGAGTGCAACACGCACGAACCTCTCCACTCTGACCAAATCCTCA
ATGGCGTCGTCATCATTATGCAACAAAATTTCAATCTTGCCATGACAGACCAACTGATCA
GCCCACCAAAACAGTGTGACCGAATCGTCACCATCCAGCCCGGTCACCGGCTCCTGGCAC
TTCCGGCAGCATATCATTTCTAATAGCACAACACCGAAGCTGTACACATCAACCTTGGTG
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TTGGTCACCGTGGTGTGCATCTGCTGGTCACTAAGAAGCCTGGCAATCCCGAAGTCACTA
ATCTTTGGATTTTTCTTGTTATCTAACAATATATTGTCGGGCTTGATGTCACAGTGGATG
ATTGGATAATCGCATCCTTCATGTAAGTACTCCAGGCCCTTGGCAATGCCAAGGGCTGCT
TCAGCGCGCCAACTCCACATCGGTTGCTGCTGAGGCTGGAATAGGAAGCTCCGAAGGGAA
CCACCTGGCATGAACTCGAACACCAACATCCGTTGCTCCTGCTCTTTGCAGTAACCCACC
ATGCGGACTAGGTTCCTGTGGTGGATCTGGCCGATGGACTGTACCTCATTCGCGAACTCC
CTCTCGCTGTAATCATTGGAGCTGATGAGCTTCTTCACTGCTATCTCAGGGTAGTGTAGC
GACTTAAACACCCCATGGTAGACCTCGCCAAAGCCTCCTCTGCCTAGCAACTTATGAAAG
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TTCTTCTTCCTAAGGTACCAATGTAATATGAGACTACTTACTGCAGACAGCAACAGGAAT
GCTGAGCCACCAAGTAGTGCATAAGGCAATATCCTTCTCGGTGACGCCGGCACCGAGGGG
CTGCTCGTCCGCACCTTGATCAATGCCTTCATGACGACGTCTCCTCCTTGCCGTCCAAAT
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GGCGAGTTTCCCCAAGTGGTGTTCGGGAGCTTGACAACCCCAAACTCGGCGGAGCGGTTC
TTCCCGTCACAACTCTGCGGCATGAACCCCTGTGTGCAGCCCATGTACCTGAGCTGAGAA
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CAGTATGAATTGGGGCCACACAAACCTTGCAGAGAGGTTTTTATCTTGCAACCTTCAGCT
GGGAACTGTCCCGTGACTGCCCACGGCACGTTGCTCGTTCCCATGGCGCTCTTCGGTCGG
GTGTACATGCGGAAGATGCCATCTGGATCGAGTGATGCATACTGGTGGTAACCAAACCTA
GACTTTCGATGCGGGGGTATCAGGTCACGTGCAGTGCTGTCATTGATGATCCGATAGAAC
AGATGGCCTGATGAGTCAAAGAAAATAGTCGAGTTGCCGACCTGGTTGTCCGGCTGGTTG
GTGGAAGTGCTCCAGTATGCATTGTGCGAATCCAGGTTGCCGGTGGCAAGGTTCGTGAGG
TACAAGACGATGTTACCATCGCCTTGCACCTGCAGGCTGTAGCGGCCGGGGAAGAAGACC
ATGTCGGAGCGCCTGGACAGAAGAGCCTTTCCAGAGCCCAAGGATTGACCCGGGAGGAGT
GTGTCAGTTGGGTGCTGGAAGCTCTCCCAGGTGATGGGCATTCCCCCGGTGGCGAGTAAC
TGGAGGTTGCCTGAGTCTTGCAGCGCGAGAATTGAGCCGGCTTGTAGGCTAGGGTATGGG
TTCGTCCATATTATGCTACCGGTGTTGTCAGTGAGGGTGAGCTGCGGGCCGATGCTGAAC
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ACCTTCTCCTGTGCAGGGTCAGGTCCCTGGGTGAGGTTGAAGTTGAACCAGACAGCAAGG
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AGATGAGGCTGGTGGAGCAAGAGCACGAGGAACGAAGCAAGGTGGAGGACAAAAGATAGC
GATGCGCTTAATGGCTTCATTTGGGATTAGCTTCTTGCTGATCGTGGCTTTATTTCTGAT
TATCTTCTTGCATGATCAGCGTGCCATTGCGGTGTATATAAACTTGATACGATCCAGCAA
GTCTTGGGTGCCTCGTCACCTAATGTGGCTTTTAGACGAGACTTGCTTGGGTCTATGCTG
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TTGGCGAATGCCCAATTGTCACAGGCCAGGAGGAATCCCGCTGGACCTTTCGTCAGTTCT
CAATCAACTCAGTGTATTGGGGCACAACACCACAATGACGCGCGGATCTTACAGCTGCCG
TGAGGTTTAGGGTACCTATTAGCTTAATACAAAACCATCGACCCGACCGCGCAATTTGCT
GACCAAAAGGAAGCTGAACATTTCTTTCTAATTTGCTGACTGAAAGGAAGCTGAATGTTT
CCTCTCACGTTTTAGTTTGCCCAGTACGTACGTTTGCACATGGATATCACTTTATTGACT
GTAGAAGGTAATATCAAGTGCAAGTGCGCATGCACGTACGCGTGCGGGCGGGCGTGTGCG
TGCGTCGGCATCTGTCTGTGCGTGCGCGTGGGCGTGCGTTTGTATTTGTGTGTGCGCGCG
TGCCTGTGCGTGCGTGCAGTTTACCCTGATTATGCTTAAGCAACAACCAACCTCGATAGG
