| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
No map location |  |
Predicted Genes from contig_44638
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_60658 |
1 |
1400 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_60658
Contig Sequence (9843 bp)
>contig_44638 9843 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCATTTGAACCGGGACTAATGGTCTTTCGGCCCTTGGCCGAAAGACCCTTTTTCTACTA
GTGCATAGTCCATTGTCAAGTCGTGGATGGATGTAACTTAAAATCTATAGGGAGAAGTTC
AACTTAACAGTCTCTGTTGAAACACTGGTATATTAAACAAGTGGAGAGAAAAGGCAAATA
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ACAAAATTCTGAAATCTCAAATGAGCCCATGAGTAAAATCGCAACTGGTGATATGGTGGT
GCTAAAGTTTAATCCCATATCGCTAGTTGAGGAAGAGTTGAACCTCTTCATATAGTGACT
TCTCCCCACCACTTTAAGTGTGTGTTGAGAAGAGAAAGGAGAAGACCACACACACTCGCT
CGCCTCGCACACACACGTACGTGCGACATGCGCGTGAATGGTCTGCCGATTTACGGGGGA
ACGACTTCCTTTGGATTTTTTATTTTTATGTCTTCGGAGACGAGATTAATTATTTCTTGT
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GACTTTAGTCCTCCTATATATATTGCTTACCGTGGTCGGCCGAAAACACACCAAAAACAC
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GCTCGCTTTAGCCAAGGAGAATATTTGGACGTGAGTATTACAGATTTTTCATTCCCACGT
TTGTGGTAAATTTCATTCTTTCGGTTTCGTATTAACATGGTATACTTCCATTATTTAGGT
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TTGCTTGGTCAACTAACATCCATACCATATATATGGTTACACAAAACGACACCGTTCTTC
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CCGCTATGGCTCGATGGTGCTGGTGCTTCTTCTGGAGGCGCTTTCGATGGTGGTGCTTCC
GATAATGGTGCTTATGATGGTCATCGTGGTGTTAAGGTTATGTTTGGGACATTATGTGTA
TGTCCTTGGTGCTATGATGCTTGTTCATGACTTGTTGCTACGATGCTATGCTTGTTTAGA
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TGCGTTGTACCATATATGTATATATGTGCCGTTAATTTACAGGGCAAAAACAAAACAGAA
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TTTCTGGGTGACGGCTAACCCATCGGCAAAGCGTCGGCACATGTCAAAAACCATGTCGAT
GATCTCGCGATTGGCATACTTGTCGGCAAGAGACTACGACTAACGGTGCCGCCTCGTCTT
CCTTTTTGCCGACGATTAGTCTATGTTGAAATCCGTACGGAAAGCCGTCTGCATAGGGCT
CTATGCTGATGGTTTGAAAAGAAGAAGTCGGTGATTATTACCGACGGCTCTATACTAATG
GTAGACGTCGACATAGGCCCCTATGCCGACAGTTCGAAGCCGTCGGCATAGAGGGTAATT
CCGGTACTGTCGGTGCTGCGTTGATGTTTGCCTTACTGTTGTCTTCCGTGTACAAATGTT
TAGGAAAAGAAAAGAATATGCATGGATTAAAATAGACCTGTAGAAACACAGGGGCGGTAC
TGTCCGCTAGTGCTCCTATAAGCAAATTTGAACTTCAGCTTGGTTCCGAGATCCAACCAA
CCAACATACATAGAGGCTCACATACATGCTAGACTGCTAGTACGGAAGGATTCCCAAGGA
CCTTCCGTATTTGACGACGTCATCGTATATCTCGTCCAACAGCTTGTACTTGAACTCGAA
CCCTTCCCCAACGAGCTTCGCCGACGAAATGCAGACTCTCAGCTTGTCGGGGCGACCACC
GAACCTGAAAACAAACATACACGCTATTCAGTATATAGATGTTGCCGTGTTTCCATTTAT
AGATGTTGGTACACTACACACCCGTCGGCCTTGACGTTGTACTGCGGGAACTTGGTGGCC
AGTAAGGTGGCCAGCTCCGCGAGGGTGGTGTCGAGGCAGCTGCAGATATATCTTCCTTGA
GCAGCCTCCTCCTCGGCTACGAAGATCATCGCGCGGCAGACGTCTTGGACATGGACCATC
GGGATGCAGCCAGACGCCCTCTCGATGAGTTCCAGGTTGCGGATCTTCTCGTCGTCACCT
GAGATAATCGTTCACCACACGCGTGCACGCTCATATATAGGTTGATCGTTGGATGAATTA
ATCTAAAAAAGATAATGGTCCCTTTAATTATCATTGCATCTTGACTCTTGAGTGACTTGG
TATCAGGCTCACCAGTTAGCAAAGAAAGGGCACAGGGAACGGAGGTATGGACAGTCGTCG
CCGGCGCCTCGCCAACCGTGACGGAAGGGCACACCGTAACAAGGCTGATGCCGTTCTCCC
GCGCGAAACTCCACGCCGCCTTTTCCATAAGAACCTTGGAGACATTGTAGGCCTGTGATA