GAAAAAAATTCTTTGGTAACATCAAGATTTGGAGATAACAGCAGATTGCACCATATATGT
GCTTAAGCAGATTACACCATATATGTGCTTAATGCACAAAGAGATGCGTGCAGTTCTCAG
GTTCCCCTAGACAAAGGGGGCAGCCTCGGCATTGTAGATTATCAGCCGTGAGACAACGTT
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TTTGTTGCAGGTGAAATGGATGTTGGCCATCAAGAACATTCTGTACTCACTTCTGACAGA
GAATTGGTGGTCCTCTCTAAGCACAAGTACCAACAGGCCCGAATCCTTGATGAAGGATAA
GAGGGCCGGAGCACTGTTGGCGATCGAGCGACCACCTGCTGGCCAGTTGTCAGTCCAGAA
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CAGCAAGCGATCCTTGGAAATTTCACTGAGAAGGGCGCCGTGGTCCCAATCTGCAGTGTT
CTCTTCGTATAACAAAAGGAAATCTTGAATTTAGAAAAAGATATATCACCTCATATTTGA
GGCTCAATAGACTAATCTACCACTAATGGTCTGGTGGACGTACCAAGTCAGTCATTGACA
CTCTCCGGTAGCAATTCAACAATTGACTTTGTACCTGAAAGAATGAAATACCCCCTCCAT
AAGCTAATATAAAAGCGTTGGGTCACTACTTTAATAATCTAAACACTTTTATATTAGTTT
ACAGAGGGAGTATGAGTTAGTGAACACCAAGAGATAACTCATGTTTTCTGAAACTTCCTC
TCTCCTAATTTAATCTTGACGTTGAACTGTCCACATGCTCCAGTGATAGAGGTGCTCTAG
TTCTTGCATGTGCTAATTACAAAAGGAAACAGAGGTGAGAGGTTATATAATAACTCAGTA
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GGCTGCCCCGTGTGCTCCAAGGGAGGCGTGAAGACGAAGATGTGGTGTGGACCACTCGGT
GTGGAGTTCCTTCGTCGGGAAGGAAACAAGGCGAAGACATTTTTTCTCTTGCTTTCACTG
TGTGGGATGATGCGGACATCGCCAACATTCACCCGTCGTTTCGCTGTTGTAGGGTGTAAT
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TTTTTGCATGACTACACTGACAAACATATATCTGGATTGGTGCTAGATAGTAGCTCAACT
TATAGACCCGACAAATGTGTTATTGATTCACGGTTTCAGTATGCAAATGACCATGCATTA
ACGTTACATGCCTAAAGTTAGTTCAACATGCAGCAGGTATAGGTAGGGGCGTCATACATA
CAGGGTGGACCTCTACCAAAGAGTTCACACTATATAAATGATCGATCTCAGTTGCATAAT
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GTCGCATTTGGTTGCCCACGGAATACCCATACAGGCTTTGGCGGGACAAATCTGGACTGC
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GCGACAAACTGATCCGGCCCATCTTCCTCTGCAGGCAGTTCCGGTTTCTGCTTCATTTGT
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TTCTTTTTTTTATCTTTTTTCAATAGTTATTTTTATAACCTAAGTTCATGTGTTTAAATT
TTTTCCTGAAATTCAGAAAATGTTCTTGATTTTAAAAAAATGTTCTAAATTTTAAATATT
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CGCCTTGAGCGAATCCTGGTTTAAGAATTGTTGAAGGCCGAGCGAGCTGGGCTGGCCCAC
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TACTCTTCTTTATACTTTAAAATATTCTAACTATATGTATTACAGTAAACACTCTTCAAA
AAATATTTAGTAAAATGTTAATCATGTATATAAAAATGTAGAATGAAAACAAAAATAAAA
TAAAATATTAAACAAGTATTTAAAAATGTTGATTATGTATATTAAAATGTTGAACAAGTA
TTTGTAGAAATGTTAAACATGTATATCAAAATGAAAAATGAAAAACAGAAATAAACAAAG
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ATAACCTCTACACGAAAGAGATATGCATTTTATTCCCTTCGCGCACTAAAATGGGCCGGC
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TCCATAATGGGCTATCCGTTCGTGTGTCACATGCCCCTAACATAATGAACATGAAACTTT
TTCATAGAATTCATCTGTCCAGTAGTAGCTAGAGACCTAGGAAATATCGTCAGATATTTT
TCCGGTCCGTCCATGACGTGTAGTACTGTGTTAGCTCATGCCTAGCACTGCATATTGCCA
TGCCATGGATCGTGATGCACCTGTTTGTTGTTATTCATTGATTCTTCCCCCTCTTCTATC
TGATAGACGCCGACGCTGACGCTGCTGCCGGGTACGACTACCCTCCTAACGACCAACCTT
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CTCCCTC