CGGCACGCAAGCACGTCATATCACGCTGACATTATTACTACCCGTCCTAAAATTAATAAG
GAACGGAAGTACTGAAAAATGTGATGGCTACCCAGCCGCCGGCATTGGTCAGTCTGAGGT
ACTCGACGTCGGTCCAGGACTCCTCGTCCAGGCCATGGCTGTCTCCTGGTAGCAGAGGCC
GGCCGGCGACAGCCCCCACTGACGATGTCAGGATCACGCGCTTCACCGTCCCCGCCCTCA
CGCACGATCTCATTACGTTAAGGGTTCCCATGACGGCCAGCTCGATCACTTCTTTCTGCC
ATGCCATGAGATATAACTAACTAAAAACAGTTCCTTTTCCAAAATCAGTGTGTTTGATCT
GGCTCTACCTCAGGATTCTCTGCGTTGTTGAGGTTCGTCGGAGCCGCGACGAGGAAGGCA
TAGTCGGAGCCGGCCACGGCCTCGTCGAAGCTGCCCTCGTCCTCCAGGTCGGCGCGGAAG
ACCTCCAAGGGACCGAGCGCTCGCAAGTCCTTGAGATGGGGGTGATTCTCCATGTCATCT
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GTCGTCCGAATAGAGAGCGATCGAGGATCTAACCAGACTTTCTGACAGTCGTCTTCACGG
TGTATCCCTTCTGCAGCAGCATCTTCACGAGGGCCGAGGCGATGTACCCGTCCCCTCCGG
TGACGCACGCCGTCTTCCTCCTCATCGCATCACCTGCCACAGATGTCATCACGCCGGCTG
TAGAGTCGAGAACCAGAGTTCTGTTCCTCTGCTGGTGGAGTGTGGTGCTTGTGGGCGGTC
GTGGCTTTCACCTTTCAGGTAAACGTGTGTCGTAGTGGGTGATCCATGAGTGGGGTTCGT
TAGAGGAATGGTTTGGATCCCAATGGTTTGGATGCTTTCAAGAAACCACATGCTAGTTGC
ATTTATTTCTTCGCAGATTGTCACCATGGAATAATCGGGAAATCTCAATTATTGCTCAAT
TAAGCTACCCTGGATATACAACGGATACATGCTTCACAACTTGTATTTTTCTTTCAGATT
GATTATACCTAGCCAACTCATGCATTGTGAATTTTTTGTGCAGCTATGATACTACTTTGT
TATTTTAATAATATGGTTGCATGCATCGATTGATGCAGAGGCCGGGGGTCAATCCTCCTT
TTCCAAAAAAAAAGAAGCTCCTGCATTGTGCTCAAGTGATGTCACCATGGAACGATGGTG
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GTATTTTTCTTTCAGATTGATTATATTTATACCTAGCCAACTGCTCCATTGTGCTCCAGT
GATATTGAAGTCTTCCATTGACCTGCTAGTATCCAAAAGAGACAACTGGCATGTCAGTAC
TACTCCTATTTACTTATACAAGGCCCCTATAAAAAAATTACGTCTATACAAGGCCACCAG
GGGTCCGACCCTCATGTCGTCTCCCTGAGGCGACGTCAGGGGCAAACGCTTGCACTGCTG
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GAACCAGGATCTAGACGCGGCGGCGATCTCCTAGTGCGGCTGGGGCATGGCGGGGAGGGA
GTTGCGCATAGCGGCCAGGGCGGCGCCCCTGGTCGTGCGACGGGCACGGTACCCTTCATG
ACCCGTGGGATCCGAGGTCTCGGACGATGGTGGGCATTGCGGCGGCCGCATACTTGGATC
CCAGCCAGATCCGATGAGGCGATGGAGGATCTCCGTCGGAGAACCGGTGGCGGCATATGT
CCTCATGGCGACTATCCGTGCGGTTCCAGACTGCCACAATATCGGGACGACGCGGCTTCC
GGTGAAAACCGCGTCTGACTACAGTCTTGGCCGACGATGTTAGCGTCTCTGACGTCGTTT
CCTTCTCGTGGCATCATTGTTAAAGGTCACATCAACTCGATTAGGATGCTTTGGGGGAAA
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GGGCCTGCCATGGTACGTGCATCAGTACCTGCTTTGGAGATGGATCACTAAAACACAGCG
ATGGCGGCCTCTGAGAGTGCGCCGGACCGGTGTGTGATCCAGTGCCGACTTTGTGGCTTG
GCTGAGGCATCCGACTTTAGACTTTAGGCTTTGGTGTGATGTCTATTTGGTATTCGGCTC
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GCTCGGGCTTACTTATGACTTTATAACATTTTTCTGAATTATTAATAAAATGACTGCATG
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AGTATGAAGTTGACCATGTAAAAGTGCAGGCACTAAACGCCGACGATATCAAGAGCACTA
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TTAGCACTTTCATTATGTACGGAGCAACGTTGCTTTAGCGAATGCACAAAAACGTGCGTT
CGAAATGTATATAGTGTGAATTATGAAGATAACGCATCAGTTTAGCACTTTCATTATGTG
CGGAGCAACGTTGCTTTAGCGAATGCACAAAAACGTGCGTTTGAAATGTATATAGTGTGA
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GACCTAAACTTAGATCGTGGCGGCGGCCGGTGACATGCATGGGCATGGCGGCGGCGGACG
CCGGCGACCCCGGCGGAGAAGAGCACCTTCTTCCCGTAGTCCCTCCCCTCCTTGGCGACA
GCG
